Id Trinity | FTRINITY_DN56366_c0_g2_i14 |
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Name Transcript | Ll_transcript_220100 |
Sequence | GTACTACTACTACTGCTTACTCCCCACCCTTCACTCCTAAATTCCAATATTAAACGTTATTATCTCAATACGATCATAACATTGATGATTAATTAAAGAG AATAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGACGAAGAGTAGAGAAAGTTCGACGGTGCAGTATCAAATCCTTTCCATGGATTCCGTCGTCTTCTCTCTCCTCCTCC ACCACCAAATCCCTTCCTCCCCACGTCATCCTTCCTCTCATTGACACAGAAAAGCACCGATTCTTCTCCATTCTTTATTCCCACTTCTCTTTTATTCACA ATACTGGCTCACATTAAAATTACCCTCTCTTTCCCTTCTTCTTATTCCTATCTCAACGATCCCTTCAATTTCAACTGGAAAACTAAGAAGAAGAGAAAAC TCTTCACAATGTTGTGGCTTATCAGATTCTCTGGGTTTTGTTCCGCTGCGATGCTCCTCATTCTTCTTTCCCCTTCTCTTCAACCTTTCCACCCAGCCCA AGCCACCCGGTCCAACCACCTTCACCGGTTCTCATTCCATCAACCCTCCAAATTCCGCAATGCAGACCAATGCGGTTCAAATAACCGAACCGGGTTTTCA ACAACCACTGTGTGTGACCCTTCCTTGGTACATGTAGCAATAACACTCGATATTGAATACCTACGTGGATCAATCGCGGCCGTTCATTCCATCTTGCAAC ATTCACAGTGCCCTGATAATATCTTCTTCCATTTTTTGCTCACTCAGATGAATCTCGAAACCCTAGTTCGTTCCACGTTCCCGGAATTGAAATTCAAGGC GTATTATTTTCATGCGAAGATTGTTAAGAATCTGATCTCAACCTCTGTGAGACAAGCGCTGGAGCAACCGTTAAACTATGCGAGAAATTATTTGCCAGAT CTTCTGGAAAGTTGTGTTGAAAGAGTGATTTACTTAGATTCTGATTTGGTTGTGGTTGATGATATTGAGAAATTGTGGACTACGAGTTTGGGTGGTTCAA CAATCGGTGCTCCGGAATATTGCCACGCGAACTTCACTAAGTATTTCACGGCGGTGTTCTGGTCGGACCGGCGATTCTCCGAAACGTTTTCAGGGAGGAG GCCGTGTTACTTTAACACCGGAGTGATGGTTATAGATCTAGGGAGATGGAGGAGAGTGAGGTACACGCGCAAGATAGAGAAGTGGATGGAGATTCAGAAG AGTCATCGAATCTATGAGCTTGGTTCTTTGCCACCGTTCCTGCTTGTTTTCGCGGGACACGTGGCGCCAATTGAGCATCGTTGGAATCAGCACGGTTTGG GTGGCGATAATGTTCGAGGGAGCTGCCGTGACCTCCACGCCGGTCCGGTGAGTCTTCTTCACTGGTCCGGTAGTGGAAAGCCGTGGCTCCGGTTAGATTC GAAGCGGCCTTGCCCCCTCGATGCTCTCTGGGCCCCATACGATTTGTACGGACACACTCAATGAGGGGTAGTCGCTGGTAAATTCAATACTCTTGTCACT TCCTTCTGTTTATTTAAATTTAATTACTGCCCAATTTTTATTTCTTTATTATTATTTTGTTCCCTCTATTCTCCTTTCTATGAAAACATTCATCAGTTTT TCGTAGCTTTGTTATATTTTTTCTCAGGCCATTTTTTCCTGTTGTAGTTGTACTCTGTTATTCTATTATGTGGTTCTTTCTCTGAAATGCAAAAAGAAAA CCAGCTGGATATTCTGATCGGCAAATGGTATTCCATCCCAAACTGTTTACTTACACTTCTTAGTATGAACTAACCAAATATAATTTTTATTTCACCTAAT CATGATTAGTTAACTATTAGTTGTATGAAGAGGTGATTTGAAGTATTCTTGTAATTGATGAATGAACCAAGCTTACTGTAGAATTTGTACTTGCATCAAC ATTAAGAAAAAGCTGCTCTCTTGGATTGAGTTTGAAGATATAAAAACGAGGGCTTTTAGCCTTTCAATAATCCTATTAAATTAAACAAATGCAACTGACA CTCATAACATTATTTAATTAGTAAACTGTTTTTTTCATTAGTGTCAGGTTGGGTTCTTGTTTTATTGTTTGGAATTTTTTACTATTTATTCCATGAATGA AACCGCAAGCGGTGGAGTTCCGATTTAGTAACCTAGAGAGCACTCACAATAGTGGGTTCTTAAATTTTTAAGAAGGTTCATCATGTGTTCTGAGATAAAT AATAGAAGTTCAGCATTAGAATAAATGTTCTAAATTTAAACAAATATAGAACAGTAGTGAAACCAGAACGAAAAATCATTCACGATGGTAAATCATTTTG AGGTTGGTGGGTATTAGCGGTTCCCATGTGAAAAATTTACATTCTACCCTATTCAGTGAAGTTTGTGTTGGGTTGAGAATAGAAGCTAAAACTGTTGTGG TTTCTAGTTATTTTTAATTAATAACGTGATAAGCAGAAACAGGAAGAAACGTGTGTTGCTGGATAGCTTAGTTGTCCACGTCTACAGTGAGAGATATATG ATGAGGCTATTTGCTGGCAGCATTAGTCGATCGATTCAGAAACAATCCAATGAGTTTCATGCATTGCGTTGGAAACTAAGCTTAAACTAACCTAAGGGTA CCAGTGCTTCTGCTGAACATTTGTGAACTATCTTCCTCAACTCTCATTTTTGTCCTTTGTATCCCACCACATGAATAGTTGCCAATTTGTATTTGCTTAT ATCTTCCATTGCCCCTGAACCCATGCTGACACCATTGGATAATTCAATTTTATTCGAGAAAATAATCTCATTTAAAATAATGTGATGGACGCATAGCTAG GAGGTTGAACAATTCAAGTTCAATGGTTATATGTTTTGAAAGCTCATTGATGTCATTGTTACTTGTAAGTGTCTGCTTAATGAGAGGGTGTGGGGACCGA TTCCTATTCACCTCTGAAATTACACGTGCTCCGTTAATTGGATTCTTCTTTATTGTTTGGGGCTACATTTGGTAGTTATTTGTTTTTTAATTTATAATTT CATTTTCTTTGAGATACATTTTGAAGGGAAAAGAAGCCATTGTGTAAAATAATGTGATCGGTTAGAGTGGAGGCTATCACTCGATTGTTTTTTATCTCAA GTTATTATGCAATTTAAAGTAGGTTGTGAATAATGTATGTGACTAACATCGTTGGATTTTGGGCTTTGCTAGCTGGAGGCTATATAAGACTTAGATAGTA GATTAAATTATTGAGGAAAAGTCTAGTGTCGGGTTCAAGATAATATACCTCTAACAGAAGATTAGGACGTTGCAACTTATGCCTTGGCCTATTATAATCA AAAGATTATTCATTTTTTATTGTTTGGATTTGATATTATATGTTTGAACTAATTCTAATGGAGATGGACATAGGAGGAGGACGTGAAATGAGGCAAAAGA CAACGCGGCTAGCCACATAGCGATTAGGCACAGGCCAATTTGATCGTAGTTTGTTAGCTCTTGAATTGTATTAGAGAAGCACAGCTTTATATTATTAATG TTTCTGGCTCGGACATGATTGCCTCCGGTGCGAAGATCCTGTAAGAAACAAAAAAAAAAGTATTGTTGGGTGTTGCCAAACAAATTTTGTTTGAAACACA CTGCTGATGAATAAATATATTCAGACTTATACTGATACATGGGGTAGTTAAAAAAACGTAGTTCATTAGTTCCACTTGGTACTTTGTTCTGCTAAAAAAC TCTTGGTACAACCAACCATTTCCCTTTATTAATTCGTACGCCTTTTCTATGTTCATTTCTTGTCTCCTAGCATTTGGAATGGCTTCAACATTATGAAGCA AAATAAATTATTCGTAGTAAAAATTGTGTCACCAAAATCTGAATGGGGAAAAGTAGTTAATTCACGTGGATGGAGTTGGAACCTGATTTCTTTTTTCGAT GTCAATATGCAGATTCTTTCATGGGTTTTACAGTAAACATTTGAAGGTAAATAAAAGACGCTCATTGGGTGCAAATTGTCAAAGATTTTTCATGGCTCTT TCTGACTGCTGGGAGGTACACGGGATTTTAGCCCCATAACCAATCTTAATCAATTGGTTCCTCATTTCATCCTGGTGTGTGTTCTTGGTTTATTTTAGAA GTTCATATCATAGGATAATATTAAAATGGCAAACTAATAACGATGAAAGCGTAATTTGGACCATTGAGTGATTAATTAATTACAGTGATATTATCATTCT TTTTTCTCCAAAATTTCTTTTTTAAACCTATGTCATAACTATTGATTTTCATTTTGAAAATAATGTGTATAAATAATGTGTAAGAAGTGTTGTGATAAAT AAAAGTGGTGATGCCGTGAATCCGTGATGTCAAA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_59557; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_220100
Blastp | - |
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Blastx | Probable galacturonosyltransferase-like 7 from Arabidopsis with 74.31% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019441317.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |