Ll_transcript_269448

• Id Trinity: FTRINITY_DN55850_c3_g2_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_269448
• Sequence: CTACTTCGGGCCCCTCCATCACGTTCCAGTTCCCCAATAACTACTAAATCGGGCTTTAATTTCCTCACCCAAACTCAACCTCTTTATTAAATTGCTTTAA TTTGCATGATGGCATTGTATCTAATGCTATTGGATCAAAATTTTGGAGGATGATGTGGTTTGTTGTTGCTTTGTCTATTTCGCTTATGCGGAACGATCTT ATCTTTTCTGATAAGGAGGTTAGCTTTATTCATATCTTGGATTTGATTCAGGCTAGATTGTGGACCTGGTTTTTTCCAGATATTGCTCTGACTGCTTTAG TTTTTGCAAATTGGTGTAATGATCCTATGTCTTGTATCTTGCATCGTTCTAAAAAGATCAAGACCTGATCCTTCTTTTATATTGGGTTAGCATCCCTTGT GCTGAAAGTTATACTACAATGTATAGATATTAAAATTTAAAAAAAACTGAATTGATAAATTACTTATAATATTTAGAAACTTCAAAGTGGTTTAATATTT CTGAGTTTCTTATAAACAACAATAAATTCTAATGTGTATGAATGAAATGTTATTGATAAAAATAAAATATATTTCAATAGTTTCTCCAACGTGAAAAATA TTGATATTAAAATGTCAGCCAAAAGGTACATATTGTAACAAATGGTGTGTAAGAGATCATCTTGTGGGTTCTATATATAGCTTGTTGCAATGTATTGTTC TCAACCATACATCAACATGAAAACATTGAATCTCAACCCTCAAACTCAAAGTGATCCACCAAGGATCATAAACCCTCTAGACCCAGAAGAATTCAAGAGG CAAGGCTACATGATGATTGATTTTCTTGCTGATTATTATGGTAATGTTGGCAAGTACCCAGTTTTAAGTAATGTAGAACCTGGTTACCTTAAAAAATTGT TGCCATCTACTGCACCATTAGGCCCTGAACCCATTGAATCCATACTTAAAGATGTGAAAGAGCATATCATCCCTGGTATCACTCATTGGATGAGTCCCAA CTATTATGGTTACTTCCCTAGCAGCAGTAGCATAGCAGGGTTTGTGGGTGAGATGCTAAGTACTGGATTTGGTGCTGTTGGATTCAATTGGATTTCATCA CCAGCTGCAACTGAGCTTGAAAGTATAGTCATGGATTGGCTTGGACAGGTTCTAATGCTGCCAAAACCCTTCCTTTTCTCTAGTAATGGAAATGGTGGTG GGGTGCTCTTAGGAACAACATGTGAGGCCTTTTTGTGCACCCTAGTAGCTGCAAGGGACAAAAAACTTTCCCAGGTTGGGACACATAACATAGGAAAACT TGTTGTTTATGGTTCTGATCAAACACATAGTTCACTTCAAAAAGCAGCTCAAATTGCTGGGATCAATCCAAAGAATTATAGAGCCATCAAAACAAAAAGG TCAAGTTCATTCGCTCTCTCTCCTGATTCATTGCTTTCTACAATTCTCTTGGATGTAGAAAATGGTTTGATTCCATGTTTTCTATGTGCCACTGTGGGGA CCACTGGAACAACAGCCATTGATCCTGTGGGATCATTGTGTAATGTGGCAAAAGATTATGGCATTTGGGTCCATGTTGATGCTGCTTATGCAGGTGCAGT ATGCATTTGTCCGGAGTTTAGATATTGCATTGATGGAGTTGAACATGCAAACTCTTTTAGCTTCAATGCACATAAATGGTTTTTGACTAATTTAGCTTGT TGTTGTCTTTGGGTGAAAGATCACACTGCATTGACCAATTCACTCTCAACAGATCCTCATTTCTTGAGGAACAAGGCATCTGAGTCGAAGAAAGTGATTG ATTACAAAGATTGGCAGATAACCTTAAGCCGGAAGTTTAATTCACTCAAATTATGGCTTGTTCTAAGAAGCTATGGTGTTGATAATCTTAGAAACTTTTT GAGACATCATGTGGAAATGGCCAAAACCTTTGAAGGGCTAGTAAGATTGGATAGGAGGTTTGAGGTTGTTGTGCCCAGGAATTTCTCCATGGTTTGCTTT AGGATTGCACCAACAGCAGTTGCTAATGGACTGCCCAATGGTACAAAATTTGACCCTATTGGGAAAATACTGAATGATAAACATTATTTGGTGAATGAAA TTAACCGTAAGTTGCTTGATTTAATTAATAGTTCTGGAAGTGTATACATGACTCAAAGTGAGATTGAAGGAGATTTTGTTATTAGATGTGCTATAGGTGC TACCTTGACAGAGGAAAACCATGTGATTATGGCATGGACGTTGGTACAGGAACATGCAAATTCTTTAGTAGGTGCCTTCAAAAAATAACAATTGTACTTC TGTATACGGAATGCATTGAGATTACCTGTCTATCGCATTTCCTGCCTCGAGCCAATGTTATGTTTTGTTTTAAAAAATTTCTTTTATTCATATTGCAATA TATGATTGATCTGGGACAGAGAATAAGACATCGTTAGAGACACGTGATCTCTATCCTCTATATAATACCTTCAAATTTAAGTTCATTGTATTAAGATACA TTTGTACTAAATAAACCATGCAATTTTCAATAAACATCCCATTTACCATTACTGTGAC
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_54997;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_269448

FPKM

• FPAB: 0.6
• FPNAB: 10
• LF1: 13.7
• LF2: 8.8
• LF3: 7.7
• LF4: 13
• UF1: 17.6
• UF2: 8.7
• UF3: 6.8
• UF4: 7

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_269448

• Blastp: Tyrosine/DOPA decarboxylase 2 from Papaver with 64.38% of identity
• Blastx: Tyrosine/DOPA decarboxylase 1 from Papaver with 63.28% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019454485.1)
• Pfam: Pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain (PF00282.18)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;