Ll_transcript_250457

• Id Trinity: FTRINITY_DN55971_c2_g2_i12
• Name Transcript: Ll_transcript_250457
• Sequence: ACAAAGAAAAATAGCTTCCATAATAACAAAAACAACAAAATTAAAATATTCTCTCCCCTTTTTTCTCTTTGCTCTTCCTTCATTCCTTGTCCCTTCTATA TATATATAACATTTTCTTCACTTCCCTTATCATTTATCATTTTCCTTTCTCATCTCATTTTTATCAATGCATTGTTCTGCTTCTCTTTTCTTTTGATTAA GAAGCAGAACATAATTTTATATTGTTTTTTCATACATGTGTGTTTGGTTCAAGACAACATAAAATCTTGTTCCTTTAACAAACTCTAGTCCTATTCTCAT TGTGGTTTATAGATATATAGAACCTTGTTTGGTTTTGTGAAAAGCAAAAAAAAAAAAGTTTTGTATTTTATGATCTAGCATTGTTTTATCTTTGTGGGTT TTAAGCTATAGTTACTAACATTTCATATTCTATACCATAAAGAAAAAAATATTCCTTTTTCTTTAACCAAAGTTTGTTCTTATAAACCCTTTTTCTATAT AATCTTGGTTCTACTTATTAGCTTCCAATTCATTCATTGAATTCCCTATCTTTGGAAGAACATTTTCTAATGGATCAACTTTCTTCTTCTACTACTATTC TTCCTGAAGCATTTCATGGGGCCAAAGATGATATTACTATGCAAATTTCTTTGATTTGGAGCCAAATCAAAGCACCATTGATTGTCCCTTTACTAAGAAT ATCAGTGGTTTTGTGCTTATGCATGTCTGTGATGATGCTTATAGAGAGGGTTTATATGGGAATTGTGATTAGTTTGGTGAAGTTATTTGGTAGAAAACCT GAGAAACGTTATAAATGGGAGCCAATGAAAGATGATGTTGAGTTAGGAAACTCTTCTTATCCAATGGTCCTTGTTCAAGTCCCTATGTACAATGAAAGAG AGGTTTATCAACTATCAATTGGAGCTGCATGTGGCCTTTCTTGGCCTTCAGATAGGATCATCATACAAATCCTTGATGATTCCACTGACCCAACAATCAA GGAGTTGGTGCAACTAGAATGCCAAAGATGGGCAAGCAAAGGAGTGAACATAAAGTATGAGGTAAGGGACAATAGAAATGGGTACAAAGCAGGGGCACTA AAAGAAGGAATGAAGCGTAGCTATGTTAAGCAATGTGATTATGTTGCTATATTTGATGCTGATTTTCAACCAGAGCCTGATTACTTATGGCGCACCATTC CTTTCCTTGTTCATAATCATGAACTAGCCCTCATTCAAGCTCGTTGGAAATTTGGTGAGTTATTAAACATTTCATGAACTTTGTTTAACTTTTATTACAA AATTAGTTTAATCGAGTGTTTTACAATTCATCTTTCGTGTAATATTTACTTTAGATAGAGTCGGCTATATAAGTAGAACAATATCGAACGATAATTATAT TTTGCTTAACTTAGGTTGTTGTTGGATTCTCTAATGTAATTTAGAGTGTTGGAATCTCTTAATGGTGGCTATCTTAGGATTATTGGAATGTCTTAGGTAA GTTAATTAATAAATCCTAAAAAGAGAGGATGGTTTTAAAATGTGTCGGTGGGTAGTTTTTATTTGGAAAATTTGAGTTTGGTTAGGGTAGCAAGGTCCCA CTTTATGGTTCAACGACCAAGCAAATATCACAGCCTAGAAGCACTTCAAACCTTCATGATTGCCTTAGATTTAAGCCACGTATCCCTTCTCTTATGGTTC TTTTTTGTAACTTTTGTGCCTATGGGACCCACCTATTTACTCTTCCCACCAAAATATTACACATATAACATGTCTCATTTTCTATCCCAACTAATAAAAA TGAGAATGAATCATCTCCATTAGAGACAAGTATTATATAATAAAACATAAAAATACACTTTTAATATTTTATTTATTATAAAATCACATTTTTTATCAGT AAAAATATGAGGAAAAATAACCACTCACCTTTCCATTAATCAAGAAGATCCTTACTCAATAAAAATATGTCAGTCCATTAAAAAAATTAAATATTAATTA TTATTTTTATATATGTTTCATTATCACCGGTATGAGATAATATATGGCAGAAAATCTAGAACATATGATATATCTTAAATATTAGAAGGCAAAAAAATGA GGGTTATTTTTGGTGTAATTTACCTCCTTAGATTTTTCTTTACTAAATTTCATTTGTTTGGTCTCTTTTGTATTATGATATGTTATTAACCATGATATTA AAATCATGGCTTTCGTGTATATTGTCCTACCTAAATCCTCATCATTCATTTATAGCAGAAATAAGGTATGGTTGTGCCATTGTGTGGCAGAAAATTTAGA TAAATATTGTACCACTATTTATTAGGGAATAGGTAAATATATTTGGAGTAAAGGGCATGAACCCAATAAATGAAAAATGTATATACCAATAAGAGTTTTT CTATTATATTTGTCTTGAATATATAGATAATATAAATGGTGAATGATTATATTTGTCTGCTTTGTCCTTACACTGTTTTAGGTAGGAAATTGAATATAAA ATATGCATGTCCAAATCCAAAATTTTTTGTTATTAGTAATTTCTGTGACAAAAGCAGAACATAAAATATGCATGTATGTTTTAATTTAAAGGGTATCTAT GTCTTATGACTTATGAGAATAACACAGTTGTTGTTGGGAATAGCATTATGGGGACAAAGATTATATGTCCCGAAGAGAATAATAATTTTTATTATTTTTT GTTTTTAACTTTTTTATTCTTGTATTAATACGTAATTGGTTTGGGACAAGATATAAGATACTATCCAGACAGAAATCCACATAGGTATTATTGTGGTAGT TGATGTCATAATTGTTGTTCTTATTGTGTTCTAGTGCTTCCTTTTTAACTCTACTTTCTCTAACACTACTACTTCTGCCAATTGCATGTGCAATTTTAAT AGTGGACCTAATTGCTTATGTCTCAGTCACTGTCTACCCCAACTAACCGACAAACTGAATTTATTTCCAACTATCTTTTTCACCTTATGTCTTTTGTCTC GAATTTCACACTAATACAAACATAATATTTAATTAAAAAATTTAAATATTTTTTATTATTTTGTTTTTTTTCGTTATTATTATAATAAATAATATTTGAG ATATGATCTGGGACAGCTGAAATATTTACGAGAAAATGATATTCATGCTAGCAAAGTTATTGATGTGGAAATGATATTTAATTTTGTTGTGGGTAATTTC AGTGAATTCTGATGAATGTCTAATGACCCGGATGCAAGAAATGTCACTGGATTATCATTTTACTGTGGAACAAGAAGTAGGGTCTTCCACTTATGCCTTC TTTGGCTTCAACGGGACTGCGGGAGTATGGAGAATTGCGGCACTGAATGAAGCTGGAGGGTGGAAGGATAGGACCACAGTGGAAGATATGGACTTAGCTG TTCGAGCTAGCCTTAAGGGATGGAAGTTCCTATACTTGTCTGATTTAAAGGTTAAAAATGAATTGCCAAGTACATTCAAGGCCTACCGTTACCAACAACA TCGTTGGTCTTGTGGACCAGCAAATCTTTTCAGAAAAATGGTCATGGAGATTATAAGAAACAAGAAAGTGACATTGTGGAAGAAGATACATGTGATTTAT AGCTTCTTCTTTGTTCGGAAAGTTGTAGCACACATCGCTACATTCGTGTTTTATTGCATCATATTACCTGCAACAGTTGTGGTACCTGAGGTCGTGGTCC CGAAATGGGGTGCTGTATATATCCCTACAATCATTACCCTTCTAAATGCAGTCGGAACTCCGAGGTCTTGATTTTCTCAACTTACTCTTCCTTGCATTTT CCGAGTATTCGAGTAATGTTATACGTACGAAACCGTACACCGGATAACTTTACTCTTTATAATGTAATGTAACTTTCCGAGTTTGCGTTATAAAGATCAA AGTTTTTTGAAGTGGTCGAGTTTACGATGACTAGTAGAACTTTAATCAAGTTTATGTTATTCAATGTGTTTCCTTTGATTCAGGTCACTTCATTTACTGG TATTCTGGATTCTCTTTGAGAATGTGATGTCGCTGCATCGAACAAAGGCAACAATTATCGGCTTGCTCGAGGCTAGCCGGGTGAATGAATGGATTGTCAC TGAAAAACTTGGAGATGCTCTCAAGGGTAAAGCAGGAGTAAAAGCACCAAAGAAGCCTAGATTCAGAATTGGAGACAGGTTTCACTTGTTAGAACTTGGT GTGGGATTCTACCTCTTCTTCATCGGCGTCTACGATGTTATGTTCGGGAAAAACCACTTCTTCGTCTACCTTTTTATCCAATCGTTCGCTTTCTTCATCG TCGCATTTGGGTATGTTGGCACCTTTGTTCCCAGCTCCTAGAAGGACTTGAAAATTCTTCATTCAACTATATAAGTTTCTATGCCTTCAATATCAACAGC ATTGTAATATATTGTGTTATAAACTTAGTATAAGAAAAAGGGGTGTCATTCTTTAAGGTTTTTGCATAATGACTCTAAAAAGAGTTAAGTAGTTTTGTTG TGAATATTAAGAAAAGATATATAAGGAAATTCATGAAGTTATTCTCCTCATAGAAGTGATAGCAGCATTCTATGGCATGGATCCTCTGTGGGGCAAATAT ATTTGATTGGATGGGTTGTTTATAAGATTATGTAGCTTTTTTGTTTGTAATTGTTTTTTTGCTTTTGCTTTTTCTTTAGATTGTATTTGTTTGAAGAAAT AATCAGCTTCAAGAAATTAAATAAAATACAAGTAGTTGTAATGTTGCATCTTAAAAAA
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_56167;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_250457

FPKM

• FPAB: 0
• FPNAB: 0.9
• LF1: 0.3
• LF2: 1.2
• LF3: 0.6
• LF4: 0.7
• UF1: 0
• UF2: 0.8
• UF3: 0.7
• UF4: 0

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_250457

• Blastp: Glucomannan 4-beta-mannosyltransferase 9 from Arabidopsis with 76.55% of identity
• Blastx: Glucomannan 4-beta-mannosyltransferase 9 from Arabidopsis with 76.55% of identity
• Eggnog: Glycosyl transferase, family 2(COG1215)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G03760)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0002916)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019456632.1)
• Pfam: Glycosyltransferase like family 2 (PF13641.5)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;