| Id Trinity | FTRINITY_DN56225_c0_g1_i2 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_60446 |
| Sequence | ATTTGAATCTAGTTTGCAGCTAACAGTTGGTTGAAATTGAATGAAACCCAAACAAATGGGATAATGTTACCCACAAGACACTTTTAGGTCACCCATATTC AATGTCCCCATACCTTTGCCCTTTTCCCTCCCCAAAAAAAATAGTATTCATCTTTGACTTTTCTGTTTTGGCTAACTAAAATATATTTCATATATTTTTT CTTATTGGGAATATGGAGTTACAAATGGTGCGTGAACCAATCTTTGTTTTCATTCTACATGTTGTGGTGTTTTAGTTACATAATTTATGGTTTTCGTTAC AATGGACAATGATCTTATGTCCCAAATCTCATTCCAAAGTTTGTACCAAACCAATTATAATCTGACACATTAGTTAAAAAATTAAACATTATTGATTTTA TCTATTTTTATTCATTTTGATGTTATATTTTATTATACATGTGGCTAACGTTGGAGCCAATTCCAGAACAGAAGTGGAATTTAGCTATAATTAATTTAAT TTATGATTAAGAGCTTCTTGCTTATTGTTGAGAAAGTAAAGAAGATTGGTTTGAAATAGTTTTCCTAGGATATTCTCTGGGAGAGATACACGTTAAGTTG GAATGAAGGAAAATGCATTGCTTACAGACAAAGCATAACAAGTATTTTTTTCCCATAATTTAACAACAACTTTCACCTACAGAGAAAGATGGCTTCATGG AACTAGGGAGCAAGAAGCATATTTATATGAAGAGAATGGAATAACTTGGGCTTGTGAAAACAAAACATTTCTATTTCCACACTCAAAATCACCCACCAGA CAAGAAACCAAGAAAATTGTGGCACGTTTGGTTAAATTTGTTATAACCAGAACCAACATATAGTTACATTAATTGTGGTAATAAAAAAATGAATTTTTTT TCATCACATTAATCCTTAATCTATTTTAATTGGTCATGAATTTTATCTAAGATTTGGTTTAAGAAAAATAGGGCAAGCCTCTTCGCTGAATGAATAAAGT TTTTCTATTTTTATAGAAATAGTAGTTAAATCATGTTACAACTAGTTCAGTTTGTAGGATTGAACTGAGCCTAAGAATATGGTATATGCTATCGGGTCGG GGGAATATGCTATTGGATCGGGTTAATGTTGGAGGGTGAATCTTACATTTTACATTCTTTGTATCCATAGATGAACAATACAAAACGTTACATACTAATA CTGCAATTGTAGTAAGGTTTTTCATCCATGGGAGGTGGAAACAGAGGAGGAAGATCGAGATCCAGCAACAACAGAAACCGTAAAAATGCAATCTTTGTTG AAGGGGGTTTCTTATCTGATTGCCATTTATCCTCGTCCCCCACTTTCAATTCACCAGGTGGAAACTGTAGCTCGAAGAAAGGGTCGGGTTCCAAATCTGG GAGGGTACATAGAGCAGAAACTTCTGCTTCTAAAACAGTGATTGTTCCAAACTCTTATTTGGGGACTACTATTGGGTATAATTACCCTTCAGCAAATAAT ATTCAGGATGACTCATGTTTTGGGAACAACAGTGAAGATAGTAATTTAAATAAGCTACAACATTTTGCTTTGGTGGATTCCAAGCAGAAGAATCAAGTTA TTGCTCATGTAGACCAAACACCTCCTTCAAAATCCAACAAAGTGGAATATACTTATGCTTATGGCTCAGATTTTGTTTTGGGTGACAGCTCTCATAGAGG ATTAGGTTTCCATTCTGAACATGATAAAACTCCAAGTGGCATTGGCACATCGTCCGATCAATTGCCCCAATCAACTGCAGTTTTAGATTCTTCGTCTGTT GAGAAGGATGTTGGTTCTGATGAGGGTATGGGCGGTGAGTTAAGCAATCAGATGACTGAAGGGTTGCCGTCAAAGATGTCTGCTGAGAGAAATCCAGGGT TTCTGTCAATTGGAGGGCTTAAACTATACACCGAGGACATCTCAGATAATGAAAGTGATCAACATGATGATGAAATGTCATCGAACGAGGATGGATCTGG TTCTTCTGAATCAGAAGAATTGGTTGGATCATCTGAAAGTGATGACTCTGAGGACACATCTGACAGTGATTCTGACATTGATGAAGATGTAGCTGAAGAT TATTTGGAAGGAGTTGGTGGTAGTGATAACATCATAGATGCAAAATGGTTGCTAAAACCTGATTTGGACGAGTCTGATGATGATGATTCTCCTAGAAGTT GCTATGACAAGACTTTGGAGAAGTTGAGTGGCATTTCCCTTCAAGAAGCCTCTAGGGAATATGGCAAGAAGAAATCCCGATCATCGAAAAAACGGTCTGG ACATTCTGGGCCTTTAGCTTTGGATGATCTAATGCTGGAAAAAGATCCAAGAACTTATTCTGCTAGAAAGAAGCATGTTCCTCAGTTCCCTCGCTCTTGG CCTTTGCAGGATCAAAAGATTGAAGCTTCCATAAGAATTCATGGTACCTCTATCCCACATCCACCTATGTCAAATATTTGATTTTGTTCTCTTACATCTA AAGACTTTCATTTACGCAAATTTCTGTGGCTCGTTGAGTTTACATTATACATCTTGAATCTTGAAAGCATTGAGTCACCCTGTTAAAGCATTGATGTAGA CGTAGTAATTAATTAAGTGCATTAGTAGTATCATTACTTATCTTTACTGTTTTAATATATTCTTTATGGGTGGCTGAAACAAATAGTGGGGATTGGCGAA TAACAAGCCGATAAACAGGTGTGTTTAATGTGTGTTTGTCTCCATATTTGTGCCTAGTGCCTGAGCTATAGAATTTTATGAATACTATTGCAACTTTTTA TAAAAAATAAACTAAAATTATTGAGTTGATGGAACAGCATGTTTCAAGCATATGGGGATTTAACATCTATAAACTGTAATACCAAAAATGGTTGAACTTC TAGTGGGAAAATTATAGATCCTGAAGAAATGGATAAGCAGTCATGTAAGGCAACAGGGAAAAAGTAAATGTAATTATTTAAATTTTTTGTTTGAGATGAT ATGGAATTCCAGCCACTTCATTTTGTTAAGGCTTGTTTTATACAGGTGAAAAAAAGAAAGTTCGTAAAGAAAAGATTGCTGTCAAACGTAGAGAAAGAAT GTTTCACCGTGGAGTTGATCTCGAGAAAATTAACTTGAAATTAGAGCAGATTGTTTTGGAGAAAGTGGATATATTTTCTTTTCAGCCTATGCATTCTCGG GATTGTTCACAGGTACAGCGAGTAGCAGCACTTTATAATTTACGCAGTAGTTGCCAAAGCTTTGGGAAAAAAAGGTGAAACAATCTTCTCATATTTATAT AATTGGAAGTTAGTGTCTGCAAATTTAATAAACTAGTTTGGATCTGTGATTTCAGATTTGTGACAGTGATGCGAACACAATTCACATCAATGCCATCTTC AAGTGGTAGACAGCGACTGTCAAAGGTTCTGTAGTTTCACACTTGTACTAATTATATCTTGACTTTTATTTATGCATTACATATTGTTTATGTTTTTACT TTTTTCGTTGTCTGAGTGAACATATGAGACAAGGTCTATTTAGGAATTAATGCATTAGAGAGTATGTAAGGATAGCACCTGGTATGGAAAAGATGGTAGA AATTCGTCTTTACGTGATTTAGCAATGGAGGAGAAACCCACTTGAGTCCATAGAAATAAGAGTAGATCATAAAGGTTATGGAATCTACAGAAAAGCTACT GGTGAAACCATTAAAAAAGGAATAGGACTAATGGCCTTTCCAAAAACACGATTTACGATAGAATCCTTTTATCCGACCCAGCCTAGTGGGAAAAGATTTT GTTGACATATATTGAGAAGTAGCATTTATGTTTTCCTCTTGTTTCCATCCTTCTATGAGATACAGATTGACATCTTGCTCTGATCCCCTCGTCAACTCTC CTAGGCCAATGCAATTGGAAGTTGAAAGATGGAAATCTTAATTAGAAGCTTCTGGTGTTTCGATGACTGGCGATTTCTTTCAAAGTTTAGACGTTTTTAG CCATGCATTACGTACATGTTTACATATTTGCAGTTATTTGTAAGTTGTTAGTTATAGTTGAGTCTAATTGTTATATGAATTTCAGCTTATGGGAGTTGAT GATGAGAGTGTTGATTTTGCCATCACCGGCTATATAAATAAGAAGCCTGTGACTGGAGACAGGAGTTCAGCAAAGAAAAGTGCTAAAAGGAATGACTTCA GAATGCAAGAACCTCAATCAGCACAGAACAAGACATCAAAGTACTCAAAGAGCCGAGGCAGCGGTAAAGGGATGGACAAGAAAGGAAGTGGACAAAAGGG TCCATTAGCTAATCAACCTGTCTCATTTGTATCAAGTGGCTTAATTCATTCAGAAACTGTGCAGATCACAGCTGTTGATACTGAAGAGAGTGATAGCCCT TATAAGAAGAGTGTCACTAGCTCTGCCAATATCGGTTCGTTCGAGGTACACACCACTGGTTTTGGTTCAAAAATGTTGGCTAGAATGGGATACATGGAAG GAGCAGGGTTAGGGAAAAATGGCCAAGGTATGGCAGAACCCATTGAGGTAATAAGAAGGCCTAAATCACTTGGTTTGGGTGTGGAATTCTCCAACACCCC TCCTGAGCCAGCTTCTGAGCCAGCTAGTAGGAACAACTACAAGTCTTCAAGTTCAAGAATTGGTGCTTTTGAAAAACATACCAAAGGCTTTGGATCAAAG ATGATGGCAAAAATGGGTTTTATTGAAGGCACAGGATTAGGTAGAGACTCACAAGGCATTACTGATCCATTAAGTGCTGTTAAGCTACCAAAGTCACGAG GACTAGGTGCCAAACGTTAATTTATGTCATCTGCTTTCTGTTCATAATGTATATTAACTTCAAATAAATCTAATGATTCTCCTTCCTAGTTTAGTTTTAT GGTATCATGACTGTGTAACTGTATTTGTTTATCATTTTCAATGGTAAGAAAAGAAAGTTCAGAAGATTCCTTGTATATGGTTAATTAATTATTTAAATCC AGTGATGTAATACTTTATATACGCCACGTGTTTATAAAGTAATAATCCATTGGTCAACAAATAAAAGGGGTTAGATCTAAACTCTTCCTCCTTTTTCTGT ATAGAACTAGAAGC BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_58364; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_60446
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Zinc finger CCCH-type with G patch domain-containing protein from Drosophila with 55.56% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019463089.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |