Ll_transcript_204249

• Id Trinity: FTRINITY_DN56968_c1_g1_i6
• Name Transcript: Ll_transcript_204249
• Sequence: CGTAAATCAGGTGCTTTTCTTGAGATGATAATGTAGTGTTACTCCTTCCCACGCACGCTTTGCGAACCTTTCCCTCATATATAAACCTCTTTCATTCAGA GGCAGAAAAAAAGGAAAGGCTTCTGTGTTCAATGGGAGAAAAAGGTGAATGCTCTGGAGTCAAACCCTCTGATGATGAAATCTGGGCAAAACTTGTTCCG TCAGACTCGAGATATTCAGACGTCGAGATAAGGTCAGACGAAAAAGTAATATGTTCAGAGATATCAGCTGCATTTGGTGACAAACATAGCTGGTGCAAAA TAATAAGGAATTCTGATCTATGTTCTGCTACAGTAGAAAACAAGAGTCCGAATACAATACTTGTTGATGGGACTGAGGTGCACAATGAGAACACTGTTGT CATCAAGGATGGAAGTGAAATTATTCCAGGTCCTGATAAAGGGGGTTAGTCCGTTAGAATCTCTTTAATACTTATGCTAGTGTAACAATTTCTATTGCTG ATGACATATATAGGGTAAAAAATTGTAAATTATGTTTTATATCTTCAGCTCTGCTGTTACACTTCCATAAATAGTGATGCTGATGGTCTAATGCATTGGT TTGTCTAAAAATAGATACATTTAAAGTTTCTTTCGGTTGATTAACAGGTCATCATGTTTTCTTTAATAGGATTCAAACTTGGTTTGACAAAAGTGGTGAA ATTGTTTGGGTGCAAAATAACGTTAGTATAGGTCATTATAGAGAAAATAGACTACCATATTGCCTTGGGAGGTAAATTGGCATATATTAGGGCATGTAAT TTGTATCTGTTTTCTAATCTAAAAAATGTCCGAACAAGTGGGAATTACTTGTATCAATAGGTTTTTTTTCTTTCTGATTTCATATGGTTAAATTATACTT GGCAGTGTTAAGTTTCAACTTCTGGTTGGTTTTACATGATTTTCGGGTTTTCTGAATAATTAGTAAATGTCTTTATTGTAGAGTTAGAGTGTTAGATTGA GCCTGTATGCTAATTATTTGGCTTTTGATACTAATGTTTTAACATTTCCAAGCTAAATACATCAATTCTATCTTTCTCTATTTTCATGCTGCTAGGATTT GTCAGCTACAGATTTGATATCTTGTCAAGCCCAGAAACCAGCCAGAGGCAGCTGCAGGTTGACAGTTTATAATTTATTCCGTGTCCTTCAATGTCTTCAG CACTTTTTTCATCCGTAGCAATAGTACTCACTTGACTGTTTTTTCATCAGATCTGTGTTGATGTTGAGAATGCTAAGTGTAGCATTTGCTTAAACATATG GCATGATGTTGTGACTGTTGCTCCATGCCTTCATAATTTTTGCAATGGTTGCTTCTCAGAGTGGTTAAGGAGATCACAAGAAAAACGTTCAAGTGTACTT TGTCCTCAATGCAGAGGAGTTGTTCAATTTGTTGGAAAAAACCACTTTCTGCGTACCATTGCAGAGGATATGCTAAAAGCTGATTCTTCCTTAAGACGCT CAGATGAAGAAGTTGCACTCTTAGATACTTATTCATCCGTACGATCAAACCTTGTCATTGGATCTGGAAAGAAGAATTGTCGAAAGAGAGCTCACACCCC AGTGGATGATCAAAGTGATGGCACATACCTTCAGTGTCCACAATGTGTTCATGAAGTTGGTGGGTTTCATTGCAATAATAACACTGTTCATCTCCAATGT CAAGCATGTGGAGGAATGATGCCATCCCGGCTTGGTTTTAACATTCCTCAATATTGTTCAGGATGTGATAGATCATTTTGTGGAGCTTACTGGCATGCTT TAGGGGTAACGGGCAGTGGTCCTTACCCTATTTGCTCCCAGGATACTTTAAAACCTATCTCAGAACACTCTATCTCAAGAATCCCTTTGTTAGCACATGA AAATAATGTGCATGAACAGAATATCACTGATAGTTGCATTAGACAAATGGGGAAGACATTACAAGATGTTGTATCAGAGTGGATAGTAAAGCTGAACAAC AAAGAAATTGATGTAACACGTTTGGCGTTGAATCACGTTGAGACGATTAATGCTAGGACTTCTGTATGCTGTGATTGTTATCAGAAGTTGGTGTCATTTC TCCTATACTGGTTTCGGATTTCTATCCCGAAATACCGTCTTCCACCAGAAGCATCAGCAAGAGAAGATTGCTGGTATGGATATGCATGTAGGACACAGCA TCATAGTGAAGAACATGCTCGGAAAAGGAATCATGTATGCCGTCCAACAAGAGGCTCCAACATGTGATGATCGAGAAAATAATATATGCACCGACAGTTC CGGAGCTTTTACACTATCAACACATCATCCATTCATGTGTTAAAATAAAAGTAATACACATGAATGAAGAAGTGAAAAACAAAGTGGTGTGTCTATTGGG TGTTGATTTTTCTTTATCTTTTGCATTTTAAGGAGCTTATAAAGAACTATGATGACAATCATTGACTTGCAATATAAGTTATCTTGAAATTTGGGGTTGC TAACATTATGGCTTAAGGTTTTTATACGGTTTAATGAAGTACAAATTATT
• Tissue: flowers
• Gene name: LI_gene_64719;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_204249

FPKM

• FPAB: 0
• FPNAB: 0.3
• LF1: 0.2
• LF2: 0.1
• LF3: 0.2
• LF4: 0.1
• UF1: 0.1
• UF2: 0.1
• UF3: 0.1
• UF4: 0.2

Labels

• FPAB: abscising flower pedicels
• FPNAB   : non-abscising flower pedicels
• LF1: lower flowers stage 1
• LF2: lower flowers stage 2
• LF3: lower flowers stage 3
• LF4: lower flowers stage 4
• UF1: upper flowers stage 1
• UF2: upper flowers stage 2
• UF3: upper flowers stage 3
• UF4: upper flowers stage 4

Annotations of Ll_transcript_204249

• Blastp: E3 ubiquitin-protein ligase CHFR from Homo with 29.19% of identity
• Blastx: E3 ubiquitin-protein ligase CHFR from Pongo with 26.23% of identity
• Eggnog: zinc ion binding(COG5243)
• Kegg: Link to kegg annotations (55743)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019458160.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;