Id Trinity | FTRINITY_DN55783_c0_g1_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_193618 |
Sequence | CTTTAAATATGACAATTGTCTTTGTCTTCTGTGTCACAGAAGAAAACTGAAACCGGCACTCAGATTTATAGTCATAGTCAAACTATGAAGCACTATTCAA AACTCAAAAACTTCCATGTGATTTTCTTAGTTCTTTTTCCTAATGCACTTATGTAGTTTTGAGTTGTGAATTCTGATCCTTTTGTTTCATGAATTTTGCC TCCACTACATTCTTCTATATATGCTGATTCCTTAAGTGCAGTACATGAAAAAGTGTTTAGTTTATGTAGCACCTTTGAAGATTTCCTTGCCATGATGGTG TTTGAGATAAACAATGATTTTGTGCAGGTTATTGGGGTTATCTCTGCAATTCTATTATTGGTATCATTAAGAGTCAAAGTAGCATCATGTGATGAGTACC CTGCTATGCATTGCAGAAAACACAGTGCATTTTTGACTGATTTTGGTGGGGTTGGTGATGGCAAAACATGCAACACCAAGGCCTTTCAATATGCTATTAG CAATCTCAGCCAATATGCATGTGATGGGGGAGCACTACTTGTTGTTCCACCTGGGAAATGGTTAACAGGAAGCTTCAATCTAACTAGCCATTTCACCCTT TTTCTTCAAAAAGATGCTGTTATTCTTGCTTCTCAGGTTTTTACTTACTCCCCCTTTTTCTCAACAATCATAAATTCATAACCTTGCATATGCATAGTTT TATTATTTGATTACAATTACAAAAAACACCTCTTTTCTAGGATGAAAATTGTTATAAGTTACCCACATTAGGGAAGTGATTTAGCCATTAAATAGGTAGG ATGAATTATTGGTTTGCTTTATTGTGAATGCTGTGATCTAATGATGTGGTAACGTCAACAAAATCCTTAGTTCAAAGCACATCCTAGTTAGTAACACAGT TAGTCTTTCAAGTTTCAACAATGATACTCAACAAACACATGAGTGACAGAGGACAGAAGTTAGAAGATAGGATTGGTTTATAGTAGTGCAATGTTTAACT TGCTTTCTTTTCTGTATGGCACATGTGCACCTTTTTGTAATTTTCTTTTTGATGAGATGACACATGTTCACATTATTTTCCCCTGTAGAATATATAAAAT GGAAGATGCTTAACAGTTGCTAGCAAAGAAAAAAAGGGTATAGCTTTTTAATGTTGTGGTGAAGCCCATTGACTAGAGATTCATGCATGCAATAAAATAA CTAGAAAGTTGGGTATCTAATTTCCTATTTCTGATGTTTTGTCAACGGACATATTTATAATATAACATTATGGCATCGTTCGACTCATTTAGCTGACCTC ACCTAATGAGATTACGGTTTGGTTGTTATTGTTGTAATTTCCTGTATCTCTCACATACCAATGATTTCTTGGCATGTTAGTTCAGCATCCTTTGACTTCA CAATATTGGTGAACATTGACAGGATGAATCAGAATGGCCTCATCTTCCTGTCCTACCATCATATGGCAGAGGAAGAGATGCTCCTGGTGGAAGGTTTAGT AGTCTCATTTTTGGAACTAACCTCACTGATGTTATAATTACGGGTAACGACTACAGGACCCTTTGTTATACCTCTGTTAGAACTCATTTTAATGACATCT ACTTTTAATTTTTTGCTCATTAGGCTACAATGGAACAATTGATGGACAAGGATCTTATTGGTGGGACAAGTTCCACAGAGGTGAATTGAATCTCACGAGG CCATACTTGATTGAGATTATGTTCTCAGATCATATCCAGATATCAAATCTTACTTTGATCAATTCTCCATCTTGGTTTGTCCATCCAATTTACAGCAGCG ACATTATAATTCAAGGGCTAACCATTTTTGCGCCAGTTGACTCTCCCAACACAGATGGCATAGATCCTGATTCTTGTAACAATACTAGGATTGAAGATTG TTACATTGTCTCCGGTGACGATTGTGTCGCAATTAAAAGTGGTTGGGATGAGTATGGAATCAAATTTGGAATGCCAAGCCAACACATCATCATTAGAAGG CTAACATGTATATCCCCTGATAGTGCTATGATTGCTTTAGGGAGTGAAATGTCGGGTGGAATCGAAGATGTTCGAGTTGAAAACATCACAGCTCTCAATA CTCAATCAGCAGTTAGGATCAAAACTGGAGCTGGTAGAGGGGGTTATGTTAAAGACATATTTGTTAAAGGAATGAGCTTGAACAAAATGAAGTATGTGTT TTGGATGACCGGTTCGTATGGATCACACCCGGATACTGGCTTTGATCCCAAGGCACTTCCTAACATTACTGCGATAAATTATAGAGATGTGAGGGCTGAT CATTGCAAATATTCAGCAAGACTTGAAGGAATTCCTAATGATCCTTTTACAGGTATATGCATTTCTAATGTAACTATCACAGGTGGTAAAAAGAAATTGC AATGGAATTGCACTCATGTTGGAGGGGTTACAAGTAATGTACTTCCTAAGCCTTGTAAATTGCTTCCAGAGAAGAAAAGGACATTTGATTGTCCTTTCCC AGAGGACAAATTGCCCATTGAAAATGTTCAGTTGAAGACTTGTTGCTTTTAAACAAATTATTCTTCTATAAGAATGAGTGTATTTTAATTTTGAGTCTAA CCTAGTAGCAACACCATTATTCTTTATGTGAAATTTTTAAAAAGGAAATGAATTCTACTACAAGTTATAGACTATATGCTTTGTTTGTCTTGTTAGTGAA TGATGTTGGGATTGTTATGTCTAATATTTTAACCATAGCATGCTACTTACCCCACAATGGATGATAATAATAGGTTCCCAAGTCATGTCTACATCTGTAG ATTCTTGAATTGCACTAGATCATGCAAGAATTATAATGCCAAATTTCATCACTCTATCACTAAATGGGTCATTATTCATCACACTTTTCCTTTAATCTGT CATTAGAAAAATATTACTTTTTTCAGAAATCATTACATTATCCTCTCAGACCTCACTAGGCGAAAATAAATTATTCTTATGGATTAAGCTCAACTAACTT TTGAACCACATGAAAGTAGTGAAAAACATTCAGTCAAATTGGCATGCCAATTGCCAACAATAGCCTTTAGGAACAACATTGTTATTTTCCTGCCACTTTC TGGTAGTGATTTCTGCTGCTTAACCTTCTACTTAGCTCCTAAATGAGTATCACCTAATGCTCCTGGAGCATGTCTTTGTGAAAAGTGGTCATGCTCACAA TGCTCCATGACAATTTTGTGTTCCTTAGGAAATGTGAGGAAGAGGGAATTAAAAACAGGTCAAAAGCAGGTAAGTTAATAAAAAACTGAATGAACTAGTT GTTCTTACATAAAAAAGAAGTAAGTCAGTCTCGAGCATGCGAACGATAGCTCCCATTTTGAGTCTTGGATTCACATCAGGATCTACGCATCGTAGAGCGA CCAAAATAATTCGTTTAAGTTCTTTGGAAGAAGGCATTTCAGGCAACTTTGGATCAACCACATTAGCAACCTTTCCTTTGTAAATCATTGATTTGAACCA CTGTACTATGAGACTCTGCAATATGGAGTCATGATTAAGCCATTATGTAAAGGACTAAGAAGCTTAAAAAGGCCAAAATCAGAGATCTTTGGATTCCATT GGTGGTCAAGCAATATATTTCTAGATTTTATGCTGCCATGGACAATCTTTGGTTCAATCTCTTCATGAAGGGAGCTTACTGGTCCAGGAAA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_54411; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_193618
Blastp | Probable polygalacturonase from Vitis with 65.48% of identity |
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Blastx | Probable polygalacturonase from Vitis with 64.35% of identity |
Eggnog | Glycoside hydrolase family 28(COG5434) |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019450638.1) |
Pfam | Glycosyl hydrolases family 28 (PF00295.16) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |