Id Trinity | FTRINITY_DN56598_c0_g2_i15 |
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Name Transcript | Ll_transcript_156432 |
Sequence | CACTTGGTCAATTACATAAAATATTCTAGATATTTCCGAGAAACAGAAAAAATGGAAACTTTGTGAATTTTAATACAAATAAAAACCCAATTATATTTTT GGGTTGGTTTTGCTACTATCATCATTCACTCACTGTATTTAATCCTCCTCCAAATGGAACAAAACCCTAATGGTTCTTGTATAAACCAGTAGCCGCCGGC TTGATCCTCTTATATATTGTTCATCTTTTTCTTACCTCACTGTTTTCTCTTTTCTTGGTCTTACTTCATAACCTTAATTTCACCTTTAGGAATTTCTTGT CTATAATCATGAAAACTTGACTCTGGACTCTAGAAAACTTGAATTAAATTTTGCAATCTTGTTTTCTGATTGATTCTCCGTGTAGTTTTTGTTTCAGCTT CTGAAATGTTTTTGCAGCACTTTTTCATAAAGTAAAGCTTGAATTTCTCTTGGTAGTTTTTTTCTTCAGTAACTGCAAGTCATAATTTTGTGAAGTTGCC AATATGGGGTGTGGTAATTTAGCTTCTGTGATGAGAAAGTTTGATTCTTTTAGTTGTTTCTGGGTTTAGGGTTTAATTTCAGGTTTTGGGTAATCAGCAG TTTTAGTTTTGAAGTTATATTTATGAAATAGATGATTAGAGTGTGATTATCAATTATCAATATTAAATTTAGATTCTGAAGAATGTTGTCTGAATTGGGA AGAAGACCGATGCTTGGGAACAAGGAGGGTTCTTTTGGTGATGATTTGGAGAAGGAGTTAGGGATGTTGCTTCGTGGGCAACGTAGACAGGAAAGTGATG ATTGGGAAAGAGAACTCAATATTTTCAGAAGTGGATCAGCGCCTCCAACTGTGGAAGGTTCTCTTAATGCAGTTGGAGGATTGTTTAGTGGTGGTGCTGA 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Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_61505; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_156432
Blastp | Pumilio homolog 2 from Arabidopsis with 56.86% of identity |
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Blastx | Pumilio homolog 2 from Arabidopsis with 56.19% of identity |
Eggnog | pumilio homolog(COG5099) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT2G29190) |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000352) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019454082.1) |
Pfam | Nucleic acid binding protein NABP (PF07990.11) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |