Ll_transcript_71531

• Id Trinity: FTRINITY_DN56001_c2_g1_i13
• Name Transcript: Ll_transcript_71531
• Sequence: GACAAGATTATTGAAATAAGCTAAAAAAACTTGTAGGAAGGTCATAAGCTATTTTCATAAGCTTATTGTGATAATCTGTCACCATAGGCTCTTCCAAACA CGCATATAGTAACATTGTGAATTTTTTTAATAAGGGTGTTTGGATTATAGCCTATTTTATGTTAAAAATAGTTTACAATAAAAATTAGAGTTTTCTTAAG TGTCTTTTCCCAAAATTTTAGCTAAACCAAATATATAGGTTATGTATTTAATCATGCAGCTTTATTGATTGCCTTTACATCAGGCAAATTTGGCTAATTA CAAAATAGGATGGGACATTTGAGTTATTTTGGGTCCACCCCTTTTTGAAGAACTAATGTAATCCCATGTCTAGTTCTATTGCATTTATAAAGACAAATGT TGAATAGCACATATTTTTTCGTCAAATTTACACAAACAGATCTGATTACTGCATTTCTTTAGTTTGACAATAGTCTCACTTTTAATGCTACCACAGGCAT TTATTGCGGTCTTGCCCTCTTGGGCTATGAGAAGGAGTAACCACTAATTGCTTAGCTTCCTTTTAATTGCCACATAACATCATTATGCTACTTTTGCAGA TTGCTGGCTCGTTGGCTTGTGCCAAGAGAGGTTGGGTGAATGTGGATGTCAGTAAGATTGAGTGTGAGTTATGTGGTGCACAGTTAGATTTTGCTTTGCC CTCAAATTCTTTTGAAGCTGATACTTCTAGCGAGGAACTTCCTAAACTGCTCAATGAAGGACACAAAGTTGGCTGTCCTTGGAGAGGTGACAGCTGTCCA GAAAGCTTGGTGCAATTCCCTCCTACTTCACCTTCAGCTCTAATTGGAGGTTTTAAGGACCGGTGTGATGGACTCTTGCAGTTTTTCTCCCTCCCCATTG TATCTTCATCTGCAGTTGAGCAGATGCGATTTACACATAGCCCTCAAATTGACAGATTTCTTGCTCAACTACAAGTTCCAACAGCTGGAGAATTACGCTA CAGAGTGGATAGTGCATCTGGAATGGGTGTTACTGGAGAACAGGTTTTTCATTCATATTCCAATGCCCAAAAGCTCATAAGTCTCTGTGGATGGGAGTCA AGGTGGCTTCCTAATGTGCACGACTGTGAAGAACATTCTGCTGAATCTGCTAAGCATGGTTACAGCTCTGGTCCCGCCAAAGGTTCTGCACAGGGTCCAA CTGTAAGCAGGAAGCAATTTTCAACATCATCCTGGAAAGATACTGGGGATAATGATGTACTGGGTTCAGAATTTAACTGTGAATCTAGGTCACCTTTGTT AGATTGTAGCTTTTGTGGCGCCACAGTTAGAGTATGGGAGTTTTTGACTGTCCCCCGTCCAGCTCATCTGGCTCCCTATGGTATTGATACCCCTCAAACG AGCAAGAAAATGGCATCAACACGAGGAATAAGTGCAGCTAGTGGCATTAACGAATGGGCCACCACTGATGGTGTTGAAAAAGAGCGTACTGGAAACCATG ATGATGCTACAACATCTGATAAAAGGAAACTTGTATCCAAAAAAACTTTAGATTTAGATCTTAAAATGGCTAGTGGGCCATCCTTGTCTACCCCAGATCA TGTGCTAGATGCCAATATTGGAAGAGATTTAATGATTCGGCGGCCTCTTGGAAGTGAAGGTGGTGATCATGCAGCTTCTTATGAATCACAAGGCCCCAAC GCATGCAAGCGCAAGTTGGATGATGGTGGAACCACAGCAACCAGGTCACATCTATGCATGCAACAGGCTGACATTGTTGAAAGAACTAAAGTGGACCGTG AATACAATGAAGTCATTGGTGGTCAACAGTTTTCAGCTTTCCCTTCAAAGCGTGCCCGTGATACAAATCTGCCAGGAACTTTCCAATTTCCGTTAAGAAG TCCTTCTGGTGATGTCCCTAGTAATCCGTTGGATATTCAATTAGAAGCAGGTACAAACATAGTTAACCAATTGAGCACAGAAAGGGATCATGATATCGGC AACCTATCTACCAGAGATTCCGCCCATGCATCTTCTATTATTGCAATGAATACAATTTATCACAGCTCAGATGCTGAATCAATGGAAAGTGTTGAAAATA TTCCTGTAAATGATAATGATGTTAATTTCCCTTCTGTTGATTTGAATGAGACATCAGAGCTAAATAGTAGCTATCAGATGCAGCAGAGTTCTTGTTTCCA ACCGCGTTTAGAAACAGCAGGAGCAGAGACAGGTGTTAGCAGTTCAAATGCTTGTGGGGAAGTTTTGAACACAGAGATATTGACTGCACATGCTAGGGGT GGGCCCAGTTTTGGTATTAGTGGGGGAAGTGTTGGCATGGGTGCAAGTGATGAAGCTGAAATCCACGGGACTGATATGTCAGTTCATAGAGGTGATAGTT TAGGTGATGTTGAACCAAGTGCTGAAATCATTGAAAGTCAGGGCCAAGCTGGTGAATTTGTGCCTTGTCATGGACATGTTGGTGATTTTGTGCCTGAGGA AATGACTCGAGAAGATAATCAAGGGGATAGTCAGGCTATAGTGTCTCAATCTACACCAAGAACTGAGAGTGGCTCAAAAACTATAGTTCCAGCCAAGGTT GAATATGTTGAAAACGATGAGAAGCCCAGTGGCAGCATGCAGATGCCAGGCTATGAAAATGGTGCACATCCATCTCTTTCTTGCAATGCTGTTGTATGTT CAGCCTATGAAGCATCCAAGGAAGAAGTTACTCAGACTAGGAAGGCATCTCATAATGATGATGGGGCATGTCATGAATCAGGTTATTTTGTGGGGACTCC TTACAGAGACAACATTAATGGAGGTGTTGAATTTAATCCAATCAAACTACATAATGACTACTGTCCTTGGGTGAATGGGGATGTCGCTGTTGCTGGTTCT GACAGTCCTTGCTCCAGTTCTGCTGTGGGTACTGTAGCTCTATGTGGCTGGCAGCTGACTTTGGATGCCCTGGATTCTTTCCAGTCTATCGGACATCTTC CAGTGCAAACTCTGGAATCTGAATCGGCAGCATCGATGTGCAAGGGTGAAAAGTTAACCCCCACCCAGAAATTGTTAGCACAGAACTCCTATGTAAGAAG CCGTGGAAGAAATTGAAAATTTCAGTTGAGTTTTTACTCAGAATGTGTAGCATTAGTATTAGTGTTGCTATATCCATAATTATGTTTCCTTTCTGAAGTC AGTTTTGATGCTTTTATATTTGTTGCTATTCTATTGGATTTTGGATTCGTATTATTTAATAAACTATTGCATCTAAAACCTTGTTATCAAAAAGCTTTTG GGTCAAGGTATGTTACATAAATAGCGAGACCATTAATTATTATATTATCTTAAATTCATTTAATAATGATTTCAGTATTT
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_56462;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_71531

FPKM

• FPAB: 0.4
• FPNAB: 0.2
• LF1: 0
• LF2: 0.4
• LF3: 0.1
• LF4: 0.2
• UF1: 0.1
• UF2: 0.1
• UF3: 0.2
• UF4: 0.1

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_71531

• Blastp: NIPA-like protein from Xenopus with 27.54% of identity
• Blastx: NIPA-like protein from Xenopus with 27.22% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (399009)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019443770.1)
• Pfam: C3HC zinc finger-like (PF07967.12)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;