Ll_transcript_192444

Id TrinityFTRINITY_DN55716_c5_g4_i4
Name TranscriptLl_transcript_192444
SequenceTATGAGTAGGGGAATTAGTAGAAAAATTTAGTAGGAGAATATATCATTTTAATATGCAAGTATAACTGAGGTATTGTGAATGCTGTATTTTAGATTTAAA CGTTCCAAATAGCATATCTCTATCATCTTTTTCATTTTTCTCATCACATACAGTTGCTTTTGTTGTTTTCTTTTTAACTTTTTAATGTATAATTTGTTTA TTGATTAGTGTTTTTTGTTGTTGTTGGTGCTGTTTGTACTTAGAATACTTAAATGTTCAGACACATGAGTCAAGTCTTCCCATTTGGGTGGTTGTAAATT AATGTCTTCTTGTGGAAAAGTTGTTGAATGGTTCTCAACCCATTCTCAAGCGAGGTTCTCTTTAGTTGTCTCTATTTTTTTTCTTAACTCAAATTTATGT TCAATTTTGTAGTCTTTTATACTCTAAAGGTTTTTAACTTTTTATTAATGTTGGAAACATATATAACCTTGTTAATTTTTATTAACATAACTAAGTATAA TATCAAAATATAATTTTTTAACATTTTCTATCTTGTGTATGGATTGTTGTATTAATGAGAAATTGAGAATAATTTCCCACTTTTATTCAGTAGTCCTAAT TGTGCAACTTTGAGATTCTTGAGACAGTGTATTCTTATTCTGTTTGGCTTTCCTTCTGTTAATAGTTGTTTGTTTTTGTTTGTATGATATATAGAAATTG GTTGAGAAAAAACAGAAGCACTAGTTTCCAAGAATACAGGAATCTATAATGTTTCATCTCTGGAGCAATTCACAACAAGACCAAAAAAGCAAAGAGCTTT ATGCTGAATCTAAGGTTAAAGAGCTACAGGATGCAATTGGGTCCTTATCTGGACACAATTTGAAGTATTGCACTGATGCTTGTTTGAGGAGATATCTAGA AGCTAGAAACTGGAATGTAGACAAGTCCAAGAAAATGTTGGAGGACACACTAAGGTGGAGATCAACCTATAAGCCTGAGAAAATCCGTTGGGATGAGGTT GCGATGGAAGGGGAGACAGGGAAATTGTATAGAGCAACTTTTCATGACAGGCAAGGAAGGACTGTTCTTATTTTGAGACCTGGAATGCAGGTAACATATA GCTTGTACATATGTATGATTAATTGGTCCCTACAATTTAAAACTAAATATAAATAAAGTCCACATAACTTTCAAATAATGTAAAATGATCCTTATAACTT TATAATAATGCAAAAAATTTCCAGGCTGTGCCCTTATAGTTTCAGATTTGGCTCCTCTAAACGTCAGGGTTACACTTTAAGGAATATAGTGCAAATGTAA CTATTGATTGAAAAATCAATGATTATGATGAGATGTATGCACATGTATGAAATTTAGAGTTATTAAAATTTCCCCAGTTAGAGGAAATGAAGAGGACGAG TAGGATCGGTAATGAACTGAACCAACTCGATATTCGTTCGAAACTCGATATATAAACTAATTTTCATGTTTATTATGACTCATGCATTATTTTTTATATT TATTGTTATTATATATATACAATATCATATTTATATGTATAAGACTTTTATAGTATTTTTAAAAATTAATTAACTATTTAAGTTGTTTAAGTGAACCAAT TTGAATTGAGCCGGATAATTCGCGAACTTTAATCGAGCCGAATTCGAGCTAAAAAAATAACTTGAGTCGAGTTTTGAGCTGAATAAATCTTTACCAAGAT GAACCAAGCTGAATTCTGGTTCGACTTGGTCTACTCGTTTCCATCCCTAAGGGTGAGTATTGCTTCTTCTGATCTGGAATTCATGAATTTAAATCCGACA TCTTTCTTTGAGAGAGTAAGACCTGGTACATTTGTCATTCCATATCTACTCTACTAGGTCAGAGACTCATACACTAGCCACTCTTTTTAAACAGAGGAAA CTGATTCCCTATAGTTTCACTCCAAATAGGGAAGAAACCCAACTAATAAGGACTATTTTCTAATGCTTAAAGGGAGTAAATAGCAGATATTAAATTGAAT TTTGAGTGAAATTATCTGGACCAAATGAATAATTTAATCTATAGTTGATATAGTATAAATTTCTTGAGCTATAATGGGTATTGAAGTTGAATATCTATTG TGTTGAAGAACACATCTTCAATGGAGAATCAGATGCGTCATCTAGTGTATCTTTTGGAAAATGCTATGCTAAATCTTCCACCAGACCAAGAACAAATGGC ATGGTTGATAGACTTCACAGGGTGGTCAATAACAAACACACCAATTAAATCAGCAAGAGAAACCATTAACATTCTTCAGAATCATTATCCTGAGAGGCTT GCCATAGCATTTCTTTACAACCCACCTCGTGTTTTTGAAGCTTTTTGGAAGATAGTCAAGTATTTCTTAGATAACAAGACATTTCAAAAGGTGAAGTTTG TGTACCCAAAAAATAAAGATAGTGTGGAACTCATGAAGTCTCATTTTGATGAGGAAAATCTTCCCAAAGAATTTGGAGGAAAAAGCATATTGACCTATAA TTATGAGGAGTTTTCCAGATTAATGGCTGAGGATGATTTGAAATGTGTAGCCTTTTGGGAATCTGATAACAATCTTACAAACCACATTGGAGATGAGAAT TCTGCAGCATAAATAACTCTAGAGCCAGTTTGAAATAAAGCCACAGTCCTCATAGACCTGAGGTACTTAACCTTGTGTTAACTTAGTGGATATATATATA TATATATATATATATATATAGGTTATTATGGCATCGTTCAATCCATATAGCCGACCAATCTAATGAGATAAAGACCTGGTTGTTGTTGCTCTATTGTATA TGTAGCCCTTTATTTAAGGGGTGTTTAGTTGTTTTATGCTTTCATTTTCTTTTGATAATAGGTTTCACTCATGATTACATAAATATCAAGTTACTTTCAT TTTGATTACTATTTTAAGAATTTTGTGGGAAATTTTTTTTTGATAAAAATGTGAGTATGTTTAGTTAAAAAA BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_53844; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_192444

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_192444
BlastpCRAL-TRIO domain-containing protein C23B6.04c from Schizosaccharomyces with 34.88% of identity
BlastxCRAL-TRIO domain-containing protein C23B6.04c from Schizosaccharomyces with 34.31% of identity
Eggnog-
KeggLink to kegg annotations (SPCC23B6.04c)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019443185.1)
PfamCRAL/TRIO domain (PF00650.19)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;