Id Trinity | FTRINITY_DN56520_c3_g1_i7 |
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Name Transcript | Ll_transcript_156377 |
Sequence | TTTCATAATAATAATACTTCTTCTTCTCTCTCTCTTATTTGCCGGAGCCACCACTCGAGCTCCGGCGATGCTGTTCTGCCACCAACCCATTATTCTCCCT TGATTCTAACAACAACCCATTATTCTCTCTATCTCAGAAATGGGAATTCCATGGGACGACGTCGTTGTGATACAGCATGGAAAAGACGATAATGACCCCA CCATGGTAACCGTTAATTGTCCCGACAAGGCTGGTCTGGGCTGTGATCTCTGCAGAATTACCCTCGAATTTGGTCTCCACATTACCAGAGCTGGTTTCTC ACTTTTTCTCCTTTTCCTTATCTTTTCTCGTTACAGAAAATGTGCATTGTTTCATTTCATTGTTTTCGGAATTGGGTCCATGTTAGATATTTCAAGGGAT GGAAGATAGTGCTATTACTATATCATGTTTTGTATTCCAAATCCTGCATTCTTCAAAATGTTTTTTTATCCTAAGGACGATGTAGTGCGAGACTTACACC TAGTGAGGTTTTAGGAGATTGATGTAAGCAGACTTGCCATTGTTTACTTAACAAATTGTTTCCCGGATTTGAATCCACGACTTACGGGTTAAAGACAAAC AATCTTATTGTTGCATTCTGAAGCTTACCCTCTTGTTTATTATTATTCCAAGAAAATAATAAATCTTATTCACTTTGGTTTTGGATATCTTACACTGATT CTCATTGGTATGAGTGATATGGATTTGGGTTCACTTAAGCAAGGTTTTGTGTTCCAGTGAATGAAGGTAGGAGAGTTGTGCTCCCTTAACAGTTTTGGAG ACACATCTCGGATTAGTCGGGGTCTAGAGTGACTTATGGACATAGAAATTTGTTGGATTTGTTTTCTTTTATTTATTTTTCGGTGCATTGGTTTTGGAAA CAATCTCTTCGCTTATGAGGGTGAGACTGCGTAAGTCTATCCTCTCCCGACCCCGCTAGTTGGTCAATTTTTCGGTGCATTGGTTCATGTTCAGTTTATC CATTCACTTGTGAGTTCCTGTTTTTGAGTTACAAATTTTCATTTTAGTTGTTTTGAATTCAATGATGTGATGTTAGATATTTCAACGGATGGAAGATGGT GCTACAACATATTTTGGGTTATTCCAAATCCTTCATCGGTCAAAGTTGATTGGGAAAGGTTGAAGAATCGCCTCCTTTCTGCTTGTCCTTCATGTTTATT TTCTTATCACCTGAATCTACAGCCTACTACTCCTTTGCCACCTCTGGTTTACCTATTGAAAGTTTGGTGTGTTGACCAAAAAGGATTATTACACGATATT ACTGAAATTCTCTGCAACCTTCAACTTCTTATTCAGAAAGTGAAAGTGATGCCTACCCCGGATGGTAGGGCCTTAGACTTATTCTTTATCACGGACGGAA TGTGAGTATAAGATTTAATTATGTCATGCATCTTCATAAGCTTTTTCGAGAGTGAATCTTCTCATGTGCCTTTGTGTGTCGTGTGGTTACTTGAAGGGGA GAGATGGGCATGGAGAGATTTTATTAATGACCCCAGTGAAGATTTATGATATTTCTTTTATAACCGTTGCATATCTCTCTTTCCTCTATGTGACTACATG ACAAGAAAAACCCATGAGAGGACCTATTCCCTGCTCTTTCGGTCTTTCTCACACTATACAATCGATTTCAATATAGTATTATTTTCTTTGACATTTCTCT CTAAAGTCAACTTTAAGTTGATATGGAAGATTATGCTTAAAGAAAGTGAAATTGGTATCTGAGTTTGTGATACAAACTATTCCTATTTGACATTGTTCCT CTTTATGTTCTAGATGAGCAAATTATCTATGGCTCTTAAGGATCAACATGTTTAAATTATCTATGGCTCTTAAGGATCAACATGTTTTGCTTGTTCGGAT TAGAGATTAGCAAAATATGCTCTTATTCTCTCTCTGTGTAATATCACCGGCTATGTGATAATAGGATTATGAGAAATGGATTAGGCCACTGAATGGAGTG AAAATATAAGAGTACTATATGAAATTGTGTAAGTTAGTTAGCCTTGACCACTCCGTTGATGCAGTACCCTTCACTGCACGACAAAGGGAACTCTGCATTC TATGCTAATAGAAAGTCTGCGGTACAACTCTAGAGTTAGATATACAGATTGGAAACAAGAATTTAAGACATGAAAGATTGGATTGAATCATAGTAGTAAC AAGGATTCACCCCTAGTGGAACTAAGTTTCGGTTGTTGTATATGAAACCTTGGGTTGAATCATATGTACTAACGATAGGATGCTCTTGACAATTTTGTTT CAATATTGGTGTGGCACTTGGTGTGAGTTTTGTTCACTGTGTTGCCCTTTTTATTGGTGCTGCACTTGATTGTCATTTTACTGGCAAAAAGGGTTATGGA CAGAGTGGCTTGCAAATCCATGAAATATTTTGTGTTCAATTTAGATTAGCTGAGCTAAACCTTAAAATAATTAATAAATTTTTATTCAATAAGCTCAAGA ATTTTGGTTCAATTTTGAAACCATCAAACTTCGTATTGTGTTGTTTAGCCTTTGGCATTGCCGCAGTTGGAGCCTGGGGCACAAGTTTGAAACTTATGCA GAACTTATAGAGGAACCAAAGTGTAATTCAGGCAGAGAACTGAAAAGTGAAAACTATTGCTCACACAAATCAAAGGAGGGAGTAAAAACGATAGGCACCT AATAATTCTTCTAGTTTGTGTGTGACCATCTCTTTCTTTCAATGACATTCACTCTCTATCATCACAAAACGTAAACACAACTTAAGCACAAATACAAATA TTAGACACAGGTCGGATATCACATGAAACCAGTACATGGATACTGCAAGTTCTAAAAACCACAGGACAAAATATGGCTAGGATATAGCAAATGATGTTGA TATAATATTAACAGATCTAGATTAGAATAAATACATTAATGTTTCATGAGTTAACTTAAACCATTGTGGTATCCCACTTGTATTGATACAAAAAGTCAAA AACTAATTTTATAATATAGGCAAGAAGTATTCAAGCGTCTGATACGTAGACCGATACATTAACCATTTCAAAGTATCGCCACTAAGTACTCTATTGGGGG GAAAGCTAAATTGTTTCTATAGTTTCCTCTGTTATTCATGATTGTAAAATCCACTTCAAAAGAAACTGTACTGAAAATGGTATTTTTACAACCAGAAAGG CCTATTGCAGTTTCACAAACTGTGTGCTTGTCATGCCAAATTGTCAATTGTCCTCTACCCATTGTTTTGCTCTCCTTATTGTTACATCTCTTTTATTCCA TGTTTCGCCTAAATTCTTATCAATGTAGTCTTAAGTGATAAAGTTCTTGCTTTGAAAGTTTCTGATCAATCACAATGGGAATAAATATAAGTTAAATATC TCCACTCCTATTTTTGCCAGTAGATATTATGCTAATTATGTGACATCTTTTTAATTCATTTTATTGTGTTACTTTTATATTTATTGTTTTTTATACACAA AACAGGGAGTTGTTTCACACAAAACAGAGGCGAGATTACGTGTGCGAATATCTGAATGATGCTTTAGGAGAGAGTTGTATATCCAGTGAACTTCAGTTGG CTGGGCCTGAATATGGACATCCACAGGGGTTTTCTTCTCTTCCGCCGTCTTTTGCAGAAGAATTATTTACTTCTGAGCTGTCGGGCAAGAAGGTGTCTAT GCATCCTCTCAGCCAAGATATGACAACACTGAAGAAACCCACTATTGTGGTTGATGACTCATTGAGCCCATCACATACCTTGCTTCAGATACAGTGTGTT GACCAGAAGGGTTTGTGTTATGATATCATGAGGATTTCTAAGGACTCTGATATTCAGGTCGCTTATGGCCGATTCTCTTCAAGCGTGAAAGGATTTCGAA CTATTGACTTGTTTCTCCAGCAAAGAGATGGAAAAAAGATCACAGAACCTGAAATTCAGAAATCCTTGTGTTCTTCCTTAAAAGAAGAGATGCTTCATCC ATTGCGTGTGATTATAGTGAACCGGGGTCCGGACACAGAACTACTGGTTGCTAATCCTGTAGAGCTGTGTGGAAGGGGAAGGCCTCGTGTATTCTATGAT GTTACATCGGCTTTAAAAGGAATGGGTGTATTCATTTTCTCAGCTGAAGTTGTTAGACATTCAACACAAGAACGGCAGTGGGAAGTGTACAGGTTTTTGT TGGACGAAAGCCGCGATTTTCCATTGACGAGCAGCAAAGCAAGAAGTCAGATCGTGGACAAAGTTAGAAGAACATTGATGGGCTGGTAATCTGGTTTACT CCTATCAGATCAGAGAAGCACTATTTGTGTCTTTTATTGCCTTCCCTTAACTTCAATCATGCGCTTTTAGCATTTTTAGATCATCTTTTCTTTCTTTTCT TTGGCTTTAGTGATCAAATATTAAATGTACATTGCTTTTCTGTGCTAGCTTCTAAGCCATATGATAATTTAATGTTCTCTATGGATGCATGTTATGCACT ACCAATGAACTAGATTTTTCCTTCATGTCCTCATCCTTTGAGGTTTGAACATTGTATTTTTTGTACTACCAAAAGTACCCTTTCACCCTTTGGTTAAGGA GCTAATTCCTTTCGGGTTGGATGATTACCCCTCCCAACAAGTGTCGCTCCCTGAAGAACATTAAGTGTGTTCGAAAATACCTTTAAGGAATTTAAGATAA CGATTTTATATAACCAAAAAAATCAATGATTTCTTTTTTGT BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_60834; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_156377
Blastp | ACT domain-containing protein ACR9 from Arabidopsis with 69.19% of identity |
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Blastx | ACT domain-containing protein ACR9 from Arabidopsis with 60.45% of identity |
Eggnog | ACT domain containing protein, expressed(ENOG410YUMM) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT2G39570) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019419329.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |