Ll_transcript_60941

• Id Trinity: FTRINITY_DN56286_c5_g1_i16
• Name Transcript: Ll_transcript_60941
• Sequence: TGTTAGTATTTTTGTTCTAGGTGTCTTAAGTACTTTATTCTTACTATCAGAACACCTTATGACTGCCGGTTATTAATTTTTTTTATCGGCAGCCGTGAAT ATGTTAGTATTTTTGTTCTAGGTGTCTTAAGTACTTTATTCTTACTATCAGAACACCTTATGACTGCCGGTTATTAATGTTTTTTATCGGCAGCCGTGAA TATGTTAGTATTTTTGTTCTAGGTGCCTTAAGTCCTTTATTCTTACTATCAGAACATCTTATAACTGCCGGTTATTAATGTTTTTTTATCGGCAGTCGTT AATATTTAGCATTTTTGTTTTACGTGCCTTAAGCATTTTATTCTTACTATCAAACCATCTTATGACTGCCGGTTATTAATGTTTTTTATCGGCAGTTGTG AATATGTTAGTATGTTTGTTCTAGGTGCCTTAAGTCCTTTATTCTTACTATCAGAACATCTTATGACTGCTGGTTATTAATGTTTTTTTATCGGCAGTCG TTAATATTTAGCATTTTTGTTTTACGTGCCTTAAGCATTTTATTCTTACTATCGGAACATCTTATGACTGCCGATTATTAATGTTTTTTTTATAAGTTTT GTTAATATCTCGAATTTTATATTTTTTTTGTTAATTAGAATTGTTTAGTGATTTCGCATTTGGAGACAATGCCTTATGAATTTTTATATCAATAAGTGTA GTTGTTGGAGTAGTGTCAGACCCGACCCGGCGCAATGATAAGGTTGTTGCTTAGTGATCAGTTCAAACAACTGTCTCTTCGAGCAATACATCTATGCTCT CTATATCTCACTAGGTGGGACCTTGAGTACTGGGCAGCTCTGTTACGCATACTTGTTGCATGAGGGTGAGCCTCGGCGCGATGGTAAGGTTGCTTAGTGA CCAATAGGTACGAGTTCAAATCCTATGAACCGCCTCTCCGCGCTTGTGATACATCTATGCTCTCCATATCTCACTAGGTGGGACCTTGTGAACTAGGCAG CTATTTTAAGTGTAGTGTTGCCCACCAAATGTTTGAAGTTGAAGTGACATAATATAACCGGTGCCTGCTTACGGAATTTTCTTTACCTTTGTTGATGTTT ATAAGTTGATTGCTTTGAATCTCTGATCTTTCTTGAGGTTTATAAGTTGATTCCAGGGTAATAGGGGGTGTCACTGTAAGCTGCAAACAAAAAACGGTAT ATGTGTAGTTTGGATAAATATTCGGGGAGTGAGTGTAATTTTTGTATTTCGTTTCGAAATAGTTGTTGGAATATTCTTCTGGTGAATTATGAATTGTGAA TAGTGGGAAAAATAGTTGGTGTAATGTCTAAGTATAATTGAAGTATGCAGTGAAATCACTCACGGCACAATGAATTGTATATTGAGTTTTGGATTAAGTA AACATATTGCAGTAGGAGCAAGATCCTAGGAAATGGAGAGATGCAATTCGGATAATCCCATTTCGAGATTGGTCAATCTCAATGCATCTATAAATGAATA TTTCTCAATAATGTAAAAGTTGACCAATCCCTGAATGGGACTAACCGAATTGAATCCTCCATCTCAGTATGTAGGATAACTAAGTATCCATAGTCTAGAA ACTAATGGCAATTAGGTTCCAGAGATATGGAAAAATACATAAATAGAAGAAAGAAATAGAATTCGGAGAAGTAAAGAAGAGTACAGACACATGAAGTTAT TTTTTGATCACTAAGCCATGCTTCTTATTAGAGTAATTAGGCCTCACACCTTAACTCCACTCCAAAAGCTATCTCATAGAGGGAGGATTTCCCGAATTAT TATAAATGTTTCTTGGTTCGTATGCTCAACCTACAATGGATTTCATTGCTTTAACACTAGTCCTAGAAAACATTATTTATGCTTGGAAAATTGTTACTTT GAAGGCCTGTTTTGTAGATTTAGAGGTACCAGAGAGTTCTACTTTTTAATGGTTTAGTTGCGGACTTATTTTTGTATTTTGCTTTATCATTAGTTTGTTG AAGAATTTTTTTTATCTTCGTTCGGTTTTGTATTCTTCTTTTATCAAAAGGGTATTGCAACAATGAATTTTTCCTGTGCATGATTCTTGTGTAGTGCAGG TCATGACAAGTTCAATTTTTTCAAAGGGTCTGCCAACATTGCATAGTAGTAGATATCATATCCACCACCAAAGCAGCTCCGTAGTTGAGGATGAACTTGA TCCATTTTCACTGGTTGCTGATGAACTATCACTTGTCAGTAACAAGCTGCGAGCAATGGTAGTCGCTGAGGTTCCTAAGCTTGCTTCAGCTGCTGAATAT TTCTTCAAAATGGGGGTGGAAGGAAAAAGATTTCGTCCTACAGTTTTATTGTTAATGTCAACTGCACTAAATCTACCAATACCCAATGCTTCTCCTCCTA TTGAGCTAGACGATACTTTGGCTACTGATCTACGTTCAAGACAACAATGCATAGCTGAAATAACAGAGATGATCCATAGTTGGTTACAGCTGTCTATTAT AGACAATATATGTGCATACAAAGCTAAGCCCACTCTAGTAGTGTAGCCGTACAGGGTCTATCCAAAATAGCTACTAAGGTGGCAAGCCTTCTTCATGATG ATGTATTGGATGATGCAGATACGAGGCGTGGTATTGGTTCCTTAAATGTTGTAATGGGAAATAAGTTGTCAGTATTGGCTGGAGATTTTTTGCTTTCTCG GGCTTGTGTTGCCCTAGCCTCTTTGAAAAACACAGAGGTTGTATCTTTGTTGGCAAAAGTCGTAGAGCATCTTGTAACAGGAGAGACCATGCAAATGACT ACAACATCTGATCAACGGTGTAGCATGGATTATTATATGCAAAAGACATACTACAAGACTGCCTCCTTAATATCAAATAGTTGCAAGGCAATAGCCATCC TTGCAGGGCAAACAGGAGAAGTAGCTATGCTTGCTTTTGATTATGGAAAAAATCTGGGAGCATCAATTTGCCAATGAGAAATTGATGATGCGGACGAGGG ACAAGCTTAATGTCGTGACCCGATTTTCAATGTATCATCATTGGTTACATGACTTGGAGGAGGGAAAAAGGAAATTGGAATGATTCGACCATCTTCCAAA TAATTTGGAGTAGCCACTACATTTTTGCAAGCAAAATATGGAAAACACTCATTATGCCCAATTTTGGATAATATGGTCATCGAATTAGAGTTGAGTTCAG GACGATCACGGATCAGGGAAGACACTAACCCCCTATATGTATGTATTAAAGTGATACCCTTGCTATTTATTATTAAAACAAAATAGTATACTTTTTTATT AGGGTGTCTAATAAGAGGTTATCATGCTCCCAACCTCCTACGTGTCCTTAGGTGCAATAGGAAAATCAAGACTATATAGTTCCGGGTAGAAAATTGTTGA TGGGTTGATTTAGTTTTAATTAATTGAGCTTGAAAGAAAAGAAGCTGCCCTCCCTAATTTGGGTGATGGTAGATGCAGAACTAATGATCACGAGTTCACG ACTACTCCTCAATCTGAATAGGAAGGAAAAAGATGGTATTAGTTGTAGCCGTTCTTTTAATTCTATTGGTTGGTGGTATGGGAAAATAGAATGGGTTGGT GTTTCACCAGTCAGTCCTATTTTCCCAGAACACCAACCAATACATACCAAGCCCTAAACACAAGCCAGATTCGGTGTTACCCAGCTCAGGAGAAGAAAGC ATTACATTTTGATCCCATCCTGATGTGTTATGTTGATCTCATTGCTTGTCCCCAAAGACAAGGAGACAAATCCCACCGAATCACCTGGACCTTGATTTCG ATCTCATCATATCCTGTGCTCACCACTCTGGAGTCATTGGGCACTCTGTAGAGAATTGTTGAGCCCTAAAGCATAAAATGCAGAGCCTCATAGATCTTAA ATGGCTTCACTTCAAACAAACTGCACCAAATGTTCGCAGAAACTCAATACCCGATCATTGAAATGAGGGAGTCATATTTCAGAAGCCTGCATTCATTGTG GCTGCCTCTTTACGTCATTACAGCAACCATCCTTCATTGTTCTTTCTGTTATTTTTGGGTGCACTTGCATGTGACAACCTAAAGCTTGAGAAGCTTTAGC TTGAAGGGGGTGTTGGAAATAACAATAATTAAGTCTCAGTTCATGTACATGTAGGTTATTGTACCTAGGTAGTATTATTTGCATTTATTACTTCAGGAAT ATAATATCGACATGCAGTGTGCAAAATGCAGTGAAGCAATTCATGAAACTTTTCTCTATTCTCGCCTTTCCTTTTTTCTATCTAAAACCCTTCAATTAAA CAATTCATCTTACAAGATTTTAGTTGATCTGTCTACCTGTCTGTGTATGTTAATTATGTTTCTGTTTTTGAAATTTTATGGATGGGATAAATTAATTCCC TCTCCACTGTTTTGCAGGGTTTAGCATTTCAACTGATAGATGACGTGCTTGATTTCACCGGCACATCGGCTTCACTTGGAAAGGGTTCTTTATCAGACAT TCGCCATGGAATTGTAACAGCTCCAATGTTGTTTGCCATGGAGGAGTTCCCTCAGTTGCGTGCGATTGTAGAGGAAGGCTTTGAAAATCCGCAGAATATT GATCTTACTTTGGAGTATCTTGGCAAGAGCCTAGGCATACAGAGGACCAAGGAGCTTGCAGTGAAGCATGCTAACCTAGCAGCAGCAGCAATTGATTCCT TACCTCAAAATGATAATGAAGAAGTGAAAAAATCAAGAAGAGCCCTAATAGATCTTACTCAAAGAGTCATTACAAGAACAAAGTGAAAATGAAGCCTAAT TTTTTATTTGTTTTAACTAAAAGGAGCTTCATAGTTAATTAAAAACTGGTTTTTGTCATTATTCATTTTTTTCCCATAATTGTTCCTTGAAGCCCAAAGT TGTGGTGGAAATAAGCTTTTTGTAGAATCAATGTGCTTGTTTGTGTTTCTTGATTATTTTTACTTCCTTCTTATGTTGTAAAAATTGATTCGTGCATGCC ATTTCAACCATTGAACCGGTCCCAATATTAATAGGGTACAATAATTGTATTGGTCATATAATTATACTGGTCAAAATTAGTCATACTGGTTGGTTTTCAA TGAATTGTACTGGTCACAGCAGATAATTTTGAATATTAACTTTTTAATAAAAATAAAAATATTGGTTTTTTA
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_58859;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_60941

FPKM

• FPAB: 1.5
• FPNAB: 0.2
• LF1: 0.2
• LF2: 0.2
• LF3: 0.4
• LF4: 0.2
• UF1: 0.3
• UF2: 0.3
• UF3: 0.6
• UF4: 0.7

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_60941

• Blastp: Solanesyl diphosphate synthase 3, chloroplastic/mitochondrial from Arabidopsis with 58.27% of identity
• Blastx: Solanesyl diphosphate synthase 3, chloroplastic/mitochondrial from Arabidopsis with 83.46% of identity
• Eggnog: synthase(COG0142)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G34630)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019422348.1)
• Pfam: Polyprenyl synthetase (PF00348.16)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;