| Id Trinity | FTRINITY_DN56752_c2_g2_i8 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_188433 |
| Sequence | AGTGATGGACATTGGCCTGCTCAACTTACTGGGAATCTCTTTTTCCTTCCTCCTTTGGTATTTTGTTTATACATTACAGGGCACCTCAAATCAATATTTC CAGAAGAGTATCGAAGAGAGATCCTTCGCTATATATATTGTCATCAGAACGAAGATGGCGGTTGGGGACTACATATAGAGGGTCATAGCATCATGTTTTG TACTGCATTCAACTACACATGTATGCGCATTCTTGGAGAAGGGCCTAATGGAGGTCAAGACAATGCTTGTGCTAGAGCAAGAAAATGGATTCAAGATCAT GGTGGTGTTACACATATACCTTCATGGGGAAAAACTTGGCTTTCGATACTTGGTTTATTTGATTGGCGTGGAGCTAATCCGATGCCACCTGAGTTTTGGA TCCTTCCTTCGTTTCTCCCCATGCATCCAGGTTTAGTTAATTAATTCATTTTTCTTTCTCACTATCAACTTAATAATATTTTATGTAATGTTATTAATAT TATACATGTCATCAAACCGGTTAGGATACTGATATAGTGGTATAATAGTTTAATCGGTGGTTCACTAATTAAACTATATACATGTGAAGTTATATATATA TATAATATTAATATTAATGTTGAAAAATCAATCATTTTTTATTTTCATTAATAAATTAATTTTACATAAAAATTGGTCAGTATAATTGGTACGATTTTAT TGAAAACTAGTCGGTATGACCGGTTTTTGCCAATCTGGTATGATTGTATGACCAAAATAATTATTGTACGATACCGGTACGAGAACTGATTCACTGGTTA ACCGAACAATCGGCCGACACGAAATGGTTTTTATAACACTGATTTTATGTACCAAAAAAATAATAATATTTCACATGTTTTAAAATATCTATCAATTAAT TTTGTGAAATATAAATATATTTAGTTTAATTATTCCATTAATGCTTCTCATTTCATTCAGCAGAAAAAATATTAATTATTTCTTGATTTCATTAAGTAAC CAATAATTTGATACTATATATATATATGAAATTGAATCATGAAGTATATATGATTACTGAATTTAATATTTATTATATCACCTTAATTAATACAGCTAAA ATGTGGTGTTATTGCCGATTGGTATACATGCCCATGTCCTACTTATATGGTAAGAGATTTGTGGGACCTATCACACCACTCATTCTACAATTGAGAGAAG AACTATATACTCAACCTTATGAAAAAACTAATTGGAAAAAGGCACGTCACCAATGTGCAAAGGTAAGAGACATTGTCTTTTCTAATAAAAAGTTATGTAA ATATGCATATCCCATGTATCATTTGATAATTGTTAATTACATATCACAGGAAGATCTTTATTATCCCCATCCTTTATTACAAGATTTGATTTGGGATAGT CTATACATATTGACTGAGCCACTTCTTACACGTTGGCCCTTCAACAAGCTAGTTAGAGAAAGAGCACTTCAAATAACAATGAATCATATCCATTATGAAG ATGAAAATAGTCGATACATAACAAATGGTATCATGGAAAAGATTTTATGTATGCTTTGTTGTTGGGTGGAAGATCCAAATGGTGTTGCTTTCAAGAAGCA TCTTGCAAGGATCCCAGATTATTTATGGGTTTCAGAAGATGGAATGACCGTACAGGGTCTTAGTAGCCAAGGATGGGATGCGAGCTTTATTGTTCAAGCT TTGTTTGCCAGTAATCTAGTTGATGAAATTGGTCCAACTCTCGCCAAGGGACATGATTTCATCAAGAGATCACAAGTGTGTTGGATCTTCATGATAAATA CATTACAATCCCCTTTTGAATTAAGGAGAGAAAAATCAATAATATTCAGGAGTCCCCAGCTCATACGTATTCAATGACTTAACCTACTAATAGAAAGTTG AATAACTAGAATGAACACTGGATGCTAAAATGTGAAAATGATAACTAACTTTATGTAACAAATATGATAATATTATGATAGATGAATGTATATATGATGA AAAAAGTTAGAGCAATTCCTAATGTAGAAAAGATTGTAGGCTTTAGCTAATTTAAAAATGTATGGGAGAGATTGTTAGAAGCCTCAGTAAGGAGTGTATA TCAAATGAGGGTTAGTCCAATTTCAAGAATAAGATGAATCTCAATTAAAAACATGGTAAAACGAAAAAAGAAGAGATTAAAGTTTTATCAATGAATATGA TTTATGATATATGAGTATAATATTATATGATCTATATAGTTAACTTCACAGAGTGGGATTAAAGCTTGATTGCTATTTAGACACAATTATTGCAATCATA ATCCTCTCATTATTGATTAATAAGTTTGTGTTGTGCATTATTAATTGGTAACTCATCCCCTAAATCTACCATATATAATGCATCACTTCCTTATTCCATT TAATAGGTTAGGGATAACCCCCAAGGAGATTTTAAAAGTATGCATCGTCATATTTCTAAAGGATCGTGGACTCTTTCTGATCAAGACAATGGATGGCAAG TTTCTGATTGTACTGCAGAAGGTTTAAAGTGTTGTTTGCTTTTATCAACGTTACCATTGGAGATTGTGGGAGAAATGATGGAACCTGAAAGGGTATATGA TTCTGTCAATATCCTTTTGTCACTCCAGAGTAAGAAAGGTGGTTTAGCTGCGTGGGAACCAATAAAAGCTCAAGAATGGTTAGAAATGCTCAATCCCACA GAATTTTTTGAGGGCGTTGTAGTTGAGAGTGAATATATTGAATGCACTGCATCAACAATTCAGGCGTTAGTTTTATTCAAGAAATTATACCCAGAGCATA GGACAATAGAGATAGAGAATTTTGTTGTGAATGCAGTTCGATTCCTTGAAGAGACACAAATGGCTGATGGTTCTTGGTATGGGAATTGGGGAATTTGTTT CATTTATGGTACAATGTTTGGACTGGGTGGTCTAGCAGCTGCAGGGAAGACTTTCACTAACTCTGCTGCCATTCGCAAAGGTGTGAAATTTCTACTCTCA ATACAAAGAGAAGATGGTGGGTGGGGAGAGAGCTATCTTTCATGCCCAAGAAAGGTTCATATTTGAATTATTATTACAATCCTATTGCTTCCTTATTGAA ATTAATTTTTTTTCGAGATATATGAGTGTCTTGCAATAAATGCTGTTTTTAAAAATTGATTTATTTGATGATCTAATATCTTATACCACTAAAACTTGTT GGTTCTACAATAATATCTATTCACCTATACTTTTTCAACTCCAACTTTAACTAATAATAATGTCTTAATTTTAATGAATTTGAGTAATGTAGATTTACGT ACCTCTAGAAGGAAGTCGATCAAATCTTATAAATACAGCATGGGCTTTAATGGGTCTAATTTATGCTGGACAGGTTTGTTTTTTTTATGTGTTGCGTAAT GAAAATTACATTGCAATGTGTGTTTGGGGGCTAACTTTATCGTATATTAAAACTCAAAATGCTTATTTTTTTATATATTCAGGGAGATAGAGACCCGACT CCTCTTCATCGTGCAGCAAAGCTGATCATCAATTCACAATTGGAAGAGGGTGATTGGCCTCAGCAGGAAATCACAGGAGTATACTTGAAGAATTCCATGG TACATTACTCAATGTATAGAGATACTTTTCCATTGTGGGCTTTAGCTGAATATCGTAGGCATGTTCCATTGCCTTGAACCACAGCTTAACATAAAATGCT ACGAGCATTGAGAGATTGCCAAATTAAATTAATATAAAACAAAGCAAATGGAAACCATATTGGTCATATATTTAGGTGATTCCTTTCACTCTAATTATTA TGTGCAGTATATCTGTTAAAAATCATATGTAGTCAAGCTTGGTTTACTTAATAGGAATTAAGTTGGCAGAAAACCATGTGTAATGGAGGCACAAAGACCA TTTAACCTAAATGATATCTCATTTTATGTCTCAAGTTAACCATAATGTTTTATTTTGTTTTTAAATTTCCACTTTTATTCATTTGTCAATATGCGATTAG CTCAGGATAAAAAGTGAGATACTGTTTGAGACAAATGATTTTTGTCCATTGAACATTTGGTTTTATTGAGATGTACTTTGTTAGTAAAATTCACGTTGGA TAAAAATCATGTGTAATGGAGCTTATTTAATTTACTAGCATATCTATATATTAAATTTCACATTGGTATGTTAACTGTGAGAAAATTGTTAATGC BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_62886; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_188433
| Blastp | Beta-amyrin synthase from Glycyrrhiza with 80.29% of identity |
|---|---|
| Blastx | Beta-amyrin synthase from Glycyrrhiza with 74.03% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | Link to kegg annotations (BAA89815) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019432607.1) |
| Pfam | Squalene-hopene cyclase C-terminal domain (PF13243.5) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |