Id Trinity | FTRINITY_DN56200_c0_g1_i10 |
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Name Transcript | Ll_transcript_60425 |
Sequence | TTTTGCTTGCTCCCTCTCTAGGCAAACTGACCTTAAGTATTGATGAGGCAGAGAGGGGTATAATTGTAAATCACTAACATCATTCATCAGCATTCATTTT CCACTCTTCTGCTCATCAGAAACAGGTCTAGGTAAAGAAGGACATAATTGTAAAATCAACTCTTTCTCTTCATCCCTATTTTCCTTCCTTCAATTTTCTC TCAAACCAAACAAAGACTTATGGCTGCAGAGAAGAAAACAAATTTCAACCACTAAAGCCCACATTCACTACTCAAATGGGTACTTCAGCTATGAACAAGG ACAACCTTAATGGAAGCAAAATTGCACAGTGGAAGCAAAAAGAGTTGTTTTTTCTTGTTGCATATGCTTTTGTTTTCTATATCATCATCATAGTTCGTTC CCTTCAACTTTCTCGTGACCATTATAGCAAACTTTATGGTTTACGCCAAGGATGGCTCATACCCAATTACCTCAATGATATGTCAGATGCTCAGTGGAGG AATTTTCGAGGAAATATACCTGTTCTTACTCTTGTGTTCGGAATTTTCACTCTGGTGGCAAATTTGACGAGAGCTTTTTTAAATTTGAAAGTGGGGGGAA TGTCCATTGTCTGGCTTTTATTTTCTTTGGCCTACTTGGTATACCTGCATGGAGCATGCGTCATATTTATCCTATCAATAGCTACAGTTAATTATCTTTT GGTAAAGATATTCGCCCGGAAAATGTACTTTCCACTTGTAATTTGGAATTACAACTTATTTTTTCTTCTCTGCAATCGCATTTATGAAGGATATTCATTC TCTATATTTGGTGAACAATGGAAAATTTTGGACGGTTACCGGGGCAGCTTTAGGTGGCACATATGTTTCAACTTCGGTATTCTTTTTCATTTTTTGATTA GTTCCAGACTTCGAGTAATATCTTAGGTCAGAATTGTCCATGTACATGTGGCTATTCTCAAATGCATTTGCATCTGTTAGTTTTCAAACATCCTGATGGT GATACTGGTTCTCATCCCTTACCTGCACACATCTGAATTTCTGCTAACCCTGTTAGTTTCAAGTTACATGATTTGTTACTAGAACCCGTATGGATGAGAT GTTAAATTTAGTGATCTTGACATTTTAAAACCCGTATGCATGCCTTTGTATTCTCATTTACATACCCTTGTCTTAAGTTTAATTGTCTCTGGCAGTTGTG TTGCGCATGATAAGCTTCGGATTTGATTATCATTGGACAAATGAAGATTCTCATTTTGATCATGAGAAACATTATCAACGTTGTCATATTTGTAAATCAG GAAAATCTTGCTACCAAATATTACAGGAGAGAAGTCTGCAGAGTGACAAGTTCAGATATAGTACATACCTTTGTTATTTGGTGTATGCACCACTTTACAT TGCTGGTCCAGTACTGAGCTTCAATGCTTTTGCCTCACAGCTAGATGCTCCGCAGAATACTTATTCGGTTAGAAATGTGATATGCTATGGTTTTCGCTGG ATATTGAGTCTTCTCCTCATGGAATTAATGACACATGTATTCTATTATAATGCCTTTGCTATTAGGTGAGTTCCTCAGTACTCAGGAAACTACTCTTTTT TCTATTTAGTTTCTAATTTTATTCTTTGGTGGCTGAGATAATTTCTTCACCAATTAGTGGTTTATGGAAGCAGTTCTCTCCTCTGGACGTGTTCATTATC GGATATGGGGTAAGAGAAATTCCTTTAGATTACCAGACTAGTTTTGCAGTAAGGCAGTATCTATGATGTAGAAGATTTCCATGACATTTGAATTAGTTCC GAACATGCTTGACCTAAATTTTTGACATGGATGACTATTATATCAGGTTTTATATAATAATCGAGAGCATAAAGGACTCAGTTACATATATTCCAATTTT GAAAAAGAAATTTATCTTTTACAAATTATATCGGCGGTTTTTACATGTCTCTTACTATGCATCTCCAGTGTGGGAATTTTGATCTAGACACTAGCAAACA GGATATTTTACATAACCTATCCTAGGACCAAACTGTTAATTAACATTTACTACTGACATGAGGTATCCGAAAGGAATAGGACAACGACAAAGTTGAATCC TTGCTTAATTCCATTGGCAAGTTCAATCTATTAATCTTGCAGGGTAATGTTTGTGAACGTGTAATGATTCTGTTTTGTGTTTGCGTCATCGTATTACTCT ACCTGGCTAGACGTGAAATTCAATTCACTCTGCTTTCTTTATGCATCCACTGACTGTGATTGTGGCATAGGACACATTAGATTATGGTTTAAAGGCACTA TTTTTGTGGGTTTAGTTGTGTTGATTTGATGTGTTGTAAGTGGGGAACATATTTTTATCTAAGGCTTGGGATTTGGTGAACATATTATTTGTTTATATCT TATGATGGCAGGATTATTTCACACAGAAATATGCTGACCTTCCCTTTGTGTTTGATATTCATTTTCCTGATGGTTAGGTGCAATATCTTGAAGGATTAAT TTTATAACTAGTTCGGCACAATGCTTTGTCATTCTGTTATTTATTTATTTCAGGTCCTAAACTTCATGTGGCTAAAATTTCTACTGATCTGGCGCTTTTT CCGTTTCTGGTCACTGGTATGTTTCTTGCTGTAACCTTTAAGGATCTATCATCAATGTCCAAATGGGTATTTGAAGAAAGTTGATGCGGCCCCAGATTCT AAGATGAACCCTAGTGTATCTTTAGCTGGCCAAGTATCAAAATGGCCTATGAAGTGGGTAGTGTACTTGAGGAGGAAAGGAAAGAATGTCAACCTACCCG AGTGATGGGGCAAATAGTGATCGGAGGGTGATACAAGCAATGCCGCAAGTATATTGATTTTATCAGAAGCTCTTTTCATTAAATCTGCGCAAAATAACAG ATAACCCACAGTTAATCTGAATTAAGCTATAATGCAACAAAGATTAATTAAAATCACAATTAGATAAGGATTTGCATGTAAACTAAGGATTAAATATGAT AAATTTTCATATACATTGAGAGAATATGGCCGTGGCAAAACTTTCTATTGTAAGGATCAGTAGGTGTGAGAGCGGGTATCTTTTTGGGTAATCATTTTGG TTGTTATGGACAGAGGACTGAGTCCCCTGTATGAGCAGAGCTCTGTCGAAAGTAGGAACTTCATTCCATTGTATTTCCATTTATCAAGTCAATAATACAG ATTACCCACTTCTTTATCTATTCTCTTTTCTCTATATTTCCTGTGTCTAATTTCTAGTACCTGTCAAAAGTCATTGCTTTAAAATAATGTATTGTAGATA AACGGCATCGAGGCTCCAGAAAATATGCCAAAGTGTATTAATAATTGCCATAATTTGGAAGGCTTTTGGAAAAACTGGCATGCTTCCTTTAACAAGTGGC TTGTGAGGTATATGTACATTCCTCTTGGCGGATCTCAGAAAAAGCTACTGAATGTTTGGGTTATATTCACATTTGTTGCTGTTTGGCATGATTTAGAGTG GAAGCTTCTTTCGTGGGCATGGTTGACATGTATATTCTTCATCCCAGAGTTGGTTTTAAAATCAGCATCTAAAGCATTTAAGGCTAAAAGTGCTTTTGGG GAATTCATATTTCGCGAACTCAGTGCTGTTGCTGGT BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_58189; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_60425
Blastp | Putative membrane-bound O-acyltransferase C24H6.01c from Schizosaccharomyces with 53.42% of identity |
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Blastx | Putative membrane-bound O-acyltransferase C24H6.01c from Schizosaccharomyces with 53.66% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (SPAC24H6.01c) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019430171.1) |
Pfam | MBOAT, membrane-bound O-acyltransferase family (PF03062.18) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |