Id Trinity | FTRINITY_DN56520_c3_g1_i12 |
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Name Transcript | Ll_transcript_156382 |
Sequence | TTTCATAATAATAATACTTCTTCTTCTCTCTCTCTTATTTGCCGGAGCCACCACTCGAGCTCCGGCGATGCTGTTCTGCCACCAACCCATTATTCTCCCT TGATTCTAACAACAACCCATTATTCTCTCTATCTCAGAAATGGGAATTCCATGGGACGACGTCGTTGTGATACAGCATGGAAAAGACGATAATGACCCCA CCATGGTAACCGTTAATTGTCCCGACAAGGCTGGTCTGGGCTGTGATCTCTGCAGAATTACCCTCGAATTTGGTCTCCACATTACCAGAGCTGATATTTC AACGGATGGAAGATGGTGCTACAACATATTTTGGGTTATTCCAAATCCTTCATCGGTCAAAGTTGATTGGGAAAGGTTGAAGAATCGCCTCCTTTCTGCT TGTCCTTCATGTTTATTTTCTTATCACCTGAATCTACAGCCTACTACTCCTTTGCCACCTCTGGTTTACCTATTGAAAGTTTGGTGTGTTGACCAAAAAG GATTATTACACGATATTACTGAAATTCTCTGCAACCTTCAACTTCTTATTCAGAAAGTGAAAGTGATGCCTACCCCGGATGGTAGGGCCTTAGACTTATT CTTTATCACGGACGGAATGTGAGTATAAGATTTAATTATGTCATGCATCTTCATAAGCTTTTTCGAGAGTGAATCTTCTCATGTGCCTTTGTGTGTCGTG TGGTTACTTGAAGGGGAGAGATGGGCATGGAGAGATTTTATTAATGACCCCAGTGAAGATTTATGATATTTCTTTTATAACCGTTGCATATCTCTCTTTC CTCTATGTGACTACATGACAAGAAAAACCCATGAGAGGACCTATTCCCTGCTCTTTCGGTCTTTCTCACACTATACAATCGATTTCAATATAGTATTATT TTCTTTGACATTTCTCTCTAAAGTCAACTTTAAGTTGATATGGAAGATTATGCTTAAAGAAAGTGAAATTGGTATCTGAGTTTGTGATACAAACTATTCC TATTTGACATTGTTCCTCTTTATGTTCTAGATGAGCAAATTATCTATGGCTCTTAAGGATCAACATGTTTAAATTATCTATGGCTCTTAAGGATCAACAT GTTTTGCTTGTTCGGATTAGAGATTAGCAAAATATGCTCTTATTCTCTCTCTGTGTAATATCACCGGCTATGTGATAATAGGATTATGAGAAATGGATTA GGCCACTGAATGGAGTGAAAATATAAGAGTACTATATGAAATTGTGTAAGTTAGTTAGCCTTGACCACTCCGTTGATGCAGTACCCTTCACTGCACGACA AAGGGAACTCTGCATTCTATGCTAATAGAAAGTCTGCGGTACAACTCTAGAGTTAGATATACAGATTGGAAACAAGAATTTAAGACATGAAAGATTGGAT TGAATCATAGTAGTAACAAGGATTCACCCCTAGTGGAACTAAGTTTCGGTTGTTGTATATGAAACCTTGGGTTGAATCATATGTACTAACGATAGGATGC TCTTGACAATTTTGTTTCAATATTGGTGTGGCACTTGGTGTGAGTTTTGTTCACTGTGTTGCCCTTTTTATTGGTGCTGCACTTGATTGTCATTTTACTG GCAAAAAGGGTTATGGACAGAGTGGCTTGCAAATCCATGAAATATTTTGTGTTCAATTTAGATTAGCTGAGCTAAACCTTAAAATAATTAATAAATTTTT ATTCAATAAGCTCAAGAATTTTGGTTCAATTTTGAAACCATCAAACTTCGTATTGTGTTGTTTAGCCTTTGGCATTGCCGCAGTTGGAGCCTGGGGCACA AGTTTGAAACTTATGCAGAACTTATAGAGGAACCAAAGTGTAATTCAGGCAGAGAACTGAAAAGTGAAAACTATTGCTCACACAAATCAAAGGAGGGAGT AAAAACGATAGGCACCTAATAATTCTTCTAGTTTGTGTGTGACCATCTCTTTCTTTCAATGACATTCACTCTCTATCATCACAAAACGTAAACACAACTT AAGCACAAATACAAATATTAGACACAGGTCGGATATCACATGAAACCAGTACATGGATACTGCAAGTTCTAAAAACCACAGGACAAAATATGGCTAGGAT ATAGCAAATGATGTTGATATAATATTAACAGATCTAGATTAGAATAAATACATTAATGTTTCATGAGTTAACTTAAACCATTGTGGTATCCCACTTGTAT TGATACAAAAAGTCAAAAACTAATTTTATAATATAGGCAAGAAGTATTCAAGCGTCTGATACGTAGACCGATACATTAACCATTTCAAAGTATCGCCACT AAGTACTCTATTGGGGGGAAAGCTAAATTGTTTCTATAGTTTCCTCTGTTATTCATGATTGTAAAATCCACTTCAAAAGAAACTGTACTGAAAATGGTAT TTTTACAACCAGAAAGGCCTATTGCAGTTTCACAAACTGTGTGCTTGTCATGCCAAATTGTCAATTGTCCTCTACCCATTGTTTTGCTCTCCTTATTGTT ACATCTCTTTTATTCCATGTTTCGCCTAAATTCTTATCAATGTAGTCTTAAGTGATAAAGTTCTTGCTTTGAAAGTTTCTGATCAATCACAATGGGAATA AATATAAGTTAAATATCTCCACTCCTATTTTTGCCAGTAGATATTATGCTAATTATGTGACATCTTTTTAATTCATTTTATTGTGTTACTTTTATATTTA TTGTTTTTTATACACAAAACAGGGAGTTGTTTCACACAAAACAGAGGCGAGATTACGTGTGCGAATATCTGAATGATGCTTTAGGAGAGAGTTGTATATC CAGTGAACTTCAGTTGGCTGGGCCTGAATATGGACATCCACAGGGGTTTTCTTCTCTTCCGCCGTCTTTTGCAGAAGAATTATTTACTTCTGAGCTGTCG GGCAAGAAGGTGTCTATGCATCCTCTCAGCCAAGATATGACAACACTGAAGAAACCCACTATTGTGGTTGATGACTCATTGAGCCCATCACATACCTTGC TTCAGATACAGTGTGTTGACCAGAAGGGTTTGTGTTATGATATCATGAGGATTTCTAAGGACTCTGATATTCAGGTATTAACTCTTGATTTGTCATTTAT GTATGAACCTTCTGCTTCTCCCCTTAGTGAACAATGTTTACGTCAGACTGAGTCAACGGAAGCAACCTGAACAAAGAATAGAAGATTGAAAGTTGGTATT TAAGTCTGAGTCTGCAGAAAGCCTTTTCACTTTTTACTCTTATGTTTCTTGTCTTCAGGCTCTTGACAAATACGTAATTATCAAGGACAAACAATTAGCT TGTATGAATGTTATTTAACATTCTCCACAGTTTTTTATCTCTAGTTATCATCTCGATTTTATTTTTTTAATCATTCTTGCATTGATTTCCATATACCATC CTCTTATCATATGTTTAGGTGCATAGTTCTTTATTTGTAATTAGTTTTCTAATAATATAATCATTTCCGCCTTTCCCAATCAGGTCGCTTATGGCCGATT CTCTTCAAGCGTGAAAGGATTTCGAACTATTGACTTGTTTCTCCAGCAAAGAGATGGAAAAAAGATCACAGAACCTGAAATTCAGAAATCCTTGTGTTCT TCCTTAAAAGAAGAGATGCTTCATCCATTGCGTGTGATTATAGTGAACCGGGGTCCGGACACAGAACTACTGGTTGCTAATCCTGTAGAGCTGTGTGGAA GGGGAAGGCCTCGTGTATTCTATGATGTTACATCGGCTTTAAAAGGAATGGGTGTATTCATTTTCTCAGTAAGTTTTTAAGTTAAAGCTTATTATACCAA AAAATATAAGCTTTTATTCTGAAACTAACTAGATACATACTCCTTAATTTATTAAAATACTGCTTCAACACCATTTTCCAATAAGAACTTAACTTTTCTA TCTTACTTTGTAGCTATTGCTTAATTTTTGGTTGCTGACATGAGTTTTAGCACATTCTTGAGGATGTGATGGCTAGGAATGTAAAAACATTCCATCACAA GTGACATGCTTAGGAATCTTTTAAGTTCCCATTTCTATTCTTTTAGTGTACATGGGAAAGTTATTTTCTGTCAAGGTTCCATGTCAAAACCAATTGACAA TGAGATGAGCAACCCAACAAATATTTAAACTATTCTCGAGACAGTGGGGCAAGCGATGTAAAACTTACTTCCCAACATCTTTTCCAAGCGAGATAGATGC CCAGGAATGTAGAAAACATTCCCTGAACCAAACAAAAACTGCTGCGAAAATTTATATGTATTTTGAAGAAATCTTGTCATAACTTTTAAATAAAATCTCT TTATCTTACTGCAGGCTGAAGTTGTTAGACATTCAACACAAGAACGGCAGTGGGAAGTGTACAGGTTTTTGTTGGACGAAAGCCGCGATTTTCCATTGAC GAGCAGCAAAGCAAGAAGTCAGATCGTGGACAAAGTTAGAAGAACATTGATGGGCTGGTAATCTGGTTTACTCCTATCAGATCAGAGAAGCACTATTTGT GTCTTTTATTGCCTTCCCTTAACTTCAATCATGCGCTTTTAGCATTTTTAGATCATCTTTTCTTTCTTTTCTTTGGCTTTAGTGATCAAATATTAAATGT ACATTGCTTTTCTGTGCTAGCTTCTAAGCCATATGATAATTTAATGTTCTCTATGGATGCATGTTATGCACTACCAATGAACTAGATTTTTCCTTCATGT CCTCATCCTTTGAGGTTTGAACATTGTATTTTTTGTACTACCAAAAGTACCCTTTCACCCTTTGGTTAAGGAGCTAATTCCTTTCGGGTTGGATGATTAC CCCTCCCAACAAGTGTCGCTCCCTGAAGAACATTAAGTGTGTTCGAAAATACCTTTAAGGAATTTAAGATAACGATTTTATATAACCAAAAAAATCAATG ATTTCTTTTTTGT BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_60834; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_156382
Blastp | ACT domain-containing protein ACR9 from Arabidopsis with 65.62% of identity |
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Blastx | ACT domain-containing protein ACR9 from Arabidopsis with 65.62% of identity |
Eggnog | ACT domain containing protein, expressed(ENOG410YUMM) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT2G39570) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019419329.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |