Id Trinity | FTRINITY_DN56745_c2_g1_i23 |
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Name Transcript | Ll_transcript_190789 |
Sequence | CAATTTTGAAGAGTACATGTTTCAAAAGAAGAAGAAGAAGAAAACTAGAAACAAAGTTGATTGAATATGAAAATGCAAATTCAATTTTCTTTCAAATTTC ATTAATCTAAGTTTGATTCAACAAAGGTTATAGTTTTACTATTTCTGTTCCTGCGAACTCTCCTTTCTTCTTTTTCTCTCTCTACATTTCTCTCTCTCTC TCCCAAAGAGAGAGAAGAAAAAATGGAGGTTGAAAATGCAAGTGTAATGTGGCAAGGTGTTATGTTAGGAGCAATAGTTTTCTGGATTTTATGTTCCTCA TACCTCAATTTCACTCAAAAGTTAAGATCTTTTCTTCAACCTTGGGTTAATCACCATGTTGAAACTGGAACCCATGTTATTCTTCAGATCCAGAGTTACC AGCATAGATTCCTGGATGCATTTTTCTCTGGGTTGTCATGTGTTGTTTCTGTGCCTTTTTACACTGCTTTCCTTCCTCTGCTATTCTGGAGTGGTCATGG CCAGTTGGCGAGGCAGATGACATTGCTGATGGCGTTTTGCGATTATATTGGGAACTGCATAAAGGATTTGGTTTCGGCTCCAAGACCTCCATCTCCACCG GTTAGGAGAGTAACCGCTACAAAAGATGAAGAAGATAATGCCTTAGAATATGGACTGCCTTCTTCCCACACTCTTAACACAGTTTGCTTATCCGGGTATT TATTATTCTGTTTATTTATTTTTATTCCGAAATCATATCCTAATTGGCGTGGGGCTAATTTAGCTGGTGTAATAACAGAAAGGGATTCTAGACATGCCTT TAGGGTGAGAAATTTTCGTGTAGTGTTATAGAGATTGTTAGATATGTGTCTTTGACGGATAAAGATCACCGGTCCCAATGGTGGCGCATTCCCTGTCCCG GACCAATCACATATTGGCACATGAATAAAAGAATTTTTAAAAACAAAAGGTAACAAAAAAGTAACATTCTGATTGGCTTGGGACAGGGAACGGGACACCA TTAGGGATAGTTGATCTACGTCCTGTCTCTGACTAGAGAATTGAGCCGGTGGCATGCCTTAAAAGTTAATTCATATGGTTACACTTACCTTTACCATTTC TCCATCTATGTTTTGGACCAAATTAGGAGAAAATAATAACTAAATGGGTAAAAAGTAAAAACTTGGTAATGTATTTAAAAGGATAAATTTTATCTAACTT TTGTCGTCAGTTTAACTTGATTAGAAGAATATAGTTTTTCAATGTCCGATTGTTTGTGAAAGATGAAATATTTGCTTTCAATTCTTTGGTATTGTCGTTG ATGGATCTTTCTCGTTGGAATTGGTGTTCATCAGCTACCTTTTGCACTATGTGCTGACTCATACTCAAAATCAAGGTCCCTATGTTAGTTATCTCGGAGT TTCACTTGCTTGCTTGTTCGTGGTCCTCATTGGCTTAGGAAGAATTTATCTTGGCATGCACAGTTTGATTGATATTCTTGCTGGCCTTGTTTTTGGACTC GGGATCCTTGCATTTTGGCTTGCTGTTGATAAGCAAATAGACAGTTTCGTGATCTCGGGACTAAATGTTACGTCTTTTTGGGGTGCCCTGAGCTTCCTCT TGCTTTTTGCTTACCCGACTCCCGAACTTCCCACTCCAAGCTTTGAGTATCACACTGCTTTCAATGGTGTTGCATTGGGAATTGTAAGCAGTTTCACATC CTTTAACATCATCTAACCTTGTTTAGTCTTTCATATTATGAATGAATATACACAATATTACATAATTTCTTCTTGATATAATTTAGACATAACGAGTGAG AACAGGATGTAGGATTATGACACTTACGTAAGTCAGACCAGAAACACAGGTCTTGGCTCGAGGCGCTTTAAGTAATTGCAATTTATTAGCTCTAAACACA TTTCAATATTGGGGGCTCGGTATAAGAATTTAAATTCCGAACATTACTGGGCTAATCTGACTAGTCTTGAATGGTACAGTCTTACTATTGCACCTTTTGC ATGGAGCGCTAACGTTTCAGATGAATATGCTGAATACAAATTTATCTAGTGCAACTGTAGAATAGGCACATCAAGTCTCTGACATCCGCAATAAAAATGA TCCATATTATACGGAAACATGTTAAGTACAGTTTCATATGCTCACGGATAAACATCAAGCTAAGTTTCAAATGTTACTGCAATGCAGTTCACATCGTTGC AAGTTTGGAATACAGCGATTTGAAGTAGAATCAAGTAGTCTCTTAGTCCCCTAGGATTTGTTTTGGTAGTCCTCTGATACTAACTAAGCATGCCAAGGGA CGGAGCCTTCTAAATTTGTTTATTTTATCCCGATAGGAATTTTTAGCTTCGGGAGAACTGCAGCGAAGAATGTTAGAGTATGAGCTAATCTTGAATTAGA TCCCTTAGTTTCGAAAATTTGGAATTGAACATCACTGATGACTGTAATTGGAGGTGAGGAGTATGCTACTGGCTTAGTCATTTTTCTAGTATTCTTTCAT ATAGCATCTGCAATGCATTTGGAACACTTCAGTTTCTGATAGTGGAAGCATTAAGAATCATGTTTGAAGAATAGGAGAACTGGATTTGGTCCTGCTGCCT ATATATTCACAGATAAGTATGATCGGTGGTAGCTCAACAGGAATATCGTCGGAAGTTTCAAACTCCATATTTTTACCCCTTAAAGAAACCAGTACATTTT AATGAACTTATTTTTCTTTTTGTAGAATGCTAACTACAATGTATTTCTAGATGAATAAATCATTAGATTATCAACCCCTTGTGAAGAATTATAAACTCGA AAGTGAATTTTGAGGGTCAATACTCAGTATGAAGCCCTTCAAACTGTTTGCCAAGGCCCAGACACGCATTTGTAAGAGTTGACATCGTGTTCTTGAAGTA TAGCATGATCAAACTTCTTTGGTCTTGATTGCGGTTACCAGTATTTTTAGGTGTATTTTGTTTAATCACTTCTACCTTGAATTGTTGTGATCAGCACGGT GCGGAGCTAGATTGTGATGCCCTTTTTATCCTGTTTATTATTCTATATTTGTCAGTATCGAGTTCTTGTTATATAGCAATAAATCATTGAGTCATTCCAG TGTCTAAAGCCTTTTTAAAAGAGCTTTCTCTTGTTTAGTCTTACTTCCATTACTTGTATTCTGACTATTAGGGGTTTCTTATGCAAACCATTACAATTTA GTGTTGTGTTGTACCATGTATTTTACTTAGACCTGTTATGACCCTTCCCTGGATCCTTTGCATAGAGGAAACGCTATCGCACCAGGTTGCCCTTTATTGT ACCATGTTCTATGACAGAAAATATGGTTGAATCGCGTCTATGTTGTAATAAAAGCCTCGGTTATATGAGCTGATTAAATAGAAAATGGTGTCATTGCGAA ATAGATTAAGACTTAAATTAGCCTGGTATAAAGCCTTCTCTAAAGCGACTTTGAGAGTAATGTGTGCAAGTAAGGATACATTCACCCTTGATTAGCTAAA GTGGTTGAAACTTTACACTAAGTTTCTTCTAGATGATGGTTTGATTTTAAATGCTCATGTTGTTCAGGTGGCCGGGGTACAGCAAACATACCAACAATTC CACCACGACGGAGTTCCACGATTGTTCTCTCATGACTTGACAATACCTGTATTTGTCGGAAGAATGATATTGGGAATACCTACAATTTTGCTCGTAAAAT TCTGCAGCAAAGCTCTTGCAAAATGGATTATTCCAGTGGTAGCAAACACGTTGGGCATACCGATAAAATCAAGCAGCTATGTAAAATCGGATAAGATTAA ACAAGGAGGTTGCTTGCAAAAGCTGCTTCCAAAGCACGAAGTATTCGATGTTGATACCGGAATTAGATTTGTTCAATATGCAGGTCTTGCTTGGTCTGTG GTGGACCTTGTGCCATCTCTTTTTACATATACCAACTTGTGAGGTTGAGATATATGTGCTTAGAGTTCCAGTTTTGTACAGCAAGTGATCATCACCCTTT GATCAATCAAAATTATTTTCTTGTAGTAGGATTCTCTCAACTTATTCCATTGTAAAGAGTATTCTCAATCCTCTATAAAAATTCAAGGTTTATATTCAAA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_62828; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_190789
Blastp | Lipid phosphate phosphatase delta from Arabidopsis with 76.43% of identity |
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Blastx | Lipid phosphate phosphatase delta from Arabidopsis with 74.25% of identity |
Eggnog | PHOsphatase(COG0671) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G58490) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019455474.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |