| Id Trinity | FTRINITY_DN56818_c2_g2_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_11157 |
| Sequence | CTTCTCTTAGCACCATTATCACCACAATGATGCTCCCTTTTGCAACTTGACAAACACACAACCAGCTCATCTCATAATAAAAATTGAAGTTGACATATCC AACTACATTCTCTGATCTAGTTTTGTCTTCTACATTATATACTTATTTATATATTATGTAATACTATAGTAGAAGATATATAGTGAACAAATTAGATACT ATACCTTAGAAAATGGGAAGAGCTCCTTGTTGTGAGAAAGTGGGTTTGAAGAAAGGAAGGTGGACAGCAGAGGAAGATGAAATCTTGACAAAGTATATTC AGGCCAATGGTGAAGGCTCTTGGAGATCATTGCCAAAAAATGCAGGTTTATTGAGATGTGGTAAGAGTTGCAGATTAAGATGGATCAACTACTTAAGAAC TGATTTAAAAAGAGGCAACATTTCTATTGAAGAGGAAAGTCTCATTACTAAGTTGCATGCTTCATTTGGAAACAGGTAAGTGTTTCATCAAGAGGTACAT TCCAGAAATTTCTAACATATATAACAAACCAAGTAGGTACATTCCAGAAATTTCTAACATATATAACTAACCAAGTAGGTACAATGATATAATGATTCAT TTTTTCACATATTTAGGCTTCTTTGATTAATACTGTTACTGAAATTCAATCCACTCCCGTTTTTTTCTTTTTGAAAAATTCACACTTCGTCTAGATTGTA TGAGTTTTATATATTGTCATTGTGTCATTCATTATTTATTATCGTATAAAGTTTAAGTTTAACACCATGGAGACATGGATATTACACTTTTATTTTAAAT GATGGGACTATAATGCTACAATTATGGTGATGGTAACAATAATGTGGTTGAAGCCCATAAAATGAAAAAATAAAATTTTAATTACATAAATAATCACACT ATAATTTAAAACATTAGTTGAAATTAAATTTTCATATTTCTAATTATTACTTTCAGGGAGATGTTTTTTCTATATTTAGTTATAATATTTATACATAAGA ACTTCAAAATGTTGATTAATTGAGGGATTCGAGTTTCGAGACGATGCATGCATCTCGTGTTCTGAATATAATAATGAAGATAATATTTTAAAGCTCATAA AGTTTTTCATAATTCTTTCGGGGAAAGTCGTATGGTGAATTAGAGCTACCGTACGAAATGATAGTGTCTGCCCCTTCTTAAATGGCATTGTTAGATGTAT TCGTTCACACTTCCCATCTAATATATTTTTTTTTTTGATACTATTAATAATTTTATATTACTTTTTGATAAGAAATTAATTTATTTAGAGTTTATGATTA TCCTCTGTATCATTTTTAAGAATCGAATTTTCAATCTTAAGAATATATTAGAGCCTAAACTAAGTCTATACCCAAAAAAATATATTACCAATTTTATTTT TTAATCGAAAAAATGTATACACCAACAATGCGTTAAAAAATTTAAAACTGTTAGAAATGTTAAATTCAACTTTTCTTTGTTATTTTTCTTCACAAATCAC ATGTTGTAAGACATAAGTTAACAAAAACCATTATTATTTTGTAATAGTATATAATATAAAATGCCATAAGTGTATATTTGTTTAATACTTGTTAGGGTCT CTCCGGTTTACTAATGAAAATTGTAGATATGATTAGACACTCACATTAAGTATATATGGGAGTATAAAATTTATAGACAGATAGTATAAAGATTTATATA TATGCATTATATCATTCACTATTTATTTGGATTATTTTTGAAAAATCAATAATATTTAAATATCAATAATAAATGATAAAATAAAATATATAAAACTCAC ACATTATTCATACATGTATCTTTTTCTCTATCTATAGTAGACCAATAGATGAAAAGTGCATAGATGAATCCATGAGATTGTTATAACTTTAGCACAAGTC TTGGCTCGGATGAGATCACATATCTCAAATGGTGTTTCATATATTATCTCAACTCAATCACATATTGTCAAGTGGATAAAAGAAAAATTTAAAAAACAAA AGGTAATAAAAAGTAACATTATGATTAGTTTGAGATAGAATACAAGATATTATTGGGGACATGTGATTTCTATTCTTCTGTTGAATGGTTAAAAGTGGTT TTGATCAATTTGGACATGATTCTCCTTAGTGAAGATTACAATTTTCTTCTAACCTCGATGTTGTATATATTTTTGTTTAAAGTTTAATTTTTTTTAATTA CATATAAATAACAAGGTTTCTAAATTAACATAATAATATTGAAATATATTAGTTTGCTCTTCAATTTATTTAATTATATCATTTGCTTATATTTGAATTC ATACATTATATAACATCAATATATAAATAAATGGGTTTAAGTAATAAATCAATGGTTGTGGTCCATGTTTTTACCCCTATAAAAGAAATTGTTCAAGTTA AAAGTATACACGTGGTCCAAAAAATCCCGACAATAAAATTATCAACCAGTGTGGCCCCTGTCTAGTGTGAGAATTTCAATATTTTTCTTTCAAACAATAC ATTTTTTAGTTTATAATTTATATATCATTGGCTGCATTTAGGATCTAAGGTTTCAGATTTTAAAAAAAAGAATTTCCTGATTCTCACAAGTAATGAAAGA GTATTGTGACACACTACAAAAAAAAACTCTTTAACAACTATAATTTTATATTATTTTTCAACAACAAAAATTAAGAAAATTTATAAATATTTTCTACTTA TATTTCAGTATTCACCTCTCCGATTTTTCATCATACTTCATTTTTGTTGCATAGAGTCACAAAAAGTGATTGCAACAAATCCACAACCAACTACCAAGTA CCTACATTTTTAGAAAGAAAAAGTATAGAACCTTTCCCTAGAATCACTCATCCATGAATATCAATTTACTTTACATCATTTTCTTGGTAATAAATTTTCT CTCATTCCATGCTGGCAAAAAAAATCTTGATATTAAAGTTAAAAAAATTAATATGATGAAGCTTTTGACCTAGTAACAACATTTTCAGATGGTCATTGAT TGCTAGTCATTTGCCCGGTAGAACGGACAACGAGATAAAAAACTACTGGAATTCACATTTGAGTAGAAAGATTTTTTGCTATCATGGCACTACTAGTAAT AAACATGACGCCACCACCACGATCGAGCCTCGGATAATAGCTTTCCCTCCCAAGCGAAGAGGCGGTAGAACTAGCCGATGGGCTATGAAGAAGAACAAAA CCTATGCCCTAAAAACAAAGTTCAATAATCATCAACAAAGTCCAAAAGAAATTCATCATCAGAATAATAATGAAGCAGTTCCTCTACCACCTACTCCATC ACTTGAAAGTGAGAACTTGACAATGATAATGGATTTCATGGCTTTGGACCCAGAGAAAGAAGAAGAAGTAGAAGTGGGTGAAGGGTTAGGTAAAAGTTCC TCTCAAGAAGAAGAAGAAAATACAAGAGGTACATTAGTTGAAGAGGAACAGTACTGTGTAGTGGAGGAAGGTGAAAGAATAAATGAGATGTTATGCATTG AAGGTTGGAAAGAAAAAAGTGATTATGAGATTTTGGGACAGTACCAAGAAGTGATTAATGGCTGTGGGGAGTTGAGTTTTAATGAGTTCATGGACACTTG CTTTGTGGAACAAGAAAGTGGGGTTTTGTCATTGACATTTGGAGAAGAAATTCTTCAAAGTAATAATAAGAATAGTGATAATAATAGTAATAATAATGAA GAAGAAGAAGAAGTGGTGGGAAATGGTGCAATAAGAAATGAACCAAGATGTACAACTAACCTAGAGAGTAGTTTAAACCAAAGCTCAAATGGGGAGTGTA GAGATTTGTGTTCTTCCATGGCTTTGGAGGATAAAGAAAACTTGTTGACATGGCTATGGGAAGATGATGATGATCGTTGGGGAAAGGATTGTGATCAATT TGGAGATATTGATTCTGAATTGGATGTAATGGTTTCTTGGTTTAGTTGAACTAGATGTTATACTTTTAGGGTCTTTTTACTAGTTAATTTTTACGATGTA AAAACATCATGGCATTGGTTTCCTTTTTGTTTTGAATAGTATGTAATCATGTAGATAAATAAATTATAGTAGATAACTTTTTTGTGCTAGTATAGTTTGT AATTACACAAGTATTTCTAGACCACTCTTGTAGTATATGCTTTAATTAATTATTTCATTGATTGAAAAAAAA BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_63398; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_11157
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Transcription factor MYB12 from Arabidopsis with 81.82% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0002398) |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019438935.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |