| Id Trinity | FTRINITY_DN56209_c1_g1_i2 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_59866 |
| Sequence | CTTTTCTCTCTTATTTCTCTTTCCCTTGCTAGTAGCTGTTCTCTTCAACTAAAATTCGAAGTCTTAGTTTTACTTGTAACTCTCTACTCTTTTTTATCGG AAAAAAAATCTAACTCTCTATACGACGTCGTTCCGTGTTACTTTCTCGAATTTATTGTCTCTTCCTTCCTCTTACGGGTTTGTTGGGTATGGAAGGTGGT GAGCAATTGAATGAGGGTGGTTATGGTGGTGAAGTTGAAAAAATCATATCTCAGGAGTGTATAAGTGGTTCTTTGGATAAGGAGGAGAAAATGGTTGTAG ATGAAAAGCTATGCAAAATGCAGACTGAGAATTGTGTTCTTCAAGTTGAAGATGAGAAGGGAGAAATTACTGCTGGCAATGATGTGGATGTTGGATTTGG GGTGGCCGAAACTGTCGTGGTATCGGAGGAAGTGGAAGGAGTGAGTTCAGTTGTGCATGATGAGAACAAGGGTCCCAATGGAAGTGTTGTGGTTAATGGA AGATCTGTATCAGGTGCTAAAAGAGCCCGCGTCACTACTGACGAACATCAGCCTTCAGTTCATTTCATTTATAATTCCCTCACAAGAGCTAGTAGGCAGA AGCTTGAGGAACTGCTACAGCAATGGTCAGAATGGCACGAGAAACACGTTTCTTCGTCGAGTGATCCTAGTGAAGTGGTGGAATCTGGCGAGGAGACATT TTTTCCTGCTCTAAAAGTTGGCCATGAGGAGACCTCCGCTGTGCCATTCTGGATGGATAACCAGACAATTAATGATCAGAATAAGGATTTCATTCCTTTA AATCATAATTCTGTGCCTCTATATGATCGTGGATTTGCTTTGGGATTGACGTCGGCTGATGGTCCAAGTAATCTGGATGGGTATATACTGCTACTTTGTA TTATTTTATATGAAACTGTGGGTACACTTAACTTCTAGTTCTAGATGGTTTATATGATCTTAAGATGTTTAAAGGCATATTGCTAGCTTGTTTCTTGGTT GTCTAATATTGTGATGTTGCACTGCATATGGAAACTTTTGCTTGGAAACTCGACAAACCCTTGATCATTGTGGCTACAGAATTTTGTCTTTTTGGAAAGG AACCATAACCTAAAACTTTGCACTGCGCCATTTGATTTGTATTTCAAATTTCTACTTTAACTAGAGTGAATATTGAACTACATCACTTATCCTGTTAATA CATTTATATTTTTTAGTGTTAGCTTCACTATTTTAGTATATTGTTTAATGGCTGGGAGGATTTCAGATGGAAAGCCTATTTTAATTCTATGCAGAAGTCT CTATTCAGTTTTTACAAGTTTAACTTTTTGGTCCGGTATAAGGTACATTCTAAGTAGACTAACAATTGATGAATCCCTCATTTCAACCCTTTCCTTTTCT TTGCTTGCTCCATTTTCTCTAGCATGAGAAGTTAGTTCTTTTAGAAGATCCTTTTTTTAATTATTTTTATTGAGGTAGGAACTTGATTCGTATTATCTTG CAGTGAAAGTTTGATGTGGTAGAATTTGTGTAGACAATTAAATTAGTGATAGAGAAATATGACGTCGTAAGATCCATGTAGCTGACCCCACCAAGTGGGA CTAATGCTTAGTTTTTGTTGTTCTGCTGAATGAATGAGAATTTGGTGGTTGGCTGCTTTAATAATTATTTTATCTCACATGTATCTTTTTTAATTGGTTA TTGAAACTGTTGATCTGGTCATCCTTCATTTGCAACGAATATCATAGAATTTGCTGAATGTGTGGTGGTATACCATTATTGATATTTCTGGGAGTCAGGT TTCTGTTGGCCGATATGATAATATTTCTTTACGAATTTGTCTTCACATGATATGAGTAGTTCTAATCTGCCTATCGCATCTTGAAGACTTGTCATGCCTT CTGATTTTCTCATATCTTGCTGTGTGGGATCCGTAATAAAACAGAAATGTAAATGAAAGCATATGTATCATTCAAAGTTAAAAAACTTACCGTGTTCTGA TTCACCTTGGTGGTACTCCTCATGTATTAACTATATTATTATTGGTCATTTGAAAGTTAAGGAACATGCAGTGTGGTTTCTTTTGCAATATAAAAATTGA AAATTCAATTTTCAATTCATAATTTAGGAATTTATATGTTCAGGTATGAAAAAGTTTAGGTTCTAGGGACATGTAGATGTTGAATGAAGCCTCGATTAAT TGATATAGCAATTTGCAGCAGATTTTAGTTGATACAAAGTGATGTGGCTGCCAATATGGTGTGTGGTCTATGGGTTGGATTTATTAGTTAAGTAGTCTAT GGTTATAGCTTGCAAAATAGTATATATATTCTGCATTGCTTTGTTTCTCTGCAATGCTTTTCTTTAATGTTGGTATTTGATCATTGAAACATAATTCGCT CAATTTGGCAAAGAACCACAAATTGGTTCGTGCATACCAATTCGCGGTTCTTTTGTAAATTGCTTCTCTCCAGTTCTTGCGTTAATTCCCTGCAAGAAAT GAACCACGTTTTCACCGACAATTTCAGTCTAAGGAAGAGTAGTTGGTGTCTTGCTGATTTGGGACCACCTGCATGATTAGGTTATAACAAACAAGAAAAC ATGAAAGTTAATGGGGTGTTTCTCTTATGGTGAAGAAATAGTTGATTCACTGCTCTAATCTACATGGAGATATGGAAACTGCTGTGCAAGGGGGAGCCAT AGAAACCCTACATGTCAATGTCATGGGCTTATTTCAAATTGGCCTATGTATTGTTTTTTTTTCCTAATCAAAATGATCCATCTAACTGAAGAATAACCAA ATTATTAAATCATATTAGATCATAAATGACACACATCAAATATGGAATTAGATCAAAGAAAATTAAAATAAAATGTTTTTAAAATATATTATTAATTATT TATAATTAATAGTTAATGGTAATAATATAACCATAGCAAGCATACCCGCATGACTCCCAAGTGAAAAAGGAAAGAACTCATCTTCTTTCTTTTTTGATTA CCTTCCTTGCGTATGTATAGAACGTATTAACTAAGTATACCCCCACCCAACTATTTGATAGCGCAGTGTGCAGTGTACCCATACCAGTACCAAAGATAAC CACTTATCAGGGGACTATGGTATTGATATTAAGGCGAGGTTCTGGAAATTTATTTGTTGGTATGATATGCCTAGCAGAATTCTGTTTTTTGTGTGTTCTT TATCCCTCTGGATGAATAATCATCTCTAGTTGGTATCTGTGTTACCAACGGGGAGAAGTTTCAACATGTGATCTTATTAAACAACAGCAAGATTTGGTAC TTCATTCTTTTGCCACACCTAGTTTTATTGTTATCATGAGAGAATTGGGATAGAGGCATTGGGAAATATTCTTATTGCATTTTATGTTAGAGGATAAGAG CAAGGGAGGACATAATTGTCGGTCTCAGTTGGATTTTGGCTTACATAAACACAATGGTGAAACAATTTATCATTTGCTTATTCACTTTCCTGCTGCAACC ATTTTGGTATCTGCATGTTGTAACTGGAATGTGCCTAAATATGTCAAGGAGGTGCTACTCTTTCATGTTGAGCAAAAGACTGGGAAGGGCATAAAGATAA AGTCATCAAAAACAGTTCCAGGTTGATTCCTATTTACGCTTAGTGAGAAAAAGAAAAAAAAGGATTTTGGGATTATTGGAACTTCTCCAGATTCTTCACT GTGGAATTGAACTTCATAGATCTTTTTACTTTGATTTCACTTCAGATGTTTTTCTTCTTTTTTTAGCATCTTGAAGTAAAACTCGTTTTGCATCATACGT TCTGGTGGTATGTGACTAATTCTTGATGAATCATTCAATCACTTATTTAAAAGAGTGTCATGCTCATTCATGCAATTTCTATTTATTTATTGGAAAGATA TACTGTCAGCTTCCATCACAATATTGTGCTGTCTTTTGATATTTTTTAAAACTTATTGTAGGGGTCTGGAGATCATTGATGCTGCTGCTCGGTGTTTCAA TTGTGGTTCATACAGTCATTCTTTGAGAGAATGTACAAGACCTCGTGACAATGTTGCTGTCAATAATGCTCGTAAGCAACTCAAGTCCCGGAGGAACCAG AATGCTTCTTCCCGCAACCCAACTCGATATTATCAGAGTTCTCCAACTGGAAAGTATGCTGGTCTGAGAGCAGGTGCTCTTGATGATGCAACCCGTCAAC TCTTAGGCTTGGGGGAGCTTGATCCTCCTCCATGGCTTAAAAGAATGCGGGAGATCGGATACCCACCTGGATATCTAGATGTGGATGATGAGGATGAGCC TTCAGGCATCACAATATACACTGATAGGGAGATTGCAGAACAAGAGGATGGGGAAATTATGGAAGTAGATAATTTGAAACCAAAACAGAAAATGGCTGTT GAATTTCCTGGAATAAACGCTCCGATTCCAGAAAATGCTGATGAAAGATTGTGGGCTGCTGGGGCTGCACCCTCGAGTTATGACAGAAACTTACCGCAGC ACAGGTCAAATCATGGTACAGATTATGGCAGCAGAGGACATTTTCGTGATCAGAGACCGCCAGGGGATTTCAGGGATGATGCTCCTCCAGGGGATCCAGG ATTTAGTTCACCCAGGTATAGTTTTCATCCGAGGTATGGTGGACATGATTCTGGCCAAAGAAGTCCTCCAATGTCGAGATTCCAATCAGAATGGAGTAGG AAAAGTCCTTCGCGTGATGAAGAATCCCCACATCCTAGTTCCTTCCATTCTCTATATTACTCATCATCATCAGAGAGGCTTCCTTCGCCCCGGGACCGGG ATTCAGGTAGATATGGAAACCGGACCTCTGGAAGCCTGCATGACAGAGACCGAGATCGTCCATCCCAAAATAGAGACATGTCAGAAGACCGGCACTATCG CAGTCGGAGGTGAGTAGGCATCAACAGGATTGTATTGGTAGGCTGTGAAGATACATTTCCATCATTCATAGGTCAAAATCATGTTTACCCTTTTACTTGT TAGGGACAATTTTACAATGTTTTGATGAAGTTGACAGATTTATTTGTTACTAGGATTCATAACTGAAAACTTACTTTTATTTGCTTGTACAATGGATTAT CAGCTGTATTACTGTTGTGTCATTTTTATACAATATTTGGACATTTGTGAAACAAGTGGAGGTTTTAATTTTTAACTTTTAACCTATGTTTAAAA BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_58258; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_59866
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Zinc finger CCHC domain-containing protein 8 from Xenopus with 32.4% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019428177.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |