Ll_transcript_60936

• Id Trinity: FTRINITY_DN56286_c5_g1_i11
• Name Transcript: Ll_transcript_60936
• Sequence: TGTTAGTATTTTTGTTCTAGGTGTCTTAAGTACTTTATTCTTACTATCAGAACACCTTATGACTGCCGGTTATTAATTTTTTTTATCGGCAGCCGTGAAT ATGTTAGTATTTTTGTTCTAGGTGCCTTAAGTCCTTTATTCTTACTATCAGAACATCTTATAACTGCCGGTTATTAATGTTTTTTTATCGGCAGTCGTTA ATATTTAGCATTTTTGTTTTACGTGCCTTAAGCATTTTATTCTTACTATCAAACCATCTTATGACTGCCGGTTATTAATGTTTTTTATCGGCAGTTGTGA ATATGTTAGTATGTTTGTTCTAGGTGCCTTAAGTCCTTTATTCTTACTATCAGAACATCTTATGACTGCTGGTTATTAATGTTTTTTTATCGGCAGTCGT TAATATTTAGCATTTTTGTTTTACGTGCCTTAAGCATTTTATTCTTACTATCGGAACATCTTATGACTGCCGATTATTAATGTTTTTTTTATAAGTTTTG TTAATATCTCGAATTTTATATTTTTTTTGTTAATTAGAATTGTTTAGTGATTTCGCATTTGGAGACAATGCCTTATGAATTTTTATATCAATAAGTGTAG TTGTTGGAGTAGTGTCAGACCCGACCCGGCGCAATGATAAGGTTGTTGCTTAGTGATCAGTTCAAACAACTGTCTCTTCGAGCAATACATCTATGCTCTC TATATCTCACTAGGTGGGACCTTGAGTACTGGGCAGCTCTGTTACGCATACTTGTTGCATGAGGGTGAGCCTCGGCGCGATGGTAAGGTTGCTTAGTGAC CAATAGGTACGAGTTCAAATCCTATGAACCGCCTCTCCGCGCTTGTGATACATCTATGCTCTCCATATCTCACTAGGTGGGACCTTGTGAACTAGGCAGC TATTTTAAGTGTAGTGTTGCCCACCAAATGTTTGAAGTTGAAGTGACATAATATAACCGGTGCCTGCTTACGGAATTTTCTTTACCTTTGTTGATGTTTA TAAGTTGATTGCTTTGAATCTCTGATCTTTCTTGAGGTTTATAAGTTGATTCCAGGGTAATAGGGGGTGTCACTGTAAGCTGCAAACAAAAAACGGTATA TGTGTAGTTTGGATAAATATTCGGGGAGTGAGTGTAATTTTTGTATTTCGTTTCGAAATAGTTGTTGGAATATTCTTCTGGTGAATTATGAATTGTGAAT AGTGGGAAAAATAGTTGGTGTAATGTCTAAGTATAATTGAAGTATGCAGTGAAATCACTCACGGCACAATGAATTGTATATTGAGTTTTGGATTAAGTAA ACATATTGCAGTAGGAGCAAGATCCTAGGAAATGGAGAGATGCAATTCGGATAATCCCATTTCGAGATTGGTCAATCTCAATGCATCTATAAATGAATAT TTCTCAATAATGTAAAAGTTGACCAATCCCTGAATGGGACTAACCGAATTGAATCCTCCATCTCAGTATGTAGGATAACTAAGTATCCATAGTCTAGAAA CTAATGGCAATTAGGTTCCAGAGATATGGAAAAATACATAAATAGAAGAAAGAAATAGAATTCGGAGAAGTAAAGAAGAGTACAGACACATGAAGTTATT TTTTGATCACTAAGCCATGCTTCTTATTAGAGTAATTAGGCCTCACACCTTAACTCCACTCCAAAAGCTATCTCATAGAGGGAGGATTTCCCGAATTATT ATAAATGTTTCTTGGTTCGTATGCTCAACCTACAATGGATTTCATTGCTTTAACACTAGTCCTAGAAAACATTATTTATGCTTGGAAAATTGTTACTTTG AAGGCCTGTTTTGTAGATTTAGAGGTACCAGAGAGTTCTACTTTTTAATGGTTTAGTTGCGGACTTATTTTTGTATTTTGCTTTATCATTAGTTTGTTGA AGAATTTTTTTTATCTTCGTTCGGTTTTGTATTCTTCTTTTATCAAAAGGGTATTGCAACAATGAATTTTTCCTGTGCATGATTCTTGTGTAGTGCAGGT CATGACAAGTTCAATTTTTTCAAAGGGTCTGCCAACATTGCATAGTAGTAGATATCATATCCACCACCAAAGCAGCTCCGTAGTTGAGGATGAACTTGAT CCATTTTCACTGGTTGCTGATGAACTATCACTTGTCAGTAACAAGCTGCGAGCAATGGTAGTCGCTGAGGTTCCTAAGCTTGCTTCAGCTGCTGAATATT TCTTCAAAATGGGGGTGGAAGGAAAAAGATTTCGTCCTACAGTTTTATTGTTAATGTCAACTGCACTAAATCTACCAATACCCAATGCTTCTCCTCCTAT TGAGCTAGACGATACTTTGGCTACTGATCTACGTTCAAGACAACAATGCATAGCTGAAATAACAGAGATGATCCATAGTTGGTTACAGCTGTCTATTATA GACAATATATGTGCATACAAAGCTAAGCCCACTCTAGTAGTGTAGCCGTACAGGGTCTATCCAAAATAGCTACTAAGGTGGCAAGCCTTCTTCATGATGA TGTATTGGATGATGCAGATACGAGGCGTGGTATTGGTTCCTTAAATGTTGTAATGGGAAATAAGTTGTCAGTATTGGCTGGAGATTTTTTGCTTTCTCGG GCTTGTGTTGCCCTAGCCTCTTTGAAAAACACAGAGGTTGTATCTTTGTTGGCAAAAGTCGTAGAGCATCTTGTAACAGGAGAGACCATGCAAATGACTA CAACATCTGATCAACGGTGTAGCATGGATTATTATATGCAAAAGACATACTACAAGACTGCCTCCTTAATATCAAATAGTTGCAAGGCAATAGCCATCCT TGCAGGGCAAACAGGAGAAGTAGCTATGCTTGCTTTTGATTATGGAAAAAATCTGGGAGCATCAATTTGCCAATGAGAAATTGATGATGCGGACGAGGGA CAAGCTTAATGTCGTGACCCGATTTTCAATGTATCATCATTGGTTACATGACTTGGAGGAGGGAAAAAGGAAATTGGAATGATTCGACCATCTTCCAAAT AATTTGGAGTAGCCACTACATTTTTGCAAGCAAAATATGGAAAACACTCATTATGCCCAATTTTGGATAATATGGTCATCGAATTAGAGTTGAGTTCAGG ACGATCACGGATCAGGGAAGACACTAACCCCCTATATGTATGTATTAAAGTGATACCCTTGCTATTTATTATTAAAACAAAATAGTATACTTTTTTATTA GGGTGTCTAATAAGAGGTTATCATGCTCCCAACCTCCTACGTGTCCTTAGGTGCAATAGGAAAATCAAGACTATATAGTTCCGGGTAGAAAATTGTTGAT GGGTTGATTTAGTTTTAATTAATTGAGCTTGAAAGAAAAGAAGCTGCCCTCCCTAATTTGGGTGATGGTAGATGCAGAACTAATGATCACGAGTTCACGA CTACTCCTCAATCTGAATAGGAAGGAAAAAGATGGTATTAGTTGTAGCCGTTCTTTTAATTCTATTGGTTGGTGGTATGGGAAAATAGAATGGGTTGGTG TTTCACCAGTCAGTCCTATTTTCCCAGAACACCAACCAATACATACCAAGCCCTAAACACAAGCCAGATTCGGTGTTACCCAGCTCAGGAGAAGAAAGCA TTACATTTTGATCCCATCCTGATGTGTTATGTTGATCTCATTGCTTGTCCCCAAAGACAAGGAGACAAATCCCACCGAATCACCTGGACCTTGATTTCGA TCTCATCATATCCTGTGCTCACCACTCTGGAGTCATTGGGCACTCTGTAGAGAATTGTTGAGCCCTAAAGCATAAAATGCAGAGCCTCATAGATCTTAAA TGGCTTCACTTCAAACAAACTGCACCAAATGTTCGCAGAAACTCAATACCCGATCATTGAAATGAGGGAGTCATATTTCAGAAGCCTGCATTCATTGTGG CTGCCTCTTTACGTCATTACAGCAACCATCCTTCATTGTTCTTTCTGTTATTTTTGGGTGCACTTGCATGTGACAACCTAAAGCTTGAGAAGCTTTAGCT TGAAGGGGGTGTTGGAAATAACAATAATTAAGTCTCAGTTCATGTACATGTAGGTTATTGTACCTAGGTAGTATTATTTGCATTTATTACTTCAGGAATA TAATATCGACATGCAGTGTGCAAAATGCAGTGAAGCAATTCATGAAACTTTTCTCTATTCTCGCCTTTCCTTTTTTCTATCTAAAACCCTTCAATTAAAC AATTCATCTTACAAGATTTTAGTTGATCTGTCTACCTGTCTGTGTATGTTAATTATGTTTCTGTTTTTGAAATTTTATGGATGGGATAAATTAATTCCCT CTCCACTGTTTTGCAGGGTTTAGCATTTCAACTGATAGATGACGTGCTTGATTTCACCGGCACATCGGCTTCACTTGGAAAGGGTTCTTTATCAGACATT CGCCATGGAATTGTAACAGCTCCAATGTTGTTTGCCATGGAGGAGTTCCCTCAGTTGCGTGCGATTGTAGAGGAAGGCTTTGAAAATCCGCAGAATATTG ATCTTGTAAGTTAATGTGATGTTCTTTGCTGCATGTACTCTACATAATTAGCTTTTATGCCACTAAACAAGAGAAACTACTACTATGGCATCTCAGGATT CAGTGATTCTGCCATTTAAGAGGTTGAAATTAGTTTGATATGATCATTGACATAGTATGAGCCTCATTTTCCACTTTTTTTTAAGTGCTTCGTCGATGAT CGAATCGAATCGAAGCACTCCGCATAACTTAATAGAAAGTAATGTAAAATTAAAATTTCTCTGTTTTCATTGACACCAACATTTTTTATTTGCTTGGCTT CTTCAACAATTGTTAAGTTTGATAATCCAAACCTAATTATGCAGAATTCAAATATATATTGCTTGAGTAGCTCAAGTTCTGGTTTGTCAATTAAGCTGTT TAACATGATTTGTTGCTGTTGATATTATATTCATTTCATTCATCTTTTAAAGTTATTCTTGTCAGAACCTTTCTGATGCCTTAGCTTAACAAAACACAAT GAGTTCATTTGATCCATAAAGGCCCTTGTAAGAAAAAACTTCAGTGGTGGTTGCCATTGCTATATTTTGAAGTCAATTTTAGGGTGCACCTCACTTTTAA GGCCAGGAATGCAAATATCCGGGGCACTAGGGTCGTATCGGTCCTTTGGAAAACTAAACATCGTTATATAAAATTACCATATACCATACGAGGGTGAGTT TCGGTACAACAATAAGGTTGTTTGTCTTGAGGATCACATCTTCTGTCCCACAATGTGTGCCGCTTTATGTGTCATAAGAGCTATGGTTGGTTGAAAAGAA TGTATTGAAATTAAAATTTTAATTATTAAGTATTTTTCTGATCAATCACAACTCATGG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_58859;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_60936

FPKM

• FPAB: 0.2
• FPNAB: 0.1
• LF1: 0
• LF2: 0.1
• LF3: 0
• LF4: 0.1
• UF1: 0
• UF2: 0
• UF3: 0.2
• UF4: 0.1

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_60936

• Blastp: Solanesyl diphosphate synthase 3, chloroplastic/mitochondrial from Arabidopsis with 58.27% of identity
• Blastx: Solanesyl diphosphate synthase 3, chloroplastic/mitochondrial from Arabidopsis with 83.46% of identity
• Eggnog: synthase(COG0142)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G34630)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019422348.1)
• Pfam: Polyprenyl synthetase (PF00348.16)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;