Id Trinity | FTRINITY_DN55897_c2_g2_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_268661 |
Sequence | GGAAAGAAAGTCTTCTAGGAACTCCGAACAAAATCTTATATATTGGCACAGACTTGGTTTGCGTCTATGAGCCAACTCTTGTGTTTTCTGTGGCTTCATA ATGGTATTGAAGAATTTATGTGAGAGGATTTTTGCTCCAAAATGTTCTTCTAAAAGCTCAACTGACACTGTTGATAATAATCAGGTTCCTGCTTGTTCAA AAGCAGAGTCTAGTGACAGTAAGTTCGCCAAGGCTTCCTTATGGTCTAGCTTCTTTACATCAGGTTATTCAGTCTGCGAAACATTTAGTGAATCACCGGC TTCCGGAAAAAAAGTAGTCAATTCTACAAATAGTGGGTGGGCAGCTTCTGTGAGGAAAGTCGTTACTGTTGGCTCAATGAGGAGATTTCAAGAGCGTGTA CTCGGGCCGAGCAAGACTGAGGTTTCAAGCTCTGATGGTGATGTATGGCTTTTAGGTGTCTGCCATAAAATTTCACAGCACGAATCAACAGGAAATGTAG ACACTAGTAATTATTTCGCTGCATTTGAGGAGGATTTCTTCTCAAAAATCTTAATTACATATCGGAAAGGCTTTAATGCTATCAGTGATTCGAAGTATAC TAGTGACGTCAATTGGGGCTGTATGCTTCGAAGCGGTCAGATGCTTGTTGCACAGGTATTTTGCCTTTGGATTCAATGATTGGTTTTGATTGTCACATGA TACCTTCTATTAATATGTCTCTCTTGCCTTTCCATTTCCATTTTTTCCGGTTTGTTTTCTTTCAAAGCAAGGATACTAATGGCTTTCATGCGTACAGGCT TTACTTTTTCACAAATTAGGTAGATCATGGAGAAAATCTGTTGACAAGGTCAGGTGATTGACATGCAATGTGTTTCAGTGATTAGACTGTTCTCTTTTTT CTTTCTTTTCTTTCAACATTTTCGTATGTTTTTCTTTGTCATGACCCCTGAGATAGAACGTCATTTGCTTAACTTATTATTTTACTTTTTTTAATCTGCA GCCACAGGATAAAGAATATATTGCCATCTTGCAACTTTTTGGTGATTCCGAGGCTTCTGCCTTTTCTATCCACAATCTTCTTGAAGCTGGTAAAGGTTAT GGCCTTGCTGTTGGGTCATGGGTTGGTCCATATGCCATGTGCCGCACATTGGAAGTTCTAGCCCGTAATCAAAGGGAGAGAAATGACCTTGGATCGCAGC CACTTCCTATGGCCATTTATGTTGTTTCTGGAGATGAAGATGGGGAGCGTGGTGGCGCGCCAGTTGTCTGTATTGAAGATGCTTCCAGACGCTGTTCTGA GTTTTCACGGGGCCTGGCTGCTTGGACTCCATTACTTTTATTGGTTCCTTTGGTTCTTGGGCTTGATAAAATCAATCTGAGGTATGTTCCATTGTTGCAG TCAACCTTTAAATTTCCCCAGAGCCTTGGCATCTTGGGTGGCAAGCCAGGTGCTTCAACATACATAATCGGTGTTCAGAATGAAAAGGCATTCTACCTTG ATCCACATGATGTCCATCCGGTATGTTAGCATCAGCAAAATTATTACTACTTACTCAGCTTATTATGCTATTAGATTTCAGAACTTGTAGTTAAAAAGGT CTTGGGTTAGATCACTTACTACTTTATTACTACTTTTATTAATGAGGGTTAGCTCAATTGGTAGGATTGAACGATATCGACAAAAAGGACTTGGGTTTGA TTCCTGACATATATTGGCAGGTCATCTTTATGTCGAAAGTAAGGCCTGTAGCATGCCTTGACCTTGGAATGACAACCTCCCCTCCCCTTTAACTTTTGTT ACCTTAAAAAACTGAACTCGTGTAGAATTTATAGGTATGCTATGCTCCATTGTGATTCACAATTCTTCCACTGGCCTAAAATGTTACTATTTGGAGGAAA CAGAAAGGGTTAAAAATAAAAACCAAGAACTTATTCTGGTTCTTTTGTCAACAACTGCATGTTGGCTTCTCATAACATATGAAAATATTAGCATTTCGAT TCCTTCACCTCACTGACCTTTTTAAATAATTTCCTGTTTTTTTGGTTGGTGGGTAAAGCACAATTGGTTCAAGAAAGGAATGATTTCAATTTATCCTTTG TGTTTGTTTTGAATGGAAGGCTGAAAGCTTTCACGTGATTCGGACAAGAATCCTTGTTGGTTTTCTTAGCCAAATAACATGCTTTTGGCAATTCATGCCA TTTGGATTCAATCTGAGTTTCAAAATATATTGTATCAGATTCAGATTTATTTTTATTTTCGGAAACCTCAACCTTGACTCTTTTCAACACTTTGAGCTGA AAATACTAGTCTTAGACCTGGTTTTAAATGTTTCAAAACTCTTACCGTTTTACCATTATTTTATGACAGGGAGCTTCAGCTGTAATTAGATTTTTATACT TAAAATTTATTTTCTTATGTAATCATTGTGACTTTGAATGGGGATGTTATTCTAAGGTGTTCTGGTGCATTTAGCAGATGGCATAAATATGCTGTTATGT TACTTATGATTTATGTTTTTCTTTTTTATGTATCAATTACAGTTTTATATGAATGTTCTTTGCTTTAAAATTATTTATGACTTCATTCATTGTTTTCGTC GGTTTACATATTTTTTTACGGCCAAGAATGTGCTCCCAATTTTGAGGTTATAGATTGTTGATTACACTGCAGGTACAGGCTAATAGAATTATGTTAATGT GATAGGTATTACATATTTGAGGAATAGGATTAGAACTTTAGGAAAACGTTATTATATAAAGCTATAAGTACTAACCTCGAACGTCCAAAAAATATATCTA TCTCTAAAAGGAAAAGATAAAAGAAAAGAAAACGTGACGAAACAAAACATGGTTTACCTTGAATGTGATCTCAGTTTGTTTTCTTGCTATTTATATATGA GTTCCTTCGTATAGCGTTCAGCTGTTGTTGAGTTGGTGGAGATTCACTTTTTTGAGAATCCTAAATTACAGGCCCTTAGTTTGTTGCCTTAAATGGTTTG TTTCAGGTTGTTAATATCATCGGCACCAATCAAGAGACTAATACTTCATCGTACCATTCCAATGTTATCAAGCTAATGCCCCTAGATTCAATTGACCCAT CCTTGGCTATTGGATTTTACTGCCGTGACAAAGATGATTTTGACGATTTCTGTTCCCGGGCCTCGAAGCTTGTAGAGGAATCAGACGGTGCACCGTTATT CACAGTAGCTCAGTCTCGAAGCTTGTCAATGCAAGTCAACAATAATGAGGCGATAGGTGCCAACGGTGGACTCGAAGAGGAGGATGGCCTTGGTTTGGAC CTTGTGAATGAAGGTACCAATGAGGATGATTGGCAAATCCTATAAATACCAAACAATTTGGTTTATTTGAAGTACATGGTCAAAAATTTGTTGCTTGATT CACATTAGCATAAGTGTCACTGTAAGTTTGGCTACTCTTCACAGACACTGCTAGAAATGTTTGAAAAAAGTAGTTTAAAGTCATTATGATTCTTTGGGTT AAATTGTGCATTTGTTCATATATCTAACTATTGTACATTAAAAGTATTAAATGGCTTCCAAGTTCACATTGTTTCATGTATCCTTTGGATTGTACTCTTG GACTATCAAATAAATGGTAGAAATAATAGAGTCATATCTTTGGGTGTTGTCTCTTATTTACCAAACAAGTTTTGTAATGTTTGGGGGATTTGTGTTAGTT CATGTTCAAATTATGGCCATTGATTGAATTGAAATGAATTAGAAATTAAG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_55442; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_268661
Blastp | Cysteine protease ATG4 from Medicago with 87.6% of identity |
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Blastx | Cysteine protease ATG4 from Medicago with 70.37% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (MTR_7g081230) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019413861.1) |
Pfam | Peptidase family C54 (PF03416.18) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |