Id Trinity | FTRINITY_DN56664_c0_g1_i6 |
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Name Transcript | Ll_transcript_83907 |
Sequence | CTTCAGTGAGGCGTTATCCGTTTTAGAGAGAAACTAAAACAAAAACAAAAAAACAAAAAACTTTTCTTCTTTTAGATCTTGCAAAAACCCCTAAACTTTT TTTCCCTCACTTTTCTTTCTTTCCTTTTTCTTTCTTTCCTTTTTCCTTCTTTCCTTTTTCCTTCGTTCCTTTTTCCTTCTTTCTTTCTCTGCATTACACT TCATTCCCAATTCCTCGAATTCCCATGAAAGTAACCATGACGTTGTGATTCACATAAATGGATGATCGAGGTGGATCGTTCGTTGCTGTTAGGAGAATTT CGCAGGGTCCATGCCATTCAAGTTCTGGTAAAATTTGTTTAACTTTTTCTACCTTAATTTTCAAGTGATTTTCTCCAATTTTCACTATGTAACGTTCTTC TATTCCTTTTTAGTTAATCAATGAGTCTTTGATTCGGGATTGAGAACCGGGTTTTTACTTGCGTCATGTTTGCGGATATCACAAATTGCGTTGGTGGGTG AATTCAAAAAATTACTCTTTTTTTAATTTCTAATATGGGTTTTTATTCTTTTCAAGTTTTGATTATTGGGTATAGTTGAATTTACTATATATCTATGTAA AGTTCAAAATACTAGTATTTTTGTGTTAAAAGCTCTTTATAATACTTAATGGAGTAATTTTGTAGATCTAGCATTCATGAAATGCATCAGCTCCTTTATT CAGGGCCCATTTACATGATTAAGAAAGTGATTAGTAGATATTCTAAAAAAGTGATTTTGGAAAAGCTAAAAATATAGCTTCTCATAAATCCTGAGTTTCT GCCTTTTGTGCTTCTGGTTTTTAGTAAAAGCCCTACCAAATAAGCATTTCAGAAGATGATTTTTGTACCAAAAAGGAATTTTTTGTAGTTGTGAAAATCC TAAACAAATGGGGCCTATATAATATATATTGAAAGTTGAGATTTTTGTATCAATTTTATATTGGTGTGAAGCTGAGATCTACTGATGAAGCGCAGTAATA GTGTGGAAAATAAAATTGTAAACAAAGCAAGCCGGGGGTTCATGAACCATGATGATTTTGTAAAGCTAGTGGCAGTTTGTGTGATTGATATGAAGGCCAT TTTGCTTGGTGGTTATATTGGTTTTGAGTTGGCCGGAACTGACTATGACCTTTGTGATTTGCCTCAGATTTGACAAGTGAATAATTCACGAAACCAAAGT GGTTTTCGAGTGTTACATCATTTAGAAAGTAATAGAGAAGGGAGGCTGTGAAGAGATAGACAAGTGTTATTGTGGTCCAAATAAACTGAATGTTTCTTAC TTCATGCCTAGAAGCGGAGCTGAATTAAAGCTTATAACATATTTATGATAGCTAATTAATACGTGTAAAAAAATAATTTCTGTCAATCAATTATTGTAAA TTTTGCAGCACAAAAATGGGAATCTCTATCTTCATTTAAGGGCAGTTTCGTTTTGTTACAGCTGAGATTGTAGCAGGATCTACAGCATGGATTGGTAGAG GTCTTTCTTGTGTCTGTGCTCAGAGAAGAGAGAGTGAATCACGTCCTTCTTTTGATTTAACTCCAGTACAAGTAAGATTTTATTGATTTAATTGCTGGAG CAGCAATTTATAGCTAATTTAGTGATTCTGTTAATTTTCTCTTGAATCTTCCTGCCATACATAAAAGAAATGTTGTTCTAGGGTATGTGACATGTGTATA AAGGATGTGCCATGTTTTTATTTTTTGGTTACTATTGTGAATATTGTGATGATAAGCATCTTCCGAACATAATCGACAGACAAGATTGCACTTTACCCTT TTATTGAATGATCAATCTTCTTTTCAAATAATAAAAGTGTTCAAGTGGGTTCCTTGCTATATGCTCTTTTCTTGTGTATCCAACATACTTTCTACCTGGT TTGAGCTAGCTAAAAATCTGATCGCTGGAGAAAATTATTGAATAGAAAAAGCTGATAGACTATTGTGTTTAGTGGTGCCAAGATGCTGGTGTTCCTACTT ATTATTTGAAATTCTTGATACTTTTTATTCCCCTTTGGTTTTTAGTGATCAAATTATGAGGCTGACATACTCTTGTCTTTGCTTAATCTTTGTGTGTTCA AAAGCTTTCTTAACTAGAATTAACTATTCACATATTTTTGGAATTTATGCAGTTATGTTATGCTCAATTTTTCTCTTGCTCTGAATTTGTAGTAGCTTCC AATCACACCCATCTTTCACATGGCTGGGTTTTTTGTATGAATTTTTTTATATTCAGTACTTTGATCATGTTGTATACCTCTTTGGATCAAAATATTGCAC TCTAATTATCTTTTCTATTAAATATTGTTTACAATTATGGCAAAATTCTCGATGCTGAACTTTTTATTCTCAGGAAGAATGCTTGCAGAGGATACAGAGC CGTATAGATGTTCCCTATGATAGTTCTATCCCTGAGCACCAGGATGCCCTAAAGGCTTTATGGGATACTGCATTTCCTGAAGAAAAACTCCATGGCTTGA TTTCTGAACAGTGGAAGGAAATGGGCTGGCAAGGGAAGGATCCATCAACCGATTTTAGGGGTGGTGGTTTCATATCATTGGAGAATTTGCTGTTTTTTGC TAGAAATTTCCCAGTATGTCTGTTTCTTATTTTATTCATTCTTTGTGATGCTATAACTAATATTTTGGAGCATTTGTTTCGACACGGACCCAAACGAATG TTCTTTTTTGCATGCTCATATCCCTTGCTTCCTTGCATAGTTTCACTATTTTGGTGGTGAAGTGTAGATTGCATGTTTCATTTGTCACGTGGTTGTCGAT TTGTTTCGTTTAGGTTTTACTAGACATGGGTTTTATCTTACATGTTTTACTAGACACATTTTTGCACTTCTATGAGACCCTTTGCCCCCGTGTTTTGCTC TTTGTTAATCTACTATTGGTTCAATGGTTCTCAACTGTCTTGTGAATCTTAAATCTAATAAGTCATCTTTGCTATTGGTATCTCTTTCTCATAATGCCTG AACTTTTTATTCTGTAGAAATCCTTTCAGGATCTTTTACGGAAGCAGGAAGGAGATCGATCAGTTTGGGAATATCCATTTGCTGTTGCTGGTGTTAATAT CACATTCATGCTAATTCAGATGCTTGATATCTGAG BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_62058; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_83907
Blastp | - |
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Blastx | ELMO domain-containing protein 2 from Homo with 44.59% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019459125.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |