Ll_transcript_249858

• Id Trinity: FTRINITY_DN55923_c3_g2_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_249858
• Sequence: TGTTGGTGGGTTGCAGGTTAGGAGTAAAGAGGGTTGGGTGGATGTGAATCCTGTGCCTGGTGCTTTGGTTATTAACATTGGAGATTTACTTCAGGTCAGA TATTTTGTTTCTTTATTAAATATAAAATATGCACTGAAACCAATTTTTTTTGGTATCAAAAAAATATTTTTTTATATAACCAAAACATATTTAGTAAGAT ATTTTGATCTTCTATCATTATTTGTCCTCTCAAAATGTATTATATGCATTTTAGTAAGCATGTCATAGTAATACTTATATTTTTTTTGGTGCATTATAGT AATACTTATATGAGTGAAAGAGTTATAATACTTATCTTCTATATATATTATATACCTAATTTATGTCTCTCTCCTTCTCTTTTTGAATTTTCTTTATCAA ATCTTCAAAAATCTTGAATTTCTTATATATATATTTTGTTTGAATTGAATAATAATAAATTATTAGTAATATTATGAGAATAATCATTAAGATAAGAAAG TATCAACATGCTATAGTGCAAGTGCGTGTGGATGTTCTCAGCTCGGATAAGATTGCTTCTAGTGCGTGTAGATGTTCTCAGCTCGGATAAGATTGTCTCC AGTGTGATGATACTTGTATGAGACCAAATAAAAAAAAAATTAAGATTAGAAAGTGAATTTATTAAGTTATTGAATTACTAATCAATTTTTCTTTCAACTT GTTCCTGTGATTCCATTAAGAAAGATTTTCAGTTTGAATATTATGAATAAAAATAAGTGCTAGGATACCTTTGCCCCTTGAATGTACTCCTTCCCAGCTT GTGGTCCAAAATGACTTTCGAATACCAAACTCAGTTTTACAAAAGCCATTGATTTTAGCAATTTAACATGACTAATCAATATGTGAATTATTGGGGAATA ACTTATCTTAATTATAAATTATTCTAATGCTTAGCTGATAAATGTTTTTGCCTGTTTGTTAATTGTTAACAAATTTTCAAGTAGATAGATTATGTATTTA TGTCAAGAATAATAGAAAACTACATTGCTACCAAATTATTTAGGCTAGACCATAGAAACAGGATTCACTCAACTTGACATAGAACCGCGAATTCGCGGTT CTCTAGCGAACTGGTTCTCTCCCATTTCTTCCTTCCCTCCATGTAAGAAACGAACCAAAACTTTCACCATGAATTTCGGTCCAAGAAAGAAAAGAAAAGG AATTGTAGATGGCAAAATGACAATAAGAACAATAATGAAAAGCTATTGAAAGAGAAAAATTATAATCTTACTCAACAAGAGGTCGAGGAAGAAAATGGGA AGATAAAGCATAAGCAGAAAATTGAAAATTGAAAAGTCACTCCAAAAGCAAATGCAATGGAAAAGAGAAGTCACATTGGGCAATGGGAAAGAGAAAACTA GGTAATAAAAATTGAGAAGAGACGTGTAGTAGGATAGAGAAAATATCCATGACTTTAAATTTTTTTGAGAATATAATATGATATGAAAGTGTATCTTAAA AAATGGGATTTGTTTAATAGTTTAGTGATTCTTCAATTTCAATAAAACTATGCATTAAAAAATGAGAATTATTTAATGTTTGTACTGTTTGAAATTTTAG TCATTATTTTATGTGGGGGAATAAAATTATGCCTTAAAAAGTATAGATTATTTATTATTCTGATTTTGGTCATTATTATACATTAATGAACTATTTAAAA TAATATTAATAATTGTATTAGAATAATTGTAATATGTACATTATTAGTGTAAATATTTATATATATTTAGTAATTATTAAATAATTGTAATATATACTTA GCGTACCGAATATTTGAGGTAGTAACATACCGTGTATTACGTATCCGTACCCGTACCGCAAAGAACTGCGTTTCAGGTGACTATGGGGTAGACCACTAAA GTTTGAAAGTTTAGAGAATCAATTGATTTCCCGTCTGAAAGCAAAAATTTTACTAGAAGAAGAATTGTAGTTCAATTTGTTCCGACAATATTAGAGGGTG AGCGTAGCTTAACATTAAGTTGTTGCTTGGTGGTAATGGGTCTGTACTTTTCAAACACCACTAAATGGGCTTCTCTTGCACCGAGCGGCCCCTGTTTTGT TCACTGACAATGTTATAGGAAACATTATAGTATTATTCTTTCATTTCCATATTTTGATTTTCGTATCCATCGTTTTGTCTCAGATAATTTCTAATGAAGA ATATAAGAGTGCCTATCATCGGGTTTTAGCCAATTCTTCTGGTGAACCACGAGTTTCGGTTGCAGTTTTCCTGAACCCAAGTAACAGGGAGAAGTTATTT GGACCTTTGCCAGAACTAACATCAGCAGAGAAACCAGCTCTTTATAGGAATTTCACATTCAATGAATTCATGACCAGGTTCTTCAAGAAAGAGTTGGATG GTAAATCATTGACCAATTTCTTCAGGATTTGATTAATATCTGTTTCATGTTAGTATTACTGTAAAAATATATTTGTAATACTGCATCTGCTGCTATTTGT GTGAATAAAACCAGTTGTTCTGCAAGGAAAATCTGTTCGGATTTTTCTCTGTTTGGCCCAAAATTTTGGGTAGCAACGGGGTTTTCTGGCTCGATCATTA TGCTCCACGGCCTTTAAGGAAGATTTTCTTACATAAATCCAAGGCCAGTTGTAACATTTTGTATCTTTAGTGTGGAAAAAAAGTTTCAGTTGCGCATTAA ACTTTGAAATGGTCAAAAACAAATTTTGAGAGCCAAATAAAATTGAGTTGAAGGAAAAATGTTTGTGAACCTGATATACATTTTCCTTTTAGGTTTATTT ATTTTTATTTATTGGAGAAGAGTTCTTGATCTCGTACACCAGTGTGAATCTTTTGATTACTAGTGCATCTTGCTATCAAATGCATAGGTCTTGAATCACA TCATCCTGGATAAGCATATCAGGATAAATTGAAGAAGCATATTTCCTCATGCTCCTGTCGTAAGAACTAACCAAAATATTCTTTGGGTGTGGTTCACACG CTCCCTTATTC
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_55715;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_249858

FPKM

• FPAB: 5.4
• FPNAB: 1.2
• LF1: 0.7
• LF2: 0.7
• LF3: 0.8
• LF4: 1.6
• UF1: 0.3
• UF2: 0.5
• UF3: 1.3
• UF4: 0.8

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_249858

• Blastp: -
• Blastx: 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 11 from Arabidopsis with 48.24% of identity
• Eggnog: 2OGFe(II) oxygenase(COG3491)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G59530)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019434975.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;