Id Trinity | FTRINITY_DN55930_c2_g4_i4 |
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Name Transcript | Ll_transcript_250562 |
Sequence | AGAAATTCCACAATTTGTGATTGATGAATGCTATGATATGGAGCTGTATGAGTGGACAAAAGTTGACATCTCTGATGAAGCTCAGAAGGAACGTGTTAAT CAGATGATTGAAGATTATGAGCCTTTTGAGGGAGAGTCTCTTTTGGATGCCAAGTGTTTTAAGTGAAAATCTAATCTCCCCCACTTCAAAAGGTTATGGT TTTCTGTCATGTTTCTAACTACAAATTTGGTTTCTTTCCTATTTCCTATTTCCTTTTAGCTGTGCGTGATTTCACAAACGTCAAAACTTATATACTTTGA TTTTGCTACCTTCATTTTTATTTCAGCAAAATCTTTATTTGTCTTTTGTTGTATGCATGTCGCATGATATTCGTTGGGTTCAACTGACCTTTTCCGAGAG TAAGCAAGCAGATATGTAGAGGATATTTTGGAACATCATATATGAGTTCTAAGAGTACATAGGCTCGGTCTGTTTAAAGCAAAGTCTGGTCTGACCTATT TCCACCCTTATATATGTCTCACAAAAACATGTTATACCAACCAATGCCATCTAATCAGTTTAGTGCCATGGGTTGTTTGTGTAAAACTGTTTTACATTAG TAATCTACCCTCCAAAGTTCTCCACCAAAGATGGCATATATGATTAATTAATGATTTACGAGTTATATAATATTTCGTCTACTTTCATATCGATATAAGT ATGGGTTTGTTAATCCTGCCACACACATATAGCATCCCTTATACCTAAAACGTCTTGAAATATGTCTTAAAGTTTATCTCAAACCAATTATAATATATCA AAGTTAAAAAATTAAACATTTTTTATTTTATCTATTTTTTTCATTTGACTTGGGGACAATAGAATTCCCATCCTTAGACCTCTGGATTTTTAGGCCACTA GGCTGAAATAACATACTCCTCCATCTAAAAAATTTGTACTGGTTTTTAATACACAATTTTCCAACTTTATTGGATGGATAAAATAAAGTTTTAGTTTGAT ATATATGAATTGTTAGTATAAAGATTTATAAATAGTTAAAACATTATTTAATAGGAGTAAGTATGAGTTGGGTTGGGTTGAGTAAGGCTTGTTTCCTACC GGGACCAAATTGTTAGTCGTATCATTTCTATGAACTCATGACTGATTTTAGACTTGAAACTAACTCTACTTTAAATATCGATCGAGTCAGCTTTTGAACT TAAACTCAACCTTATACCTGATTAAATATAATTCATTTTAACTAAAATCTTTTCAATATTACTTATTAGTATGAATATGTAATTTGATATATAAAAAAAT ATATGCATATATATTGTTAACCATCTATAAAAAAAATAGAGAAGCAATGCAACTTTCAACTGAATAATTAAATAGATATACATTGAAATATAATGAGTAA ATGATAATAATACAAAATTGAAAGTTATAATTGTCTCTTATCCAATTCTAAATATTGATGTCTAATTTTTGAAGGGTTATATGATTAAAAATATTTTCCT TCTCATTAGCTTAGTACTCTTGCAAGTTCAAATTATACATTTATTACAACAAATGACTAATTAATTTAAGTGAAATAAAAAATTGAAAAATATTTAGGTT GTTAAGTATGTATTATGACAAATCCAATTCCTCTCATACATTGCAAAAATTGTTTGAGACAAAACCTAACTTCCATCATTCTACACTGAAATTATTCTTT GACAATCAACTGAAAGCAACTTTTGTGAAGAAAAACGAATATACTTTTCAACCAACATGATAAAATATTGAAGATATTTTTCTAATATTAATTTAGGTTC TCATGTATATTAAGATGGGATACTCTCATACACACATAAATAAATATATTTATATATATAATTTAGAGAGACTTTATTCCTTCAATGTTTAATTAAATTA ATATTTGAATTATTAAATCCTGTGTAATTAACGTGAGTTGCAATTGTTGCTTTCATTTCATAAATCAAAATCACAATTTTTTCTTTGGATCCAGAAATTG GAGAGATCTGACTATGAATACAGCGATTCCAAGATGCAGATCGCTCCTCTTCTTCCTTATCTGCTCCTCTTTACATTTCATCACAGGTTTATTTCATTTC TAATCTTCGTATTTTTAGTTTTAAGGCTATGATTTCTGCCAATAATTGTTTCAATCCATCTATGCACTGTGTTTCTGGGAAATCCCAAAATATCCAACTT TCAACCTCCACCATTTTTGTTTATTTTCTAACTTCCATAAATTCTACCTTCAACTTTCATTCCGTTTTGTATTGTGTAGGAAGCTTCAATTTTTATACTC TTATCTTCATTCAATTAGCATCACACCACAGCTTAATATCAACACATTGTGGAACCTGTTAATGAGTGCCTTCGCTAGTTAAGAAATACAAAACAATTAG GCTAGTGTTGCAAGATCCACTTCACTCACCCCTTTCAATAGCTTAAATTCATCACTTTTCAATACAAAATTACCATTTTTGCTTCCTGGGTTATTAGCTA TACAATATTTCCCCCATCTTCTTAATAATAACGTTAAGTTATTCAGCATGCTTACATATGTGTGTGTATCTCATGATTGCCCTAGTAACTTTAGTTTCCT TTTCATTGTGATCAGTGGTTTTCCCACAACAGACTCTAAAGAATATCTGATTCTCCTTTTTCGCGTATCTTTTCAGGATTTTCTGATGACTTACCTAGTT CTAAAGACACTGCAAAGACTACAGCTCATGCCCACAGCACTAGTCCTATAATTCTCATTGTATTAATTGTGCTTGTGGTATTTTCTTTGCTTTCTTTTTT ACTTTTTAAGTTGTGGCGGAAGAAGAAAAGAGAAGAGCAATATGCCCGTCTCTTGAAACTGTTTGAAGAAGATGATGAGTTGGAGCTTGAGCTTGGCCTA AGGGACTGACCATTGCAATTTGACATTTGCAGTCATTGTAATTGAGGTTGGTATTCTCTCCAACTTCAGGACTTTTATACTTCCTTACTCATCCACACTT CATTTGTGAAAACTGGATTCTAAATACGACATTCTTTTAGTTTTTTTCTTCATCATAACTCATAAGAGAGACAATTGATCGAGTTAAAACATTCCTTCAA TTTATCCTGTTGGAGTTGGAATAAATTCTGCTATTCTGTAAAATGGCAATCCATGATTTCTCGCTTATAATCCTTTTGCAAAAATACTATTTATTTTTCC ATGCATGAAGTATAGTGTTGATGTTTGAATTTTAGAAATAATCTTGTCATAATGCCTTTCTTTTGTTGTTTTATTTGGGAATTTCACCTTTTAAATGTTC TAATTACAGGTTTAGCTGAGTTTGGTGGTTTGAAAAAAAATTATTGCATAGCCAAGATGGATATGAGCTCCTATGCTAGTTTTACAGAGGAATCCGCTGT TGGATGTTTGTAATGCCATATTGAATGATTTTCTTACATAGATATTTATATATCTACATAGTAGATGAGGAGAGGATAGAGTTTGCACAAAGAGATTGGA CGGTGTGATCTAGAGTATGGAACAACCTGAAATTTGTTGACATATGTATTATAGCGTAGTATTGACATGTTGAAGGTAATATGTGTTGTCCATGAATCAT TACTTCGTTTTAATTTGAGAGCATTGCTTCCTAAACTAACCTGAATTAATAAGATATGCACTTTATGTTGTTTATTATAGTTTTGGTCTGTATAGTGAAA GGGTCATTGATGCATCCTGACACCGTTTTCAAGCTTCAATTGTAGTCTGTTATATACAGGAACTGTACACTACCACGCCTTTGTATACATTAACTATCAT GTTATTTTGAACCATTGATCAAAATAAAATCAAAGGGTAAATTAATATCCTATATTTGAT BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_55788; |
Additional information | - |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_250562
Blastp | - |
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Blastx | Probable elongation factor 1-gamma 2 from Arabidopsis with 87.04% of identity |
Eggnog | glutathione Stransferase(COG0625) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G57720) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_020221597.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |