Id Trinity | FTRINITY_DN56167_c1_g3_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_227449 |
Sequence | AGACTTGGAGTCACGGTGCTCAGACGTTGACAAAGTTGCGGTTTTTTCGGAATCCTTTTAGTGAAGTTGAGCAGAAGCAATTTCAAGTAATCATTATTTT TTTAAAATTTTGGTCAAGCTCTTTTGTGGTAGTGTGTTGTGTGTGTATATTGTTGCATGTTAGCGTTGTATAAAGATTTGACACTCTTATTACAGAACCT GTTGCAAGAAGATGATTTCTATAGGATAAGACTGCCATCTAATGTTTTGACTCCTCCAGGCAGGGACTATATCATTTCTTCTGTGAAAGCTGTAAGTATG AATCTACTTTATTTCATTTGTATATATATATTTTCTCCCTAAATTAAAAGTTGAGGTTATTATAAGCAGGTTTATGCTTGGGAATTATGAAACTTTTGGT TTAACAGTGATTGGTTTGTTTTTCCCTTTTCTAGCGTTGCATTTGATGCCTTATCGGTAGCGTGCTTATTTAGCAATGTGTTACTATAATGCTGAGTATG ATTTGTTCTACACTTATCGTGTGATACTCATTGAAATTTAAACCCTTAACCCTTTCTTCTCTTTCATTTTTCATGGTAGTGTTTTCACTGGCGGATATGT TTCAATAGCTTAGATCCTTGTTTTTCTGCTACTGCATTGGTCGCTATTTTAGTATTTTCGCAGTTTGGCTCTTAATTCCTTTAGCATTTCATCCAAGAGA AACAGTTCCTCGAATTCTATTAATTTTTTTAGAATACTCTTTTCTTGAATGATATTTTTATTTGGTTTATGGTGACTGTGGGTGATTGACTTCAAATAGA ACTGATTGTTCTGCCTTTGTGAATCCAGCGATGTCTTCCAGGGGATGGATTGGAGGAGCATTTTGTGATCCACACGGAAGGTGTTAACATATTGGCTGTC AATTATGGTGCCCCTGGAGCGTGCGCTTATCCCCGGCAACTGAAGCGTGTAAGTCAGATTTGCTTCTGACCACTGCACTTATTTCTTGTTTTTCATTAAG CAAAGCTCGAGTTTAACACACTTTTAAAATACTGTTTTGTTCTCATCTATTTTCTCTTCATCTTGCTGCTCTCAGAACTGCCATCTATTAATTATTGAAG TTGTTTAGGTTGTACATGTAGTTAATGTTAATGTTATTAGCTCTTTCCTTAATTTGCACATAATCAGTAGTTAGTAGATGCACACATTATTCAATATTTT TTTTGTATTTTCTATTGCAATAAATGCAGTTATTAGTCTAAGCAAGCATCTAGAATGATTGTAGCATGTCAGCCCAATGTATCACACAACTCTAGTGGTA ATTTTATGACCATACACTTCAAGATAAAAGTGTGATTAGATCCAAAACGACTGTTTAGAGTTTTACAGTTACCTTGTTAATATATTATTGTAATCATTCA CTTGTTTGCAAGAGTAAAATTAGCATGTATCATGCCTCTAGAAACTGAATTTAGTCTACCAAAGATTCTACAGGCATGTTTGGTTGATTTTATATCCCAC CATGGCTATTCCTTGTTCCAAAAAGTAACCAGCTATGAGAAAACCTTGATAAGCATTGCCTCAAGCCTATTTCATAACCTGGGCAAACCTTAAAATTTGT TATTGAATGCCTGATTTTGTTTTTTGAAAGCTAATCTTTTAAGTTCCTTTTTAAATTTAGCCTACAAGGTGGTCATTCAAGTCCCATACAATTTTGAAGA ACACTGAACAGGCACCGAGGTATATTTTTTATGGTTGACAATGTCACTCTTAATTATTTTTCAATCTAATATTACAACTAGTAACAGAAAGCTGCGTACA TAGTGTTCCTGGAGCATGGTTTTCTGTATTTTACTCAAGAAGGTTCTCTCTCTTTTTGTGAACTTAAGAACAAACTGAGGATGGAAAAACTGCTCAGAGT TCTTTGACATTAAGGATAAGGGCTCTTCTGAAGTGAATTTTTTTCTCTAAATTGATTAAGTAATGGTTTATCACCACTATTTATTTTAACCGGTTAAGAT CACAATACACTTTAGAGGAATTGAATGTTTCTTTGGCTCTGAACTGTTTCACTGAATTTAATGTCCAGTTTTACATTTTCAAAACTACCTGTTCGTTTCC AATGGAATCATGTTTTCCTAAAATATTTCATTTGAAAATGAAAACAGAAATAAAGATTAAAAAATGGGTAGTATGAAGGAGAAAATAGCTTGCCCTACTA AATGTTTGGGTTAACGAAACACTTCACAACTCACCCTGAAAAAAAGAAAGATGAGTAAAACTTTTGCTGTTTAGCTTATTAACATCTTATGTTATGTACA TGTGCTATCATTGGGGAAAGTTTTATACCTGTCTATCCTGTGTAATTTTTATTGGACAAATTTTCTGGTTTTGACAGGGCCCCAGTATTTGCCGAAGATG TGTTTGGTGGAGAGGAGGGAGAGAGTGAAATTGTAAAGCCAATAGAAAGGTCTTTTTGGGCTAAATATTGGATGTATGTGATTCCTCTCGGACTCATTGT GATGAATGCTGTTACCCAAGCAATGAATATGCCCGAGGAACAGGCTGGTGGGCAAGCTGGTGCTCAGGCACAGCCTGGAGCAGTGCAGCGTGGAACTAAT TCTGCGGGAGATTCCTTGTTATCTTGAATTCTGACGTGGAGAGAGATTATAGCAACACCATTCTTCAGAGTCTACACTTCCATATATGGTGTACCACCAT GGTGGCGTTGTTTCTTCATAATGGATTTTTTTTGCCATTAATATATCCATTATATCGGCATTTGGATCTTGGACCTATTGGTCCACTGGTTCCATTATTA TGTATGAATTCTCATATTGATTGGTCCCCGTTTTATTTTGTCTTGAGGAACTTGCTTTATTCACCTTTTGGTAGAACGAGTTATTCACTTGTATTAATCC TTTGCTCTTTTGGAAGTTGGCAAGATTATCACAATGGCTAATGCAAGTGCTCATAGAACTTTCTAGCACATATTCATAAAAATTTATCTGATTTAAATGT TCTTCAAGTTCTTTTCTACAATTTTCCACCAAAGGATATGTATCAAAGGTATCCCAAACATAAGCTTGGTTTCTTGAACATGGAAGATTGGCAGCAGGGT GTTGTAATTAGGGCATGTGGACGATGACAATGGTCCTGAGCTTTTGGAAGTTTCTAGCAGGATACTTTCTTGCTCTAGCATTCTCTAGAGCATCATTTAA TCTTGCTTGCCACCAGCTTAAAGGTGAAAATCATTCTAATAGAGTCCAAAGCAAATGATTATGATTTTGGAGATCAGTGAGGAACCTGTATGTTGTCTGA GTTTGCAAAGCAACAGGAGTGACATATAAAACAGTGACACACCATGTGTACCATAGTAGGTCCTCTGGGAGGATATATCTATGGTGAGGATTGATTGAGA TGACATTATGGAAAGGATATCTGGATGGAAGAGATTTTCTTGGAAACTATCCTTGTAACCTGTAAGAGCCTTGTGCAAAAAATAGTGAAGACGATTCTTT GCATACTCCTTAAGTTTTCCAGGTGGAAATGACAAATCTACCCCTGGAGGGAGGTCTCTGGTGGTGGAGGCAAAATCTGGTAAATGATTGACCATTAGGA TTAGTGGGAGAGTATTGATAGTAGTGATGAGGCTGATAGGCTTGTTTGGTCTAGAGAGAAAATCTGGGATTAAATTTTGGTTTCCTTTAATGTGTTTGTA AGTAAAATCATATATAGAAAACCAACTTTTCAACCTGAGTATTTGGGGATCAGGTGGCATCTTGTTTTTGAACTCTAGAATCTTGGGGAGGGAAGAGTTA TCCATTTGTACTTCAAATGTATGACCTCTAAGATAAAAATCAAATTTCCGGATTTCATACTTGACAGCAAGAACTTCTTTGTAGGTAATATGATAGTGTT TTTCTGCATTATTGAATTGGCCACTAGCATGCCCACGTGGAATGGAACACAACATGAC BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_57913; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_227449
Blastp | Genome polyprotein from Petuvirus with 42.74% of identity |
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Blastx | Genome polyprotein from Petuvirus with 48.98% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (921337) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_013459335.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |