Id Trinity | FTRINITY_DN55930_c2_g3_i4 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_250534 |
Sequence | CTGGGGCATGTGGATATGGCTCCTTTGCACTTGGCTTAAGTAATGGACAGCTTGCAGCTGCAGTCCCTTCCCTCTTCAAAGATGGAGCTGGTTGTGGTGC TTGTTTTCAGGTACCAATGTCATTTCTCTTCATACAAATAATTTAGAGGTTTTTTTATTGTCATGAATCATGATCATTAATATATTGTTGTAATAAATGT ATAATTTGATGCAGATAAGATGCAAGAACCCCACTCTATGCACAAAAGCAGGTACCAGAGTGGTAGTGAGTGATCTTAATCACAATAATCAAACAGACTT TGTCTTAAGCAGCAGGGCTTTCACGGCCATGGCTCAGAAGGGTATGGCCCAACAAATATTGAAGCTTGGCATTGTTGACATTGAATATAAGAGGTAAAGT TCCTTCTTTTTTCTTTATGCACCTGTTGTTTTGGTTGTTTCCACCACAAAATTGTTGGGTCTATTAGTGTGAAGTCTCACATTGGATAGGTGAGGAAGAA TGAAAGGATTTATAAGTAGGAAAAACCCATGAAACTAATGTCTTAGGTTTTTAGTTCAAGACGTGAACTTAATGACTCTCCACTCTTCCTATACCCCAGT AACAATGGAGCTCCCCGGTTGCGAGTCTGGTCCAACAAATGGTATCAGAGTCTATGGTTCAACTGAGACAAGTAGACTTACTTAAGGGGGAGCGGAACAA AAATGAGAACACCGATTCAACTGAGAGAAGTAGACTTAAGGGGGAGCGGAAAAAAAATGAGAACACCGATATGGACCAACAATTAAATAATATGACACAA TCATGGAGCATTTACTATCAGCTAGTAACGGTCTAATATGCATATTTTATTTGCTCAATGAATGTATAATGCTAATATATTGATATTGTAGTAGTAATGC ATATGTGAGATGTTTTATGAACATGCAAGCAGAGATTCTTGTTTATGTATCATGAATCAAGTGTTACTGATTCTTGTTTAATGGAACAGAGTACCTTGTG ATTACAAAAATCAGAAATTAGCAGTCCGTGTAGAAGAATCAAGCCAAAAACCAAATTACTTAGCAATTCAGTTTTTGTACCAAGGGGGTCAAACAGAGAT AGTAGCAGTTGATGTAGCCCGGGTATGTAATAATGTCATGTATACATAGCATACACCAATTAATTTGATTACCTATTTTATTATTGATTGCATAAAATTG TGAACTTTGAGTAGGTTGGATCTTCAAACTGGAGTTTCATGAGCAGAAAACAAGGGGCAGTGTGGGACACAAGCAGGGTTCCACAAGGTCCATTGCAATT CCGGATAGTGGTAACTGCAGGGTATGATGGGAAATGGATTTGGGCACAGAAGGTGTTACCTGCTGATTGGAAAACTGGGATGGTGTATGACTCTGGTGTT CAGATAACAGATATTGCACAAGAGGGTTGTTCCCCCTGTCATGAAGGGAACTGGTCTTGATTCATCACTCATGAATAACACATACACAGATATAGGCTTT ATCTTTATTCATGCTAGAGTATACAAGTAGTTTAATAAACTTACAACTTTAGCTATAATTCCTATAAACATTTTGTTTTTGCTATTGTTTTTTACAACAT TTGGTAGTACTCAAGTGACGTGTATAGCTTTGAGATTGAGGCAAAATTCACTCGTGGCATTGGCATCTATTGAAAGACCCTTGTTTTGTAAACCAAAATG CATCATCAAACAAATTGGACAAACCTCTAGGTTAGGGACTAAACATAATTTTAAAGCTCCATGACATAAAACCATACATGTGCTGTTCTCTTATATCAAA AGATTGTGATTGATCCAGGGAATTAATTATCCAAACCATTTGGACCAATCTGGCACAACAATGTCTAGGATGTGATATCACATAAAATTGCAACAAGACA GCTAGATAAATATGCAACTAGGACAGGATCCCTATTTCCAATAAAATGTGACATTTTGATTGATTTGGTACACAAATGGGTACACAAATGAGATCTCCAT TCCTACATGGATGGCCTAAATTTTCAGTGTGGAGGAGGTTTGTAGTTAAAATAGGAACAGGTAGAATGTCATACTCAAACTCCACTAAGGAGTTGCCAAC CTACCAAGCACAACAAATTATCTCAAAACATTTGGTCCTTCCAACTCAAAGTTCACAAAGTTGGGTCCTCATCTAGGCTTAGAAAGGAGCCTAGCACCAA AACTTGTTGGCTTTAGGTTATTGAAGACATTTTAGAAATCTTGGATAGGGATTTGTCAAATTTTCACCAAATTATATTTCACAATTCACACAGTAGCAGG ATAGAGAGGTTAGGTACTAGTTATCTAGCTGCCTAAATTCCTCAACTCCTGACATCAAAAAATAAGAATGTGTTCCATAACAAAAACAACTCCTATTCAT ATTATTAGAATCCAAACTTCAAATAACACACAAATCATCCCTTTTTCTTTTACACACAGGCAAGGGATAGGAATGAAAACAAGTTCCCTGACCAACCTGA AGACTGGAGCTTGAAAGCATGAGAAGAAAGCTTTCAATCTGGTATATGTAAGTTAATGAGAAAGGCTAATAACATATAAAATAGAAAACCGTGGCGAATA AAAACAAAACCAAAAGACATTCAGATACCACTGATTATGCTACTAGTATCCCTTCCCCAGAATTATGCCAAAGATTATGGAAACAAGAGCAACTCCCAAG ATGAACTTAAAATTTATGACAGGTGAAACCTGTTCGGTTCGAATATGAGTTTGAGACGAAGATGATGCTTGAGAAGTTGCTTCTGACTTTTTCTTGCTCC TCCTTTTTGATGGAGTCGAAAAGCTTGATCCAATGTCCCTGAATTTTACCTCCAAACGATCTTTCTCCTTCTCCTTCAACTTCTCTTCAAGGTCAAATAT CACGGATTGAAGTTCCTTCTTTAAATTATGATTTGTCTCGTTGAGCAAGTTCTTCTCATCTAGTATCATAGATATCTGCAGGGTGACATCATTTCATTCA GAGTTCAATTCTCTATGTATCATAGTTTATGCAAAATGATCATTTCATAAATTTTTATTACATTCAATTGCAATGGAAGAAGGAAAGATAAAGGAATATT AGTACCTCTGACTTTAGTGTCTGCACTTCTGCATTATGCTTTGTCACCAATTCTTCAATTGCATTCTTTGAAGTGAGTACCTCCTGAGATATTTCAGCAA AATTTTCATTCAGAATGTTTGAAGCATCTTCTAACCTTTTCTTATCATCAGTCACTGCTCTCAAAGATTCATCTAATTTCTTTTCTCTTTCATTAGCTTC CTCAAGTGCAATTTCAAGGCTCAATGCTCGTCCTCGAAATGCCCCGAGTTCTGATGTCAGATCAGATACCCTGTCAAGGTTTTTGTTGGCATCTGCTTCA GAATCAGTATATCTCTTTTCTAATGTGCTTATTTGTTGTTCGAGGTCCTGAATTATGTATTTATCTGCTTCAAGTAACAACTCCAACTCACTTGCCTTTT TGTCAGCATATTCTAATTTGGAATGGGATCTTTGGAATAAATCCTCCAGTTCTCGGCTACGCTGATGATTCATACTAGCTCGGTCTTCATGCTCAGCATA TTTGTCACTGACGATCTTCAGCTCCTTCTGCAACTGTGAACTCCACAAAGACGATTGATTCAAGTCAGATTCAAGTTGAGTTACCTTTTCAGTATGCTTC TGCAGTTGGCTTTGCAGGAGATTCTTTTCTTCCTCAGTTCCTGTCAATTTATCATTCAGATGAGAAATTTTCTCAGAGAATTCAGTCACTTCTCTCTCGG CATTACTGGTTTTCAGTTTTACTAAATTTAATTGTTGCTCGAGCTCCACGTTCTTCTTCTCCACTTCCGTGAACTGTGTCTCCAGCTCCCTTAGTTGCGA CTTCGCCACCCATGCAGCTGCATTTGAATCCTGAATATGTTCCTCGAGCTCAAGATTCCTTTGACTAGCAGTATCTGCTGCTGTTCCAAATTCAGTATGG AGATCTCCCAAAGACTTGACCTTCTGTTCAAGCTCTGCATTGTTTGAAAGTGCCTGGGATAGAAGGGAATCAGTTTTTTGAAAACTTACATCTGAAAGCT TCAGCTTTTCCTCTAAATCAGTGGACAACTCTTTAAACTGCTTCACATTACGGGTTAAATCCTCGACAGTGGTTTTGAGACCTTCGTTTTCTGCTTTAAC TTGAGTTAGTTCCTCCTGTACAGCCAGAACCTGTGCTCCCTGAGTCTTGAATGCAGCTTCTACTGATTCCCTCAGCCGTCCTTCCTCCTGCAACTTCAAC TTTGCACTTTCCAACTCAGAAATCTTTTCTTGCAGCTCTTCCTTTGTAGAGACAATCAGACTTTGAATTGCGAACAAATCTTCCTTTAGCTGGGCTTCTG AAGTCTTTCTCAGGTTTAACTCCTCAGTCAGCTCATCTACTAAAGAGTTCCTTGAAGATAGTCTGGTCTCAGTTTCCAATAGCTGCAATTTTGAGAGCGA TAACTCCTCCCGGGTGGTAGCGAGTTCTGCTGCGGTTGTCCTAAGTGCTTCTTCAACCTTTTCAGTTCCAACAATCTTATCATATGCTACCTTCAATTCA TTCTTCAGGGATACTATCTCATCTTCCATTCCTTTTGCACTCAATCTCCTATATTCTAAGGCCTTCTTTCCCTCTGATTCAGCGTGTGAACCATTTTGCT TATACAGCTCCTCATACTTTTGTGCCTCGGCGGCAGAAAGTTTCAGCTCTTGCTGCAATTCCTCCATCTTCTTTTTGGAGAGTTCAAGCTCAAGGCTCAC ATCATCAAATGCTTCCTTTACATGAAGAAGCTCTTTCTGCTTCACTTCATGACCTTGCAATGCCTCTTCAAGAGTGCTGAGCTGCAGATTGTATTGATTC TCAGCTTCAATAATCTGCTCTTGCAATTTCTTGTGACTCAGTTCAAGCTTTTCACATTTCTTTCCACTTTCCTCTACTTTCTCTTTTGTAGCTGAGATCT CTCCCTTCAGCTGAGCATTCTCATGTTCAGAGCTCTTCAAGGATTCAACTAGTCTTTCAGTTATGTTGGTCTTTTCATCTAAGGCATTCTCTTCCTTTTC AACTTTAACGAATTCACCATCCAAGCCATTCTCTTCCTCTTCCTTCTTTCCTTGGCTTGTAACTTCTGGCATGTCTCCATTTGTATCCACAAACTTGGTC ACCAAATTTTTTGATGCAACTTGTGTCTCTTTTTCCATGCTTGCGTCCTCTTGTTGGCTATTGTTTTAGAAGAGAGGATGAAAAATGAGAATTGAAATTA AAATCCCTTGGGATAAACTAGTCTATATAAACCGTGGTTACAGGGAACAATGCAACTGAATAGTTGATATAACGAACGTATCTAAAAAAAGTAATGCTAG TCGGTGGCAATGCTAATAATAATGAATAAGGAGATTCTAAATCGTTCATGATTTTAACCTCCGAGCAAACAAAGATTTCAATTACATGAGGGTGGGAACG GAGTTAAAGACATTGTGAAGATGTCATGTGGGTCCCTAAATACGGTGTTACAGCTTCATATCAGACATAAGACATTTTATTCTGTTGTTTGGTTGGTAGT TGCATTGAAAAAGTACTCATTGTCACTAAACCAATCAAAAAAATACTATTTTATTAAAAAAAAATACAAAGTAATATTTTTATATTATTTGGTATTATTT CATTGGATATGGACAGGGTTTGGTACAGAAAGTTGGGACGTGTGATACTGGTCATAGAAAAAGACCCAAGAGGGTAGTACACATAAGATATTTAAAAAAT ATTAAAAAAATATCACCATTACCATGTATAATAGCTCACCTAACTGTTTTATGTATAATAGAGCGGGTAAGTAACAGCGAATAGATCTCTGGACCGGAAA TGCTTAGGTCGGGAATGATTACTTCAGAAGAAGAGCCTGATGAAGATTCTAAGCAGTCTGGACACGATGGGGAGGTACCTGCGAAGATACTCCAACGTTC TAGTCAGTATGAAATAAGAGAGAGAAAATATAGTTAAAGAGATATTGTATATTGCTTTTTAACATTTTTCTTTTTTCTCAATTTTTACAATGGAACGTTG AATACGCACGGGACCCACAATGCTTAGAAATCGATGAGAACATATTTGTTGTACCACACACTGTGTCACTTCATGTGTGATTAAGAATTTGAAAAAATGA GATAAAAAATAACTTTATGTTAGACGGTCTATACTTTGAAAAAATGTTAAAATACAATGAG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_55787; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_250534
Blastp | - |
---|---|
Blastx | Expansin-like A2 from Arabidopsis with 66.67% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019412994.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |