Ll_transcript_187998

Id TrinityFTRINITY_DN56797_c4_g1_i9
Name TranscriptLl_transcript_187998
SequenceCAACTTTATATTATCTTTCACCATAAATAAATAAATACATACATTAATCTTTGCATTTGTTCTATTATATAAGCTTAGAGGAAGTTGGGTAACGGTTAAC TTCCCTCCAAACCTTGTTTCTACTTTTATTTTGTTGCTAAAACCTTCTGCTTGGTGCAAAATATCTTTCAATTAAGGTGCTTGTTCAATTTGAAGTTCTC ATCTTATAAAACTAACTTTTATTGTGGAATTTCAGAAATACTGGAGCTTATTTTATAAGAATCACACAAGACTTGATTTCTGATACTTGTCTTTCAAGTT TGGAACTTTTTTATTATAGACGAAAGGGGTATCCTTAATTTGTTTATGTGAAGCTTGATTCAATTCCTGATTCCTAAGAGAAGATTATTCCAATGAATTG TAGGTGCTCCTTACCACCAGAGTCCTTGTTTAATTCAAGCAGCATGGTTTCATTATCTTCAAATTCTGCAGCAGGAGAAGAAGGTAGAGTGGTTAGTGAT CTAAATAGGCCTCTATCACACACCTTGGCACCTTCTTTTTGGATTCGGATGGCTATGAGAATATCTAGAGCAAGGTGGTTTGGGTTCTTAAGAAGAGTAT TTCATTACCAAAATGGACCAAGCTCACACCATGGTACTAACCCTTTCGATTCTAGCACATGGATGATGCTGGAGTTCATTGCTTTGGTGGTGCAGATAAT TACTACAACATCTACTTTGGTCATTTCAAAGAGGGAGAGACCTGTTTGGCCTATGAGGATTTGGGCAACTAGTTATGATATTGGTTGTGTTCTTAATCTG CTGCTACTTTATGGCCGCTACCGTCAAATATATTTGATTCCAGGAGATACTCTTCACCTTTCTCATCTGGAACATCAGAGAAACAATGAAGAAACCAGGA TTCCACATTTAATGAATAAGTGCAAGACTTCAGTTGAGCTTTTCTTTGCCGTATGGTTTGTGATGGGCAATGTTTGGATTTTTGAGTCATCACGTTTTGG ATATTTCAATGAAGCTCCAAAGCTTCATGTGCTCTGCATCACCTTACTTGGTTGGAATGCAATCTGCTATTCTTTCCCTTTCCTACTGTTTCTGCTCTTA TGTTGCTGTGTGCCACTTATTAATCGCCTCCTCGGATACAACATGGTCTCTTCTGATAAAGGAGCAACTCATGATCAAATTTCACAACTCCCAAGTTGGA CACATCAACAAGTTCATACCAAGTTAGAGCTTGGCAATGATACAGAAGGCTGTCACAAATTGATTAATCAAGATCCTGTAAGTCACACCATTCTTAATAC AAAGAATTAGTAATCTACTCATACAAATTTTGCTTCAATTTGTATATTGAATTAATAAATTTGTTCTGATTTGGTTGGTTCCAGGAATGCTGCATTTGCT TAGCCAAGTATAAAGAGAAAGAAGAAGTTAGAGAATTGCCCTGTTCTCATATATTCCACCAAAAATGTGTGGATCAATGGCTAAAAATTATATCCTGTTG CCCTCTTTGCAAACAAGGATTAGAGAGGACAAAATAGTTTGAGACTTATTTGGTGATATACACTCTTGATGTTACCCACATTGGCCATATCATATGTATA CTTTCCAAGGGTTACTAGAGTGAGTTTGTACATGTATATATAATAGCTCACCAGTTACCAAAACTACACTCAATATTTGGTTAAGGAGTGGATTGCATAA ATTAGTTATACATATATGTTGTAATGGAGGTGTAACAAGGTTAGGGTTGTTTGATATTTGAGTAAACAGATATGGACTCTATTTGTGTAAAGACTAAAAG TATGTTGTGTGTATACAATGTAAAAAAAGAATGAAAAACTGAAAAGTAGCACTAAATCATGGAAAGTGTGAATTTAACAAAATTTATAATAAGTGCATCC TTGCTCTATTATTGCATGAAGGGGTTTGGTATCATATCTCTTTGTCACCAACAACAACACCTCATCAACCTGTCCCCACAACATATTCATGCACTGCTCA CCCACCACCGCATGTCTATTCATTCCAAATTAGTAATACAATGAACCACATTCAAATTCATTTATTTATTGGTAAACATAAATTTTCTATTAATTTTCAT TATTGATATATTTTGTGCAAGCTGTATTATGTGTCATCAATCATCATCATCATCTTCATTCAATTGCACTTATTATTATAATTATTCTTCATAATAACTC TAACCTTCTCTGCACACTCTACTTCCAAGGTAACAACGCCTCTCTTCACCTTTCTCTTCACTAATCTGATTAATTCTTAACTGGGCTTCTTCACCCTTCA TTAAATTTCTAATCTTTTTCTTCCTTCTTCTTCCTCTGTTGCTACTTTATTGTAGATCCATGAGTTGGTGAAGGAGAGATGTAACTAGTTAATTTTTTGT AGGATTATTTTTGTAATCACCACGAGTGAGTGGTTGGGTTCTATCTTCTATGAACACTTGGATATTATATTAACTGCTTTAACTGTTTCAGTTCAAGGAA TTAGTGTGTCTTCAGGCATCAAGTACCAGATTTTGCTCCCACTGGTGCCTCCAAAAATTTGACAGATCTTGGCATTTGGGATAGATCAACTGAACTTGGA AATGGTTAAAAGTTATGGAATGTTCTGATTTGCTTGAGATACTATCATGTTGCAGTGCATAGAGGGAATTTTGCATCTATTTTATCCAATATTGCGATGT TGTGACCTTGACTTAAATAAGCAGCAAACAGGCCTCAAAGATCCTGAAGTTCTTGCAAGGGAAACAGTGTTCAGTGTAAGTGAAATCGAAGCACTTTATG AGCTCTTTAAAAAGATCAGCAGTGCTGTGATTGATGATGGGCTGATTAACAAGGAAGAATTTCAACTGGCATTATTCAAGACAAATAAAAAAGAGAGCTT GTTTGCTGATCGGGTATTTGATTTGTTTGACACAAAGCACAATGGGATACTCGGTTTTGAAGAGTTTGCTCGTGCTCTCTCTGTCTTCCATCCAAATGCC CCTATTGATGATAAGATTGGATGTATGTCATTTTAGATTTTTTTATTTTCTGTTAATCATTATGTTGGAATGAAATTTTTGTGAAGTGTAATAACTCTTG TATTCTATTGCTTAGAAAAGAGAAAATCTCCCAAATTACGAGTGATGTTGCAGAACTTCGACGGTCTACACCTCCCATTCTCAATACCCAAAGGCCCCAA TTCTCACTACACAAATGACAATATGTCCTCACCTTCTAACTCATCTCTTACTTATAGGCAGCATGCCTTATTTCTCCAGCTATCCCAGCCCCAAACTAAC TAACTCCATAAAGATTCCTAACAGCGTTCTATGTAAATGGCTACTAGGTGTTACCTACTATAAAGCTTATCAATTAAGAAGGGCTTACAATTTGAATAAG TTCTTTAGTTTACTTCTGTGGTGCTTCTTTTTAATGAACAAAAATTAAACCATGTGATATCTTGTTTCAGTTTCCTTTCAATTATATGATCTCAAGCAGC AAGGTTTTATTGAAAGGCAAGAGGTATTAGTCTTCTTAGATCTGATCCTTTAGGTACTTGCTTCTTATATGGGACAAGCCTTATTTTTTTTGGCATTTTG TTTGTAAAGGTGAAGCAAATGGTAGTTGCCACACTTGCTGAATCTGGCATGAACCTATCAGATGATGTTATAGAGAGTATAATTGACAAGACTTTCGAGG AAGCGGATACGAAACATGATGGCAAGATTGACAAGGAGGAGTGGAGAAACCTTGTTTTACGCCATCCTTCACTTTTGAAAAACATGACCCTTCAATATCT CAAGTAATTTTTTTCAAGTTATAATTTATTTGTCAACTTTTGTGTTTACATTTTCCGAAATGAACAGAAGCAGTTAGCAAAATCACTCAAGATCAGCACT ACCTATGGGCTAATAGCAGTAAACAAATGAAGTAGTTCATTTTTACATATTTAATTGATGTTGGGTTTGTTATTTATTTGACTTTCCATACATGGTACTT CCTTCCATATGGAGGAGTGAACATTTTGTTTTTTTTGTGGGACTTTTGTAACATCCATTTTTTGATGTGTTTGAGCAGGGACATCACCACAACATTCCCA AGCTTCGTATTCCATTCACAGGTAGATGATACCTGAAGCTTCTATTATTTACTTCATCTTTTCAGAGACTCCTCTTATGTAAAAAAGGACATATCAGGGA GATTCTTTTATTTTTTATGAAAGTGGTTTTATATGGTTTTGTTTAGGATTCATTTCAGTGGTGCAACCTTGTTCAAATACATATTATTTATTGCTTCAAA CACCCTCATGTTCATTCCTGTTTCTATTCATAGTGACTGAAAATATTGCAATGTCAATGACCAAACTAATATTTTGATTATAATGGTTGATGATATTAAT CTCAAAGATCAAGTTGACCGGTT BLAST
Tissueflowers
Gene nameLI_gene_63241; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_187998

Labels

FPAB abscising flower pedicels
FPNAB    non-abscising flower pedicels
LF1 lower flowers stage 1
LF2 lower flowers stage 2
LF3 lower flowers stage 3
LF4 lower flowers stage 4
UF1 upper flowers stage 1
UF2 upper flowers stage 2
UF3 upper flowers stage 3
UF4 upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_187998

BlastpE3 ubiquitin protein ligase RIE1 from Arabidopsis with 21.28% of identity
BlastxCalcineurin B-like protein 2 from Arabidopsis with 87.1% of identity
Eggnogzinc ion binding(ENOG41121N2)
KeggLink to kegg annotations (AT2G01735)
CantataDBLink to cantataDB annotations (CNT0002341)
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019456046.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;