Ll_transcript_269449

• Id Trinity: FTRINITY_DN55850_c3_g2_i3
• Name Transcript: Ll_transcript_269449
• Sequence: CTACTTCGGGCCCCTCCATCACGTTCCAGTTCCCCAATAACTACTAAATCGGGCTTTAATTTCCTCACCCAAACTCAACCTCTTTATTAAATTGCTTTAA TTTGCATGATGGCATTGTATCTAATGCTATTGGATCAAAATTTTGGAGGATGATGTGGTTTGTTGTTGCTTTGTCTATTTCGCTTATGCGGAACGATCTT ATCTTTTCTGATAAGGAGGTTAGCTTTATTCATATCTTGGATTTGATTCAGGCTAGATTGTGGACCTGGTTTTTTCCAGATATTGCTCTGACTGCTTTAG TTTTTGCAAATTGGTGTAATGATCCTATGTCTTGTATCTTGCATCGTTCTAAAAAGATCAAGACCTGATCCTTCTTTTATATTGGGTTAGCATCCCTTGT GCTGAAAGTTATACTACAATGTATAGATATTAAAATTTAAAAAAAACTGAATTGATAAATTACTTATAATATTTAGAAACTTCAAAGTGGTTTAATATTT CTGAGTTTCTTATAAACAACAATAAATTCTAATGTGTATGAATGAAATGTTATTGATAAAAATAAAATATATTTCAATAGTTTCTCCAACGTGAAAAATA TTGATATTAAAATGTCAGCCAAAAGGTACATATTGTAACAAATGGTGTGTAAGAGATCATCTTGTGGGTTCTATATATAGCTTGTTGCAATGTATTGTTC TCAACCATACATCAACATGAAAACATTGAATCTCAACCCTCAAACTCAAAGTGATCCACCAAGGATCATAAACCCTCTAGACCCAGAAGAATTCAAGAGG CAAGGCTACATGATGATTGATTTTCTTGCTGATTATTATGGTAATGTTGGCAAGTACCCAGTTTTAAGTAATGTAGAACCTGGTTACCTTAAAAAATTGT TGCCATCTACTGCACCATTAGGCCCTGAACCCATTGAATCCATACTTAAAGATGTGAAAGAGCATATCATCCCTGGTATCACTCATTGGATGAGTCCCAA CTATTATGGTTACTTCCCTAGCAGCAGTAGCATAGCAGGTATGATAGAATATAGTTATGTTAATAATTATTGGGTGATTACTAAATAGTTATCTCTATTT TATGCGGGCTGGTATCCTCTCTAGTACTAGAATATATGACCCATATTGGTTTGATGGTTTAAAAAAGTATTTAAAAATTGGAATGGTAAACTTTTTACTA ACAAATGTCACAATCTCCTCTAATATTGAACTTTGGAGTCCTAGACACTATCCTGTTTCCGTTTATGCATGTTATTGGTTTATTTGTTGTCTACATTTCT CTCTTTTATGCATTAACTAAGACAAGTATATTTCTACCGATAGGGTTTGTGGGTGAGATGCTAAGTACTGGATTTGGTGCTGTTGGATTCAATTGGATTT CATCACCAGCTGCAACTGAGCTTGAAAGTATAGTCATGGATTGGCTTGGACAGGTTCTAATGCTGCCAAAACCCTTCCTTTTCTCTAGTAATGGAAATGG TGGTGGGGTGCTCTTAGGAACAACATGTGAGGCCTTTTTGTGCACCCTAGTAGCTGCAAGGGACAAAAAACTTTCCCAGGTTGGGACACATAACATAGGA AAACTTGTTGTTTATGGTTCTGATCAAACACATAGTTCACTTCAAAAAGCAGCTCAAATTGCTGGGATCAATCCAAAGAATTATAGAGCCATCAAAACAA AAAGGTCAAGTTCATTCGCTCTCTCTCCTGATTCATTGCTTTCTACAATTCTCTTGGATGTAGAAAATGGTTTGATTCCATGTTTTCTATGTGCCACTGT GGGGACCACTGGAACAACAGCCATTGATCCTGTGGGATCATTGTGTAATGTGGCAAAAGATTATGGCATTTGGGTCCATGTTGATGCTGCTTATGCAGGT GCAGTATGCATTTGTCCGGAGTTTAGATATTGCATTGATGGAGTTGAACATGCAAACTCTTTTAGCTTCAATGCACATAAATGGTTTTTGACTAATTTAG CTTGTTGTTGTCTTTGGGTGAAAGATCACACTGCATTGACCAATTCCCTCTCCACAAATCCTCATTACTTGAGGAACAAAGCATCTGAGTCAAAGAAAGT TATTGATTACAAAGATTGGCAGATAACCTTAAGCAGGAAGTTTAACTCACTCAAACTATGGCTTGTTCTAAGAAGCTATGGTGTTGATAATCTTAGGAAC TTCTTGAGACATCATGTGGAAATGGCCAAAACCTTTGAAGGGCTAGTAAGATTGGATAGGAGGTTTGAGGTTGTTGTGCCCAGGAATTTCTCCATGGTTT GCTTTAGGATTGCACCAACAGCAGTTGCTAATGGACTGCCCAATGGTACAAAATTTGACCCTATTGGGAAAATACTGAATGATAAACATTATTTGGTGAA TGAAGTTAACCGTAAGTTGTTTGATTCAATTAATAGTTCTGGAAGGGTATACATGACTCAAAGTGAGATTGAAGGAGATTTTGTTATTAGATGTGCTATA GGTGCTACCTTGACAGAGGAAAACCATGTGATTATGGCATGGAAATTGGTACAGGAACATGCAAATTCTTTACTGGGTGCCTTCAAAAATATCAATTGTA CTTCTATATAGAGAATGGAGAGAGATTACCTGTCCTGAATAGCATCACATTCCTGTGTCGAGCCAATCAGAATGTTACTTTTTGTTTTATAATTTTTCCT TTTATTCATGTTGTAATATATGATTGGTTTAGGATAGAGAATGTGACAATTAGAAACAAATAATCTCTATCCTCTATGTAGGACCTTCAAATTTAAGTTC ATAAAATTGTACTAAGATGCATTTGCACTCAATAAACCATGCAATCTTCAATAAACATCCCAT
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_54997;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_269449

FPKM

• FPAB: 0.1
• FPNAB: 0.6
• LF1: 0.9
• LF2: 0.3
• LF3: 0.5
• LF4: 0.8
• UF1: 0.8
• UF2: 0.6
• UF3: 0.3
• UF4: 0.2

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_269449

• Blastp: Tyrosine/DOPA decarboxylase 5 from Papaver with 65.4% of identity
• Blastx: Tyrosine/DOPA decarboxylase 5 from Papaver with 64.69% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019454485.1)
• Pfam: Pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain (PF00282.18)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;