Ll_transcript_219168

Id TrinityFTRINITY_DN56304_c1_g1_i1
Name TranscriptLl_transcript_219168
SequenceTAGATGGGGAGTTATTAAGAATTTTTTTTTTTTTTTGCTTTTTATGTTTAAAGTTTGTATTTTTATGTGATTAATATGGTTATGTTGTTTCTGATTTTGA TAGTTTGCACTGATTTGGTTCGTGGTGCAAAGGATAAGCATCTCAGAGTTAAGGGACCTGTGAGGATTCCAACGAAAGTTCTCAATATCACTACAAGGAA AACCCCTTGTGGAGAAGGTCTTTTTATTTTCCTTAAATTTTTAATCTTTGTTTGTTGTTGTTATGTGGTTGTTTGATTCTAATATGAAATGTTATGTTTT TAATGTTGAAATTCAAGTGGACATATTTTTTGTGGTTATCTTTGTTTTATTTGCAAATTGTAGTTTGTGTCGCGAAAAATTTGATTTGGTTTTATTTGAC TGGTAACATGTTTGCTGCTTTTAGAGATGCTAATTGATAAAGGAAGAGTTTAGGTTATTGATTTAGTTTTGCTAAGATTTGTTGATTATGTGTTGTAATT TCAATTCTAAATGTCAATGGGGTGATGCTATTGATGCGATTAGATACCGTTTGACGCATAGATGGTGAGAGGGAAAATAATGGAATATAGTTCTAGTTTT CTTTGATTTCACTATTTTAGCGGAATCCAAATGTGCCACTTTTTAACTCGTGTTATGTCATTTTTTATTTATAAAATGTATTGAACATTGAACACACCAT ATATGTTCTGTACTTCTGTTCATTGTTACCAAATACATGGTGCATGTACGCGATTCGTTTAGTATGTGGTATGCCACTATTTACATTATTATTGTTATGA CATGACTTTCTTTAAGATGAAGCATGTACATGATACATGGAGTTTGGTACATGATATGTACGGTTAATGAGAGAATATGATAATTATGGTTCTGTTGTGT CCTGTTCAAATACCTCAACCTAATGGTACCTTAATTGTTGATTGCCTCTCACTAATCAATTGTAATTTTGTAAACTAAAAATAATTTAAACATGGTTGGG GTCATGAGTGTTGATAGCAATTTAGAGTTCCAATAGAATCATTACCCGTCAATATGTATTTCCGAATTGTTTCATTTTACATGGCTGATTTTGTTTCTTT TGTTCCGATCCTGCTTATTATTTCAGGTACCAACACATGGGACAGGTTTGAGTTGCGTGTGCACAAGCGTGTCATCGACCTCTACAGTTCCCCCGAAGTG GTCAAGCAGATTACCTCAATCACAATTGAACCTGGTGTCGAGGTTGAGGTGACCATTGCAGATGCTTGATTTCAGTTGCATCCTACTTTGTTTTGTACTT TAGCCTCTCCTTCCCGGGAATATGTTGAGAGTCTAATACATCAGTTAATGCATTTCTTTTTGCTGTTTAATTTTTTAAGTTGATTACTCGTGCACTAGAC TTGATTATCTTTTGTTTATGGTTGAGGATATCATGAGAAATGTCGTGCTTAATATGTTTTAAAATTTTGATTTTTTAATATTTTAAGCTTTGGTTTGAAA TTACTTGATACTGTTATTGTTATTTTCCTTGCAAATCTAATCTCACCTTAGTTTTGTAGAAAATTGGTAAGATGGAGCATATACTACATTGATATTAATT TACTGTTGCAGTAAAAAAATTGTTGATGTTAATTTACTGCTTCATTGCTTGCTATAGTAAACTCTTGCTTATGGACCGAGAGAGGGGGAG BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_58996; 
Additional information-

Expression of Ll_transcript_219168

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_219168

Blastp-
Blastx40S ribosomal protein S20-2 from Arabidopsis with 93.62% of identity
EggnogtRNA binding(COG0051)
KeggLink to kegg annotations (AT3G47370)
CantataDBLink to cantataDB annotations (CNT0001524)
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_007162293.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;