Ll_transcript_9061

• Id Trinity: FTRINITY_DN56822_c2_g1_i11
• Name Transcript: Ll_transcript_9061
• Sequence: GGAAGGGTATGATTTGTGCTGAATAGTTGCGAAATAAAGGGTGGTATAGTAATTTTAACTACAGAAGAAGGAAAGAAACATAAAAATCCACAAAAGGGTT GAAAAATCAGTGATGGATTACGCTGAGAGAGAGAAAAGAAACACAACCCTCGCGGCGGCATAGTAATGGCCAACAGATTGAATTTCTGCTCTCGCAACAG TTGAAAGGACTTTCCGTGGAAATTGGTAAAACACTTTATAGCAGATTGAAGAATGTTTTTGAATAACGGGTGATACTTCATCTTATTTCCTAATTATCAT TTTATCAATATTAATCTAGTAAATTGTTTGAAGATGCTTCAATATTGATTAATAAAGAAAACTGATAGTAGAAAATGACTTTGCATAGAGAGAAAAAGGA AGTGCTGTGTCACATGAATAATCCATGGACCACACCAGACAGTTGTGGTAGTTTGACCATTGACGTAGAAGGTTCATGTAAATTATTTAATGTAATTTAT TTTATGATTGTGCACTTTAAATCATTTTAACTTTTAATGGTTTTTAGTCCTCTAACCGGATAACGTCCCGAATCTTATCCCAAAGTTTGTGTCAGGCCAA TAAAAACATGTCACATTAGTTAAAAGAAATTAGTTAAAAGAAATTAAACATTCATCATTTTTTTTTTTGCATTTTGATTAATTTGGTACATAGTTGGGGA CAACAAATCTTCATCCCCTCTAACTAATGCACAATTAGTGTAACTTTCTGACTTATGCATAATTAGTTCTTGCAAGCATCTTCTCTTGTAAATTTGAGTT AAAGCAAAGTTAAAAGGTTTATAAACTTCATTTTATGACTCGAAATTAACATGACATTTTGGGTAATTAAACAATCACATCAGGTAAAGTCTATGAAGTA TAAATTTACCAGTACACCCATGCCTCCAAAGTCAAGCCATAATAAAAGTTCCTTATAAGCTAACGGTGTTTCCCAACACTGTTAGAAATGGGAAATATGG CATTCCTCCTCGATCCCACATCGCAAAGAAGACATGCAAAGAGCTTGGTTGTAGTTTTCGACCTTGTCTTCTATTTATAAAAAAAGTTAAAGATGTATGC ACTGACGGTATATGAGTTTTATGCATTGTCATTATATCTTCACTATCGATATTTAATTATTATTAACTTTTTTTAAAAAGATAATCCAAATAAATGGTAG ATAATGGAGTGTACATGTACAAGAGATGTATTCACTCCAAAAATAATGGTTAAAATTATTCCAAATCCTTGCCCTTTATTCATGAAGCTTCACTACCCTG CGTTGGGGACACTCCATTTGCAATGGCGCTAATTGAATTAATGAATGACTCTAAAATAAATATAAGTCATTTTTGTGGATTGGTATGGATTTGATAAGTT CTTGCTATTTAAAAAAAGTTTAATCATTAAGTTAATATATCCATGCTAAAAAATGCAAACCCAACGCAGTATATGATATATCATCTTATTAAATATTTAT ACCTATAAGAAAATGAAATATCACAATAAAGATTTAATATGTATGTACTGACAGTATAAATATTTTTTACACTATCATCAAATCACCAAAGATTTTAAAC TCTAGCAACAATAATATAAAAAAGAAATTAATAGATTAAAGATGACCAATCATGACTTGGCGTCTTGAAGTGGGGCCTCTGGTTAAAAGAAACATGCCAC GTGGGATTAGTGATAATGTTTTTGATCCTCAAATGTAACAAAGGTTAAACTCACTTTCCATGTCCACTCATCTCTCATTACACTAAACTCACACTATGGA GATTTCTGCAATGGCTTCAACCACTCCTTCTTCCACTTCCTCTCTCACACTCAACACTTTCTGCAAGCCTCCTCACCTGAAACATTCCCATATCTCACTC CCAACCTCAACCACCATTTCACTTCTCACTCTCTTCTCCCCTCCCTACGAAGCCAAAGCAATCTCCAAGGATCAGATTCTCTCTTCCCTAACCCAAGTGG AGAAAACGATCGATCAGGTTCAGGAAGTGGGTTCCAGTTTTTTGGACAGTTCACAGCGTGCTTTTGAAGCTATAGGGAGTGCTTTGAAACCAGCAATTGA AACAGTGTTGCCGTTTGTGCAGCAAGCTGGGGAAGAGGCCTTGAAAGTTGCTTCACCGGTCATATCAGAGGTTGCAAAGAAGGCACAAGAAGCACTCCAA AGCTCCGGTGTTGATGCTCAACCAGTTCTTAAGACAGTGGCAGATGCTGCAGAACAAACGACCAAGGTGATTGAAGTTGCCAAACCAATAGCTTCAACAA CTGTTGAGACCTTGTCTTCTTCAGATCCTACTGTGATTGCTGGAACGGCTGGAGCACTTTTTATTGCATACCTTCTGTTTCCTCCAATCTGGTCTGCAAT CTCCTTTAATTTCCGTGGTTACAAAGGTGATCTTACCGCTGCTCAAACCCTTGATCTAATATCTACCCAAAACTACATTTTGCTTGATATTAGGTCAGAG AAGGATAAGGACAAGACCGGTATCCCCCGCCTTCCCTCTAGTGCTAAAAACAAGTTGATTTCTATTCCTTTGGAAGAACTGCCAAGTAAGCTGAAAGGAG TGGTGAGGAATGTGAAGAACGTAGAAGCTGAAATAGCAGCTTTGAAGATTTCATATCTCAAGAAAATCAACAAAGGCACCAACATTGTGATCTTGGATTC GTACTCGGACTCGGCTAAAATAGTTGCAAGAACACTAACCGGCCTTGGTTTTAAGAACAGCTGGATTATTGCTGATGGGTTTTCTGGGGGCAGAGGATGG ATAAATAGTAGGTTAGGAACAGATTCATATAAATTTTCTTTTGCAGAAGTGCTGTCACCATCCAGAGTCATTCCTGCTGCTGTTAGAAATTTTGGTACCA CAAGCCAATCTAGTAGGAAACTTCTACCTGGGTCTGACTGAATCTTTTTCTGCATTCTAATGAGTCATTTTTATTGATTAAATTGATCATGTGATAGCCC ATACCAAATCCTCTCTTTTCATCTGCTTGTTCACTTTCAACTCTTCACCTTTATCAATGGATTGTTCCTGGTTTATTATCATTCCCAATCACTACAAATC TATGGACATGGTTGAAATAATAATATCCACAACGGGAAGACATGTTTTGAGTTATTAGAGTAGTCACCTTAATAGTACTGCATATTGAGCAAGAGCAACT ACTGTGACTAAGTGTGAATAACACATCATATTTATCATTTGGTCAATCAATACAAAAGACAATTTTTAATCAAAATTTTTAAACATATTAATTACTCTTA TACTTATGAATTAGCTTTGGCAGTGTAGTTGTAAATTTATCAAAGGTTGTTGTAGTTTGAAGTTGCAAATGTATTCAAAGATGATTAATTT
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_63438;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_9061

FPKM

• FPAB: 4.6
• FPNAB: 7.8
• LF1: 7.7
• LF2: 4.5
• LF3: 3.9
• LF4: 5.3
• UF1: 8.1
• UF2: 6.2
• UF3: 4.2
• UF4: 4.5

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_9061

• Blastp: Calcium sensing receptor, chloroplastic from Arabidopsis with 68.16% of identity
• Blastx: Calcium sensing receptor, chloroplastic from Arabidopsis with 70.33% of identity
• Eggnog: Calcium sensing receptor(ENOG4111GSH)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G23060)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019463659.1)
• Pfam: Rhodanese-like domain (PF00581.19)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;