| Id Trinity | FTRINITY_DN56840_c1_g5_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_9471 |
| Sequence | AAATTAAGAGTATCTCTATATCTATATTTTTTTTATTCTTTTTTACAATATATCATTATTCTTTTAACATTTTTTTTATTTTTATTACTTCGTTTTCAAC TCCATATTTAATTAATCTTTGTATGAAAATGATACATATAAAAAAAATAAGAATGCAGACACACTAGTAATAATAATAATTTCAAAGATTTGGATTAGAT TCGGTAGGATAGAATTTTATAGTATAATAATTTTTAGAAAAGTTTTGTTTGAATTCAAAAAATTGAGGTGTTGAAGTAAGGAAAATCATTTTATATTCAT TTTATCATGGTTACAGTCTGTGATTAGCATGAATTAATAATTAAAAGTAAACCTGCTAGTTATTAATTAAACTTTCTTCTTCCATTCTTTCTATCAACAA TCTCTGCAATTCCCATGGAGGCCAATCCCCAATCTTCAGGTTCAACTTTCTCTTTAAATGTGTAAATTATGGGTGAGCACGGCATGACCTGCTCATCCGA TTTGGCCTGATCATCGTCGGGTCAAAATATAGTAAGGTTTCATCACGTCTAGGTTGAGTTTAGAATTTCATATTCATATATATAAATATACAATTATATT TAATCAGGTTTAAGTCGGTTGAACATATAATATTTGGTGTCGGATTAACTTCAAGTATAGGGCAAAATACAAATTCAACAAAATGACCCGAGTAACTATT AAAAGGAACTGGTTCGTGCTCACTCCTAGTGTAACCATTTTTTCCTAATGTTTTATACTGCAAATTTGTGGTATAAATTTAGTATCATGAAATTTATTTA TCTTTGATAATTTGATCATATGAAATCAGAGTTTATTTTTATTTACTATAAGTACACCCTAAGGGATAAGAGTATGGAATAATATGTTATATAAGCGTGT GGTTTTGGGTTCCACAATGTTGCAGTTTTGAGAAATTGTGGTTCATTAACTGAAATGACAGGTGCAGAGAGCAATACAAACACACCCTCAAGATGGTTAC TCAATGGAATGACGGCTCTTGTTACTGGTGGAACCCGTGGAATTGGGCATGCCATAGTGGAAGACTTATGTGGGTTTGGTGCCACCGTTTACACTTGTTC TAGAAAGGAAGCAGAGTTGAATAAGTGCTTAGATGAGTGGAGAATTAAGGGTTTTTTGGTTTCTGGGTCAGTGTGTGATGTGTCATCGCGACCTCAAAGA GAAAAGCTCATTCAAGAAGTGGCCTCCACCTTCAATAGCAAGCTTAACATTTATGTAAACAATGTAGGAAACAACTTTAGGAAGCCAACCATTGAGTACA CTGCTGAAGATTATTCGGAGCTGATGACAGTTAACTTGGACTCTGCATTCCATCTGTGCCAATTAACATATCCTCTTCTAAAAGCATCTGGAATGGGAAG CATTGTGTTCATTTCATCTGTTGCAGGTGTCACCAGCTTGGGAACTGGATCAATCTATGCAGCAAGTAAAGCTGCAATTAATCAGCTTACGAAAAATCTG GCCTGTGAATGGGCAAAAGATAACATAAGGAGCAATTGTGTTGTACCTTGGGCAACCAGAACCCCACTTGTTGAACATGTAATCTTCTTTTCCCTATCAT TTTTCTTTTCACTGTTTATTCTGCTAGCTGGAAACAGCCTCTCTGCTTGCGAGGGTAAATGGGAACCACTTGCAATAGGCCACTCTGTTTACTTTGCTAC AAAAACCTTAAAAGAATATTACATCGTTGACAAACGCATTAGCTAAAAATCCAAGTCCTATAGGGTCAGGAAAATGTTATTAAGAAGCACATAACTAACT TTACCAACTGTGTAGCTATACAAACAGTAGATTTTCAATTAACTTCCATGATAAACTTCACCAAACTAATTGCACTGCTAAACACATGAACAACCAATTT ACTCATGTATGCATAATATAAACTACTACCCAACCTAACATGATAATCTATATGGTCATGTTGTGCATTGGTGGATTATTGAGTTATTTTGGCTATAATA TATGTTATGCAATGTCCACCAACTGAGGCTTCACTTTCAGCATAAAATGAGTAAGAATTTTTGGTAAAGGCAAGGGTATGATTCAATTCAACATTTTCTT CATTTGGGTTTGACTGTGATTTGTGTCATAGACTCATAGCTCAATGGGTCGGATTAGGTTTATCATTGGATGAACTACATTTTGCAGCTCCACTCCATTA GCTACTGCTTGTGAATCTTTTTATGGATTACATCCATTATCTCAAATTTTGGCTAAACTAGTCCACTAATGCAAATAGTTTATGGGAGAATATTGAGTTA TTTGGATATTGGACAATTGACGGGGCGAACTGCTAATTTTTGGATATGAGATATCCATCCTCATCACTATTGACGCATTTATTTACTTATAACACATATT TCATTCCACGTCTTTATATGGACCAGAAGTAACAGGTAAATTAACACGGAGTGAATGTTTCTGTATCTGCTAGTGTTTAAGCTTGTTCTTTAATTGAAAT TCTTTACTATTTCCACTTTGAATTAAGTACAGCTAGAAATACCACACCCGCAGTTTGATTTCGATATTACTGAGCCAATGTAGCAGAATTTTGTAGTTTT TCTTGTTGGGAATTTTATATCTATTGAGAATATGGACTAATGAATTATCCACTATACTCTTTTAGCCAACATTTTGGTAATTGCAGTTTGATTAGTAATT TCTTTGGGTTCAATATTTTTGAGACTTAGGATATCTATATGACCCATCATTTTTTCTGTTTTTTCTTCAATTTATAGTTGTTTCAGAACCAAAAGTTTGT AGATGATATTATGTCTAGAACTCCACTTAAGCGCATTGCAGAACCGGAAGAAGTGTCATCATTGGTGGCTTTCCTTTGCTTACCTGCTGCTTCTTACATC ACTGGACAAGTTATTTGCGTTGATGGAGGATTAACAGTCTTTGGATTTCAACCCAGCATGAGAATTACCTAAGATTCCTTTGTTGCTTACCTTGAGAATA AACAAATAATTCTCAGTTTCATTTCAATTCTCATGGTGTCTATGTTTATGCATGGTTACATTTGTGCTTAAAATAAAAGATGTGGAAAGGACAGATATGT TATGTATAGATCTGAAATTACCAAAACTAACCATCATGGTGATGTTTTGAGACAAACATTCCAATACATCATGAGTTATACTAATATTTATATGGTTTGA GGTACCGGAACCGGTGCACAATACCTTGGTCTATGCAATTTGTCTTTTTTACATTATTGTTAAAAAAACTTTTTTCCAAAGGAATCTGGTATATAGTATG CAGTACGTCGAATCTAATATGCGGTAAGTAGGCTAGATGAGCAAACTTTATTTGTTATCAGGACCCCAGTTATTCTAGTTGTCCTCTGCTCATGCAATTC ATATTCAAGCGTGATTTATAAGGAGGTTATGTGTTTCTCATGATTTAGAAGCTCGCACAAACTATATCGAAGATGTTTTTCAATGTGAATTGTATTGTAC TATTGTTCATATACATGGAACCAGAATATCAAAACTTAAAAGGGATAAATATTATAGTTAATTTTTGCATTATCACTAAGATTGAAAGACTCACACAAAT ATACCAAGGTTGTTCTCTAAGTGTATTTATTGTTCATATACAATTTTAGTTAACTTCTGAATCATAAGTGATATAAACTAGCATAGGCCAAGCTATGAGC CTAGGACTAAAGATGCTCATATTGGTCCCTTATAAGAGTCATGACTAAGTCGAGACCAACGAAAGTCTCAAAGGACTTAATTGACTATGGAGATGACTAT AATTAAGAACATTTATGTCCTTAATGTATTGTTTAAATTTATATCTTTTATTACATTTGAATTGAATATATGAGATTTATATCTCATGGGTAGTCTTAGA TTTATTTCTAGATTTAGGAGTTTATTTAATTTCATGATAAGTATGTTAATTCAATTCAAGTAACATGGGGATGAGAGTTAATTAAATTAATTCTTTTATA GTTGGCCCATTAGTGTTCTTGTTTTATCATCATGTGCACGACAAAGACAAAGAAGCATGAGTTAGGACAAGTTAGTATGGCTCAAGACAAGGTGGCAAGA AAATAGGAAGGTGTCTTGAGACACATCAAAGTGGCACGACTTCATCCTATCTCCAAAGGAGCTAGGAGATATGGCAAGGGATTTCTATTTTGACCAAGAA AATAAAGCAAGGAGATAAGGCACTACCAATTCAGGCAAAGAAAAAGTCAAGATAGGGTAATCTCCAACACCACACGGCTAGAATGTAGGAGAATCAAAGA GGAGTTAGACTCCTATTTTTGAGGCGTGTGGAACAACAAGATAAGGCAAGAGATGAGTTGATCTTTAACCTTCTTGAATCAGTCCAAGTCCAAGACCAAG TCAACTTATTCCACAAACCGAATTCCCTCCTTCTACATATTGATCAAGACACAAGATTAATTTTCTTTATCAAAGAATTCGATTGAAGCCATTGAGGAAA TTAAGTTCAAGAATTCTGACATCAGCCATTGTTTTGGAGATCACATGGCCACCTTGATTTGAGGTTGAATCCGTGAGCATGTTGAATTGGCTTTAAGGAG TTCCATTCCAGTTTGGCAAGGTGATCAAAACTTAGTCAAAGACCAAGGCAAACCAACTGAAGTCCTACTTGGATGACTCTCTCAAGTCCATATGGTTCCA CCAGCCTCATGGGTGCTCAAGCCTTTCAAGACCATAAGACCAAGTTGGTTGCACCCTCTACATGATTTTTAATTAGGACTTTAATTCTTTTGTTTTCAAA GTTAATTAGATTTTATTTAAATTAGACTTAGTCTTTAATTAATTGCATTCAAATTTGCCTATTTATGTAATTGGATTTCATTAATGAGAATCAAATTGAT TTTGAGTAAAAAAAAAAAAAAA BLAST |
| Tissue | flowers |
| Gene name | LI_gene_63603; |
| Additional information | details; |
| FPAB | abscising flower pedicels |
| FPNAB | non-abscising flower pedicels |
| LF1 | lower flowers stage 1 |
| LF2 | lower flowers stage 2 |
| LF3 | lower flowers stage 3 |
| LF4 | lower flowers stage 4 |
| UF1 | upper flowers stage 1 |
| UF2 | upper flowers stage 2 |
| UF3 | upper flowers stage 3 |
| UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_9471
| Blastp | Tropinone reductase homolog At5g06060 from Arabidopsis with 65.17% of identity |
|---|---|
| Blastx | Tropinone reductase homolog At5g06060 from Arabidopsis with 66.16% of identity |
| Eggnog | Dehydrogenase reductase(COG1028) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT5G06060) |
| CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000276) |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019418078.1) |
| Pfam | short chain dehydrogenase (PF00106.24) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |