Ll_transcript_226850

• Id Trinity: FTRINITY_DN56113_c2_g1_i5
• Name Transcript: Ll_transcript_226850
• Sequence: CAGAAACTGTAGGACGTAAATATGCTCCCGGCTAAGATATAGTGATTATACCAACACAAAATATTGATTCTTTTTCCACAACAACTCACTTCAAGTTCCT TTGAAGTAAATACCTTTTGTACCCTTTGAATTTAATTTTTTGGAAGCTGCAAAAATCAATATTGTGGAGAATCAGACAGACCCAGATGTTGTTTATCTTC ATGTGTTTGCAGAAAACTGCATTTTAACTTCTGGGTATTGAAGATTGAAGATTTAGACTTCAAAGTTTGAATCTTTTCTATTGTACTTGTGGGCAGTGAT TTTAACTTCAAAGTTTGAATCTTTTCTATTATACTTGAGGACAGTGATTTCAAGTTCAAAGATTTGGTTTAATGGAACCTCCTACAGGGTTTTCTGCTTC TTTGTGGAACTTTATTCTTTTTCTTCCTTTTTTCATTGGGCTTTTGCTTCTAGGAACTATCAAAGGTGTCTTTCTCTGCCCTTTGATATGCTTATTAATG TCCATTGGGAACTCTGCTATCATACTTGGACTATGGCCAGCACATGTTGTTTGGACATACTATTGCGTCGCGAGTTCTAGACAGTTAGGACCTTTTCTGA AGCTAGTTATCTGCATATGTGTACTGCCAATACTGTTGATTTCATTGCCGGTGGTTGGAATTGTTGGAAGTATCATAGGTGGAGCAGCCTTCGGATTTCT TTCGCCAATATTTGCTACTTTTGAAGCTATAGAGGAAGGAAAAGAAGACAAGCTTTTGCACTGTTTTACTGACGGTACGTGGAGCACTATTGATAGGAGT TGCATGTCTGTCATGGATGTAAAAGATGTTTCTTTCCATTCCTATTTCTCGGTTATGGATGACCTGCGGCAAAAGGGACCTCCAACTGGGAGATACTATG AGATCAGGTTTCGTCATTGTATGCCTCACTGTGTTTTTTCTTTTTTCTCTTAAGCTTTCCGTTGAATTTGTTACATGCAAATCCAATTTTATTGTTTTGG GTAATAAACTGCGTGACAGTATTTTTCTTTAGCGCTGGCCTGTGTGATAAAAGGTTTGTGTTTTTATCTCGTAGTTTGTGTTTTAAAAGCGTTTTTCATT GAAAAGTTTTCCATAATCATAATACTCACAGAAATCATGTCTATCCCAAATTGACTGTGGTGAAGTACTTTGTTGGTTCAAAGCTCCATTGTTTTCCAAT TCTTGAAGAGAGAATGTGCTTGTATGTCACTCTAAATATTTTTCAGTTTTTGATATATTAAATCTTCGTTGTTTGTGGAAATGGTAAGGTTATTTGCCTT GTGACCTAGAGGTCATGCATTCAAATCCTGGAAACAGTTTCTTCCCGTGCTATACATCTACACTCCCCAGATTCTATTATATGAAGCCACATGTACCGTG CCACCTTTTTTTGTTTGTGAAACAAGATAATTTCAGCTTCAATCACTAGTTCTATAACTTTGGAAATTGAAGATCTTAAAAATTGTAAAGCCTTAAATTG GAACCTATTAAAAATTGTATGTTTGCACAAGTCTCACACGGAATCACGGAAGAATGGTTTCACACACTATAAGTCAGTTTGACTTGCCACATATGGCTAC CTTTTAAGTTTTAAGTCCTTGAAATCACAGATGGCACTGTCCCGTTTTTTATACCTTTTCGGTGATAGTTTGATGTAGAAAATGTTGACAGAAGGCATTG GTATTGGATAGAATTTCTAGGAATGACAATTCTTTTCATGTGATATCTTTTGGTTCTGGGTAAGTTCCAATATAAACCTAAGTGCATAAATTTTATAACC AAAATGATTCAGTTAATTGTTCTGCCGAAGTTCGGTTTTGTTTTACCAATATGGTGAACCAGGTGACATAAATTGTTTAGCTCTTGTTCTTTCTCGTACA TTTTGTTTAACCAAAGTGTATTACGAATTAACATGGGATGAGATTACTCAATTTTACTTCTTTGAAAGTAAATTAAGTTTCTCCATCTATTGTTGGAGTC TGCGAACTTCAAAATGCAACAAAATTGTGACTATGAAAATTAATTTTAGATAAACATGTTACTCATTATACTCTAAATATGTTGTTGTCTGATGAGAGGA GTTATGTTATATGAACCATGATCGTCTATTTTGAAATTTTAATGATGTTCTTTTTCCTTGTTCGGTTCAGGCTGCTTTATCTCCCTGGTGCAGTTTTAGC TGCAATTATCGGAGTCATAGTTGATGTGCCAGTTATATCATTCGTTGCCCTTTTCAAAGCCCCCTATATGCTTTATAAGGGGTGGTGTCGATTGTTTCAT GACCTCATTGGCCGTGAAGGTCCTTTCTTGGACACAATCTGTGTACCTTTTGCAGGACTTGCTATCCTTTTGTGGCCATTGGCTGTTGCTGGGGCAGTTT TGGCATCCTGGCTAGCAAGTATATTTCTCGGGGCTTTCGCAGGGATTGTTGCTTATCAGGAGTCTTCCTTCTTGTTGGCCCTTCATTACATTGTTGCAGC TTTGTCCTTTTATGATGAATACAGCAATGATATTCTCGACATGCCGGAAGGATCGTGCTTCCCTAGGCCTCAATATCGTAAAAATGTTGACTCGTCACAG AGAACTGCACGTTCAAATTCCTTAAGATCCAGCCTCCGAAAGGCTCCTTCTAGGTCATATTCAATTAAAAATAATATCACTGAGTTGAAATCACTCGAGC TATTCGATTGCTTATTCAAGGAATGTCATAATGTTGGAGAAAAAATGGTTTCCGAAGGTTTAATAACACGAAAAGACATAGAAGAAGCCAAGTCTGGTAA AGGGAATAGAGTTATTAGTATCGGTTTGCCAGCATATTGCCTTCTCCAGGGACTCTTGCGCTCTGCGAAATTCAATTCAACG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_57402;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_226850

FPKM

• FPAB: 0.1
• FPNAB: 0.3
• LF1: 0.2
• LF2: 0.1
• LF3: 0
• LF4: 0.2
• UF1: 0.2
• UF2: 0.3
• UF3: 0
• UF4: 0.1

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_226850

• Blastp: Uncharacterized membrane protein At3g27390 from Arabidopsis with 59% of identity
• Blastx: Uncharacterized membrane protein At3g27390 from Arabidopsis with 58.72% of identity
• Eggnog: NA(ENOG410Y9F4)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G27390)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019447429.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;