Id Trinity | FTRINITY_DN57031_c4_g1_i2 |
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Name Transcript | Ll_transcript_172439 |
Sequence | TTTCAACTGGCTATTTGTTTATTTATTTATTTAAATGCTGTTCTTTGTTTTCAAGTTTCAACTGGGTATATTTGTTTTCCTCTCTTTTCGAATGGGTGCT CTGGCATAATTATTGTTGTTGTTTACGTTAATAACATGACAATATTAATTTTTTTCAACTGGGTATTTGTTTTTCTTGACTGGCCGACTAGGCAATCCAA TCTTGCATTTTGTTTGTTGTTTTCCTTTATGCTGTTACTGTATAAATTGTTGGGATTTTAGGGCAAGATAATTTTTGGTTTAAATCTTAGTGCAACTGTT TAGTTTTTGAGGGAAAGAGAGGGTGGCCCAGCGTACGAAACACCTGTGTGGTGTGGTACGATTATGGTAGATATTTGCAGTCCTATCCTGCAAGCGTAGA GGTTATTGAACCTGTGAAGCTGGGACATCCAGGTCACATGGTAGCAACAATCTTATTATTGCACAAAGGCTCACCCTCAAATTTTGGGCAAAATAATTGT TTTTTAAAATCTAATTTAGATGGCTCTTCTTTGTTTTAAACTGGGTATTCTTTGATATTTGTTGTGTTTCTGAATGCTATGGCATTGTAAGTTTTTGGTT TCATAGTAGAATTGTGTAATTTGAGTTGTTCCAATTCAGGGGGATTATAATTGTGAAGTTAAGGAGAGGACAAGAGCTGAAGCTGAGAGCAATAGCTAGG AAGGGTATTGGTAAAGATCATGCTAAATGGTCGCCTGCTGCAACTGTCACTTTCATGTATGAACCAGAAATCCACATAAATGAGGATTTGATGGAGTCCC TGACACTTGAGGAGAAAAAAGAATGGGTTGAAAGTAGTCCTACCCATGTGTTTGACATTGATGTAGTAACTCAACAGGTTGAGTTTTTTCTGATTTGTTT TCTTTAAATTTTGGTTATGCACTTCAGACTGATTTCATCACTACTGCTAGTATTACTATTATCTGATCATTATCTGGTGCTTAATATTTGTTTTGTTGCT TACATTCCTTTTTTGAAATTATCTCAAGACATGCACTTTCGGTACCTCACTAATTGTTTCTGGGCAATCTGTGATAATATACTTGTCTTGTACGCTATGT ACTGTCTATAATGCGGCTTGTAAGCTTGTTTTGATTTTAGGGTTTAGATAGAATGGAGAATATAGAATTAGGTAAGATAAGTATGTTGGATAACAAATAT TTTTCTGCATCTCTTTGACCTTTTGCATTGAAGTGGACAAGAAAGTATAATTAGACGCACTTGTTTTTTTTCTGCATTCAATGATAGAACCTGTTATTTG ATGTTATGGAATGATTGCATGGTGCTTCCCGGGAGTAAAATTTGTTTGTTAGTGAACTTGAAGACTGTTTTTTCAATTGTTTATGGGGACAACCTCTAAT GTAAGCTTACAGAACCATACATATATTGAAGGCATACACAGCAACTGAGGGACCAATATTCTCCAGTTTTTCTTCCCTCAATTTTTTTCTTCTTCCCTTT GCCATTAATCCTTTAGAATGAGAGGGGAATTGTTTTAAATTGCTTCCGTCACTCCGATGTCGAGGCTGGGTAATAGGAAAATTCTTCACTTAAAACTTCA TGCAGTGTCATTCTGGAAGGTGAACAAACTTGATTCCTGGAAAGATTTTGCATATAAGATACAACTTCAGTGCTGAAAGTGTAAAAAGAGACATTGCTGG AATGAAGGTCAAGGATTTAACTGCATCAAGACTAGTCTGGTCCTAAGCTGCCAATTCCTTAATGAATACGAGTCTGAGGCTGTACATAAATTTTAAATAA GATGTTGGTATCAAGATTTGTGATACATCTATAGCATAAATGATTGTTGCAGCATCTCCAGGAGCATTATCTGGATTATGGAGAAGATATTGATACACTT TCTGCCAAAGCATTAAGAGTTATTGAAATTGATGTCTTCTCTATCCAACTATTTCAACCACTTTGTGCTGTATACATTTTTGTCTTTGTCAATTGTTGAT ATATGTTACTGAATACCCATTTCCGTCTTATAATATATTTCTTTTATCAAATAAAGAAACATTTGAAGATTCTGTTTGTGATTTGGTACTATGAATCCTT CATTGGTGTATTTTGCATTATTATTATTATTAAAACGCTTAAATATATTTTTAGCCCCTGCAAATATAGGAAAATTTGGTTCTAGTCATACAATTTATTT TTAAGTTTTAAGTCTCTACTTTAGTTGATCAGTTTTTGTTTTAGTCCCTGTTACTCCATTAGTGATGCATCTACACCACAATTGGTCATGTCATCTATTA ATATGACATGTGTCATATGTGAGTGTTAGCTACATTATCATTAGGAACTAAAATCAAAATTTTGGAATATAAAACAAAAAAAGTAAAATTGTAAGGACTA GAACCAAAATTCGGTAAATCTCCATGGACTAAAAAGCATATTTACTCCTTATTAAAACATAAAGATCAAAGTTTGCAATCCTTTGGTTGCTCTGTCTTGA GTTCATTTATTGTGGCTAAGATTTTAGCTTTTTATCAGGTTACAGTGGTTGATCCTGAGGCATACACCTACGATGATGAGGTGATTAAGAAAGCAGAAGC AATGGGCAAACCTGGACTAGTAGAAATCAATGCAAAACAGGATAGCTTCATATTCACAGTTGAATCTACTGGTGCTGTTAAAGCTTCTCAGTTAGTACTA AATGCCATAGAAATTCTCAAGACGAAGCTGGATGCTGTGCGGCTATCCGAAGATACCGTGGAGGCTGATGACCAGTTTGGTGAGCTAGGTGCGCATTTGC GAGGGGGTTGATCAAGTCGGTATACCGTGGATGCTGTGTTTTTCCTGAACTTGTTTTGTTGCATGCTGTGCTTAACTGAATAGCTGCCAGCAGGTGCTTC CTCATTGCACCAAAGATGCTAATTGTCATTATGATCCCTTTTATATAAACAGTTATCTTTCAAATTTAAGCCAATTAAACAGTGCTACCATGTGATATAA TCTATTTTCTTTTTCCTGTCAGTTGTGGGTATGGTATGTTGATGTTTACACTTGAAGCAGTTGTGCTTTCATTCCATCCACTTTTAAGTATATAAATGAA TTTAGGAACTGGTATTCACTTGAGCTTTAAAACATCTTTGT BLAST |
Tissue | flowers |
Gene name | LI_gene_65234; |
Additional information | - |
FPAB | abscising flower pedicels |
FPNAB | non-abscising flower pedicels |
LF1 | lower flowers stage 1 |
LF2 | lower flowers stage 2 |
LF3 | lower flowers stage 3 |
LF4 | lower flowers stage 4 |
UF1 | upper flowers stage 1 |
UF2 | upper flowers stage 2 |
UF3 | upper flowers stage 3 |
UF4 | upper flowers stage 4 |
Annotations of Ll_transcript_172439
Blastp | - |
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Blastx | DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 3 from Arabidopsis with 87.91% of identity |
Eggnog | DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates (By similarity)(COG0202) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT2G15430) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019422056.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |