| Id Trinity | FTRINITY_DN56564_c4_g1_i15 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_154884 |
| Sequence | TCTTGCAGATGCTTGGCTTTGTTTAGGTAACTGCATTTGGAAGAAAGGTGATTTATCAGCCACAAAGAATTGTCTAAGTCTTGCATTAAATAAGGTTAAT GCCAACACTGGAGATCCATGATTTAAATTACATTACGGGTGCAGTAATTTTGTTCTGGTTGAGATTCTGCACAGTGAACTAGTGATGGATATTGGTTGTT ATGCAGGGTCCTAACAAAAAAATTCTTTGTCAATTATCAATGCTTAAAAGGAAAATGTCTCAAGGTGCAGAGAATCAGGTAGAACTTGTTGAGGAAAGCA TTCAACATGCCAAGGAAGCAATCACTTTGGATGTCAAAGATGGGAACTCTTGGTGTACGTTTGTTAAATAAACTATTACTTTGATATATCTGGCATATCC TCTTATTGATTAACCACTTGTAAATATATGTTCATCTGTAAACATGTCGGTTGCTGTAAATTAGCTAGTGATTAGGCTGTCAGTTAGCTACTGATCTTCT CCTAGACTGATTAATATTTCAATTAAATAAGGGACCGGTTTGCATCCTAAACACAATTTGCTTAAAATATTGATTATCCCCTTGGTTGTTCCTTGATTAA CTGTAATTACACCATAAAATAAGGGCTCGTTGTGCAAACTAGACATGCTCAATTTCTCTCATACTTTATGCTCACCTTCCCACTAGACATTAATCTTTAT AGTTATTATGACCTTGGTCAAAAAAACATCATAAATAATGCTGTTCATAGAATCTGAAAACACTTTTATTTATTTTCATGCTTGTCCTTGAAAGTTGTTT GTAACTGAGGTCTCTAATATGTGGGAAGGGGGTGTTAGATCTTGTCTGTTGTGAATATAAGTTGCAAGATCTGTATGTTTTAAGTTTTAACATCATCTGA TCTCCTTGACAGATAATCTTGGAAATGCATGCCTTACAAGTTTTTTTGTCAATGGCGCTTGGGATCATAGCAAACTTTTAAATTCTTTGAAAGCATATCA AAATGCTGAGAAAGATGAAAGAATGAGTTCTAATCCAGATCTATATTTTAATAGTGCCACTGTTCACAAATATCTAGAGAACTACCAGAAGGCTCTTAGT GGTTTTGAGGCTGCTGCTTTAAAGGATCCGGGTCTCAATGCTGCAGAGGAGGTTCAGAAGATAGTCAATTTACTTGACAAGGTCGACAATTTGTTGAGGG TAATGAAATTTTCATATGGCTATGTAGTAACCTAAACCTAGTAATTAGTTGAAGCCTTTTTTTCACAAGAGGATTTTTAGTAGATTGATATCCTAGCATG GTGGATTCTTTTCATGATAGAAGCTGGTAACTGCAAGCAACATTAAAGTCAATCCCCCACCCCCTTTACCCAGCAAAATAATAAAAAAGGGTTGTACTCA ACATCTTATTTTGGAAGAGGCAGCTTGCTATATATGATTTATAAATGTACAGGGACATGTAAGAGTTAAGCGAATTGCATCTTTGGCATCATCATTGTCT GCTGTTAATTGTAAGCACCTTTCTAACCCATAGGTTTGAGTTCATTGTCTCTAAATTCTATTAAGCCTGTGCTGTTATGATCCTTTTTACTAGTATACTG ACTAGATTCATGTCTACCTTCTGATGCAAGTGAATTTGTCATACAAAAGAGTTACCATAAACCTTCTATCAGAGGGTCCAAATAGAGCTGTAGCGGTTGA GGGGAAGGTGTTTTTCTTTATCAGGAGTGAGAGTATTGCTCCTCTATACTATTTGCTTTGTGATGCAAATCAAACTTGCTTTGTTCTCTCAGTTTATGGT GTACATAATGATGTGGTAAGAACTGCTGCTGAAGTTTTAAGTCGATTTCTTCTTTTGTCTCTTAATCATGCTTTTCATAAGGAAAACATCCCTTGTCTGT GTTTGGATAAATGTCAAATGTGACAAACGGATTGCCCGGTTCCTTCTTTTACATCCCTTCTTAAAAAGTGGAAAAATCAATGGTGGCGGGTGGTCTTTGT ATTTAAGCATATAGACTTTGGTACAATTGAGATATGTTTACTTGTGCATTATGATCAACAACTGTGAACATAGAAGAGAAAAGAAATGACTGAATGCAAC GGTATGCAACAAAGTATGCAACATTTAACCCAACAACAACCAAACCTTTATCTCACCAAGTGTTAAATAAAAATGACCCCATCCATTATATTATAATGTA TAAATCTTTGCTTATTTTTTCTATATTTGCCATTCATGTGAGTGCTTTTAGTTTGCTGAATAAAATTTTGGTCTAGCTGGTTATTGTTATGTTTCTATAG TATGGTTCTTGGGTTGAAGAATTACAATGGAGTTTAATTGAGCCCTGATTATTCAGATTAAAGAAGGAGATCAGCTAACGCTGCTTAACCCTTACTTTCG TGATGTTGATTTGTCCTGGAAAGATAAGGTACACTTTCATCAAAGTTATTCTTGATTCAATGCAATGTTTTGTCAATTC BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_61219; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_154884
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Tetratricopeptide repeat protein 5 from Rattus with 43.75% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019453516.1) |
| Pfam | Tetratricopeptide repeat protein 5 OB fold domain (PF16669.4) |
| Rfam | - |
| GO | - |