Ll_transcript_9473

• Id Trinity: FTRINITY_DN56840_c1_g5_i5
• Name Transcript: Ll_transcript_9473
• Sequence: AAATTAAGAGTATCTCTATATCTATATTTTTTTTATTCTTTTTTACAATATATCATTATTCTTTTAACATTTTTTTTATTTTTATTACTTCGTTTTCAAC TCCATATTTAATTAATCTTTGTATGAAAATGATACATATAAAAAAAATAAGAATGCAGACACACTAGTAATAATAATAATTTCAAAGATTTGGATTAGAT TCGGTAGGATAGAATTTTATAGTATAATAATTTTTAGAAAAGTTTTGTTTGAATTCAAAAAATTGAGGTGTTGAAGTAAGGAAAATCATTTTATATTCAT TTTATCATGGTTACAGTCTGTGATTAGCATGAATTAATAATTAAAAGTAAACCTGCTAGTTATTAATTAAACTTTCTTCTTCCATTCTTTCTATCAACAA TCTCTGCAATTCCCATGGAGGCCAATCCCCAATCTTCAGGTGCAGAGAGCAATACAAACACACCCTCAAGATGGTTACTCAATGGAATGACGGCTCTTGT TACTGGTGGAACCCGTGGAATTGGGCATGCCATAGTGGAAGACTTATGTGGGTTTGGTGCCACCGTTTACACTTGTTCTAGAAAGGAAGCAGAGTTGAAT AAGTGCTTAGATGAGTGGAGAATTAAGGGTTTTTTGGTTTCTGGGTCAGTGTGTGATGTGTCATCGCGACCTCAAAGAGAAAAGCTCATTCAAGAAGTGG CCTCCACCTTCAATAGCAAGCTTAACATTTATGTAAACAATGTAGGAAACAACTTTAGGAAGCCAACCATTGAGTACACTGCTGAAGATTATTCGGAGCT GATGACAGTTAACTTGGACTCTGCATTCCATCTGTGCCAATTAACATATCCTCTTCTAAAAGCATCTGGAATGGGAAGCATTGTGTTCATTTCATCTGTT GCAGGTGTCACCAGCTTGGGAACTGGATCAATCTATGCAGCAAGTAAAGCTGCAATTAATCAGCTTACGAAAAATCTGGCCTGTGAATGGGCAAAAGATA ACATAAGGAGCAATTGTGTTGTACCTTGGGCAACCAGAACCCCACTTGTTGAACATTTGTTTCAGAACCAAAAGTTTGTAGATGATATTATGTCTAGAAC TCCACTTAAGCGCATTGCAGAACCGGAAGAAGTGTCATCATTGGTGGCTTTCCTTTGCTTACCTGCTGCTTCTTACATCACTGGACAAGTTATTTGCGTT GATGGAGGATTAACAGTCTTTGGATTTCAACCCAGCATGAGAATTACCTAAGATTCCTTTGTTGCTTACCTTGAGAATAAACAAATAATTCTCAGTTTCA TTTCAATTCTCATGGTGTCTATGTTTATGCATGGTTACATTTGTGCTTAAAATAAAAGATGTGGAAAGGACAGATATGTTATGTATAGATCTGAAATTAC CAAAACTAACCATCATGGTGATGTTTTGAGACAAACATTCCAATACATCATGAGTTATACTAATATTTATATGGTTTGAGGTACCGGAACCGGTGCACAA TACCTTGGTCTATGCAATTTGTCTTTTTTACATTATTGTTAAAAAAACTTTTTTCCAAAGGAATCTGGTATATAGTATGCAGTACGTCGAATCTAATATG CGGTAAGTAGGCTAGATGAGCAAACTTTATTTGTTATCAGGACCCCAGTTATTCTAGTTGTCCTCTGCTCATGCAATTCATATTCAAGCGTGATTTATAA GGAGGTTATGTGTTTCTCATGATTTAGAAGCTCGCACAAACTATATCGAAGATGTTTTTCAATGTGAATTGTATTGTACTATTGTTCATATACATGGAAC CAGAATATCAAAACTTAAAAGGGATAAATATTATAGTTAATTTTTGCATTATCACTAAGATTGAAAGACTCACACAAATATACCAAGGTTGTTCTCTAAG TGTATTTATTGTTCATATACAATTTTAGTTAACTTCTGAATCATAAGTGATATAAACTAGCATAGGCCAAGCTATGAGCCTAGGACTAAAGATGCTCATA TTGGTCCCTTATAAGAGTCATGACTAAGTCGAGACCAACGAAAGTCTCAAAGGACTTAATTGACTATGGAGATGACTATAATTAAGAACATTTATGTCCT TAATGTATTGTTTAAATTTATATCTTTTATTACATTTGAATTGAATATATGAGATTTATATCTCATGGGTAGTCTTAGATTTATTTCTAGATTTAGGAGT TTATTTAATTTCATGATAAGTATGTTAATTCAATTCAAGTAACATGGGGATGAGAGTTAATTAAATTAATTCTTTTATAGTTGGCCCATTAGTGTTCTTG TTTTATCATCATGTGCACGACAAAGACAAAGAAGCATGAGTTAGGACAAGTTAGTATGGCTCAAGACAAGGTGGCAAGAAAATAGGAAGGTGTCTTGAGA CACATCAAAGTGGCACGACTTCATCCTATCTCCAAAGGAGCTAGGAGATATGGCAAGGGATTTCTATTTTGACCAAGAAAATAAAGCAAGGAGATAAGGC ACTACCAATTCAGGCAAAGAAAAAGTCAAGATAGGGTAATCTCCAACACCACACGGCTAGAATGTAGGAGAATCAAAGAGGAGTTAGACTCCTATTTTTG AGGCGTGTGGAACAACAAGATAAGGCAAGAGATGAGTTGATCTTTAACCTTCTTGAATCAGTCCAAGTCCAAGACCAAGTCAACTTATTCCACAAACCGA ATTCCCTCCTTCTACATATTGATCAAGACACAAGATTAATTTTCTTTATCAAAGAATTCGATTGAAGCCATTGAGGAAATTAAGTTCAAGAATTCTGACA TCAGCCATTGTTTTGGAGATCACATGGCCACCTTGATTTGAGGTTGAATCCGTGAGCATGTTGAATTGGCTTTAAGGAGTTCCATTCCAGTTTGGCAAGG TGATCAAAACTTAGTCAAAGACCAAGGCAAACCAACTGAAGTCCTACTTGGATGACTCTCTCAAGTCCATATGGTTCCACCAGCCTCATGGGTGCTCAAG CCTTTCAAGACCATAAGACCAAGTTGGTTGCACCCTCTACATGATTTTTAATTAGGACTTTAATTCTTTTGTTTTCAAAGTTAATTAGATTTTATTTAAA TTAGACTTAGTCTTTAATTAATTGCATTCAAATTTGCCTATTTATGTAATTGGATTTCATTAATGAGAATCAAATTGATTTTGAGTAAAAAAAAAAAAAA A
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_63603;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_9473

FPKM

• FPAB: 8.6
• FPNAB: 7.9
• LF1: 4.4
• LF2: 5.8
• LF3: 8.5
• LF4: 11.3
• UF1: 4.2
• UF2: 7
• UF3: 10.4
• UF4: 8.1

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_9473

• Blastp: Tropinone reductase homolog At5g06060 from Arabidopsis with 66.28% of identity
• Blastx: Tropinone reductase homolog At5g06060 from Arabidopsis with 66.28% of identity
• Eggnog: Dehydrogenase reductase(COG1028)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G06060)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0000276)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019418079.1)
• Pfam: short chain dehydrogenase (PF00106.24)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;