| Id Trinity | FTRINITY_DN56153_c4_g1_i14 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_227426 |
| Sequence | GTAGAAACCCTAACAGGGCTGTGATTACAAAGAGAGAGGGCTATAGTGGGATTCTCAATTCGATGGCTTCAAATCCTTCAATCCAAGGTGCCGCCATTCC CCTTTTTCTCAATAGGGTTTTGGCTTTGGTATCTTCGATTCATAGGATAAGATCTTTCACTTTCCCTTCCTTCCCCTCTATTCATTTATTTCCATCGAAT TGGGGTTTTTCCCACAATGATAGATCCATCAAAATTTACACTTGATATGAGCCCTACACTTTTTTTCAAATTTTTTTATTTTTTATGTCTTTTATTTTGA TATACTCTTAGTTTTGTTGCACTGGGTATAATTTATGAGGAAACATTTGTGCATTGTTTTCTCATTGACTCTCAGTGCAGAGAGAGAAAGCTTGATTATA ACAACTGCTTATTTCTGATGAGGATGTTTCCTTTTTTGTTTTGAACAGAAAAAGGAATGTTTTTATTAATTGGAAATATTGTTTGTGTGTTGTAATTGAG CAGCGGCCAGACAACCGTAGGGATGGTATCCACAGGTGGTGGGTTTTTTCACTCTCATTCGTCTACTGATTCCATCCCATATTTTCAGTTTTTATAAATT AATCTAATTTCTTTATTTTTTGTAATTAGGGTTATTTTGATATGAAATTTGTGTTTGAATGATAAGATTCAAATCTTACGTAATAGGAATTCATACTTGG TTAGATAGATGTTTGGATTCATGGTAATATTAACAAATACTTTTGAAAATAGTTTTTCATTAGTTTATTTTTATAGATAAATATATGGTTATGGATGTGA TAGGCTTTAGACCTCTGGATTTACAACATGAAGTAAAAAATAATTCAGCAGTTGAGACGATATAATTAGAGTACTTAGAAAGGAAAATATTGTTAAATTC ATATAAAGGAGTTTATTGTCAAAATCTGAAATGTTTATCCTCTTTGGGAGGAGGAAGATATGAACCATGAAAATGAGGTTTATCATAATATAAACTAAAC AGGCACCGTGAGTCAATGTAATAATAAGGAATCAAACAATGGTCGATGTTCAATAAAGCTAAATTAAAAATATTTTAACTGATTTCATTAATTAATAAGA GTTTAAATCATGTTTATTTGTAAAAAATATTTACACTGTCGATATATATATATTAAATTCAATTAATAACGATGAACATTCTTATTTATTGACAACAAAG AATTATTTTAATACTTATATAATGTATTTTTGGTAATCTTGCATAAATATTAAGTAAAAGGAATATTAAACAAGTGATAAAATTTTTTTTTTATGTATTT AAACATTTTAATAATACAAAAAGTACAACAAAGAATTATTTTAATATTTTTATAATGCAATTTTTTTGTAATATTGCATAAATACTGAACACAAATTTAT TATTTCGAGTCCTGCGAATGGTATCCGTGGAAAAATAAAAAAATATAAGTCATCAAGCTAGTTATGAAAGTATTATGATGATATTTTAATTCAATTGATA ATTTATTAATTAAATCGCATATTTGTTAAATTAATCCAAAATAAACCGGTCCAAAAGTAAAACTGAAAGTTAATCCAAAATAGACTGAAATTGCAAAAAT TGAAAGTGTTCGGATTGTATTGGACATTTTTATTAAAGACCGATCGGTCCGGTCTGATTTTTGGATTCATCTCTTGGATCCAGACCGAATTGAAATTGTT TAAATGTATCCCTTATAAGTATTTTACACACTTAAATATATAAGTCCTAACTTGTTCTTTATTGTCTAAATTGTTTAGATGTTATATTGTTTAGATGTCA TATTTGTTTATTTAATATTGGCGTCTTGCTATTTTTTTATTGTTTTTGTTGGTTTTTACTTTTAATATTATTTAACACTTTTTAATATCGTTTTATGATG TTGAATATGTTTTTTTGCTTATACATAATATTTAGTAAATTTTATGATTTTTTAATGTACGGCAATTTTAATTTTTTATAAAAAAAAATCTAAACCGAAC CGAAACCACCTATAATATTTGAACTGGACTGAATTAGACATCTTAATATAATCAATTCAGACCGGACCAGACTGCATATTAATTAAGTGTTTGAATTAGA TGATTTTTTGACAAAAAACAATCGAGATGGACCGCGAACACTCCTACCTTCCATTATACAAAATTTCCTTTTGTTAAATTCAACTTTTACTTACCAAAAT TTTGTTAACCGGACGTTTTTGGTATATTAGAATCTGAAATATTCCTTGTATATATGTGAAGCATCCAATTAAAGTCCACAAGGCTACTCACAATATTAAT CATGACAGATAACCATTGTTTAGCTATAATAGTTTCATATTAATTATTAATGTGAATGACCTGATACACTCAACTTTATTATACAAATTCAATTAACAAC ATTTGTTAGATTTGGAGGTGCAGCTAGGCATACAAGCAAGTCTGTGCATCTTAGTTAACCTTATTAAAATATATTTGTACAAGCAACTCTGCATCCTTAG TTAATTTTACTAAACCATATTTAGATTTCTCTTTACCCATTATTTATCATATATATTAATCAATGACCAAAAACTATTTTTTGTTCTCTTTGCCTAGTTT AAATATGCAAATCATGTTTTCGGTTGGACTTAAAGTTGTTTGTCTCGTAAGTTTTGACCTAAAAGGTCACGAGTTCAGACCTGAAAATAGCTGCTTTAAC TAACGTTTCATACATTTATCCTCCTCACACTCCACTAGTTTGGAGCATCGTGTATTAGTAGCCCTTTTTAAGACTTCCTCCATAGAGAGGATGTTGTTGC AATGTTGCCTTCATCTGTTCTATCCTTGAATAGAAAGCTGAACGTACCATATTAGATCTAAAGAAAATAATAATTTAATGATGAATGGACCTACATATAT ATGATTGGTATACAGATTCAATGGTGAAGATTTTTTAAGAAGACTTGGAGGGAAGAGTGTGTTATTTGTGGGGGACTCCTTGAGTTTGAATCAATGGCAA TCACTCACATGCTTGCTTCACATAGCTGTGCCACATGCCAAATACACTTTACTGAGGACTGGTGATCTCTCCATTTTCACCTTCCAGGTTAGACTTTTAT AACCTCTAACTTCTTATTCCTTCTCCCTTTTCTCTTTTATCATTTATTATATCAACAATAGTTCTCTACTCACATTTCCATTCACCCCAAGTACTATTGA TCTATGTCAAAGTGGGTTTGCTTCATCTGACTTTACAAAAACTTCTTTGGATTGAAACCATAGATAGTTTTGGAATTATAAATGATAGTTTAAATGGTAA TATGACCTACTAACAACAGCTGGTGTAATAATTGATTGATTTATGATACATTAGATTCCCATATCTATCTATGTATGCAAAAAGTGTAGCCAAAAAGTTC ATTCAATGCAGTTGGTGTTGATTAAAGAAAATAATCTTATGCTTATATATCCATCATTTAAAAGTAATCACTAGTTTAGCAACTATCCAGACAAAAACAG AAGGAACAACTTAATTAACTGAAATAAGAAGTTATTTGAGTGAGAGACTTAGTTGAAGGCAATTATTGGATTAAAGAGCACATGACTTATAGTTTGCATA CCAAGTAATATGCAGAAGTATGATGTTAAAGTGATGTTTCTCCGCAATGCATTTCTGGTGGATACTGTAACCGAAAGTATTGGTCGAGTCCTGAGACTAG ATTCCATTGAAACTGGAGATATGTGGAAAGGAGCAGACATATTGATATTCGATTCTTGGCATTGGTGGCTACACACAGGAAGAAAACAACCGTGGGATTT GATTGAAGATGGAAGTAATAGATACAGAGATATGAATCGGTTGGTTGCATATGAGAAAGGGTTAAAGACATGGAGCAAATGGGTTGATGACAATATTGAC ACTAACAAAACAAGGGTATTCTTCCAAGGAGTCTCTCCAGATCATCTAAATGGAGCTAAATGGGGGCAAGCAGGTGCAAAATTTTGTGAGGGGCAAATGA GGCCAGTGTCTGGATTAAATTATCCAGGAGGTGCACATCCAGCAGAAATTGTACTAGAGAAAGTGTTAAGAGGCATGTCAAAGCCAGTTTATTTGCTCAA TATTACAACATTGTCACAGCTTAGGAAAGATGGTCACCCATCTGTTTATGGACATGGTGGCCATAATGACATGGATTGCAGCCACTGGTGTCTACCTGGT GTTCCTGATACTTGGAATCTTCTTCTCTATGCAGCTTTACTTCAAAATTATGCTCTCTAGCTACTTGCTAATCCTTCTATAATGACCCTCAATTATATAT ATATATATATATATATATATATATATATACTGTTATTTATCTTGTCACTAATAAGAAGCTATATGCTATAGAAGATATATTTCAGAAAAAAAGCAATGAA CTTTGTGTAGGTGCATCAATGGTGACTCATCTTGTATTTGTATAGTAGTTGTTTGGGGTATCATATATATAACAAGGCAATATATATATATATATATACT GAAATTTTCTTCATAAACATGATACTTTCTCTACTCTTTTTAATTTATTCATTGTTCATTTATAATGTTA BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_57775; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_227426
| Blastp | Protein trichome birefringence-like 43 from Arabidopsis with 56.4% of identity |
|---|---|
| Blastx | Protein trichome birefringence-like 43 from Arabidopsis with 57% of identity |
| Eggnog | Pfam:DUF231(ENOG4111BK6) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT2G30900) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019459204.1) |
| Pfam | GDSL/SGNH-like Acyl-Esterase family found in Pmr5 and Cas1p (PF13839.5) |
| Rfam | snoR143 (RF01432) |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |