Id Trinity | FTRINITY_DN56581_c1_g1_i2 |
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Name Transcript | Ll_transcript_153862 |
Sequence | AGATGAGCCACTCTTGTTCCACCATTCCCTCTCTTTCCATTTGGATAATAATAATAATATTATAACTCCAAATCTTTCCACACAAATTTCCCATCAAAAC AAATATATACAAATAATCACACAAATTTCATACAATACTTTGTTTTTGTGTAGAGCTAAAATCATACATCGCAAAAGGAGAGCTAAGGTGAGTGAGTATC TTTGTTATACAAATATTAAGATGGATTATATCAAAATTCAATTTTGGTTTCAATATTATTTTTAAAATGAGTGATCTTTCTATTATTTTTGTGTGTTAGT TCATTTAGTAGAGTGAGTGAGAGAATCAAGAAATTGAAGTTTGCATTTGAATAATAAATGGTGACTATTTTGATTACTATAATAAGTGAATATATGTGGT TGATGTGTGTTAGTCTGTGATTATCCATGATGAGGATATTGCCTCTTTGCTCAGCCACCCCTACCTATTATTCCTCTTCTTCCAACCAGGTACCATCCTT TTTCTTTATTCATCTTTTCATCATTTTCATTCTTGTTTTTCATTACTCATACTCTTAATTGTTTGCTGAACTCAATTTGTTATTCTGGATTCTGCCATTG CTCATTGTGCTGTATCAATCTAGATATAAAAGGGCATTTGTGAGTTTAGTTTTGGAAGGGGAATGTTTAGTGGAGAAGTTATTCAAGGGGAAAGTTTGGT TTAACCTTCCCCTTCGGTTCGATTTCCCCTCTGTGACTAAACTCACTCACAAACACACCCTCTAAAGCTCCTGCTATGCTAAGGGGTGGATCCACTAAGT GGGGCTATAACAGATAGCCTTTCCTTGCATTTGCGACAGGCTGATTCCGCAATTCAAGCCCGTGGTCTTCTGTCACATGGCGACATGATAGAATGTTGGA CCTAATAAGAAAACTTTAATTGATGTGTTCTGGAATGTGCTCTTGATTGATTACTCATGGTGTCAAGTGTTGAGTTTTAGTATCTATCACCCGTTCGATT TTATTTACATGTCGTAATTATTAATCTTATTCTTGAAGATTCCCGTGTTTGGGGGATTGCACCCTCTGTGCCCTCTTCGGAAGGATCACAATGAGAGTCG ATGTACCGCAGAAGGCGCACATTTGAGTTTACAATATGGAGCTCACTCCCACTCATTGAGAAATTCATTTACAGTACAAGCTACAAATTCATGGGGTTAT TCATCAGTGACATCAGAGGTGCATCATTCACTGAGTAATGGAGAACCCAGATGCATAGAGAGTTATAGTTTATCAGAAGGGTTGGTGGATTTTGCAGAAA AGTCAACTGAAGAATCTAATGCATTAGTAGCACCAACACAACCAGAACCATTATCAAGTCTTGACATAGTGACAGAGAAGTTGACGCCTGCGCCTGATTC GATTAACCTGAACAATGAATCGTTAGCCAGTACAAAAGCAAGTCTAAGTGACCTTTTTGCTGGCATAGATGAGTCACTCAGTGCCTCGATTAATAAAGGA GAAAATGCTTTACGAAGCTCACTGGATACAGCCACTTCTTTTGTAGATTCTATCATAAAGGATGCTAATAAAACTGCTGATGATGTTTTTAGCGGGGCAT TTTCTGCTGTTGGTCAAACAGGAGAATTAGCAAATAAGAAGCTTTCTAGCTTTTCAAGTGCACTAAGTGGAACCACAGATAAAGCACCTTCTGTGGCTAT TGATGTGTTGCGGCGAACAATCACAGCGGCAGAGGGTTCTTTAACAAGTGGAGCTTCTTATGCTGTCTACCTATACGGCTCAGCCAAGGAGCTTCTTCCT TCGGGTATTAGGGATGCAGTCAATGTATATGAAGATAAAGCGACAGATATCTTGAGGCCTATAGGGTCTGCATCTGAAAAGATATATATAGCTCTATATT CATTGGAGAAGAGTCTTGGCTTGGATCCAAATGACCCAATTATTCCATTTATTGTTTTTGTGGGCTCTTCAGCAACAATATGGGCTGTTTATTGGTTGTG GACATATGGAGGTTACTCAGGAGATTTATCCCCCAAAGCTGCTTTTGAGCTTTTGGCCGGGAATAAAGATGCCGCACTGATAGACATCCGCACGGAGGAT TTGTTAGAAAAAGATGGCATTCCTGATCTTCGACGAGCGGCTCGGTTTCGCTATGCAAGTGTATCTCCACTTGAGGTTGATGGCTCCACAAGCAAGTTGT TGAAGAATGGCAGAGACCTTTATGATTCCTTGACTGCTACTCTTGTTCGTAATTTGAAGATTGTTAAGGCATTTAACCTTTTACCCAGAAACTCTTGAAT TTGCATAGAATACCCAAAAACTCTTCCTCCTTTTAGATTTTCTCTACATGACATTCTGTCCAAACAGGGTATAATGTACTGAAAATACAGTTACTTGAAA ATGTCTCAGAATCTATTTTCTCTGGCCTATAGGACAGCTCCAAGATTATAGTATTGGATGCTGATGGCACTCGTTCTAAAGGCATCGCAAGATCCTTGAG GAAATTTGGGTTTAAAAATACATACATGGTTCAAGGTGGCTTTCAGTCTTGGGTGAAACAAGGTCTCCGCATCAAGGAACTCAAAACTGAAACAGCATTG TCCATACTCAATGAGGAAGCTGAAGCAATTCTGGAGGAAGTTAGTCCTTCTCCTTTGCAACTTTTAGGTTATGGAACGGCTCTTATTGCGGGGTCATACG CATTATTAGGTGAGTGACATTTTCTTTCATTAACTATCAATTTTTTAGACTTCTAGGAGTTTTTTTCACAGATTTTTGTGTAGCCTACTACTTTTCACAT CATGTGTAAGAGGTTATAGCGTGTCTGTAAATTCATTTTGATTCAGTATGTTAAAGCGAGGTTCCAATAACATTAAACATCATGCTTATGTGTAACTCAA TCTATGAGACTTTTTTCATCCATCTTGATCTGACAAAGCACAAAATCGATGTTGTCTCAGAGTGGGAGAAGACATTGCAGTTAATTGGAACATTTGGTCT TGGTTTGGTATGTGTTTTTTTTTCTTTCAGCAAGTGCTTCTTATAAATTGTTTCTTTCAGTGAATTGGTCCAAAAAAGTGCAACACTATGAACTTCAGTT CGATTGCAAAATAGTCATTCACCGTCTAAATCATCGAAGTTGGATGATAAATGTCATGTCCAAAGCATAGTTCAGGGTCTATTTTACACATGTTCTGAAG TTGAGGACTTCATACAAAGTTCATGGGGTATTTTTAAACGGTGACGGACTATTTTTCACGTGAACAAGAGTCCAGGGTTCTTTTTGCACATTTTTTAAGT TGAGGGATTAAACCACACAGGTGCACATCATGCTACATTGAGGGGGTGTTTTTGGTCCTCAAAATCAGAAAGTTGGACATCAGTTCTTACATCATTTCCC ATATGTTTTACATTCTCTTGGTCAATAACTAGTGTTTTTCCATGTCTTCCTCCAATGTTCCGCTTTATATTTCATCAGACCATCTATCTGCGATTTTCTT CATATGAGGGCTCGGAAGATCTTAAGGAAGATGTGAGGCTATTGCTTACTCCGGTTAGAGTTGGAGCTCAAGCATTTTCATGGGCTGCTGGAAAAATAGA ATCAAATGGGATAGGATTACCAACATCACCTTCATCATTAGATGTTCAAAACCGGGTATTGCAAGCTGCTGCGAAACATGAATCTCAGCCATCTGATAGT GGAGATAATCAGGACTCAGTTCCTCTCAATCAGAATGTATGACATTATCATTCACATTAAATGCAGAATAGAGATTGCTATGGTCACAACAAATTAACTG AAAGTTCCAACAAACACTTTAGAGGGTGATTTTTGTACACCATGCTGCCACTAAGTTTGAATGATTATATTTGATGTTATAATGTCACTGAGTGGATAGC ATAATTTGCAATGTCAGAACTCAGAATAATAAGGATGTGATTAGTAAATAAATAATTATTTGTCAGAACTCAGAACAATTTGTGGTATTGCAGCTTATAG TAATGTAAACTCATCAGTTTATGTTTTAATCTTTTATGATCCAATTGCAACTGGG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_61360; |
Additional information | - |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_153862
Blastp | - |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019438272.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |