Id Trinity | FTRINITY_DN56752_c2_g2_i11 |
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Name Transcript | Ll_transcript_188441 |
Sequence | AGTGATGGACATTGGCCTGCTCAACTTACTGGGAATCTCTTTTTCCTTCCTCCTTTGGTATTTTGTTTATACATTACAGGGCACCTCAAATCAATATTTC CAGAAGAGTATCGAAGAGAGATCCTTCGCTATATATATTGTCATCAGAACGAAGATGGCGGTTGGGGACTACATATAGAGGGTCATAGCATCATGTTTTG TACTGCATTCAACTACACATGTATGCGCATTCTTGGAGAAGGGCCTAATGGAGGTCAAGACAATGCTTGTGCTAGAGCAAGAAAATGGATTCAAGATCAT GGTGGTGTTACACATATACCTTCATGGGGAAAAACTTGGCTTTCGATACTTGGTTTATTTGATTGGCGTGGAGCTAATCCGATGCCACCTGAGTTTTGGA TCCTTCCTTCGTTTCTCCCCATGCATCCAGGTTTAGTTAATTAATTCATTTTTCTTTCTCACTATCAACTTAATAATATTTTATGTAATGTTATTAATAT TATACATGTCATCAAACCGGTTAGGATACTGATATAGTGGTATAATAGTTTAATCGGTGGTTCACTAATTAAACTATATACATGTGAAGTTATATATATA TATAATATTAATATTAATGTTGAAAAATCAATCATTTTTTATTTTCATTAATAAATTAATTTTACATAAAAATTGGTCAGTATAATTGGTACGATTTTAT TGAAAACTAGTCGGTATGACCGGTTTTTGCCAATCTGGTATGATTGTATGACCAAAATAATTATTGTACGATACCGGTACGAGAACTGATTCACTGGTTA ACCGAACAATCGGCCGACACGAAATGGTTTTTATAACACTGATTTTATGTACCAAAAAAATAATAATATTTCACATGTTTTAAAATATCTATCAATTAAT TTTGTGAAATATAAATATATTTAGTTTAATTATTCCATTAATGCTTCTCATTTCATTCAGCAGAAAAAATATTAATTATTTCTTGATTTCATTAAGTAAC CAATAATTTGATACTATATATATATATGAAATTGAATCATGAAGTATATATGATTACTGAATTTAATATTTATTATATCACCTTAATTAATACAGCTAAA ATGTGGTGTTATTGCCGATTGGTATACATGCCCATGTCCTACTTATATGGTAAGAGATTTGTGGGACCTATCACACCACTCATTCTACAATTGAGAGAAG AACTATATACTCAACCTTATGAAAAAACTAATTGGAAAAAGGCACGTCACCAATGTGCAAAGGAAGATCTTTATTATCCCCATCCTTTATTACAAGATTT GATTTGGGATAGTCTATACATATTGACTGAGCCACTTCTTACACGTTGGCCCTTCAACAAGCTAGTTAGAGAAAGAGCACTTCAAATAACAATGAATCAT ATCCATTATGAAGATGAAAATAGTCGATACATAACAAATGGTATCATGGAAAAGATTTTATGTATGCTTTGTTGTTGGGTGGAAGATCCAAATGGTGTTG CTTTCAAGAAGCATCTTGCAAGGATCCCAGATTATTTATGGGTTTCAGAAGATGGAATGACCGTACAGGGTCTTAGTAGCCAAGGATGGGATGCGAGCTT TATTGTTCAAGCTTTGTTTGCCAGTAATCTAGTTGATGAAATTGGTCCAACTCTCGCCAAGGGACATGATTTCATCAAGAGATCACAAGTGTGTTGGATC TTCATGATAAATACATTACAATCCCCTTTTGAATTAAGGAGAGAAAAATCAATAATATTCAGGAGTCCCCAGCTCATACGTATTCAATGACTTAACCTAC TAATAGAAAGTTGAATAACTAGAATGAACACTGGATGCTAAAATGTGAAAATGATAACTAACTTTATGTAACAAATATGATAATATTATGATAGATGAAT GTATATATGATGAAAAAAGTTAGAGCAATTCCTAATGTAGAAAAGATTGTAGGCTTTAGCTAATTTAAAAATGTATGGGAGAGATTGTTAGAAGCCTCAG TAAGGAGTGTATATCAAATGAGGGTTAGTCCAATTTCAAGAATAAGATGAATCTCAATTAAAAACATGGTAAAACGAAAAAAGAAGAGATTAAAGTTTTA TCAATGAATATGATTTATGATATATGAGTATAATATTATATGATCTATATAGTTAACTTCACAGAGTGGGATTAAAGCTTGATTGCTATTTAGACACAAT TATTGCAATCATAATCCTCTCATTATTGATTAATAAGTTTGTGTTGTGCATTATTAATTGGTAACTCATCCCCTAAATCTACCATATATAATGCATCACT TCCTTATTCCATTTAATAGGTTAGGGATAACCCCCAAGGAGATTTTAAAAGTATGCATCGTCATATTTCTAAAGGATCGTGGACTCTTTCTGATCAAGAC AATGGATGGCAAGTTTCTGATTGTACTGCAGAAGGTTTAAAGTGTTGTTTGCTTTTATCAACGTTACCATTGGAGATTGTGGGAGAAATGATGGAACCTG AAAGGGTATATGATTCTGTCAATATCCTTTTGTCACTCCAGAGTAAGAAAGGTGGTTTAGCTGCGTGGGAACCAATAAAAGCTCAAGAATGGTTAGAAAT GCTCAATCCCACAGAATTTTTTGAGGGCGTTGTAGTTGAGAGTGAATATATTGAATGCACTGCATCAACAATTCAGGCGTTAGTTTTATTCAAGAAATTA TACCCAGAGCATAGGACAATAGAGATAGAGAATTTTGTTGTGAATGCAGTTCGATTCCTTGAAGAGACACAAATGGCTGATGGTTCTTGGTATGGGAATT GGGGAATTTGTTTCATTTATGGTACAATGTTTGGACTGGGTGGTCTAGCAGCTGCAGGGAAGACTTTCACTAACTCTGCTGCCATTCGCAAAGGTGTGAA ATTTCTACTCTCAATACAAAGAGAAGATGGTGGGTGGGGAGAGAGCTATCTTTCATGCCCAAGAAAGGTTCATATTTGAATTATTATTACAATCCTATTG CTTCCTTATTGAAATTAATTTTTTTTCGAGATATATGAGTGTCTTGCAATAAATGCTGTTTTTAAAAATTGATTTATTTGATGATCTAATATCTTATACC ACTAAAACTTGTTGGTTCTACAATAATATCTATTCACCTATACTTTTTCAACTCCAACTTTAACTAATAATAATGTCTTAATTTTAATGAATTTGAGTAA TGTAGATTTACGTACCTCTAGAAGGAAGTCGATCAAATCTTATAAATACAGCATGGGCTTTAATGGGTCTAATTTATGCTGGACAGGTTTGTTTTTTTTA TGTGTTGCGTAATGAAAATTACATTGCAATGTGTGTTTGGGGGCTAACTTTATCGTATATTAAAACTCAAAATGCTTATTTTTTTATATATTCAGGGAGA TAGAGACCCGACTCCTCTTCATCGTGCAGCAAAGCTGATCATCAATTCACAATTGGAAGAGGGTGATTGGCCTCAGCAGGAAATCACAGGAGTATACTTG AAGAATTCCATGGTACATTACTCAATGTATAGAGATACTTTTCCATTGTGGGCTTTAGCTGAATATCGTAGGCATGTTCCATTGCCTTGAACCACAGCTT AACATAAAATGCTACGAGCATTGAGAGATTGCCAAATTAAATTAATATAAAACAAAGCAAATGGAAACCATATTGGTCATATATTTAGGTGATTCCTTTC ACTCTAATTATTATGTGCAGTATATCTGTTAAAAATCATATGTAGTCAAGCTTGGTTTACTTAATAGGAATTAAGTTGGCAGAAAACCATGTGTAATGGA GGCACAAAGACCATTTAACCTAAATGATATCTCATTTTATGTCTCAAGTTAACCATAATGTTTTATTTTGTTTTTAAATTTCCACTTTTATTCATTTGTC AATATGCGATTAGCTCAGGATAAAAAGTGAGATACTGTTTGAGACAAATGATTTTTGTCCATTGAACATTTGGTTTTATTGAGATGTACTTTGTTAGTAA AATTCACGTTGGATAAAAATCATGTGTAATGGAGCTTATTTAATTTACTAGCATATCTATATATTAAATTTCACATTGGTATGTTAACTGTGAGAAAATT GTTAATGC BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_62886; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_188441
Blastp | Beta-amyrin synthase from Glycyrrhiza with 80.29% of identity |
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Blastx | Beta-amyrin synthase from Glycyrrhiza with 84.65% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (BAA89815) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019432607.1) |
Pfam | Squalene-hopene cyclase C-terminal domain (PF13243.5) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |