Id Trinity | FTRINITY_DN56175_c1_g1_i3 |
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Name Transcript | Ll_transcript_227062 |
Sequence | TAAGCATCTCAATAAAAAGGATATTGTGTTATGTGAAAATGCATTCTCACTGTGTATTGTGAGCATGAGTGGTTATTGTGGTTTTGGATGAAGATTTGAG AGTTTGTCTAGTTGTATAAATGATGGAGTTGAAAAGGAATTTTTTTTGTTGGTAATTGTGATCATGGTTGCAGAAATTCTCGAAACCATAATGGTTGCAG AGATTCTCAAAACCCTAATTGTTGCGGAGTTTCTCAAATCCTTCACGGTTGTGGATAATTGCAGGAAAATGAAGCAGATGCGTTTGAATTTGCGATAGCT ATTAGATTTAGGATACTTCCAAAAACTTAGCATTTGGAGTCTCAATTGCTGTTGCGGATCCAGAATTAAAACCTTGATAACTAGTATATACTCTATGCCA ATGTGAGTAGATATTGATATACACTGTATGCCAATATGAGAGTTGTAACAATTAAAGAGTCAAATTTACATGTGTAAAATATAAATAGCTCAGTTGGTAG AACTGCATGACATTAAGTTTAGTAACCAGGTTCTAACCCTGGTAGCTACCGTATATTGCTGTGAATAAGTGGAATCGAGGTATCTCGTATTTCAAGGTGG AGTAGATATAGATGTGAGAGATGTGTCAGTTGAGGAATGATGAATCAAAATATGCATCCAAGCGTTCAGAGGTTTTGTTTGAAGTTTAACTGCTTTCTTA ATTCTTAATTGATACGGCTTGAAATACTGGTTGCTTATATATGCATAAATAGATCGGCACCATTCAGTTGAAAGTACAGAAATGTAAGCATTAAAGAAAT TTAGTCTTTTTGTTTAAGGTTAGAGATGTTAGCTATCAACCACCAGGGACTCCGCTCAAGCTTCTGAATTCAGTTAGCTTTTCACTTCCAGACAAAAGTC TTGGGCTAATTTTTGGACAGAGTGGAAGTGGAAAAACAACTCTCTTGCAGCTTCTTGCAGGAATAAACAAGCCAACCTCTGGATCCATTTGCACCCAAAA ATATGGGAATGATGGAAATCCTAGTCAACCCCCAGAGCCCTTGGTGCCAGAAAGGGTTGGTATCGTCTTCCAGTTTCCGGAGAGGTATTTTGTGGCTGAT AGTGTGCTTGATGAAGTCACTTTTGGGTGGCCTAGGCAAAAGGATAGCTATCAACTGAGGGAGAATCTTGCACAGGGGCTTCAGAGGGCAATTAACTGGG TTGGCTTAAGTGGGATACCGTTGGATAAAAATCCTCACTCCCTTAGTGGTGGTTACAAACGTCGTCTTGCCTTGGCAATACAATTAGTCCAAATCCCTGA CCTATTGATATTAGATGAGCCTCTTGCTGGTCTTGGTATAAAATTGCAACCTTTGACTTCTTGATTCTAGTTTGCTATTTATTGCTGTTATTAATGAACT TTATTTTTTCTTATTAAGTTAACCATTGAAAAAGACTTCAATTAGATCTCGCAAAAACCCAGCTTCTTCTACAGTTTTGTATTTTAAAAACATTTTGTTG TCGTAATTCAGCTTACATTAGTTGTTCTGCCTCTTTTTTTTATTTTAAAAAAACAAACAAATTACGAAGAAGGCCTAAGTCATAGTTTCAGGAGGGGAAG GGTGGGCTAAATTGGAGGCACAAACACAAAGTGTCATTGATGTAATTCAATCCCAGGTGAAAGTAATCTCCGAAGGAATTTGGTGCAATTGAGCTTGTGG GCATGTTTATAGTTTTGTTTTTGAATGGTGTGAATTACTACTTTTGAGGAAATAGCAATATTTTTTTTATAGAATGAACTGTATATATTTTTTTAAGCTT TGTCTAATAATTGCTCCTGGTCAGATTGGAAAGCACGTGCCGATGTTGTGAAGCTTTTGATGAATCTAAAAAAGGAATTAACTGTGCTGGTTGTCAGCCA CGATTTGAGAGAGTTTAAAAGTCTAGTTGACCGATCATGGAGGATGGAAATGGGTGGCTACCTTAGAGAAGAGTTGCTACAATTTTAATCTGTACTCATT ACCTTGTTTATCAGGAACAGATCTTGTTCCGTACATTGTCCCGCACCAAAAAATTTAGTTGACATATCATATTTTTATTTATGTGAGATAATGTATGAGA TAAGATCTGGTACCTCATATCTTTGTTATTAGCATGAAGTGCAATTAAGTTCGAGAGATATAAACTGTTCATACCTACCACCTATTAAGCTTAAGCTTGT GGGATGTTTTTGATGTAGAATTGGAACTTGCAAAGAAATAATTTGAGGATGGCTTTGTTTGGAAGGGAAGGGAAGAGAGGGTTTTAAAAAGTTTTTCTTT TGTTTGGGAGTTAAGTGAAAGATACGGGATGGTTTTGAAGGTTTTTTAACACTCTTAATGTGTTTATTTTCATAGTTCCTTCAATTTGTGATTTTTGTAG TGACAAAATGTGAAAATATCTAAATGCAATTAGTAAAATTTTATAATTATATTATTG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_57965; |
Additional information | - |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_227062
Blastp | - |
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Blastx | ABC transporter I family member 11, chloroplastic from Arabidopsis with 74.58% of identity |
Eggnog | ATPase activity(COG1122) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G14100) |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0001897) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019429672.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |