Ll_transcript_202248

• Id Trinity: FTRINITY_DN56441_c3_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_202248
• Sequence: GAACACGTATGAACAGGTACTGTTTGGGATCCTTATTATATTGCATTTATTCAGTTTGGTTGATTGTTCTCACATATATTCTATCTCAGTTGGTATTGGT TATTAAAAATAACAGTAGTGGCAATTAGAATCACATTTTGTCATTGAGCATCATGAAGTTTGATAACATCTTTATTTGGTACATTTTACTTTCCAGTGAT CTTTTATATTGAATGTAAGCCACTTACTACTCTCACTCTGCTACTGTGTGGAAGAGCAGACAACATCTAATTACATGATAAAACTAATGTATTCAATTTT GAAATTTAGGGCAGTCAATTGTGAGTGCTGATTCTTTGTAACTTCCTCAATCATAGATCATAGTGACAATAATAGTCAATAAATAGGGGTGGGTGACAAT TACTATTGTTAGTACTTGCTGCATTGAACAGTGATAAGAGGGCTTGGGTTAACCGGGATCTGGCTTCTCTGAAGTGAATGGCAGCGATGCATATTGTGCT TATATTATAATTTCCAATATAGTCATTTGTTTGGACGAGGATGATATTCATACACTTATTTTGGTATATGGTTACAGCTTACCAAATATCTGGTCTATGT TAGTGCCGGTGATTGAGCAAATATTGCTGTGTGGTTGTGGTAGTAATGGTCACCTGATCTCTGCTGATAGTTGTACCATGAAATTTTCTCTTGAATAATC GTGTCAGAAAACAATATACCGTTAGATTTATAAATTAATTCATGCATGTTCTCCTTACTACCCATGCTTTTGGGACAGTTGGTTCATGACATTGTATTGA AGTCTTTGTGACGAAGTGATCTAGAGTTCTGTCCATGTTTCAAGCCAAAAAGCCCTGTTGTATGAGGGGGGTGTTAAATTAAATACCATTCATGTGCCTT CATCCAAAACCTTAAATTTTTTGGGATAGTTGGATTGTGAAAATACTAATGGTTATGGTAGTGGGTGCTGCAGAGGCTGTGATGGCTTTGGTGGAAAAAT GGATGCTGGTGATGGTGATTATATGATTGTACTGATTTACATATTTTCGTTAAATAATAAGAGAATGAGGATCGAATAGAATAACTGAACTATATTCTGT GGAACAAGTGTTTTTTCCAAAAGAAAATTTAACGCCATTGTAATTCTGTTATAATGCATGTAGAATAAGCTACTACCTGTTATTTACTTATTTTTATTTA AATAATTTAATCAACTAAATATTCACTATTATCAAAAGAAGTGAGAATCTCCTTCCACTTTTGATGATAATCGTATCATCCTTGCCTTTCAGCCTAATCC GTTTAGCACGTAATCTGTAGTCCGATCGTCTTACATATTCCAGCATATGTATTCCAGCAGTTGGTAAGTAGAGCGTTGGCTAGGCGATTCCTTATATACG ATAGCATCACGCCTTTCACCAAGCCGACCCTCAATGTGGATGAAGCTGCTTATTTTGCGTTGACTTCCGTCCGATGATGTGTATATCAACGTAGAAAAGA TTTAGTGAAATTTAGATCTACCTTATTTTATTAGTAACTCAAATAAAAGTGGAAACTCAGTTTTTTCCCTTTATTCAAAGCAGGAAGCTGTCACTCAATT ATTTACAACTTCAAGCTGCAGGAGCTAAACAATACAAGGATGATGGGCCTAGAAAAAGGAATTCACGGAGACGAGGAACTCACACAAGCTATGATAGTGA TGGTAGCATGTTTGAGCAACGTTCTCTTTCAAAGAATAACATAAATGCAATTCGTCGTTCCCAAGTAGGGCCCCGGAATCAGTCCTGATATATACTGCTT TGTATTTTATGAAGATTATTGTAGCCATATTTTCCCTATCTTTTTTATCTTCTAAACTTAATATTGTGATGGTGAAAGTGAAATGAGGATATCTTGCCTA TATTTATATGTCAAATAAAAATAATCACTTGACACTGAATATGGAGTTTGGATTGTCATTCACGCGCTAAAGAGCACACTCATGTTTTATGTAAGTTAAA GAATATACTTTAATGAGCATCATATGCTTTGATATGGAGTTAAATCTTATTTTTTTTTCAGGTTCCTCAAGTAGTTGATACGTTATGGCATCTTCAGTCT AGGGATATGCTGCCAGCTGTGTGGTTTATTTTTAGCAGAAAGGGTTGTGATGCAGCTGTGCAATACCTTGAAGATTGCAGACTATTAGACGATTGTGAAA CAAGTGAGGTTGAGCTAGCCTTGAAGAGGTTCCGCATTCAGTATCCTGACGCTGTCAGAGAAACAGCTGTGAGAGGACTTCTGCAAGGGGTTGCTGCACA TCATGCTGGTTGCCTACCTTTGTGGAAGGCATTCATAGAAGAACTATTTCAAAGAGGACTTGTCAAGGTTGTTTTTGCTACAGAAACCTTGGCTGCTGGA ATCAATATGCCTGCTAGAACAGCTGTCATTTCGTCACTTAGCAAAAGAAGTGACAGCGGACATGTCTATTTAAGCTCAAATGAACTGCTTCAGATGGCTG GGCGTGCTGGACGCAGAGGCATTGATGAGCGTGGTCATGTAGTCCTCATCCAAACACCTAATGATGGTGCTGAGGAGGGTTGCAAGGTCTTGTTTGCTGG ACTTGAGCCTTTAGTGTCCCAGTTTACTGCCTCATATGGAATGGTATTGAATCTTCTTTCTGGTGTAAAAGCCATTCGGTCAAATGAACCAGATGAAGTG AGACCTTCATCAGGAAGAACTTTAGAAGAAGCTAGGAAGTTAGTTGAGCAGAGTTTTGGAAATTATGTTAGTAGCAACGTTATGCTGGCTGCCAAGGAAG AAATTAAAAAAATTAAGAAAGAAATTGAATTGCTGATGTCAGAAATCACTGACGAAGCCATTGATAGAAAAAGCAGGAAGGCTTTATCACAGTGGGAATA CAATGAGATCACGGAGTTACAGGAAAATTTAAGGGCAGAAAAACGTGTTCGGAGTGAATTGCGGAAACAGATGGAAGCAAAGAGAATTTCTGCCCTGAAA CCTATACTGGAAGACCCTGAAAGGGAACATCTACCATTTTTGTGCTTGCAGTATAGAGATTCTGAAGGAGTTCAACATTCAATTCCTGCAGCATATTTGG GGAAGGTTGACTCCCTAAATGCTTCAAAACTCAAGATCATGATTTCTTCAGATGATTCTTTTGCGTTAAATTTTTTAGATGAAGAGCCAACAGGTGTTAC TGATTCTTCATTAAATAAAAATCTTGAACTATCATATCATGTGGCTCTTGGTTCAGATAACTCCTGGTATCTATTTACAGAAAACTGGATTAAAGCAGTA TATGGGACAGGCTTTCCTAATGTTCCATTGGCTCAAGGGGATGCTCTACCTCGAGAAATTATGAGTACTCTCCTTGATAAGGAGGAAATGAAGTGGGATA AGGTTGCTCAATCCGAACATGGTGGTTTATGGTTCGTGGATGGATCTCTAGAAACATGGTCTTGGAGTTTGAATGTTCCTGTTTTGAGTAGCTTATCTGA AAATGATGAGCTACTTTTAAAGTCTCAAGTCTACCAAGATGCCGTTGAACTTTACAAGAACCAAAGAACTAAAGTTGCACGCTTGAAGAAAAAGGTATCC CGTACTGGAGGGTACAAAGAATATAACAAAATCATAGACGCTGTCAAGTTTACTGAGGAGAAAATCAAACGGCTGAAGACTAGATCAAAGCGCTTGTCTA ATCGTATAGAACAAATTGAACCCGCAGGATGGAAAGAGTTTATGCATGTTAGCAATGTCATACATGAAACCAGAGCTTTAGATATTAATACACATGCCAT CTTTCCACTTGGCCAAACCGCGGCTGCAATTCGAGGAGAAAATGAGCTTTGGCTTGCAATGGTTCTTCGCAATAAAAGTTTACTGGAACTAAAACCTGCA CAACTTGCTGCAGTTTGTGCAAGTTTAGTGTCGGAGGGTATCAAAGTCCGACCTTGGAAAAACAACAGTTATATTTACGAGCCTTCTGCAACTGTAGTCA ATTTCATAAGGTTGTTGGATGAGCAAAGAAAGGTCCTGATGTCAATTCAGGATAAACATGATGTAACAATATCTTGCTGTTTGGATAGCCAATTTTGTGG CATGGTTGAAGCCTGGGCTTCTGGTTTGACATGGAGAGAAATAATGATGGATTGTGCTATGGATGATGGTGATCTAGCTCGCCTCCTTCGTAGGACCATT GACCTTTTAGCCCAGATTCCGAAATTGACAGATATTGATCCTTTGTTGCAGCGCAATGCAAAAGTTGCATATGATTTCATGGATCGGCCTCCAATAAGTG AGCTTGCTGGGTAATAGTAGTGTCTTTGTTCTCCTGTCCTGTGCTCCATTTGTAAATATTATTGTTGTATGATTAATTTCCCTAAATTATTTTCTTCTTC ACAAAACCCACTTTTCAGTTAACTTAATTGTTTTTATTATTTTGATCTCTCCTCTTCTTCTTTTTTGCGCATTTTGGTATGTTAACGCAATTTCTGTTAG TGTATTAGTCACTCTTGTCAAAAAAAAATTGTAACCCGGCTATTTTAGAGCTCCATGGTGTTCTTCTTAACAGAATAAGAACATTTTTACTCTATTTTCT ATTGTGGGATTCTTATTTTTTAAGTTTTGTTTTTAAATAAGAATATTTTTTGTTGTAACTAAGAGAAGTAATGAGAGAGATGTTGTAAGGAAAATGTAGA TATTGTTG
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_60179;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_202248

FPKM

• FPAB: 0.6
• FPNAB: 0.1
• LF1: 0.1
• LF2: 0.2
• LF3: 0.2
• LF4: 0.3
• UF1: 0.1
• UF2: 0.3
• UF3: 0.4
• UF4: 0.3

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_202248

• Blastp: DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH15 chloroplastic from Arabidopsis with 68.11% of identity
• Blastx: DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH15 chloroplastic from Arabidopsis with 68.13% of identity
• Eggnog: helicase(COG4581)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G70070)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019445516.1)
• Pfam: Helicase conserved C-terminal domain (PF00271.30)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;