Ll_transcript_9530

• Id Trinity: FTRINITY_DN56829_c3_g1_i11
• Name Transcript: Ll_transcript_9530
• Sequence: CTCACCTCAATCAATATCTAAATAAACGTCGTCGTTACCTCTCATTATTATCTCTTTCCCTTACCATAGCTTCAGATTAGTCAATCTTCTTTCTCTCACA CCAAAACCAACCTCACAATATTTTTCTTCATTATTTCTTAACAATTATTTCTCCAATTTCAAATTTAAATTTAATTTTCCTATTTTTTAATATAATGATT TCCTTATGGATCGAGCTTGATAATGGTGATTAATGAACCTTATTTATGAACTGTATAAGCGATTTAGCATAAAAAATAGGATGCATAGTTTCTGGTTCTG GATGTTGATTTTCAAGGAAAGATCTATTCTGTGGTTACAGTTACAGTTCCTCTGACGTTTCTTCAGTAACCGTTTTGGATTTTGATGATTTGCAGTTGCG TTTAGATTGGGGTTCTTGAAGATTTGTATTGCACATGGTGTTTGCTTTGGATGAAGACGGGTTATAATTGTTGTGAATTTGGACATTCTGGATGACATGA CAAGGGGTGTCCTGTTGAGTGTTGATGGCGACAATAAAGATATGAAAGAAGTGACTCAGTGGTTACAGGATGAGAAGACCTTTAAAGACGGAGTTGAGGG CGAGGGGAACAGTTTACTAGGAGATGACGTAGTCAAATGTAATGGAGTAGCTGAAGAAGTCAAGGTTGTTGGACGGGGAGGGACTCTGGAGTCCTCTTCT GTCCAGCAGCATATACCACAACCACAGCCTCAGGGGGCAATAATTTGTTGGGAAAGGTTTTTACATATTAGATCTCTTAAGGTCTTGCTTGTGGAGTATG ATGACTCTACTCGTCATGTTGTCACTGCACTCCTTCGCAATTGTAGTTATGAAGTTATTGAAGCAGCAAACGGATTGCAAGCTTGGAAGATGTTGGAGGA TTTAACCAATCATATTGATCTCATTTTAACTGAGGTTGCAATGCCTGGCTTATCTGGCATTGGTCTCCTATACAAGATTATGAGCCACAAAACACGGAAA AACATTCCAGTAATTAGTAAGTTTTCCCAAGTGCCAATATTGTGTACACATGCACACACATATTTGGTTTGCTGAATTTCTTTTTCTCATGACATGCTGT AAAAGAGCTACTCTTTTGTATGGCTTCTAATGGGATTGGTCTGCAGTGATGTCTTCTCATGACTCTATGGGTTTAGTCTTTAAGTGTTTGTCAAAGGGGG CTGTTGACTTTCTTGTTAAACCCATAAGGAAGAATGAGCTTAAAAACCTGTGGCAGCATGTTTGGAGGAGATGCCATAGTTCTAGTGGTAGTGGGAGTGA AAGTGGTACACAAACCCAGAAGTCTGTAAAATCCAAGAGCCTTGAGAAGTCTGATAATAATTCTGGAAGCAATGACAAGGATGATGATGGAAGTGAAGGC CTGAACAATGGGGATGGAAGTGACAATGGGAGTGGCACTCAGAGCTCCTGGACTAAACAAGCTGTGGAAGTTGATAGTCCTGAACCTACTTTCCAGTGGG ATCAAATTGCCGAATGTCCTGACAGCACTTGTGCCCAAGTTGTTCACTCCAATGCTGAAATTTCCGGTGACAAAGCAGTTCCTCTAGCCATAAAGGAGTC TACGGAACAAAAGGAACAACTTGGTAAGGTTGATTTTTCGGTTAATGCATTAACTATCTTGCTACCCCCTCTCTCTTATGAACGCACACAGATTAAGTAT GTTTGTCAAACCAATTAAGTAATATTATAGTGTATTGGTTGATGAAGCTTTTCTTCAGATCAACTATATTGTTGATCTCACTATATACTTATATAGTGAA CATGTAATCATGTTAGAATACAAGTCATGTTAAAACCAATTTCTTCCTTTGCATTGACTTTTGGATTTCTGTTAGGATCTTTATTTCAGTAGCACATGAT TCTTTCAAGGATTTGAAAATTAGATCAGACTTGACCTGATGAAGGAAACTAATTCATGGTTTGGCAGAATCACAATGTGTGTGTGTATATAATCAACAGA GCCTATCTTGATGCTGGTCATTCAACAGATTGTCCAGTCTTGCAAACTTCATGCTCCATATGTCCAGTCTTGAGCATGAGGTGTGTCTGTTGTGTTAGTC TTACACCACTGATTATGAGTAAAGAACAATTTAAATGGCTAGTGCGACTCCCCTCCAATGAGCTAGTTTTTGGGGTAGAATTATGCCCAATATTCCAATT ATTAATATGTACCTAAGTGCATGTACATATGTGTACTTTTTTGAAATTTGGTTTGTTGTATTTATTCTTTTCTTGGGCAATGTCACAGATGAAAATATAA TCAAGTATTGATACTGACTACATGGTCGACTATTTAAATGGGTCCTAGTCAAATCTGCAGGTTCAAAACATAGCCAAGCTCAACATGTAGGCCCCTCTAA ATTCAATGAGAAAATTAGTAGAAGGCTGGACCTTAATTGTGAGAACCAATGCAGTGAGGCAAGGTGCAAAGGTATGTCACTGTCTGATGCCATTCCTAGA ACTTTTGATTCTCAGATGCATAGTGGAGAATTTGAGGCCCTAGACAGAAGACCATACTCAGATGTTGAAGATAAAGGTACTAATAATGATGAAGAATTGC CATCTCTTGAGCTTAGTTTGAAGAGGCTTAGAGGAGTTAAAGATGCTGGTAATATTCAGGATGAACGGAATGTTTTAAGACGTTCTGACCTTTCTGCCTT CTCAAGGTATAATGCAGCCTCTAATGCTAAGAAGTCTCCCACTGGATATGTTGGAAGCAATTCTCCACATAATAATAGCTTAGAAGTCACAAAGAAAGAT TTGTCTCGTGACATTCAGTCTAATTCTAGTGGCAATCCTCCTAACCAGAACTCAAATGGTGCTAGCAATAACATTGATATGGGTTCCACCACTGATAATA ATGCTTTTACTAAATCTGCTGTTATAAGGGCCCCAGCAGTGGTATCAACAACCAAGTGTCTGTATCAATCGTCGGCTTTCCAGCCTCTAAAGAACAATCT CATGTGTACTTCTCAACAAGTAGTATTACATGATACTGAAGATAAGACTGCACCAACACTGGCACCGCCTAGAGTAGACGTCCATAAGGATTCTGCAACT AAGGACTTTTGCCACCATTATGAAAGCCATAACTGTCTTGCTAACAACATGCAGCACCAGTTGCCACCTGATCATCGTGCTGAATTATTTAAGAAAATGG CTGCTACTGCTCCAAATTTTGGGTCATCAAATGTGGTCGAAGTGGCAGTTGAAGGTAATGTTGGAAATTACAGTGTCAATAGAAGTGCTTCGGGCAGCAA CAATGGAAGCAATGGACAAAATGGGTGCGGCACAGATTTTAATGTTGGAGGGACAAACATAGAAAATAACAATGGATTCGCTGTGAATAGTGGTAGTGGT GATGGTAGTGCGAACAGAGTAGATCAGAACAAGATTTCTCAAAGGGAAGCAGCGTTAACTAAATTTCGCGAGAAGAGAAAGGAAAGATGCTTTCATAAAA AGGTTCGATATCAGAGCAGAAAGAAATTAGCTGAACAACGCCCGCGATTTCGTGGACAATTTGTGCGACAGTCCTCAACTGGAAGTGCAAGTGAGGCAAC AGATAATAGCTGATTCAGAGCATTTGGTAGAATGGCATAATAATGATGACCCGCTACTACAAAAACTCAAGGAACCTTCATGTAGAATTTGGGCATTGTT GTCTGTTTGTGTATTGTGCTAATGTATAATGAACTCTAATTATCCCAACTTGTTCGTTTGGAACCTGAATGTATTTATGTTGTGGAGAGACTTTTTATGC CTATTGGGGGCATGGAAAACTTACATTTAGTGACTGCATTATTTCTAATACTTTTCTCATTGATTTGGTGTTTTAATAATCAAATGTGTATTTGTTTAAT CATCAAAAA
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_63500;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_9530

FPKM

• FPAB: 1.8
• FPNAB: 1.8
• LF1: 1.6
• LF2: 1.8
• LF3: 1
• LF4: 1.2
• UF1: 1.7
• UF2: 1.8
• UF3: 3.1
• UF4: 1.2

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_9530

• Blastp: Two-component response regulator-like PRR73 from Oryza sativa with 43.23% of identity
• Blastx: Two-component response regulator-like APRR7 from Arabidopsis with 61.42% of identity
• Eggnog: Transcription factor(COG5641)
• Kegg: -
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0000796)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019427737.1)
• Pfam: CCT motif (PF06203.13)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;