Ll_transcript_191501

• Id Trinity: FTRINITY_DN55749_c1_g2_i3
• Name Transcript: Ll_transcript_191501
• Sequence: ACAATCGTTTCTCTCTCCGTGGACCGAAATAACCACTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTTATAACTAACCCCAAACTCTCTTCTCTTCTTTGACACTCACT CAATGGAACACTGCATATTCTCCAACCTCAAAACCCAACCTTTATGGCTCCTCTTCCTCTTCTCCCTCGGTTCCATCACCCTCCTTCGCTTCTCCTTCAT TTTCCTCAACTGGGTCTACGTCAATTTCCTCAGACCCTCCAAAAACCTCAAAAAGTACGGATCTTGGGCCCTCATCACCGGCCCCACCGACGGCATCGGC AAAGGTTTCGCCTTTCACCTCGCCCGGAAGGGACTCAACCTCGTCCTTGTCGGCCGCAGCCCGGAGAAGCTGAAGGATGTCTCTGATTCAATCGCCGCCA AGTTCGGGAAAATTAAGGTTGTCACGGTTGTTGTGGATTTCTCAGGTGATCTAGATTCTGGGATGGAGAAGATTAGAGAAGCGATTGAAGGGCTTGATGT TGGAGTATTAGTGAACAATGTTGGGGTTTCTTACCCTTATGCTAGATTCTTTCATGAGGTTGATGATGAGATTTTGAGGAATTTGATTAAGGTGAATATT GAAGGGACTACTAAGGTTACTCAAGTTGTGTTACCTGGTATGATTAAGAGGAAGAAAGGTGCTATTGTTAATCTTGGTTCTGGTGCTGCTATTGTTATTC CTTCTGATCCGCTTTATGCTGTTTATGCTGCATCTAAAGCGTAAGTCTTTGTTTTTTGAATTATCATTTTCGCTTATTTTGTGCTTAATATAACTCTTAT AGTTCATATTTAACTGATTAAAACCAAACATGTTATACATAATTAGATAGAAAGTTACCGATCCAAGTGGTACATGCTTGATTCCTCTTAAGTAAAGTCT CGAGTTCGAGACTTGTGGATGGAAAAAATGTTCAGTGGGAGAGTTAGCCTTATATGCCTGTGGATGTTCCGGCTCGGATATGATTGTCTCCGGTGCGAGG ATATCTGTGAAAAAAAGAAGATAGAAAGTTTGTGTTCCACTTACATGTACTGAGATTTAGGGGAGATTGCAATCCTTATAGCTTGTGGAAAGCTTATGAA AAATAAGCTTATGAAGATAGATTATGACTTTCCTTAAATTATTTTAGATTATTTGATATTTAAGATAGCTTATAATTAAATACAAGTAGGAGGATTATAA CCTTTTTATAACCTTATTCAAATAAGATGAGAGGAACTTATATGAAGGTTTAAAACACTTATTAGTAGTAAAAGCTTAATTAAGATGCTTATTTAAACGC ATCCAAGTTTGTGCTCGGCTAAATGACTTGCATGTACTGAGTTTTGTTCTATTTTGTTCTTTTATTTGGATTCAGAGTATATGCAATATGTGTGCTATGC TATGTTGTTTTATGCGGTGAACTGAGTTTTTATGTTTGTTGCTTCAGGTACATCGATCAATTTTCTAGATGTCTGTATGTGGAATACAAGAAATACGGGA TTGACGTGCAGTGTCAGGTATTGAATTCTGTTCTTGCTTTTACCTTCAAGGCTTCAACCATGGGCTACCCCATCCATTGATAACGTCGGGCTACCATTGG CCCACACTCTTTCCGTTACCTGTTAGCATTCTGCCATATGGGCATGATATGCTACATGCCATCCCATCTCTGAACTCATACATTCCGTCCCATCTACCTT ATCCTTCTTGCTTAGTTGCTCTGTTGGTTCTTTGGCTCCATCCACGATTTGATGCTCTTATACTGGTTGTAGAAATTGGTCATGTCCACCACCAGATCCT TGATAAACATGTGTGACAGTGGTGGAAAACAACGAGGAAGGGATCTTGGTGAAGCACACGAGTTTGGATAGAATCAAGTTGGTATTTTGGTTCACCCCAT TAAGCCTAAGTGTTGACAATTTCTGGCTTTTGGGGGTCAGATTTTAGGGATTCAATATTGTCTTTGAAGCTCTCTCACCCTGTGGATCTCTTTGATTATG GGTTTTGAGTAATTGAGTGGCAATGGTGGTTCTTCGGTGATAAGTCTGTGTGCAATAGTTTGCTGATTACTTATGTGAATTATTAGGCAAAGTACAATTT TACATTCGCGTATGCCTCTGCTATTTCATTTTCCCTTAGTCCATCCAAACTCTTTTTTCCGAACAGTTGGAAAATTGTCCGCCTAAATATTAGTTTATGA AAGAGAGTGGACTATGGGTGAGTTTTGGTGAACAATTTAATTGATCATTTCTTCAGTATGTTTTTTCCTGAAAATAACTAAAAAGTGCATCAAAAGCTAT TTTCCTAGGTTGTTTTTGCAAGCCTCGATAGCTTCTCTTAAACTCTTCCGAATTGTCATGGATTGGTTTGCTTTTATGTGTGCAAAGTCTGCTATGATTT TTGCCATCTCTAATAAAGATTTTGTGGATGCAGGTTCCGTTATACGTGGCAACAAAGATGGCATCAATAAAGAGATCATCATTCTTTGTCCCATCGACAG ATGGATATGCCAAAGCAGGTGTGAGATGGATCGGCTATGAACCTCGTTGCACACCATACTGGCCCCATACCCTTCTCTGGGCCTTGGCATACTCATTGCC AGAGTCTGTTGTTGATGCTTGGCGCCTCCGGTTCTGCCTCGGTATTCGGAAGAGGGGACAGCTCAAGGATTCAAGGAAGAAGGAATGAAAACATCCATGT TTTTGATATGTAGGCATAGATACAGATGAGTAAATCATCATTTAAGTCCTCCAAAGATAACAGCTTTATCAGTTAGGTCCTTGGAATAGTTTGCCACCAA ATAAGTTCATGAAAGTTTAAATGCTACAAAGCTGTCAAAAAATTTAATTGTCACTAATTAAGTCCTTAGGAAGGACCTATATGGTGACATTTTAAAACTA TCATGGACTTGTTCGGTGACACAAATTTTTGAAGGACCAAACTGGTAATGTCATCTTCGGAATACGGAATCGAGGGTTTACTCATAGTAGATTAAGGTTC TAAGTGTCTGTTATGTTTCTGATTTTCATGTTAGTATTGGTTAGCCTTTATGAGATGTAACAATGGATTGGCCTAATCTTTTTCATTCCTTATATTTGGT TGGTTCTGTTCAGTGTTGTATGATGATTAAACAGTTGCTGATTTTGTTGAGTGTTGAAATAATCTGATTTTGCACCTGCACTTGGATCAATCAGATTATT TGAATCAAATTGAATTGAATTTGACCTCTATATTTTGAATTCCTCAACTTTTTAGGCATATTTAAATAGGTTTATGGATTTTTAAAATTTGTAATTTGGT TCTTTAAACTTATAAATACTGTACTTGAATTTCAAA
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_54137;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_191501

FPKM

• FPAB: 0.4
• FPNAB: 1.1
• LF1: 0.4
• LF2: 0.3
• LF3: 1.1
• LF4: 0.8
• UF1: 0.8
• UF2: 0.5
• UF3: 0.9
• UF4: 0.8

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_191501

• Blastp: Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase 1 from Arabidopsis with 65.26% of identity
• Blastx: Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase 1 from Arabidopsis with 65.57% of identity
• Eggnog: Dehydrogenase(COG0300)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G67730)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019414745.1)
• Pfam: short chain dehydrogenase (PF00106.24)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;