| Id Trinity | FTRINITY_DN56358_c5_g1_i12 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_217561 |
| Sequence | CTCCAATAAGTATTGAAAGCGAGAAAATGTGATATAGAGATATAGAAAGGAGTGTTGGTGTGGCTCCAAATTAACCACGAAACTATAACATAATAACAAC AATTTATATTCACTCAATTCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATTCTGCAACACAGTGCATATACCAAAGTGAGACCACTCAGGCTAGGAGCTTCAGG GTTTTGTGTGCCTCTCATCAAACCCCGAAGGTAAATAAATCATTCTCCTCCAACTTCTACTGCACATAATTTTATGTTGATTGTACGTAATTGCAGGGGA ATCAAATGATCATATCCATAACTGGAGCAACAGGTTTTATAGGAAGAAGGTTGGTGCAAAGGCTTCATGCAGGTTATCCATTAGTTCAGCCTATAACTCC CTAGGCCCTTTCACTTTTTGTTTTATGATATGTGCCCTTTTTTTAGTACATTCATATATGGATCCTAAAATCATTGTGTTCTCATGTCCCCAGCCAATCA AATTTGACCAAATAATAATAAAAAATGTTATTTTATGTTTTTGTAAATTTTCTTTTTAATTATGTCACACTCTTCCGTCGGATTGAGACAGGGTATGAGA TAGGTGATCTCTGTCCATTGATATATAGCCTTTTTCTAGCGCTCTCATGTGGATGAGGATCTGTTGTCCCCAATTATGTCTCCAACTATGTACCAAACCA ATCACAATGCAGAAAAAATAAATAAAATGATAAATATTTAATTTTGTAACTGATGTGACATGTTGTTATTGGCTTGGGACAGAGTTCGGGGTTCGGGACA GCAGATCCTTGTCCCCCTCATGTATCTCTAGATTTCAACCTTATTTGTCCAATCCTGGATATCCTGTACTATCAAGGTGCATTCTGGTTGTATTGTCCTC TTATGTTGCAAAATAATTACAAAATATAATTTTGAAGCCTCTTGTGTCAAATAACTGATAAATGGTTGTGTCCTTATGTCATTGCCCTGCATAGTGAATC TGTAGAATCACTGAATTTTGTTAGATCTCTTGCATTCCTCTCTGTATCATTTAAACTCTTTGCTTTTGCTGGTGTAACATTCTCTTCTTAACTAACAATG TTTTGCAGACAATCATAGTGTTCATGTCTTGACCCGTTCTAAATCTAAAGCACAAGAAATCTTTCCGGGTAAGAAGGTAATATATTACAGTAATAATTTG CATTAGTACTCACAGTTAGTAAAAACATATACTGACTACAACTCGTTATCAACTGCAAACTTTTTCCAAAGAACAAAATGACATATCTACTTCACTGAAT AAGGGCAAAGCACCTTAAGAATCATATTTGTCATTGTTGGTTTTAATTCATAAATAATCTGGATTCCTCTGCTAATTATTTTTTACCTTTATCTTCTTTG TAGTAGTGGAAAAACTAATAGTTTTCTGTACAACCGGAGTCAAACTCAGATATATACTATACTTCGGATTAACTGGTTAACTCTGCCTTGGTATTTCCAG TGAAAGACTTTCCAGGAATCAAGATTGCAGGGGAGCCAGAATGGAAAGATAGCATTCAGGGCTCAACCGGGGTTGTGAATTTGGCTGGATTGCCCATAAG TACCAGATGGTCTTCTGAGGTTATTGCCATGCTTTTATCACATCCATTATCTAAATGAATAAATGATTTAAACTTGAGGTTACATCTAGTGGTGGTTATT TAGAGATAATAGCGTAATAGTCATCTTTCTTTTAATATCTTTTTCCTTGTGTCCGTTAGAACTAATTTGAGGTTTTTCTTTGCTTGTTGTTAGTATAAGT CTTTCTTTTCTAGTATAACCTACTGAACAACATTTCTTAGAGCCTAGTACCGGACAATACATATATAACACCAAAAGCATTACATAGATTTTAATGTTGC AGATAAAGAAGGAAATCAAGGAGAGCAGGATTAGAGTGACCTCAAAGGTAAGCATACATCTCCAACGGATAAAATAATAAAAATATCTTTCTTTTTTCAT TTGGCAAAATATATCTTTGCGTCAACTTAAGCAAGAGTTATTTACATGAACCATTTCTTATTCTTCCTCTGACCTATTCATTTCATAGCAAAGGTTGTAG AATTGATAAACAGTTCACCAGATGATACTCAACCTAAAGTTTTTGTTAGTGCAACAGCAGTTGGTTATTATGGTATGCTTTTAAGCCTAGAATGGTTCTT TATTGGTTGATCATCTTCTTGCTTGTTAATTAATGTTGTCATCGATTATTTTCTCCCTTCTTGTGTAATAATACTTATTGTCATTGATTATTACATTCTT CTGCTAGCAAATGTAGTTATTTTTGTAGCATGTATGATTTTGCATCAAAAGTTTGCTTAACATTTTCATTTGATTTTGCTGTGTTCAGGCAGCAGTGAGA CACAAGTTTTTGATGAACAAAGTCCATCGGGAAAGGATTACTTGGCCGAGGTTTGTAGAGAATGGGAATCAACAGCCCTACGAGTAAATGGTGATGCTAG AGTAGCTCTTATTCGTATTGGTGTTGTTCTTGGTAAAGATGGTGGAGCACTAGGTATGAACTACTTAACTACATGCTTCTGGCTGCAAATTTACTATCTA ACATGAAATACTATCTAATCTAGTTAGGGTTTTTATTAATGCATTATTCTTGAAAATCATTATATTGTTTGGTTTGACTGATAATTAATTCCTTGAGCCT CTGCAGCTAAAATGGTACCCCTCTTCATGATGTTTGCTGGTGGTCCTTTAGGCTCTGGAAAACAGTGGTATTTAAACTCAGTCACTTGGCTTGTTATAGT TTGCTTTTTAGTACTGTTAATCTATTATTACCGGCACTCGATTAGTGAAGCAATTTCTCCCCTCTGCCTTGCTTTTTTTCTTTCTAAATTGCAAACAAGT GAACAACTCTGTTTGCTGCTAGGATAACCTGCTATGTTAATTTCTAGGTAGTTGTCAACTTGTCATGATTGCGGGTTTTTTTTTGTACAGGTTCTCTTGG ATTCATTTGGATGACATTGTCAATTTAATATATGAAGCACTATTAAATCCATCTTACAAAGGTGAAACTATTCACTCCCATATTTCCAAATTGAAATCTA TCAAAATTCCAAAAAAAGAATGGCAAAGTGTAGGTGATTGTATTACATTAACCTGCAGCCGCAATTAAACTTTAAATTTTGCTATTTCTTCGTGATTACT GCCATCCAATCAACACTCCAAGACTGTATCATAATGAATTTATTTCCTTTTAGGTGTACAATCAATGGTTATACTTTCTTTTTTCAATGACTATTTGATG AACTTATTGCATTATGAATTTATAATGATTCTTATTTAGGAGTTATAAATGGAACGGCCCCAAATCCTGTCCGATTGTCAGAATTATGTGAGCAACTGGG ATATGTCTTGGGTCGTCCCTCGTGGCTGCCGGTACCAGACTTCGCGCTCAAAGCTGTCCTTGGAGAAGGTGCTTCTGTGGTCTTAGAAGGGCAGAGAGTG CTTCCTACTCAGGCTAAGAAGTTGGGCTTCCCATTCAAATATTCCTACGTGAAGGATGCCTTAAAAGCAATTCTTTCATGAAGCACTTTTCTTCTTTGGA TTATTGCATCAGCTTTTCCCAGACACAAGTGGCATTCACTGTAGACATTTAAAGGTGGTACAGTTATGGTTAATTATGATAATGTATAAATATATGATTC TCTTCTGGCATGTGCCACTTTACTACTAGGTGATATGCCATCACCCATTTCTTCCTTAACATTGCTAAATTGCCACTTCATTATAGAGGCAGCCATATTT GTTCACAGCAAAACTTTGCATGATTTTATGAGTTCTATTCTAATGACTATAAATATGAAGATTTTTTATATCACTTCACTATAGATGCTAA BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_59496; |
| Additional information | - |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_217561
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Epimerase family protein SDR39U1 homolog, chloroplastic from Arabidopsis with 68.52% of identity |
| Eggnog | Epimerase(COG1090) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT2G21280) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019450999.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |