| Id Trinity | FTRINITY_DN56225_c0_g1_i16 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_60461 |
| Sequence | ATTTGAATCTAGTTTGCAGCTAACAGTTGGTTGAAATTGAATGAAACCCAAACAAATGGGATAATGTTACCCACAAGACACTTTTAGGTCACCCATATTC AATGTCCCCATACCTTTGCCCTTTTCCCTCCCCAAAAAAAATAGTATTCATCTTTGACTTTTCTGTTTTGGCTAACTAAAATATATTTCATATATTTTTT CTTATTGGGAATATGGAGTTACAAATGGTGCGTGAACCAATCTTTGTTTTCATTCTACATGTTGTGGTGTTTTAGTTACATAATTTATGGTTTTCGTTAC AATGGACAATGATCTTATGTCCCAAATCTCATTCCAAAGTTTGTACCAAACCAATTATAATCTGACACATTAGTTAAAAAATTAAACATTATTGATTTTA TCTATTTTTATTCATTTTGATGTTATATTTTATTATACATGTGGCTAACGTTGGAGCCAATTCCAGAACAGAAGTGGAATTTAGCTATAATTAATTTAAT TTATGATTAAGAGCTTCTTGCTTATTGTTGAGAAAGTAAAGAAGATTGGTTTGAAATAGTTTTCCTAGGATATTCTCTGGGAGAGATACACGTTAAGTTG GAATGAAGGAAAATGCATTGCTTACAGACAAAGCATAACAAGTATTTTTTTCCCATAATTTAACAACAACTTTCACCTACAGAGAAAGATGGCTTCATGG AACTAGGGAGCAAGAAGCATATTTATATGAAGAGAATGGAATAACTTGGGCTTGTGAAAACAAAACATTTCTATTTCCACACTCAAAATCACCCACCAGA CAAGAAACCAAGAAAATTGTGGCACGTTTGGTTAAATTTGTTATAACCAGAACCAACATATAGTTACATTAATTGTGGTAATAAAAAAATGAATTTTTTT TCATCACATTAATCCTTAATCTATTTTAATTGGTCATGAATTTTATCTAAGATTTGGTTTAAGAAAAATAGGGCAAGCCTCTTCGCTGAATGAATAAAGT TTTTCTATTTTTATAGAAATAGTAGTTAAATCATGTTACAACTAGTTCAGTTTGTAGGATTGAACTGAGCCTAAGAATATGGTATATGCTATCGGGTCGG GGGAATATGCTATTGGATCGGGTTAATGTTGGAGGGTGAATCTTACATTTTACATTCTTTGTATCCATAGATGAACAATACAAAACGTTACATACTAATA CTGCAATTGTAGTAAGGTTTTTCATCCATGGGAGGTGGAAACAGAGGAGGAAGATCGAGATCCAGCAACAACAGAAACCGTAAAAATGCAATCTTTGTTG AAGGGGGTTTCTTATCTGATTGCCATTTATCCTCGTCCCCCACTTTCAATTCACCAGGTGGAAACTGTAGCTCGAAGAAAGGGTCGGGTTCCAAATCTGG GAGGGTACATAGAGCAGAAACTTCTGCTTCTAAAACAGTGATTGTTCCAAACTCTTATTTGGGGACTACTATTGGGTATAATTACCCTTCAGCAAATAAT ATTCAGGTTTGTCACGCCTGACAAAGTTTTTAACTTCATATATTATTTTTAAGGCAGATGATAAATCAGATTTAGTGTTAATTTTGAACAATCTATATGC TTTTAACTAAAATGGTGTTTTTGACCTTAAATGGGGTCTTGTGCTATATTGTTCATTATGTTTCAGCAGTTGTGTTTAACTCTCATTATACACAACACTA TGGCACTACCTAAGAGGGCGAGCCTCATGCAACGGTAAGGGTGTAAATCTGTTTGCCTCCCCAGACCTCACGAGGTGGGAGTCTCGGGCAGTGGGATGCC ATTTTTTATAACGGTAAAATTCCTACATACAGCATAACCAAGCAAGATCATTCACTCTACTTAATCAGATAGCTAGTGCATTTTGACTCGCGTGATGTTA TGCCCAAGTGTGTGGTGCACATTCTACTCATGCGCATAAGTATCCTAGAGAATGAACATTGCTGGAATCTACAACTTGATGAGTACTTGAAAATTAAACC ATTCATCTTGTAACTTATCTCCCCCATGTTGTTTCACTGCTTGTTTCTGTTTAAATATGCATGTAATTTCATACAGATTAGATGAGCTTTTTCCATCATA GCATCAAAGTAACTTGCATTTGTTGGTATATTATTAGGATGACTCATGTTTTGGGAACAACAGTGAAGATAGTAATTTAAATAAGCTACAACATTTTGCT TTGGTGGATTCCAAGCAGAAGAATCAAGTTATTGCTCATGTAGACCAAACACCTCCTTCAAAATCCAACAAAGTGGAATATACTTATGCTTATGGCTCAG ATTTTGTTTTGGGTGACAGCTCTCATAGAGGATTAGGTTTCCATTCTGAACATGATAAAACTCCAAGTGGCATTGGCACATCGTCCGATCAATTGCCCCA ATCAACTGCAGTTTTAGATTCTTCGTCTGTTGAGAAGGATGTTGGTTCTGATGAGGGTATGGGCGGTGAGTTAAGCAATCAGATGACTGAAGGGTTGCCG TCAAAGATGTCTGCTGAGAGAAATCCAGGGTTTCTGTCAATTGGAGGGCTTAAACTATACACCGAGGACATCTCAGATAATGAAAGTGATCAACATGATG ATGAAATGTCATCGAACGAGGATGGATCTGGTTCTTCTGAATCAGAAGAATTGGTTGGATCATCTGAAAGTGATGACTCTGAGGACACATCTGACAGTGA TTCTGACATTGATGAAGATGTAGCTGAAGATTATTTGGAAGGAGTTGGTGGTAGTGATAACATCATAGATGCAAAATGGTTGCTAAAACCTGATTTGGAC GAGTCTGATGATGATGATTCTCCTAGAAGTTGCTATGACAAGACTTTGGAGAAGTTGAGTGGCATTTCCCTTCAAGAAGCCTCTAGGGAATATGGCAAGA AGAAATCCCGATCATCGAAAAAACGGTCTGGACATTCTGGGCCTTTAGCTTTGGATGATCTAATGCTGGAAAAAGATCCAAGAACTTATTCTGCTAGAAA GAAGCATGTTCCTCAGTTCCCTCGCTCTTGGCCTTTGCAGGATCAAAAGATTGAAGCTTCCATAAGAATTCATGGTACCTCTATCCCACATCCACCTATG TCAAATATTTGATTTTGTTCTCTTACATCTAAAGACTTTCATTTACGCAAATTTCTGTGGCTCGTTGAGTTTACATTATACATCTTGAATCTTGAAAGCA TTGAGTCACCCTGTTAAAGCATTGATGTAGACGTAGTAATTAATTAAGTGCATTAGTAGTATCATTACTTATCTTTACTGTTTTAATATATTCTTTATGG GTGGCTGAAACAAATAGTGGGGATTGGCGAATAACAAGCCGATAAACAGGTGTGTTTAATGTGTGTTTGTCTCCATATTTGTGCCTAGTGCCTGAGCTAT AGAATTTTATGAATACTATTGCAACTTTTTATAAAAAATAAACTAAAATTATTGAGTTGATGGAACAGCATGTTTCAAGCATATGGGGATTTAACATCTA TAAACTGTAATACCAAAAATGGTTGAACTTCTAGTGGGAAAATTATAGATCCTGAAGAAATGGATAAGCAGTCATGTAAGGCAACAGGGAAAAAGTAAAT GTAATTATTTAAATTTTTTGTTTGAGATGATATGGAATTCCAGCCACTTCATTTTGTTAAGGCTTGTTTTATACAGGTGAAAAAAAGAAAGTTCGTAAAG AAAAGATTGCTGTCAAACGTAGAGAAAGAATGTTTCACCGTGGAGTTGATCTCGAGAAAATTAACTTGAAATTAGAGCAGATTGTTTTGGAGAAAGTGGA TATATTTTCTTTTCAGCCTATGCATTCTCGGGATTGTTCACAGGTACAGCGAGTAGCAGCACTTTATAATTTACGCAGTAGTTGCCAAAGCTTTGGGAAA AAAAGATTTGTGACAGTGATGCGAACACAATTCACATCAATGCCATCTTCAAGTGGTAGACAGCGACTGTCAAAGGTTCTGTAGTTTCACACTTGTACTA ATTATATCTTGACTTTTATTTATGCATTACATATTGTTTATGTTTTTACTTTTTTCGTTGTCTGAGTGAACATATGAGACAAGGTCTATTTAGGAATTAA TGCATTAGAGAGTATGTAAGGATAGCACCTGGTATGGAAAAGATGGTAGAAATTCGTCTTTACGTGATTTAGCAATGGAGGAGAAACCCACTTGAGTCCA TAGAAATAAGAGTAGATCATAAAGGTTATGGAATCTACAGAAAAGCTACTGGTGAAACCATTAAAAAAGGAATAGGACTAATGGCCTTTCCAAAAACACG ATTTACGATAGAATCCTTTTATCCGACCCAGCCTAGTGGGAAAAGATTTTGTTGACATATATTGAGAAGTAGCATTTATGTTTTCCTCTTGTTTCCATCC TTCTATGAGATACAGATTGACATCTTGCTCTGATCCCCTCGTCAACTCTCCTAGGCCAATGCAATTGGAAGTTGAAAGATGGAAATCTTAATTAGAAGCT TCTGGTGTTTCGATGACTGGCGATTTCTTTCAAAGTTTAGACGTTTTTAGCCATGCATTACGTACATGTTTACATATTTGCAGTTATTTGTAAGTTGTTA GTTATAGTTGAGTCTAATTGTTATATGAATTTCAGCTTATGGGAGTTGATGATGAGAGTGTTGATTTTGCCATCACCGGCTATATAAATAAGAAGCCTGT GACTGGAGACAGGAGTTCAGCAAAGAAAAGTGCTAAAAGGAATGACTTCAGAATGCAAGAACCTCAATCAGCACAGAACAAGACATCAAAGTACTCAAAG AGCCGAGGCAGCGGTAAAGGGATGGACAAGAAAGGAAGTGGACAAAAGGGTCCATTAGCTAATCAACCTGTCTCATTTGTATCAAGTGGCTTAATTCATT CAGAAACTGTGCAGATCACAGCTGTTGATACTGAAGAGAGTGATAGCCCTTATAAGAAGAGTGTCACTAGCTCTGCCAATATCGGTTCGTTCGAGGTACA CACCACTGGTTTTGGTTCAAAAATGTTGGCTAGAATGGGATACATGGAAGGAGCAGGGTTAGGGAAAAATGGCCAAGGTATGGCAGAACCCATTGAGGTA ATAAGAAGGCCTAAATCACTTGGTTTGGGTGTGGAATTCTCCACCAGTCCTCCTGAGCCAGCTTCTGAACCAGTTAGTAGGAACAGCAAGTCTTCAAGTT CAAGAATTGGTGGTTTTGAAAAACATACCAAAGGTTTTGGATCAAAGATGATGGCGAAGATGGGATTTATTGAAGGGACTGGATTAGGCAGAGACTCACA AGGCATCACGAATCCATTAAGCGCGGTTAGGCTACCAAAGTCGCGAGGATTAGGTCCGAAGCGTTAATTTAGGTGTCATTTGCGTTTGGTTTCCTAATGT ACATTAGTCTCTAATGATTCTCCAATCTGGTTTAGTTTTAATGTAGCATGATGACTGTATTTGCGTATGTAGCATCACTTTTAAAATGCTATATTTGCTG TCTCTAAACGAAAGAAAGAAACCAAGTTCTATGGAAGACATGTTATGTAATTATGTTGAAGACAATTATGTTTGTGTTTCCTTTTCTAAGCTTGTATATA GTGTTTTCGTGATTGTGAAATTAATTTTATTGAATTCAAAAAC BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_58364; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_60461
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | G-patch domain-containing protein C1486.03 from Schizosaccharomyces with 41.24% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019463089.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |