Ll_transcript_250548

• Id Trinity: FTRINITY_DN55930_c2_g4_i3
• Name Transcript: Ll_transcript_250548
• Sequence: AGAAATTCCACAATTTGTGATTGATGAATGCTATGATATGGAGCTGTATGAGTGGACAAAAGTTGACATCTCTGATGAAGCTCAGAAGGAACGTGTTAAT CAGATGATTGAAGATTATGAGCCTTTTGAGGGAGAGTCTCTTTTGGATGCCAAGTGTTTTAAGTGAAAATCTAATCTCCCCCACTTCAAAAGGTTATGGT TTTCTGTCATGTTTCTAACTACAAATTTGGTTTCTTTCCTATTTCCTATTTCCTTTTAGCTGTGCGTGATTTCACAAACGTCAAAACTTATATACTTTGA TTTTGCTACCTTCATTTTTATTTCAGCAAAATCTTTATTTGTCTTTTGTTGTATGCATGTCGCATGATATTCGTTGGGTTCAACTGACCTTTTCCGAGAG TAAGCAAGCAGATATGTAGAGGATATTTTGGAACATCATATATGAGTTCTAAGAGTACATAGGCTCGGTCTGTTTAAAGCAAAGTCTGGTCTGACCTATT TCCACCCTTATATATGTCTCACAAAAACATGTTATACCAACCAATGCCATCTAATCAGTTTAGTGCCATGGGTTGTTTGTGTAAAACTGTTTTACATTAG TAATCTACCCTCCAAAGTTCTCCACCAAAGATGGCATATATGATTAATTAATGATTTACGAGTTATATAATATTTCGTCTACTTTCATATCGATATAAGT ATGGGTTTGTTAATCCTGCCACACACATATAGCATCCCTTATACCTAAAACGTCTTGAAATATGTCTTAAAGTTTATCTCAAACCAATTATAATATATCA AAGTTAAAAAATTAAACATTTTTTATTTTATCTATTTTTTTCATTTGACTTGGGGACAATAGAATTCCCATCCTTAGACCTCTGGATTTTTAGGCCACTA GGCTGAAATAACATACTCCTCCATCTAAAAAATTTGTACTGGTTTTTAATACACAATTTTCCAACTTTATTGGATGGATAAAATAAAGTTTTAGTTTGAT ATATATGAATTGTTAGTATAAAGATTTATAAATAGTTAAAACATTATTTAATAGGAGTAAGTATGAGTTGGGTTGGGTTGAGTAAGGCTTGTTTCCTACC GGGACCAAATTGTTAGTCGTATCATTTCTATGAACTCATGACTGATTTTAGACTTGAAACTAACTCTACTTTAAATATCGATCGAGTCAGCTTTTGAACT TAAACTCAACCTTATACCTGATTAAATATAATTCATTTTAACTAAAATCTTTTCAATATTACTTATTAGTATGAATATGTAATTTGATATATAAAAAAAT ATATGCATATATATTGTTAACCATCTATAAAAAAAATAGAGAAGCAATGCAACTTTCAACTGAATAATTAAATAGATATACATTGAAATATAATGAGTAA ATGATAATAATACAAAATTGAAAGTTATAATTGTCTCTTATCCAATTCTAAATATTGATGTCTAATTTTTGAAGGGTTATATGATTAAAAATATTTTCCT TCTCATTAGCTTAGTACTCTTGCAAGTTCAAATTATACATTTATTACAACAAATGACTAATTAATTTAAGTGAAATAAAAAATTGAAAAATATTTAGGTT GTTAAGTATGTATTATGACAAATCCAATTCCTCTCATACATTGCAAAAATTGTTTGAGACAAAACCTAACTTCCATCATTCTACACTGAAATTATTCTTT GACAATCAACTGAAAGCAACTTTTGTGAAGAAAAACGAATATACTTTTCAACCAACATGATAAAATATTGAAGATATTTTTCTAATATTAATTTAGGTTC TCATGTATATTAAGATGGGATACTCTCATACACACATAAATAAATATATTTATATATATAATTTAGAGAGACTTTATTCCTTCAATGTTTAATTAAATTA ATATTTGAATTATTAAATCCTGTGTAATTAACGTGAGTTGCAATTGTTGCTTTCATTTCATAAATCAAAATCACAATTTTTTCTTTGGATCCAGAAATTG GAGAGATCTGACTATGAATACAGCGATTCCAAGATGCAGATCGCTCCTCTTCTTCCTTATCTGCTCCTCTTTACATTTCATCACAGGATTTTCTGATGAC TTACCTAGTTCTAAAGACACTGCAAAGACTACAGCTCATGCCCACAGCACTAGTCCTATAATTCTCATTGTATTAATTGTGCTTGTGGTATTTTCTTTGC TTTCTTTTTTACTTTTTAAGTTGTGGCGGAAGAAGAAAAGAGAAGAGCAATATGCCCGTCTCTTGAAACTGTTTGAAGAAGATGATGAGTTGGAGCTTGA GCTTGGCCTAAGGGACTGACCATTGCAATTTGACATTTGCAGTCATTGTAATTGAGGTTTAGCTGAGTTTGGTGGTTTGAAAAAAAATTATTGCATAGCC AAGATGGATATGAGCTCCTATGCTAGTTTTACAGAGGAATCCGCTGTTGGATGTTTGTAATGCCATATTGAATGATTTTCTTACATAGATATTTATATAT CTACATAGTAGATGAGGAGAGGATAGAGTTTGCACAAAGAGATTGGACGGTGTGATCTAGAGTATGGAACAACCTGAAATTTGTTGACATATGTATTATA GCGTAGTATTGACATGTTGAAGGTAATATGTGTTGTCCATGAATCATTACTTCGTTTTAATTTGAGAGCATTGCTTCCTAAACTAACCTGAATTAATAAG ATATGCACTTTATGTTGTTTATTATAGTTTTGGTCTGTATAGTGAAAGGGTCATTGATGCATCCTGACACCGTTTTCAAGCTTCAATTGTAGTCTGTTAT ATACAGGAACTGTACACTACCACGCCTTTGTATACATTAACTATCATGTTATTTTGAACCATTGATCAAAATAAAATCAAAGGGTAAATTAATATCCTAT ATTTGAT
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_55788;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_250548

FPKM

• FPAB: 3.8
• FPNAB: 7
• LF1: 6
• LF2: 5.6
• LF3: 4.5
• LF4: 5.7
• UF1: 8.9
• UF2: 5.3
• UF3: 5.3
• UF4: 6.7

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_250548

• Blastp: -
• Blastx: Probable elongation factor 1-gamma 2 from Arabidopsis with 87.04% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_020221597.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: -