| Id Trinity | FTRINITY_DN56234_c5_g1_i2 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_59618 |
| Sequence | GAATTCAAGTATGTGTTCACATTCTTGTTTTATTATATGTGTGAGAATCATGAGATTCAAGTTCCTTAGAGGATTAATTATTTATCAATTATAAGGAAAT TCTAAAATTTGGTATTAATAAGTTTTAAATTTTATGATTCTTCATCATTAGTGTTTCTCCCAATTTTATTTGAACTCTAATGTTAATTTTTTTGGGGATT TTGTGATTCTCTATCATTTTCAGAAATTCATGATCTTCAAATTAAGATTTATGATTTAATATCATCCCTAATTATGAAATTTAGGGATTTATTTTTCTGT TAATTCAAAATATGATATTTGATATTTTTTTCTTGTTAGGTAATGCTTTGGAAATCACTTCAATTATATATTATTTATTTGGCTGCATATAATACAGTAT ATATGCATTACTTCATTTGGGTGTGTTTATATGTATATGTTACACTACTCGTGATTTTTTGTTTATGTATATATACTGCAATACTCAAGATTTTATACAA TCATATTATATGTCCAGCATGAATTGAAAGATTTATTGTCCTACATAAGGGTGACAAATAGATGGGTTTGGATGAATTTGGATTTGAATGAGTTTGTATT TGGATGTTAATGGATGGATGGAAAGTCATTTATCAATCCATATAAATTCATTTAAACTATATTTAAATTACTCAATACATCCGTATCGAATGAATTTCAA TTCATCCATGACTCTGTTTTCATGGATTTGGATGGATGAGTATCCAATCCATTTGATTTTTATTATTGGAACTAAAAATACTATCGAAGAAAATCATTAT TTTAAAAATTACCATCTTAACTACATATTTTTTAAATCACCTTTTAGACTAACACTTCTAAAATCATTTATAAAATACTTTTAAAAATCAATTTTTACAA AAGTGATTTTTTGAACTTTTATAGAAATTTTTTTTTTCAATATTCTACAAGTATATGATGTTTAAGGTTCTATGTGTAAATTTTTTAAGAAATACTTAAC AGTGTGTAATATCTATGCAATGTGAGTGTAAAGATTTATACATAATTATTAAATCATCGATCATTCATTTGGATTACTTTATTTGAAGAGTCAACTATAT TAAATATAAATGGTGGATGCTGCAATGATAATTTATAAAACTCAGATATTCTCAGTGCATACATTTTTCTCATATTTATATATGTTAAGTTAATATTAAC AACATACACATATCATATAATTGATATCAATTTAATAAATATTAAAAGTGAGAGTGAGAATCATAGATACACTTGCTTGAATTTAGTTTTCTTAATATTA AATGAAATTCCAAAGAAAAGAAAATCATTTTTGAATTTGGTTTTCTTAATATTCGTGGATATCTACTAGATATAATAGATGGATTTGAATCCATCTATTA TAATATTATCCATTGGATTATATCCATTTAAATCCATTAGTTCTAATGGATGAATTTAAATGAATTTAATTTGGATGAACTATAGATTGTGGATAATTTT GTCACATCCAGTCCCATGTACCAAAAGCATACTTAGAACACATGTATGGTCTCATACATATTATATTTATATTCATAAATATATAAGCATTGTATTATAT ATATATATATTGCGACAGTTTCCAATTTATATACGCATTGTTGTATAATACATGCTTGCACAACTTGCAATCTATTTATTTATTTTTCCATAAATATATG TATGTATATGTTGTACAATATTATGCATATGTGATGTGCAAGAGTTTACATGAGCTATTTCATGTTAATGGGTATGAAATATACTGATTATACTTGATAT ATCGCCCTGTGTCATTGTATTATGCCACTGAGTATAGTAAATATGTTTTAATATGTATTTGGAATTATATTGTAATGTTAGATTTGTCATAAGTGAGCTA TATAGATAAAATCTTAGATAGTTTTAGCATGAAAGATAGTAAACCAAGAGATGCCTCTATAGTTAAGGTTGAAAAGTTTAGTCTGGAATAGTGCTAAAAA ATGACCTTGAAAGATATGAGATACAAAAAGTTCCTTGTGCATCTATAATTGGAAGTCTAATGTATGCTAAAGTTTGCATATGTCCCGACATAGTGTTTGT CGTGAGAGTTTTGGAAAGATATTTGAGTGATCCTGGAATCATCTCTTGAAGTCGGTTAAAAGTGTTATGCGTTACTTGAAGAGAACAAAGGAGTACATGC TTACTTATCAGATGTCTGGGAGTTTTTAGATCATTGTGTATCCTGACTCCAATTTTGTTAGATGTCAAGACAACACACCCTCCACATATGGATATGTGTT GGTGGAAAGTACTATTTTTTGAAAGTCTCCCAAACAGACACTCATACCTCCTTCAACTAAGATATTAGACCATGGCATATGGTTATAGAATTTTGTCATT GACTTATGTGTGATCGATGGCACTGAAAGACCATTAAAAGTTTCTTGTGACAAGAAGTTCATTGTTCATTACTCTAACAATAATAAGAGTTCTACAAAGT CAATTTATTGACATGAAAATTCTATTTGTTAAAAAAATTATTCAAAATAGAGAAATTTCCACAAAACATGTAGGGACAAATTTTATGCTAGAAGATCCAC TCACTAAACATTTGATACATAAAGTCTTTCATGAGCACATTGCTCGAATGCGTATTGTTCCTTAAGATACTGCAGTTTCGTGGGAGTCTATATGTTTTAT GGATTACTTTTGATGTCATATATAGTTTTATGCATCATAAAGTTGATAGTTTATTGTTTTATTGTAAACTTTATTCGTGTGTTTTTGTTTGTATTGTGTT ACAATTAAAGATTTTGGACTGATCTCACTAAAGACTAAAGTGAAAGCAGTTGAAAATAGACATGTTTAAGATTTCATTGCGTGAAATTTCCATGTCTAAC AAATAAAAATTGTAGTACTAGGAAGTGACTCCTAGGTTGGTTCCCAAGGATTATATCACAAGCAAAGGTTCAAACGTCTTATACACATGCACACAGGGGA TTTGTTGTATGATATGAACAAAGCAAATGCAAAACAATAATTAAGCAATATAGTATAATAACTAAATTATTTTTGTTCAATTGTTCACAACTCAATCCTC GATTTCAATAGATCAAATTAAGATTCTAACTATTGACTTCCTAATTTTTCGAGAATTAATTAACTAAGAAAAATCAGCATGAGCATGAAACATTTAACAA ATTTACACAGACTAAATGTTCATGCACTAGTGAATTAATTATCTGAGCGAAAATAATTCACAGACCTATTTCTTAATGATGGAATTAAACAAACCATAAT TAGAAATAGGATAGAAGAAATGAAGAGAAAAGAAACATAAAATAGCCTTCCATGGAAGGAAGAAGCTAAACCGAAAAGAAGAAGAAAACCGTAGCAAAGC AAAAAGATAAAATGAAACTAAACTAAAATGTAAACGAAACTAAACTAAAATGTAAATGAAACTAAACTAAAATGTAATGTATGAAATGGGATGTTCTAGA ATCCGAATTCCCTAAGCTTCAGAATAAGTAAAACCGAAAATGGGCTTAAAACAATGGCCCAAAAACCAAGATGAAATTACAAATAAAACACCTAAAGTAA AATATAGTCTTCACTTTAGCACACATCTTCCACTTCTATAATACCCAAAATACCCTTGTTGTCAAATATGAGGTTGAAATGATAATAGATTTAATTACCC TAAATAATCCCAAATTAACTCATTTTAGGAATAATAGTCTAATAAAGTTTAAAACACTAAACCATGTCAAACAAAGTCAATTAGGCATCAAGAGTCATCA ATAATAGTAAAATAAGGTTGTGAATAGTGGGAAATATATTCTCATCAATGTCACTCATACATATTTCATCTATGCTAATTAGTATATTAATATGATGATC CTCATGGTCGAGTCACACTTTATTGTGATGAAGGTTGTGGTGGTTCCATGGTTGATATATAAGATGAACCATATTATATTAAGGAGAAGTTTAAATTTAA ATAGCCTATAGAAGCGCGCCTAAAGAATATATTATATAATAGTTTCAGGAAAATATGAAATCCAAGTAGGAGATTGCTAGAAATTTATAATTTATAATTA ATATGAGTATCATATATTTAATACAATTACATCATCTATTTATTTAAGAGGTTACAAAACAAGTGATCTAATTTTGAAAACCAGTAGGATTTCTAAAAAT GACTATTTATTTGGCATGATATTCTTTGTTTGTAATTTGTATCATATTTATGTTAATAATACAAATTTCTAGTATTAATTGTGTGTGAGCTATTGAG BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_58439; |
| Additional information | - |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_59618
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 from Nicotiana with 51.16% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_017437985.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |