Id Trinity | FTRINITY_DN56358_c5_g1_i11 |
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Name Transcript | Ll_transcript_217560 |
Sequence | CTCCAATAAGTATTGAAAGCGAGAAAATGTGATATAGAGATATAGAAAGGAGTGTTGGTGTGGCTCCAAATTAACCACGAAACTATAACATAATAACAAC AATTTATATTCACTCAATTCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATTCTGCAACACAGTGCATATACCAAAGTGAGACCACTCAGGCTAGGAGCTTCAGG GTTTTGTGTGCCTCTCATCAAACCCCGAAGGTAAATAAATCATTCTCCTCCAACTTCTACTGCACATAATTTTATGTTGATTGTACGTAATTGCAGGGGA ATCAAATGATCATATCCATAACTGGAGCAACAGGTTTTATAGGAAGAAGGTTGGTGCAAAGGCTTCATGCAGGTTATCCATTAGTTCAGCCTATAACTCC CTAGGCCCTTTCACTTTTTGTTTTATGATATGTGCCCTTTTTTTAGTACATTCATATATGGATCCTAAAATCATTGTGTTCTCATGTCCCCAGCCAATCA AATTTGACCAAATAATAATAAAAAATGTTATTTTATGTTTTTGTAAATTTTCTTTTTAATTATGTCACACTCTTCCGTCGGATTGAGACAGGGTATGAGA TAGGTGATCTCTGTCCATTGATATATAGCCTTTTTCTAGCGCTCTCATGTGGATGAGGATCTGTTGTCCCCAATTATGTCTCCAACTATGTACCAAACCA ATCACAATGCAGAAAAAATAAATAAAATGATAAATATTTAATTTTGTAACTGATGTGACATGTTGTTATTGGCTTGGGACAGAGTTCGGGGTTCGGGACA GCAGATCCTTGTCCCCCTCATGTATCTCTAGATTTCAACCTTATTTGTCCAATCCTGGATATCCTGTACTATCAAGGTGCATTCTGGTTGTATTGTCCTC TTATGTTGCAAAATAATTACAAAATATAATTTTGAAGCCTCTTGTGTCAAATAACTGATAAATGGTTGTGTCCTTATGTCATTGCCCTGCATAGTGAATC TGTAGAATCACTGAATTTTGTTAGATCTCTTGCATTCCTCTCTGTATCATTTAAACTCTTTGCTTTTGCTGGTGTAACATTCTCTTCTTAACTAACAATG TTTTGCAGACAATCATAGTGTTCATGTCTTGACCCGTTCTAAATCTAAAGCACAAGAAATCTTTCCGGGTAAGAAGGTAATATATTACAGTAATAATTTG CATTAGTACTCACAGTTAGTAAAAACATATACTGACTACAACTCGTTATCAACTGCAAACTTTTTCCAAAGAACAAAATGACATATCTACTTCACTGAAT AAGGGCAAAGCACCTTAAGAATCATATTTGTCATTGTTGGTTTTAATTCATAAATAATCTGGATTCCTCTGCTAATTATTTTTTACCTTTATCTTCTTTG TAGTAGTGGAAAAACTAATAGTTTTCTGTACAACCGGAGTCAAACTCAGATATATACTATACTTCGGATTAACTGGTTAACTCTGCCTTGGTATTTCCAG TGAAAGACTTTCCAGGAATCAAGATTGCAGGGGAGCCAGAATGGAAAGATAGCATTCAGGGCTCAACCGGGGTTGTGAATTTGGCTGGATTGCCCATAAG TACCAGATGGTCTTCTGAGGTTATTGCCATGCTTTTATCACATCCATTATCTAAATGAATAAATGATTTAAACTTGAGGTTACATCTAGTGGTGGTTATT TAGAGATAATAGCGTAATAGTCATCTTTCTTTTAATATCTTTTTCCTTGTGTCCGTTAGAACTAATTTGAGGTTTTTCTTTGCTTGTTGTTAGTATAAGT CTTTCTTTTCTAGTATAACCTACTGAACAACATTTCTTAGAGCCTAGTACCGGACAATACATATATAACACCAAAAGCATTACATAGATTTTAATGTTGC AGATAAAGAAGGAAATCAAGGAGAGCAGGATTAGAGTGACCTCAAAGGTAAGCATACATCTCCAACGGATAAAATAATAAAAATATCTTTCTTTTTTCAT TTGGCAAAATATATCTTTGCGTCAACTTAAGCAAGAGTTATTTACATGAACCATTTCTTATTCTTCCTCTGACCTATTCATTTCATAGCAAAGGTTGTAG AATTGATAAACAGTTCACCAGATGATACTCAACCTAAAGTTTTTGTTAGTGCAACAGCAGTTGGTTATTATGGTATGCTTTTAAGCCTAGAATGGTTCTT TATTGGTTGATCATCTTCTTGCTTGTTAATTAATGTTGTCATCGATTATTTTCTCCCTTCTTGTGTAATAATACTTATTGTCATTGATTATTACATTCTT CTGCTAGCAAATGTAGTTATTTTTGTAGCATGTATGATTTTGCATCAAAAGTTTGCTTAACATTTTCATTTGATTTTGCTGTGTTCAGGCAGCAGTGAGA CACAAGTTTTTGATGAACAAAGTCCATCGGGAAAGGATTACTTGGCCGAGGTTTGTAGAGAATGGGAATCAACAGCCCTACGAGTAAATGGTGATGCTAG AGTAGCTCTTATTCGTATTGGTGTTGTTCTTGGTAAAGATGGTGGAGCACTAGGTATGAACTACTTAACTACATGCTTCTGGCTGCAAATTTACTATCTA ACATGAAATACTATCTAATCTAGTTAGGGTTTTTATTAATGCATTATTCTTGAAAATCATTATATTGTTTGGTTTGACTGATAATTAATTCCTTGAGCCT CTGCAGCTAAAATGGTACCCCTCTTCATGATGTTTGCTGGTGGTCCTTTAGGCTCTGGAAAACAGTGGTATTTAAACTCAGTCACTTGGCTTGTTATAGT TTGCTTTTTAGTACTGTTAATCTATTATTACCGGCACTCGATTAGTGAAGCAATTTCTCCCCTCTGCCTTGCTTTTTTTCTTTCTAAATTGCAAACAAGT GAACAACTCTGTTTGCTGCTAGGATAACCTGCTATGTTAATTTCTAGGTAGTTGTCAACTTGTCATGATTGCGGGTTTTTTTTTGTACAGGTTCTCTTGG ATTCATTTGGATGACATTGTCAATTTAATATATGAAGCACTATTAAATCCATCTTACAAAGGTGAAACTATTCACTCCCATATTTCCAAATTGAAATCTA TCAAAATTCCAAAAAAAGAATGGCAAAGTGTAGGTGATTGTATTACATTAACCTGCAGCCGCAATTAAACTTTAAATTTTGCTATTTCTTCGTGATTACT GCCATCCAATCAACACTCCAAGACTGTATCATAATGAATTTATTTCCTTTTAGGTGTACAATCAATGGTTATACTTTCTTTTTTCAATGACTATTTGATG AACTTATTGCATTATGAATTTATAATGATTCTTATTTAGGAGTTATAAATGGAACGGCCCCAAATCCTGTCCGATTGTCAGAATTATGTGAGCAACTGGG ATATGTCTTGGGTCGTCCCTCGTGGCTGCCGGTACCAGACTTCGCGCTCAAAGCTGTCCTTGGAGAAGGTGCTTCTGTGGTAAGGAATAATCTTTGCTTA ATTTTCACTGAGTGCATGCATCTTCTATGTGAGTTACTTGAAATGCAGTGGTATTCTCTCTTTGTAGGTCTTAGAAGGGCAGAGAGTGCTTCCTACTCAG GCTAAGAAGTTGGGCTTCCCATTCAAATATTCCTACGTGAAGGATGCCTTAAAAGCAATTCTTTCATGAAGCACTTTTCTTCTTTGGATTATTGCATCAG CTTTTCCCAGACACAAGTGGCATTCACTGTAGACATTTAAAGGTGGTACAGTTATGGTTAATTATGATAATGTATAAATATATGATTCTCTTCTGGCATG TGCCACTTTACTACTAGGTGATATGCCATCACCCATTTCTTCCTTAACATTGCTAAATTGCCACTTCATTATAGAGGCAGCCATATTTGTTCACAGCAAA ACTTTGCATGATTTTATGAGTTCTATTCTAATGACTATAAATATGAAGATTTTTTATATCACTTCACTATAGATGCTAA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_59496; |
Additional information | - |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_217560
Blastp | - |
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Blastx | Epimerase family protein SDR39U1 homolog, chloroplastic from Arabidopsis with 74.24% of identity |
Eggnog | Epimerase(COG1090) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT2G21280) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019450999.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |