Ll_transcript_250458

• Id Trinity: FTRINITY_DN55971_c2_g2_i13
• Name Transcript: Ll_transcript_250458
• Sequence: ACAAAGAAAAATAGCTTCCATAATAACAAAAACAACAAAATTAAAATATTCTCTCCCCTTTTTTCTCTTTGCTCTTCCTTCATTCCTTGTCCCTTCTATA TATATATAACATTTTCTTCACTTCCCTTATCATTTATCATTTTCCTTTCTCATCTCATTTTTATCAATGCATTGTTCTGCTTCTCTTTTCTTTTGATTAA GAAGCAGAACATAATTTTATATTGTTTTTTCATACATGTGTGTTTGGTTCAAGACAACATAAAATCTTGTTCCTTTAACAAACTCTAGTCCTATTCTCAT TGTGGTTTATAGATATATAGAACCTTGTTTGGTTTTGTGAAAAGCAAAAAAAAAAAAGTTTTGTATTTTATGATCTAGCATTGTTTTATCTTTGTGGGTT TTAAGCTATAGTTACTAACATTTCATATTCTATACCATAAAGAAAAAAATATTCCTTTTTCTTTAACCAAAGTTTGTTCTTATAAACCCTTTTTCTATAT AATCTTGGTTCTACTTATTAGCTTCCAATTCATTCATTGAATTCCCTATCTTTGGAAGAACATTTTCTAATGGATCAACTTTCTTCTTCTACTACTATTC TTCCTGAAGCATTTCATGGGGCCAAAGATGATATTACTATGCAAATTTCTTTGATTTGGAGCCAAATCAAAGCACCATTGATTGTCCCTTTACTAAGAAT ATCAGTGGTTTTGTGCTTATGCATGTCTGTGATGATGCTTATAGAGAGGGTTTATATGGGAATTGTGATTAGTTTGGTGAAGTTATTTGGTAGAAAACCT GAGAAACGTTATAAATGGGAGCCAATGAAAGATGATGTTGAGTTAGGAAACTCTTCTTATCCAATGGTCCTTGTTCAAGTCCCTATGTACAATGAAAGAG AGGTTTATCAACTATCAATTGGAGCTGCATGTGGCCTTTCTTGGCCTTCAGATAGGATCATCATACAAATCCTTGATGATTCCACTGACCCAACAATCAA GGAGTTGGTGCAACTAGAATGCCAAAGATGGGCAAGCAAAGGAGTGAACATAAAGTATGAGGTAAGGGACAATAGAAATGGGTACAAAGCAGGGGCACTA AAAGAAGGAATGAAGCGTAGCTATGTTAAGCAATGTGATTATGTTGCTATATTTGATGCTGATTTTCAACCAGAGCCTGATTACTTATGGCGCACCATTC CTTTCCTTGTTCATAATCATGAACTAGCCCTCATTCAAGCTCGTTGGAAATTTGGTGAGTTATTAAACATTTCATGAACTTTGTTTAACTTTTATTACAA AATTAGTTTAATCGAGTGTTTTACAATTCATCTTTCGTGTAATATTTACTTTAGATAGAGTCGGCTATATAAGTAGAACAATATCGAACGATAATTATAT TTTGCTTAACTTAGGTTGTTGTTGGATTCTCTAATGTAATTTAGAGTGTTGGAATCTCTTAATGGTGGCTATCTTAGGATTATTGGAATGTCTTAGGTAA GTTAATTAATAAATCCTAAAAAGAGAGGATGGTTTTAAAATGTGTCGGTGGGTAGTTTTTATTTGGAAAATTTGAGTTTGGTTAGGGTAGCAAGGTCCCA CTTTATGGTTCAACGACCAAGCAAATATCACAGCCTAGAAGCACTTCAAACCTTCATGATTGCCTTAGATTTAAGCCACGTATCCCTTCTCTTATGGTTC TTTTTTGTAACTTTTGTGCCTATGGGACCCACCTATTTACTCTTCCCACCAAAATATTACACATATAACATGTCTCATTTTCTATCCCAACTAATAAAAA TGAGAATGAATCATCTCCATTAGAGACAAGTATTATATAATAAAACATAAAAATACACTTTTAATATTTTATTTATTATAAAATCACATTTTTTATCAGT AAAAATATGAGGAAAAATAACCACTCACCTTTCCATTAATCAAGAAGATCCTTACTCAATAAAAATATGTCAGTCCATTAAAAAAATTAAATATTAATTA TTATTTTTATATATGTTTCATTATCACCGGTATGAGATAATATATGGCAGAAAATCTAGAACATATGATATATCTTAAATATTAGAAGGCAAAAAAATGA GGGTTATTTTTGGTGTAATTTACCTCCTTAGATTTTTCTTTACTAAATTTCATTTGTTTGGTCTCTTTTGTATTATGATATGTTATTAACCATGATATTA AAATCATGGCTTTCGTGTATATTGTCCTACCTAAATCCTCATCATTCATTTATAGCAGAAATAAGGTATGGTTGTGCCATTGTGTGGCAGAAAATTTAGA TAAATATTGTACCACTATTTATTAGGGAATAGGTAAATATATTTGGAGTAAAGGGCATGAACCCAATAAATGAAAAATGTATATACCAATAAGAGTTTTT CTATTATATTTGTCTTGAATATATAGATAATATAAATGGTGAATGATTATATTTGTCTGCTTTGTCCTTACACTGTTTTAGGTAGGAAATTGAATATAAA ATATGCATGTCCAAATCCAAAATTTTTTGTTATTAGTAATTTCTGTGACAAAAGCAGAACATAAAATATGCATGTATGTTTTAATTTAAAGGGTATCTAT GTCTTATGACTTATGAGAATAACACAGTTGTTGTTGGGAATAGCATTATGGGGACAAAGATTATATGTCCCGAAGAGAATAATAATTTTTATTATTTTTT GTTTTTAACTTTTTTATTCTTGTATTAATACGTAATTGGTTTGGGACAAGATATAAGATACTATCCAGACAGAAATCCACATAGGTATTATTGTGGTAGT TGATGTCATAATTGTTGTTCTTATTGTGTTCTAGTGCTTCCTTTTTAACTCTACTTTCTCTAACACTACTACTTCTGCCAATTGCATGTGCAATTTTAAT AGTGGACCTAATTGCTTATGTCTCAGTCACTGTCTACCCCAACTAACCGACAAACTGAATTTATTTCCAACTATCTTTTTCACCTTATGTCTTTTGTCTC GAATTTCACACTAATACAAACATAATATTTAATTAAAAAATTTAAATATTTTTTATTATTTTGTTTTTTTTCGTTATTATTATAATAAATAATATTTGAG ATATGATCTGGGACAGCTGAAATATTTACGAGAAAATGATATTCATGCTAGCAAAGTTATTGATGTGGAAATGATATTTAATTTTGTTGTGGGTAATTTC AGTGAATTCTGATGAATGTCTAATGACCCGGATGCAAGAAATGTCACTGGATTATCATTTTACTGTGGAACAAGAAGTAGGGTCTTCCACTTATGCCTTC TTTGGCTTCAACGGGACTGCGGGAGTATGGAGAATTGCGGCACTGAATGAAGCTGGAGGGTGGAAGGATAGGACCACAGTGGAAGATATGGACTTAGCTG TTCGAGCTAGCCTTAAGGGATGGAAGTTCCTATACTTGTCTGATTTAAAGGTTAAAAATGAATTGCCAAGTACTTTCAAGGCCTACCGCTACCAACAGCA TCGATGGTCTTGTGGCCCAGCAAATCTTTTCAGGAAAATGGCCATGGAGATTATAAGAAATAAGAGAGTGACATTGTGGAAAAAGATATATGTGATTTAC AGTTTTTTCTTCGTTCGGAAGGTTGTAGCACACATCACCACATTTGTGTTCTATTGCATTATATTACCTGCAACAGTTGTGGTATCTGAAGTTGAGGTTC CAAAATGGGGTGCTGTTTATATCCCTTCAATCATTACCCTTCTAAATGCAGTTGGAACCCCAAGGTCACTCCATTTGTTGGTATTCTGGATTCTCTTTGA GAATGTCATGTCTCTGCATCGGACTAAGGCGACAATTATCGGCCTACTCGAAGCTAGTAGAGTGAATGAATGGATTGTTACTGAAAAACTTGGAGATGCT CTCAAGAGTAAAGCAGGAAGTAAAGCACCAAAGAAGCCTAGATTCAGAATTGGAGACAGGATTCACTTGTTAGAACTTGGTGTTGGATTCTACCTCTTCT TCATCGGCGTCTACGATTTTCTGTTCGGGAAAAACCGTTTCTTCGTCTACCTTTTTGTCCAAGCATTTGCCTTCTTCATCATGGCATTTGGTTATGTTGG CACCTTTGTTCCCAACTCCTAGAAGGACTTGGCAAAACTCTTCATTCAGCACTTTCAGTATCAACAGTTTTGTGATATATTGTGTTTTAAGCTTAGTTAT GCAAAATTGAAGCTTGTTAGTATAACAAAAGGGTGGTGATTCTTTAAGGTTTTTGCATAATCAGAGTCATTGAGTGACTCTAAAAGAGATAATTAGTTTT CTTGTGAATATTATTAAGCAGTTATATAACTAAAATCAGGAAGTTATTCTCATAGAAGTGATTAATGCAAGAAGTGATAGCATCATTCTACTAGCATTAT CCTCTATGGGGCAAACATCTTTGATTGGATGGATTGTTTATAAGATTTTGTAGCTTTTTTCTTTTGTACTTTTTTGTAAAACTTCTCTGTAGCTTTTATT TACATTGTATGTGTTTGAAGAAATAATCAGCTTCAAGAATTTGGTTATAATACACAAAGTTCTAATATTGCATCTTTCTTTATGTTCACACTTTTTTTGT CAATGTGGCTTTTTCATAAGCCCAATTGTGATATTTGTCTAGTAATGTTAAATCAATAAAAATTAAAG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_56167;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_250458

FPKM

• FPAB: 1.3
• FPNAB: 1.6
• LF1: 3.3
• LF2: 11.9
• LF3: 8.1
• LF4: 5.5
• UF1: 3.8
• UF2: 12.3
• UF3: 5.8
• UF4: 2.6

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_250458

• Blastp: Glucomannan 4-beta-mannosyltransferase 9 from Arabidopsis with 76.55% of identity
• Blastx: Glucomannan 4-beta-mannosyltransferase 9 from Arabidopsis with 82.3% of identity
• Eggnog: Glycosyl transferase, family 2(COG1215)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G03760)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0002916)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019444290.1)
• Pfam: Glycosyltransferase like family 2 (PF13641.5)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;