Ll_transcript_227407

• Id Trinity: FTRINITY_DN56153_c4_g1_i6
• Name Transcript: Ll_transcript_227407
• Sequence: GTAGAAACCCTAACAGGGCTGTGATTACAAAGAGAGAGGGCTATAGTGGGATTCTCAATTCGATGGCTTCAAATCCTTCAATCCAAGGTGCCGCCATTCC CCTTTTTCTCAATAGGGTTTTGGCTTTGGTATCTTCGATTCATAGGATAAGATCTTTCACTTTCCCTTCCTTCCCCTCTATTCATTTATTTCCATCGAAT TGGGGTTTTTCCCACAATGATAGATCCATCAAAATTTACACTTGATATGAGCCCTACACTTTTTTTCAAATTTTTTTATTTTTTATGTCTTTTATTTTGA TATACTCTTAGTTTTGTTGCACTGGGTATAATTTATGAGGAAACATTTGTGCATTGTTTTCTCATTGACTCTCAGTGCAGAGAGAGAAAGCTTGATTATA ACAACTGCTTATTTCTGATGAGGATGTTTCCTTTTTTGTTTTGAACAGAAAAAGGAATGTTTTTATTAATTGGAAATATTGTTTGTGTGTTGTAATTGAG CAGCGGCCAGACAACCGTAGGGATGGTATCCACAGGTGGTGGGTTTTTTCACTCTCATTCGTCTACTGATTCCATCCCATATTTTCAGTTTTTATAAATT AATCTAATTTCTTTATTTTTTGTAATTAGGGTTATTTTGATATGAAATTTGTGTTTGAATGATAAGATTCAAATCTTACGTAATAGGAATTCATACTTGG TTAGATAGATGTTTGGATTCATGGTAATATTAACAAATACTTTTGAAAATAGTTTTTCATTAGTTTATTTTTATAGATAAATATATGGTTATGGATGTGA TAGGCTTTAGACCTCTGGATTTACAACATGAAGTAAAAAATAATTCAGCAGTTGAGACGATATAATTAGAGTACTTAGAAAGGAAAATATTGTTAAATTC ATATAAAGGAGTTTATTGTCAAAATCTGAAATGTTTATCCTCTTTGGGAGGAGGAAGATATGAACCATGAAAATGAGGTTTATCATAATATAAACTAAAC AGGCACCGTGAGTCAATGTAATAATAAGGAATCAAACAATGGTCGATGTTCAATAAAGCTAAATTAAAAATATTTTAACTGATTTCATTAATTAATAAGA GTTTAAATCATGTTTATTTGTAAAAAATATTTACACTGTCGATATATATATATTAAATTCAATTAATAACGATGAACATTCTTATTTATTGACAACAAAG AATTATTTTAATACTTATATAATGTATTTTTGGTAATCTTGCATAAATATTAAGTAAAAGGAATATTAAACAAGTGATAAAATTTTTTTTTTATGTATTT AAACATTTTAATAATACAAAAAGTACAACAAAGAATTATTTTAATATTTTTATAATGCAATTTTTTTGTAATATTGCATAAATACTGAACACAAATTTAT TATTTCGAGTCCTGCGAATGGTATCCGTGGAAAAATAAAAAAATATAAGTCATCAAGCTAGTTATGAAAGTATTATGATGATATTTTAATTCAATTGATA ATTTATTAATTAAATCGCATATTTGTTAAATTAATCCAAAATAAACCGGTCCAAAAGTAAAACTGAAAGTTAATCCAAAATAGACTGAAATTGCAAAAAT TGAAAGTGTTCGGATTGTATTGGACATTTTTATTAAAGACCGATCGGTCCGGTCTGATTTTTGGATTCATCTCTTGGATCCAGACCGAATTGAAATTGTT TAAATGTATCCCTTATAAGTATTTTACACACTTAAATATATAAGTCCTAACTTGTTCTTTATTGTCTAAATTGTTTAGATGTTATATTGTTTAGATGTCA TATTTGTTTATTTAATATTGGCGTCTTGCTATTTTTTTATTGTTTTTGTTGGTTTTTACTTTTAATATTATTTAACACTTTTTAATATCGTTTTATGATG TTGAATATGTTTTTTTGCTTATACATAATATTTAGTAAATTTTATGATTTTTTAATGTACGGCAATTTTAATTTTTTATAAAAAAAAATCTAAACCGAAC CGAAACCACCTATAATATTTGAACTGGACTGAATTAGACATCTTAATATAATCAATTCAGACCGGACCAGACTGCATATTAATTAAGTGTTTGAATTAGA TGATTTTTTGACAAAAAACAATCGAGATGGACCGCGAACACTCCTACCTTCCATTATACAAAATTTCCTTTTGTTAAATTCAACTTTTACTTACCAAAAT TTTGTTAACCGGACGTTTTTGGTATATTAGAATCTGAAATATTCCTTGTATATATGTGAAGCATCCAATTAAAGTCCACAAGGCTACTCACAATATTAAT CATGACAGATAACCATTGTTTAGCTATAATAGTTTCATATTAATTATTAATGTGAATGACCTGATACACTCAACTTTATTATACAAATTCAATTAACAAC ATTTGTTAGATTTGGAGGTGCAGCTAGGCATACAAGCAAGTCTGTGCATCTTAGTTAACCTTATTAAAATATATTTGTACAAGCAACTCTGCATCCTTAG TTAATTTTACTAAACCATATTTAGATTTCTCTTTACCCATTATTTATCATATATATTAATCAATGACCAAAAACTATTTTTTGTTCTCTTTGCCTAGTTT AAATATGCAAATCATGTTTTCGGTTGGACTTAAAGTTGTTTGTCTCGTAAGTTTTGACCTAAAAGGTCACGAGTTCAGACCTGAAAATAGCTGCTTTAAC TAACGTTTCATACATTTATCCTCCTCACACTCCACTAGTTTGGAGCATCGTGTATTAGTAGCCCTTTTTAAGACTTCCTCCATAGAGAGGATGTTGTTGC AATGTTGCCTTCATCTGTTCTATCCTTGAATAGAAAGCTGAACGTACCATATTAGATCTAAAGAAAATAATAATTTAATGATGAATGGACCTACATATAT ATGATTGGTATACAGATTCAATGGTGAAGATTTTTTAAGAAGACTTGGAGGGAAGAGTGTGTTATTTGTGGGGGACTCCTTGAGTTTGAATCAATGGCAA TCACTCACATGCTTGCTTCACATAGCTGTGCCACATGCCAAATACACTTTACTGAGGACTGGTGATCTCTCCATTTTCACCTTCCAGGTTAGACTTTTAT AACCTCTAACTTCTTATTCCTTCTCCCTTTTCTCTTTTATCATTTATTATATCAACAATAGTTCTCTACTCACATTTCCATTCACCCCAAGTACTATTGA TCTATGTCAAAGTGGGTTTGCTTCATCTGACTTTACAAAAACTTCTTTGGATTGAAACCATAGATAGTTTTGGAATTATAAATGATAGTTTAAATGGTAA TATGACCTACTAACAACAGCTGGTGTAATAATTGATTGATTTATGATACATTAGATTCCCATATCTATCTATGTATGCAAAAAGTGTAGCCAAAAAGTTC ATTCAATGCAGTTGGTGTTGATTAAAGAAAATAATCTTATGCTTATATATCCATCATTTAAAAGTAATCACTAGTTTAGCAACTATCCAGACAAAAACAG AAGGAACAACTTAATTAACTGAAATAAGAAGTTATTTGAGTGAGAGACTTAGTTGAAGGCAATTATTGGATTAAAGAGCACATGACTTATAGTTTGCATA CCAAGTAATATGCAGAAGTATGATGTTAAAGTGATGTTTCTCCGCAATGCATTTCTGGTGGATACTGTAACCGAAAGTATTGGTCGAGTCCTGAGACTAG ATTCCATTGAAACTGGAGATATGTGGAAAGGAGCAGACATATTGATATTCGATTCTTGGCATTGGTGGCTACACACAGGAAGAAAACAACCGTGGGATTT GATTGAAGATGGAAGTAATAGATACAGAGATATGAATCGGTTGGTTGCATATGAGAAAGGGTTAAAGACATGGAGCAAATGGGTTGATGACAATATTGAC ACTAACAAAACAAGGGTATTCTTCCAAGGAGTCTCTCCAGATCATCTAAATGGAGCTAAATGGGGGCAAGCAGGTGCAAAATTTTGTGAGGGGCAAATGA GGCCAGTGTCTGGATTAAATTATCCAGGAGGTGCACATCCAGCAGAAATTGTACTAGAGAAAGTGTTAAGAGGCATGTCAAAGCCAGTTTATTTGCTCAA TATTACAACATTGTCACAGCTTAGGAAAGATGGTCACCCATCTGTTTATGGACATGGTGGCCATAATGACATGGATTGCAGCCACTGGTGTCTACCTGGT GTTCCTGATACTTGGAATCTTCTTCTCTATGCAGCTTTACTTCAAAATTATGCTCTCTAGCTACTTGCTAATCCTTCTATAATGACCCTCAATTATATAT ATATATATATATATATATATATATATACTGTTATTTATCTTGTCACTAATAAGAAGCTATATGCTATAGAAGATATATTTCAGAAAAAAAGCAATGAACT TTGTGTAGGTGCATCAATGGTGACTCATCTTGTATTTGTATAGTAGTTGTTTGGGGTATCATATATATAACAAGGCAATATATATATATATATATACTGA AATTTTCTTCATAAACATGATACTTTCTCTACTCTTTTTAATTTATTCATTGTTCATTTATAATGTTA
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_57775;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_227407

FPKM

• FPAB: 0.4
• FPNAB: 0.4
• LF1: 0.3
• LF2: 1
• LF3: 1.2
• LF4: 1.3
• UF1: 0.5
• UF2: 0.7
• UF3: 1.5
• UF4: 1.2

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_227407

• Blastp: Protein trichome birefringence-like 43 from Arabidopsis with 56.4% of identity
• Blastx: Protein trichome birefringence-like 43 from Arabidopsis with 57% of identity
• Eggnog: Pfam:DUF231(ENOG4111BK6)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G30900)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019459204.1)
• Pfam: GDSL/SGNH-like Acyl-Esterase family found in Pmr5 and Cas1p (PF13839.5)
• Rfam: snoR143 (RF01432)
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;