Ll_transcript_192436

• Id Trinity: FTRINITY_DN55716_c5_g4_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_192436
• Sequence: TATGAGTAGGGGAATTAGTAGAAAAATTTAGTAGGAGAATATATCATTTTAATATGCAAGTATAACTGAGGTATTGTGAATGCTGTATTTTAGATTTAAA CGTTCCAAATAGCATATCTCTATCATCTTTTTCATTTTTCTCATCACATACAGTTGCTTTTGTTGTTTTCTTTTTAACTTTTTAATGTATAATTTGTTTA TTGATTAGTGTTTTTTGTTGTTGTTGGTGCTGTTTGTACTTAGAATACTTAAATGTTCAGACACATGAGTCAAGTCTTCCCATTTGGGTGGTTGTAAATT AATGTCTTCTTGTGGAAAAGTTGTTGAATGGTTCTCAACCCATTCTCAAGCGAGGTTCTCTTTAGTTGTCTCTATTTTTTTTCTTAACTCAAATTTATGT TCAATTTTGTAGTCTTTTATACTCTAAAGGTTTTTAACTTTTTATTAATGTTGGAAACATATATAACCTTGTTAATTTTTATTAACATAACTAAGTATAA TATCAAAATATAATTTTTTAACATTTTCTATCTTGTGTATGGATTGTTGTATTAATGAGAAATTGAGAATAATTTCCCACTTTTATTCAGTAGTCCTAAT TGTGCAACTTTGAGATTCTTGAGACAGTGTATTCTTATTCTGTTTGGCTTTCCTTCTGTTAATAGTTGTTTGTTTTTGTTTGTATGATATATAGAAATTG GTTGAGAAAAAACAGAAGCACTAGTTTCCAAGAATACAGGAATCTATAATGTTTCATCTCTGGAGCAATTCACAACAAGACCAAAAAAGCAAAGAGCTTT ATGCTGAATCTAAGGTTAAAGAGCTACAGGATGCAATTGGGTCCTTATCTGGACACAATTTGAAGTATTGCACTGATGCTTGTTTGAGGAGATATCTAGA AGCTAGAAACTGGAATGTAGACAAGTCCAAGAAAATGTTGGAGGACACACTAAGGTGGAGATCAACCTATAAGCCTGAGAAAATCCGTTGGGATGAGGTT GCGATGGAAGGGGAGACAGGGAAATTGTATAGAGCAACTTTTCATGACAGGCAAGGAAGGACTGTTCTTATTTTGAGACCTGGAATGCAGGTAACATATA GCTTGTACATATGTATGATTAATTGGTCCCTACAATTTAAAACTAAATATAAATAAAGTCCACATAACTTTCAAATAATGTAAAATGATCCTTATAACTT TATAATAATGCAAAAAATTTCCAGGCTGTGCCCTTATAGTTTCAGATTTGGCTCCTCTAAACGTCAGGGTTACACTTTAAGGAATATAGTGCAAATGTAA CTATTGATTGAAAAATCAATGATTATGATGAGATGTATGCACATGTATGAAATTTAGAGTTATTAAAATTTCCCCAGTTAGAGGAAATGAAGAGGACGAG TAGGATCGGTAATGAACTGAACCAACTCGATATTCGTTCGAAACTCGATATATAAACTAATTTTCATGTTTATTATGACTCATGCATTATTTTTTATATT TATTGTTATTATATATATACAATATCATATTTATATGTATAAGACTTTTATAGTATTTTTAAAAATTAATTAACTATTTAAGTTGTTTAAGTGAACCAAT TTGAATTGAGCCGGATAATTCGCGAACTTTAATCGAGCCGAATTCGAGCTAAAAAAATAACTTGAGTCGAGTTTTGAGCTGAATAAATCTTTACCAAGAT GAACCAAGCTGAATTCTGGTTCGACTTGGTCTACTCGTTTCCATCCCTAAGGGTGAGTATTGCTTCTTCTGATCTGGAATTCATGAATTTAAATCCGACA TCTTTCTTTGAGAGAGTAAGACCTGGTACATTTGTCATTCCATATCTACTCTACTAGGTCAGAGACTCATACACTAGCCACTCTTTTTAAACAGAGGAAA CTGATTCCCTATAGTTTCACTCCAAATAGGGAAGAAACCCAACTAATAAGGACTATTTTCTAATGCTTAAAGGGAGTAAATAGCAGATATTAAATTGAAT TTTGAGTGAAATTATCTGGACCAAATGAATAATTTAATCTATAGTTGATATAGTATAAATTTCTTGAGCTATAATGGGTATTGAAGTTGAATATCTATTG TGTTGAAGAACACATCTTCAATGGAGAATCAGATGCGTCATCTAGTGTATCTTTTGGAAAATGCTATGCTAAATCTTCCACCAGACCAAGAACAAATGGC ATGGTTGATAGACTTCACAGGGTGGTCAATAACAAACACACCAATTAAATCAGCAAGAGAAACCATTAACATTCTTCAGAATCATTATCCTGAGAGGCTT GCCATAGCATTTCTTTACAACCCACCTCGTGTTTTTGAAGCTTTTTGGAAGATAGTCAAGTATTTCTTAGATAACAAGACATTTCAAAAGGTGAAGTTTG TGTACCCAAAAAATAAAGATAGTGTGGAACTCATGAAGTCTCATTTTGATGAGGAAAATCTTCCCAAAGAATTTGGAGGAAAAAGCATATTGACCTATAA TTATGAGGAGTTTTCCAGATTAATGGCTGAGGATGATTTGAAATGTGTAGCCTTTTGGGAATCTGATAACAATCTTACAAACCACATTGGAGATGAGAAT TCTGCAGCATAAATAACTCTAGAGCCAGTTTGAAATAAAGCCACAGTCCTCATAGACCTGAGGTACTTAACCTTGTGTTAACTTAGTGGATATATATATA TATATATATATATAGGTTATTATGGCATCGTTCAATCCATATAGCCGACCAATCTAATGAGATAAAGACCTGGTTGTTGTTGCTCTATTGTATATGTAGC CCTTTATTTAAGGGGTGTTTAGTTGTTTTATGCTTTCATTTTCTTTTGATAATAGGTTTCACTCATGATTACATAAATATCAAGTTACTTTCATTTTGAT TACTATTTTAAGAATTTTGTGGGAAATTTTTTTTTGATAAAAATGTGAGTATGTTTAGTTAAAAAA
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_53844;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_192436

FPKM

• FPAB: 2.8
• FPNAB: 2.7
• LF1: 3.3
• LF2: 1.4
• LF3: 1.3
• LF4: 1.4
• UF1: 2.8
• UF2: 1.6
• UF3: 0.7
• UF4: 1.5

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_192436

• Blastp: CRAL-TRIO domain-containing protein C23B6.04c from Schizosaccharomyces with 34.88% of identity
• Blastx: CRAL-TRIO domain-containing protein C23B6.04c from Schizosaccharomyces with 34.31% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (SPCC23B6.04c)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019443185.1)
• Pfam: CRAL/TRIO domain (PF00650.19)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;