| Id Trinity | FTRINITY_DN55799_c0_g5_i9 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_192924 |
| Sequence | GAACAACCATGTGGCATAATTTTATCATAAAAAACAAAAAACAGAGAATTCCTATACTATCCTTGTCCCTTTAGGTTTTCCAATGATTCTTATTCTTACA CAGTGATAGTACTTATTACTTATATATCTCCACACACATGCATGCGAATTTGTGAAATTGATTGAGATCGAAGAGTGATCGATGGGTGTGGAAGAAGGTG TTCCTGCTGCTCTTGGATTCCACATGCCTGCTGAATGGGAACGCCATTCTCACTGTTGGATGGGTTGGCCTGTAAGACTTTCTTTATATGTTACAGTTTA ACATAATCGATTATTTGATCTCATTATTTTATTAACAGGAACGGTGTGATAATTGGAGAGATAACGCTATTCATGCCCAACGTCTATTTACCACTGTTGC TTCTGCTATCTCAGCTTTTGAACCTGTTACCATTTGTGCTTCTTCTTCTCAATGGGAGAATGCACGGAATCAACTACCCTTACATATAAGGGTCGTCGAA ATCAGCATGAATGACTCTTGGTTTCGTGATACTGGTCCCACTGTCAGTTTCTCTCTCTTTTTTTCCTTCAACTCATTTCTTATTCTTTCTAACAACACTT GCTTTTCATCTTAGCCATCAATTTCTTTGAAATAAATCTAATGCTGTAGATCTATTCGTTAATTCAAACCATTGAATTTTGAAGAAACTGATGGCTAAGA TGAAGAGCAAGCGTAAAAGAGTTACTCTGGGAGTAACTTGATTTGATGCCTCCCCTTTCGTTATTATCTTCTACTTTGTGACCATTTTCATATAGTTTGA ACTGATTCATGTTAGAGTTTGCTTTAACATCCTAAACATGTGGGACTAGCTCGTTGACCTGTTGGGCTAATCATGTTTGGTCCAATATGTTATGGATCTA TAGTTAGGAACAGGCATGAGTCATGGCTTCGATCATCTGATTCATGTGTATGAAAATAAAATATGGGTTATAATCTGGAGACTCTGCTTTTTGTTGTTTA CACTTTTTCATTCTGTTACTGTTTTTGTTCAATAGTTTGTTGTTAGAAGAAATCCTTCAGAGCCCGGCGATGAACACCATCCGATTGCAGGGATTGACTG GACCTTCAATAGTTGGGGAGGTGTAGAAGATGGATGTTACTCTGACTGGAGTCAGGATACCCTTGTTGCGAGAAAGATTTTGGAAATTGAGAAGATTCCT AAATTTCCGCATTCAATGGTGCTTGAAGGTGGAAGCATCCATGTGGATGGAGAAGGAACTTGTCTTACCACTGAAGAGTGTCTCTTGAACAAGAATAGGA ACCCTCATTTGAGTAAGAGCCAAATTGAGGATGAACTTAAGGCATATCTTGGAATCAGGAAGGTCATATGGTTGCCTCACGGATTGTATGGTACATAAAC TCGACACTGATCTTTTAGACTAAGAATCTTCTTAATCGATTGAACTTTGCTCAGCATAATTAATTTTGGATTGAGATAGTTAAAGGTTTTATGTGGATCA TTTATCATGAGGTGTAGTATAAGGTTAAATACGGATTAGTTATCAGATAAGAATAATTCTGCTTATGAGAAAAGACTTGATTCAGCATATAAGCAATGAA ACAATGGAGCAGTATAAGATACAGGCATACAGCTCAGGACAGGATCGGTGGAAAACAAGTCATACAACCATTTTACAATACTTATCAATTATAATCAGTG AAATCTGATTGTTCTCTAGTTATTAATTCACTTTCTCTCAGTAAATTAACTTCTGTGCTTTTGACTATGCTTTTACTATGCAAATAAAAGGCTCTTAACT TTCACTATTAGTCTATATTGACTATATAATTATTTTGGAGCATGTAGAATGAAACTCAAAATAAAGTAAAATTGACACATCTCCGTCCATGTTTGGTTGG ATGAAAGCTAAATAGAAAAAGTTGGAGGTCTCATCCAGACAACAATAATAACAAGAAGTTGGGACTTAATCTTTTAAGTTAATTTTTTACAAAAGAAATT TAGACACTTATGTAGAGATTATCTGGAAATATTTTGATACTTTTTTAGGTTCGTAGTTACATTTGAATTTTATATATTCCCTGAAACCTAATTAAGAAGT ATGCCGCTCTTATGCAGGAGACGATGATACAAATGGTCATATTGATAACATGTGCTGTTTTGTGAGGCCTGGTGTGGTTCTGCTGTCTTGGACTGATGAT GAAACTGATCCACAGTATGAAAGATCTGTAGAAGCATATTCTTTGCTTTCAAGTGTAACTGATGCCAATAATAGAAAATTGGAAATAATTAAACTCCATG TCCCTGGTCCTCTCTATATGACAGAGGAAGAGGCTGCTGGGGTTTTTCAGGTAAAGTTTTAAGTTTGCATTTCTTTCCTTTTACATTTAAACTTCTATCT CGTAGTAGTTTAAAATTATAAAGAAGGAAGACCGTGTTATCGTTATTTTTCACTTCATTTAACAAAGTACAGAAATAATTTTCAAAATATGATTCCAATG GTCATTGTAGTGTATCTTTAAATGACGCAATGCATAGTCTGTTGCTGTATGGTCATCTGTTTTAGAACTTTAAGATGTCATATTTGAGTGCACTCTTTTG TTTGTGGCAATATAGTTTGCTATGTCACTGGCCTTATATTTTAAATGTCGGTTGCAAAAATGCTGTCATCAGACTGGGTACCACACACAGAACCATACAG GTACACCTATGGTTTTGTGGGTATCCACTAAATATTGCCCGAATCATTTTTTAGGAACATCGGTTTGTGATCAGTTGCAGACATTAAAAGTTGACATTTC AAGTGATGGCTATGCTACACCTTATTATATAAAAAATGTATCCTGAGCTCAAAGCAACATTGATGCATGGTATGATCAACATTAAAGTGGTACTGGTATT ATTGGTTACACTTCCGAGTTGAGTTTTTCAAGCTACTAAACAGAGTGACAGACTAAGAGAATGTTTGTTCTGATGTAATTCTATATTTGTCAGGATGATG AGGCTAAGCCGAGACTCCCAGGCACTAGGCTTGCTGCTTCCTATGTAAACTTCTACATTGCAAATGGAGCTATTATTACACCACAATTTGGAGATAAAAA ATGGGATGATGAAGCTGTCAGAGTCCTATCTAAGGCATTTCCTGATCATAAAGTAAGTAAAACTGATTGTTAAGAAACTATTTTTCAGTTGAAGAATCCT AAAATTTTATCCTAAACATCTACAAGAATATCAGGTTAAAGAAAATATGGGTGGGTAAGAATGAAGCACTAGCCCATGGATGAAACAGACAACAACCGAA ATTTGCTGAAATGGGAACATGTGGTGATTGGTCCTGAATATCTATAACCATAAACTGTTCTATGGGCATGAATAACATATGCATCACAAATTGAGTACGG TTTTCCATGAAAAAGCTAAAAGTATCAAAATACTAATAATAATTTGTACCTTGTACTCTAGTATTTGGAAAGTGGTGTATGAACTATGAAATTTGGGTGG ACTGATTTCATTTTTTTGAGTTGTTTTGGTTGCTGAATCACATAAAATGTTTGTATTTTCATAGGTTGTGGGAATTGAAGGTTCCAGGGAGATTGTTTTG GCTGGTGGAAATATACACTGCATTACTCAGCAACAACCAGACATTTGATCAAATTGTTGCATTGGAGTCTTTATGTTTCAAATTAAATAATTAAATTCCT TGGTTTGCAAGGTGGTGGAATTGTATTGGAAATAAAATTTAACTGGCATTCCAAATTGCAAAATCATGGTTTATTCTGTTGAATGATTGAATCGAATTTT TTTAGAATAAACTAAAACAAGTTTTGCTTTGCTTTTAAGCAGAAGAAACCTTGCATGCATCTATTCAACAAAACTTGATATAAAAT BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_54549; |
| Additional information | - |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_192924
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Agmatine deiminase from Arabidopsis with 69.83% of identity |
| Eggnog | Agmatine deiminase(COG2957) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT5G08170) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019439055.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |