Id Trinity | FTRINITY_DN56840_c1_g5_i6 |
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Name Transcript | Ll_transcript_9476 |
Sequence | AAATTAAGAGTATCTCTATATCTATATTTTTTTTATTCTTTTTTACAATATATCATTATTCTTTTAACATTTTTTTTATTTTTATTACTTCGTTTTCAAC TCCATATTTAATTAATCTTTGTATGAAAATGATACATATAAAAAAAATAAGAATGCAGACACACTAGTAATAATAATAATTTCAAAGATTTGGATTAGAT TCGGTAGGATAGAATTTTATAGTATAATAATTTTTAGAAAAGTTTTGTTTGAATTCAAAAAATTGAGGTGTTGAAGTAAGGAAAATCATTTTATATTCAT TTTATCATGGTTACAGTCTGTGATTAGCATGAATTAATAATTAAAAGTAAACCTGCTAGTTATTAATTAAACTTTCTTCTTCCATTCTTTCTATCAACAA TCTCTGCAATTCCCATGGAGGCCAATCCCCAATCTTCAGGTTCAACTTTCTCTTTAAATGTGTAAATTATGGGTGAGCACGGCATGACCTGCTCATCCGA TTTGGCCTGATCATCGTCGGGTCAAAATATAGTAAGGTTTCATCACGTCTAGGTTGAGTTTAGAATTTCATATTCATATATATAAATATACAATTATATT TAATCAGGTTTAAGTCGGTTGAACATATAATATTTGGTGTCGGATTAACTTCAAGTATAGGGCAAAATACAAATTCAACAAAATGACCCGAGTAACTATT AAAAGGAACTGGTTCGTGCTCACTCCTAGTGTAACCATTTTTTCCTAATGTTTTATACTGCAAATTTGTGGTATAAATTTAGTATCATGAAATTTATTTA TCTTTGATAATTTGATCATATGAAATCAGAGTTTATTTTTATTTACTATAAGTACACCCTAAGGGATAAGAGTATGGAATAATATGTTATATAAGCGTGT GGTTTTGGGTTCCACAATGTTGCAGTTTTGAGAAATTGTGGTTCATTAACTGAAATGACAGGTGCAGAGAGCAATACAAACACACCCTCAAGATGGTTAC TCAATGGAATGACGGCTCTTGTTACTGGTGGAACCCGTGGAATTGGGCATGCCATAGTGGAAGACTTATGTGGGTTTGGTGCCACCGTTTACACTTGTTC TAGAAAGGAAGCAGAGTTGAATAAGTGCTTAGATGAGTGGAGAATTAAGGGTTTTTTGGTTTCTGGGTCAGTGTGTGATGTGTCATCGCGACCTCAAAGA GAAAAGCTCATTCAAGAAGTGGCCTCCACCTTCAATAGCAAGCTTAACATTTATGTAAACAATGTAGGAAACAACTTTAGGAAGCCAACCATTGAGTACA CTGCTGAAGATTATTCGGAGCTGATGACAGTTAACTTGGACTCTGCATTCCATCTGTGCCAATTAACATATCCTCTTCTAAAAGCATCTGGAATGGGAAG CATTGTGTTCATTTCATCTGTTGCAGGTGTCACCAGCTTGGGAACTGGATCAATCTATGCAGCAAGTAAAGCTGCAATTAATCAGCTTACGAAAAATCTG GCCTGTGAATGGGCAAAAGATAACATAAGGAGCAATTGTGTTGTACCTTGGGCAACCAGAACCCCACTTGTTGAACATTTGTTTCAGAACCAAAAGTTTG TAGATGATATTATGTCTAGAACTCCACTTAAGCGCATTGCAGAACCGGAAGAAGTGTCATCATTGGTGGCTTTCCTTTGCTTACCTGCTGCTTCTTACAT CACTGGACAAGTTATTTGCGTTGATGGAGGATTAACAGTCTTTGGATTTCAACCCAGCATGAGAATTACCTAAGATTCCTTTGTTGCTTACCTTGAGAAT AAACAAATAATTCTCAGTTTCATTTCAATTCTCATGGTGTCTATGTTTATGCATGGTTACATTTGTGCTTAAAATAAAAGATGTGGAAAGGACAGATATG TTATGTATAGATCTGAAATTACCAAAACTAACCATCATGGTGATGTTTTGAGACAAACATTCCAATACATCATGAGTTATACTAATATTTATATGGTTTG AGGTACCGGAACCGGTGCACAATACCTTGGTCTATGCAATTTGTCTTTTTTACATTATTGTTAAAAAAACTTTTTTCCAAAGGAATCTGGTATATAGTAT GCAGTACGTCGAATCTAATATGCGGTAAGTAGGCTAGATGAGCAAACTTTATTTGTTATCAGGACCCCAGTTATTCTAGTTGTCCTCTGCTCATGCAATT CATATTCAAGCGTGATTTATAAGGAGGTTATGTGTTTCTCATGATTTAGAAGCTCGCACAAACTATATCGAAGATGTTTTTCAATGTGAATTGTATTGTA CTATTGTTCATATACATGGAACCAGAATATCAAAACTTAAAAGGGATAAATATTATAGTTAATTTTTGCATTATCACTAAGATTGAAAGACTCACACAAA TATACCAAGGTTGTTCTCTAAGTGTATTTATTGTTCATATACAATTTTAGTTAACTTCTGAATCATAAGTGATATAAACTAGCATAGGCCAAGCTATGAG CCTAGGACTAAAGATGCTCATATTGGTCCCTTATAAGAGTCATGACTAAGTCGAGACCAACGAAAGTCTCAAAGGACTTAATTGACTATGGAGATGACTA TAATTAAGAACATTTATGTCCTTAATGTATTGTTTAAATTTATATCTTTTATTACATTTGAATTGAATATATGAGATTTATATCTCATGGGTAGTCTTAG ATTTATTTCTAGATTTAGGAGTTTATTTAATTTCATGATAAGTATGTTAATTCAATTCAAGTAACATGGGGATGAGAGTTAATTAAATTAATTCTTTTAT AGTTGGCCCATTAGTGTTCTTGTTTTATCATCATGTGCACGACAAAGACAAAGAAGCATGAGTTAGGACAAGTTAGTATGGCTCAAGACAAGGTGGCAAG AAAATAGGAAGGTGTCTTGAGACACATCAAAGTGGCACGACTTCATCCTATCTCCAAAGGAGCTAGGAGATATGGCAAGGGATTTCTATTTTGACCAAGA AAATAAAGCAAGGAGATAAGGCACTACCAATTCAGGCAAAGAAAAAGTCAAGATAGGGTAATCTCCAACACCACACGGCTAGAATGTAGGAGAATCAAAG AGGAGTTAGACTCCTATTTTTGAGGCGTGTGGAACAACAAGATAAGGCAAGAGATGAGTTGATCTTTAACCTTCTTGAATCAGTCCAAGTCCAAGACCAA GTCAACTTATTCCACAAACCGAATTCCCTCCTTCTACATATTGATCAAGACACAAGATTAATTTTCTTTATCAAAGAATTCGATTGAAGCCATTGAGGAA ATTAAGTTCAAGAATTCTGACATCAGCCATTGTTTTGGAGATCACATGGCCACCTTGATTTGAGGTTGAATCCGTGAGCATGTTGAATTGGCTTTAAGGA GTTCCATTCCAGTTTGGCAAGGTGATCAAAACTTAGTCAAAGACCAAGGCAAACCAACTGAAGTCCTACTTGGATGACTCTCTCAAGTCCATATGGTTCC ACCAGCCTCATGGGTGCTCAAGCCTTTCAAGACCATAAGACCAAGTTGGTTGCACCCTCTACATGATTTTTAATTAGGACTTTAATTCTTTTGTTTTCAA AGTTAATTAGATTTTATTTAAATTAGACTTAGTCTTTAATTAATTGCATTCAAATTTGCCTATTTATGTAATTGGATTTCATTAATGAGAATCAAATTGA TTTTGAGTAAAAAAAAAAAAAAA BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_63603; |
Additional information | details; |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_9476
Blastp | Tropinone reductase homolog At5g06060 from Arabidopsis with 66.28% of identity |
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Blastx | Tropinone reductase homolog At5g06060 from Arabidopsis with 66.28% of identity |
Eggnog | Dehydrogenase reductase(COG1028) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G06060) |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000276) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019418078.1) |
Pfam | short chain dehydrogenase (PF00106.24) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |